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Effective results for Paenibacillus vortex V453 (eggnog40)

Summary

Number of putative secreted proteins: 279
- Predicted by T4SEpre: 0
- Predicted by EffectiveELD: 54 eukaryotic-like domains, contained in 279 proteins (8 high, 271 medium Z-score)
Predicted protein secretion systems (parentheses indicate weak positive predictions lacking more than 50% of core proteins of a secretion system): None

Protein based results

Putative secreted proteins (weak evidence indicated by parentheses)

ProteinEffectiveT3EffectiveCCBDT4SEpreEffectiveELDPredotar
715225.PVOR_03963(PF03714) (PF00395)ER
715225.PVOR_04053(PF12733) (PF00395)ER
715225.PVOR_20654(PF12733) (PF00395)ER
715225.PVOR_21684(PF00704) (PF00395)ER
715225.PVOR_30743(PF00704) (PF00395)ER
715225.PVOR_26850(PF12733) (PF00395)ER
715225.PVOR_08635(PF12733) (PF00395)ER
715225.PVOR_18919(PF16334) (PF16335) (PF17168) (PF08760)
715225.PVOR_10524(PF01547)ER
715225.PVOR_10529(PF01547)ER
715225.PVOR_26273(PF13416)ER
715225.PVOR_08645(PF03442)ER
715225.PVOR_23954(PF13416)ER
715225.PVOR_06230(PF13416)ER
715225.PVOR_08720(PF03442)ER
715225.PVOR_00700(PF07488) (PF03648) (PF07477)
715225.PVOR_03205(PF13416)ER
715225.PVOR_12545(PF01547)(ER); ER
715225.PVOR_08105(PF02894)(ER)
715225.PVOR_30858(PF13416)ER; (ER)
715225.PVOR_16579PF16116ER
715225.PVOR_16619(PF13416)ER
715225.PVOR_17569(PF13416)ER
715225.PVOR_05303(PF01547)(ER)
715225.PVOR_06900(PF01547)ER
715225.PVOR_08500(PF01547)ER
715225.PVOR_26158(PF08279)(ER); ER
715225.PVOR_08560(PF07488) (PF03648) (PF07477)
715225.PVOR_04203(PF01391)mitochondrial
715225.PVOR_21104(PF00704)ER
715225.PVOR_16219(PF00395)ER
715225.PVOR_01145(PF08279)mitochondrial; (mitochondrial)
715225.PVOR_08545(PF13416)ER
715225.PVOR_25568(PF13416)ER
715225.PVOR_25563(PF13349)ER
715225.PVOR_05098(PF13416)ER
715225.PVOR_12695(PF00704)ER
715225.PVOR_09255(PF00395)ER
715225.PVOR_00865(PF01547)ER
715225.PVOR_31894(PF00395)ER
715225.PVOR_18184(PF01547)ER
715225.PVOR_16524(PF13349)ER
715225.PVOR_03923(PF00395)ER
715225.PVOR_15789(PF00704)ER
715225.PVOR_25918(PF01547)ER
715225.PVOR_07050(PF13416)ER
715225.PVOR_04633(PF01547)ER
715225.PVOR_23484(PF01547)ER
715225.PVOR_06775(PF01547)ER
715225.PVOR_10484(PF01547)ER
715225.PVOR_10489(PF00395)ER
715225.PVOR_11685(PF13416)ER
715225.PVOR_12455(PF13416)ER
715225.PVOR_28494(PF01789)ER
715225.PVOR_05203(PF13416)ER
715225.PVOR_08355(PF13416)ER
715225.PVOR_04093(PF01547)ER
715225.PVOR_10394(PF13416)ER
715225.PVOR_32246(PF13416)ER
715225.PVOR_04758(PF13416)ER
715225.PVOR_06450(PF01547)ER
715225.PVOR_00435(PF00902)ER
715225.PVOR_23349PF08635(mitochondrial)
715225.PVOR_08430(PF00395)mitochondrial
715225.PVOR_25768(PF13416)ER
715225.PVOR_31419(PF00395)ER; (ER)
715225.PVOR_32266(PF01547)ER
715225.PVOR_07105(PF01547)ER
715225.PVOR_08450(PF08279)ER
715225.PVOR_14784(PF01547)ER
715225.PVOR_04718(PF01547)ER
715225.PVOR_09430(PF13416)ER
715225.PVOR_26003(PF01547)ER
715225.PVOR_11204(PF13416)ER
715225.PVOR_17434(PF13787)ER
715225.PVOR_16349(PF01547)ER
715225.PVOR_30628(PF08279)ER
715225.PVOR_05123(PF02894)(ER)
715225.PVOR_18154(PF00704)ER; (ER)
715225.PVOR_24619(PF17125)(mitochondrial); mitochondrial
715225.PVOR_00720(PF13416)ER
