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Effective results for Citreicella sp. SE45 (eggnog40)

Summary

Number of putative secreted proteins: 116
- Predicted by T4SEpre: 0
- Predicted by EffectiveELD: 22 eukaryotic-like domains, contained in 116 proteins (3 high, 113 medium Z-score)
Predicted protein secretion systems (parentheses indicate weak positive predictions lacking more than 50% of core proteins of a secretion system): None

Protein based results

Putative secreted proteins (weak evidence indicated by parentheses)

ProteinEffectiveT3EffectiveCCBDT4SEpreEffectiveELDPredotar
501479.CSE45_4485(PF03480)ER
501479.CSE45_4777(PF03480)ER
501479.CSE45_4808(PF03480)(mitochondrial)
501479.CSE45_1386(PF02386)ER
501479.CSE45_2621(PF02386)ER
501479.CSE45_0806(PF03480)(ER)
501479.CSE45_2091(PF03480)ER
501479.CSE45_3674(PF03480)ER
501479.CSE45_3055(PF01970)(ER)
501479.CSE45_4826(PF01970)ER
501479.CSE45_4523(PF03480)(mitochondrial); (ER)
501479.CSE45_2086(PF03480)ER; (ER)
501479.CSE45_4729(PF03480)ER
501479.CSE45_5184(PF03480)ER
501479.CSE45_0739(PF03480)ER
501479.CSE45_2696(PF02386)ER
501479.CSE45_4935(PF01970)ER; (ER)
501479.CSE45_1181(PF03480)ER
501479.CSE45_4692(PF01970)ER
501479.CSE45_4472(PF03480)ER; (ER)
501479.CSE45_4876(PF03480)mitochondrial
501479.CSE45_4922(PF03480)ER
501479.CSE45_1971PF10563ER
501479.CSE45_1799(PF13778)(ER)
501479.CSE45_4914(PF03480)ER
501479.CSE45_4465(PF01970)ER
501479.CSE45_3010(PF03480)ER
501479.CSE45_5133(PF01970)ER
501479.CSE45_5139(PF03480)mitochondrial; (mitochondrial)
501479.CSE45_0561(PF03098)mitochondrial
501479.CSE45_2832(PF13778)ER
501479.CSE45_3944(PF01774)mitochondrial; (mitochondrial)
501479.CSE45_4891(PF03480)ER
501479.CSE45_2364(PF03480)mitochondrial; (mitochondrial)
501479.CSE45_4883(PF03480)ER
501479.CSE45_4531(PF03480)ER
501479.CSE45_1300(PF02386)ER
501479.CSE45_1301(PF03480)ER
501479.CSE45_0323(PF03480)ER
501479.CSE45_1547(PF03480)ER
501479.CSE45_1129(PF03480)ER
501479.CSE45_1121(PF03480)ER
501479.CSE45_3680(PF01970)ER
501479.CSE45_4511(PF03480)mitochondrial
501479.CSE45_4428(PF01970)ER
501479.CSE45_1101(PF01774)ER
501479.CSE45_3257(PF03480)ER
501479.CSE45_4575(PF03480)ER
501479.CSE45_4445(PF03480)ER
501479.CSE45_5394(PF13510)(mitochondrial)
501479.CSE45_5156(PF01958)mitochondrial
501479.CSE45_1904(PF03480)ER
501479.CSE45_3265(PF03480)ER
501479.CSE45_5364(PF03480)(mitochondrial)
501479.CSE45_2122(PF03480)(mitochondrial)
501479.CSE45_0444PF00411(ER)
501479.CSE45_5262(PF03480)(mitochondrial)
501479.CSE45_3591(PF02485)(plastid)
501479.CSE45_0912(PF13510)(mitochondrial)
501479.CSE45_1175(PF13510)(mitochondrial)
501479.CSE45_5223(PF02195)(mitochondrial)
501479.CSE45_2220(PF02195)(plastid)
501479.CSE45_5157(PF03480)(ER)
501479.CSE45_3671(PF01970)(ER)
501479.CSE45_0253(PF03480)
501479.CSE45_0702(PF07930)
501479.CSE45_1381(PF14532)
501479.CSE45_2399(PF02538)
501479.CSE45_2248(PF13023)
501479.CSE45_5055(PF01970)
501479.CSE45_4714(PF02195)
501479.CSE45_4926(PF02538)
501479.CSE45_4921(PF02538)
501479.CSE45_5270(PF13510)
501479.CSE45_2690(PF10609)
501479.CSE45_4930(PF01970)
501479.CSE45_4738(PF13510)
501479.CSE45_4733(PF02538)
501479.CSE45_0583(PF01730)
501479.CSE45_0585(PF05292)
501479.CSE45_2063(PF16952)
501479.CSE45_4902(PF01958)
501479.CSE45_3488(PF02386)
501479.CSE45_4879(PF02195)
501479.CSE45_0205(PF13510)
501479.CSE45_2053(PF14532)
501479.CSE45_2233(PF03098)
501479.CSE45_3630(PF09458)
501479.CSE45_3129(PF02485)
501479.CSE45_3012(PF02538)
501479.CSE45_3948(PF01730)
501479.CSE45_2556(PF02195)
501479.CSE45_2318(PF13510)
501479.CSE45_0573(PF01774)
501479.CSE45_1138(PF02538)
501479.CSE45_4664(PF03480)
501479.CSE45_3362(PF13023)
501479.CSE45_4886(PF05292)
501479.CSE45_3212(PF02195)
501479.CSE45_5332(PF10609)
501479.CSE45_3211(PF02195)
501479.CSE45_1545(PF14532)
501479.CSE45_1546(PF13023)
501479.CSE45_2571(PF02195)
501479.CSE45_5326(PF02195)
501479.CSE45_3690(PF02195)
501479.CSE45_2586(PF02195)
501479.CSE45_5172(PF01970)
501479.CSE45_1104(PF01730)
501479.CSE45_4560(PF13510)
501479.CSE45_0190(PF10609)
501479.CSE45_1911(PF11927)
501479.CSE45_0443PF00411not used
501479.CSE45_3418(PF02195)
501479.CSE45_4761(PF13510)
501479.CSE45_5384(PF11927)

Detailed merged results for each protein sequence

Individual results for each protein sequence

Genome based results

Summary

  • Gram negative: YES (FDR = 0.5 %)
  • Functional Type III secretion system: NO (FDR = 12.5 %)
  • Functional Type IV secretion system: NO (FDR = 7.2 %)
  • Functional Type VI secretion system: NO (FDR = 7.7 %)

Individual results for each secretion system

Parameters:

==========================================================
EFFECTIVE_T3_OLD=selective
EFFECTIVE_T3_NEW=selective
PREDOTAR_ANIMAL_OR_PLANT=a
PROTEINS=INPUT PROTEINS
MODUS=genome
RUN_PREDOTAR=T
RUN_EFFECTIVE_T3=T
RUN_T4SEpre=0.5
RUN_EFFECTIVE_CCBD=T
RUN_EFFECTIVE_ELD=4
CheckM_COMPLETENESS=
RUN_EffectiveS346=T
GENOTYPE=COG Profile
EMAIL=
==========================================================