715225.PVOR_21964(PF02894)mitochondrial
715225.PVOR_19164(PF00395)mitochondrial; (ER)
715225.PVOR_27759(PF00395)ER
715225.PVOR_31399(PF00395)ER
715225.PVOR_16604(PF02894)(mitochondrial)
715225.PVOR_13399(PF13367)ER
715225.PVOR_04898(PF13416)ER
715225.PVOR_21309(PF02894)(mitochondrial); mitochondrial
715225.PVOR_07815(PF01547)ER
715225.PVOR_21829(PF00902)ER
715225.PVOR_19084(PF01547)ER
715225.PVOR_00280(PF00395)ER; (mitochondrial)
715225.PVOR_08080(PF01547)ER
715225.PVOR_30483(PF01547)ER
715225.PVOR_16039(PF01547)ER
715225.PVOR_20454(PF01547)ER
715225.PVOR_31579(PF00395)(mitochondrial); (plastid)
715225.PVOR_17674(PF08279)(mitochondrial)
715225.PVOR_22174(PF00395)ER
715225.PVOR_15839(PF13416)ER
715225.PVOR_04583(PF13416)ER
715225.PVOR_13085(PF13416)ER
715225.PVOR_00480(PF01547)ER
715225.PVOR_06880(PF13416)ER
715225.PVOR_18509(PF01547)ER
715225.PVOR_30373(PF00704)ER
715225.PVOR_01265(PF00704)ER
715225.PVOR_23559(PF13416)ER
715225.PVOR_06260(PF13416)ER
715225.PVOR_09075(PF13416)ER
715225.PVOR_08650(PF00395)(mitochondrial)
715225.PVOR_22084(PF13349)ER
715225.PVOR_30338(PF13416)ER
715225.PVOR_29823(PF13349)ER
715225.PVOR_30298(PF13416)ER
715225.PVOR_05028(PF13416)ER
715225.PVOR_09250(PF08279)(mitochondrial)
715225.PVOR_18974(PF01547)ER
715225.PVOR_26233(PF13416)ER
715225.PVOR_05865(PF13416)ER
715225.PVOR_12810(PF01547)ER
715225.PVOR_25843(PF01547)ER
715225.PVOR_27555(PF01391)(mitochondrial)
715225.PVOR_23334(PF13416)ER
715225.PVOR_27300(PF01547)ER
715225.PVOR_08425(PF00395)ER
715225.PVOR_19254(PF13349)ER
715225.PVOR_20524(PF13416)ER
715225.PVOR_05113(PF02894)(ER)
715225.PVOR_28479(PF00139)(ER)
715225.PVOR_06090(PF01547)(plastid)
715225.PVOR_04618(PF02894)(mitochondrial)
715225.PVOR_20554(PF13367)(ER)
715225.PVOR_07935(PF12733) (PF00395)
715225.PVOR_18114(PF01547)plastid
715225.PVOR_25908(PF08279)(mitochondrial)
715225.PVOR_12400(PF02894)(plastid)
715225.PVOR_12190(PF17125)(ER)
715225.PVOR_28319(PF12867)(ER)
715225.PVOR_15649(PF12746)
715225.PVOR_04743(PF12867)
715225.PVOR_25583(PF13787)
715225.PVOR_04358(PF13416)
715225.PVOR_24189(PF01784)
715225.PVOR_03745(PF00395)
715225.PVOR_25808(PF08279)
715225.PVOR_08140(PF13349)
715225.PVOR_06180(PF12867)
715225.PVOR_04763(PF13416)
715225.PVOR_16544(PF12867)
715225.PVOR_24084(PF12867)
715225.PVOR_28284(PF00477)
715225.PVOR_08690(PF00398)
715225.PVOR_21939(PF00190)
715225.PVOR_18859(PF01391)not used
715225.PVOR_18854(PF13518)
715225.PVOR_08100(PF02894)
715225.PVOR_19179(PF01391)not used
715225.PVOR_24294(PF12867)
715225.PVOR_14854(PF01547)
715225.PVOR_16694(PF13518)
715225.PVOR_19379(PF13518)
715225.PVOR_02935(PF03848)
715225.PVOR_16549(PF08279)
715225.PVOR_29309(PF08279)
715225.PVOR_25998(PF13320)
715225.PVOR_10284(PF03714)
715225.PVOR_00500(PF00704)
715225.PVOR_30123(PF00395)
715225.PVOR_01370(PF00395)
715225.PVOR_28454(PF09370)
715225.PVOR_18129(PF11918)
715225.PVOR_02541(PF02403)
715225.PVOR_23529(PF02894)
715225.PVOR_07785(PF13367)
715225.PVOR_16424(PF12867)
715225.PVOR_08775(PF00190)
715225.PVOR_07275(PF01702)
715225.PVOR_11339(PF02873)
715225.PVOR_26865(PF08279)
715225.PVOR_11109(PF01784)
715225.PVOR_16599PF16116
715225.PVOR_19079(PF01547)
715225.PVOR_30578(PF06283)
715225.PVOR_10449(PF01547)
715225.PVOR_17874(PF00398)
715225.PVOR_28959(PF06925)
715225.PVOR_12750(PF02894)
715225.PVOR_07845(PF06283)
715225.PVOR_21539(PF02873)
715225.PVOR_24534(PF17125)
715225.PVOR_30553(PF06283)
715225.PVOR_25913(PF02894)
715225.PVOR_27660(PF06925)
715225.PVOR_24259(PF01547)
715225.PVOR_10764(PF02894)
715225.PVOR_10769(PF02894)
715225.PVOR_20824(PF13518)
715225.PVOR_18029(PF08279)
715225.PVOR_02281(PF00398)
715225.PVOR_25096(PF13320)
715225.PVOR_01060(PF12867)
715225.PVOR_06285(PF02894)
715225.PVOR_16294(PF02894)
715225.PVOR_09490(PF13416)
715225.PVOR_03860(PF08271)
715225.PVOR_04678(PF01547)
715225.PVOR_04673(PF01547)
715225.PVOR_20134(PF06925)
715225.PVOR_29813(PF00704)
715225.PVOR_23114(PF13518)
715225.PVOR_19569(PF13238)
715225.PVOR_01215(PF00190)
715225.PVOR_16964(PF00395)
715225.PVOR_04658(PF02894)
715225.PVOR_00230(PF02894)
715225.PVOR_05408(PF02894)
715225.PVOR_25106(PF01547)
715225.PVOR_09944(PF01702)
715225.PVOR_24359(PF12867)
715225.PVOR_24354(PF12746)
715225.PVOR_00455(PF00704)
715225.PVOR_00100(PF06283)
715225.PVOR_15019PF08795
715225.PVOR_15484(PF00707)
715225.PVOR_25748(PF00190)
715225.PVOR_18479(PF16332)
715225.PVOR_08475PF03133
715225.PVOR_23904(PF12867)
715225.PVOR_16644(PF08279)
715225.PVOR_12555(PF02894)
715225.PVOR_25061(PF02894)
715225.PVOR_28464(PF09370)
715225.PVOR_18799(PF02894)
715225.PVOR_12550(PF06283)
715225.PVOR_08510(PF00395)
715225.PVOR_25046(PF02894)
715225.PVOR_18804(PF12867)
715225.PVOR_17829(PF12867)
715225.PVOR_21654(PF13238)
715225.PVOR_21304(PF06283)
715225.PVOR_15289(PF07931)
715225.PVOR_08550(PF01784)
715225.PVOR_07875(PF12867)
715225.PVOR_16589PF16116
715225.PVOR_07265(PF01702)
715225.PVOR_16444PF08795
715225.PVOR_31884(PF00395)
715225.PVOR_05183(PF08950)
715225.PVOR_12680(PF03142)
715225.PVOR_18504(PF00165)
715225.PVOR_12760(PF06283)
715225.PVOR_21634(PF12867)
715225.PVOR_23499(PF14330)
715225.PVOR_27650(PF00707)
715225.PVOR_00650(PF02403)
715225.PVOR_13929(PF00395)
715225.PVOR_15199(PF00395)
715225.PVOR_28659(PF12867)
715225.PVOR_16164(PF12746)
715225.PVOR_14104PF08795
715225.PVOR_06290(PF02894)
715225.PVOR_20104(PF01391)
715225.PVOR_28489(PF00395)
715225.PVOR_20819(PF13518)
715225.PVOR_25623(PF00190)
715225.PVOR_06105(PF03662)
715225.PVOR_16754(PF07931)
715225.PVOR_13714(PF08279)
715225.PVOR_24124(PF00395)
715225.PVOR_23784(PF12867)
715225.PVOR_00405(PF13238)
715225.PVOR_28699(PF00902)
715225.PVOR_06805(PF13416)
715225.PVOR_27140(PF08279)
715225.PVOR_06915(PF08279)
715225.PVOR_05780(PF00902)
715225.PVOR_14169(PF03848)

Detailed merged results for each protein sequence

Individual results for each protein sequence

Genome based results

Summary

  • Gram negative: NO (FDR = 0.5 %)
  • Functional Type III secretion system: N.D.
  • Functional Type IV secretion system: NO (FDR = 7.2 %)
  • Functional Type VI secretion system: N.D.

Individual results for each secretion system

Parameters:

==========================================================
EFFECTIVE_T3_OLD=selective
EFFECTIVE_T3_NEW=selective
PREDOTAR_ANIMAL_OR_PLANT=a
PROTEINS=INPUT PROTEINS
MODUS=genome
RUN_PREDOTAR=T
RUN_EFFECTIVE_T3=T
RUN_T4SEpre=0.5
RUN_EFFECTIVE_CCBD=T
RUN_EFFECTIVE_ELD=4
CheckM_COMPLETENESS=
RUN_EffectiveS346=T
GENOTYPE=COG Profile
EMAIL=
==========================================================