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Genomes encoding eukaryotic-like proteins

PF00126 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family

Copy number in non-pathogens:
Mean=28.96 Stddev=37.05

Genomes significantly enriched in this eukaryotic-like domain (ELD; score >= 4):

Genome Class* ELD score Number of proteins containing this domain
Burkholderia cepacia s 5 227
Burkholderia cenocepacia J2315 s 5 225
Achromobacter xylosoxidans s 4 185
Burkholderia cenocepacia H111 s 5 225
Achromobacter xylosoxidans NH44784-1996 s 4 194
Burkholderia ambifaria IOP40-10 s 4 181
Burkholderia cenocepacia HI2424 s 5 218
Burkholderia cenocepacia BC7 s 5 223
Burkholderia cenocepacia K56-2Valvano s 4 212
Burkholderia sp. BT03 s 6 275
Burkholderia cenocepacia s 4 214
Burkholderia cepacia ATCC 25416 s 5 227
Burkholderia gladioli 3848s-5 s 4 210
Burkholderia sp. AU4i s 5 239
Achromobacter insuavis AXX-A s 4 204
Burkholderia sp. UYPR1.413 s 4 201
Paraburkholderia nodosa DSM 21604 s 5 230
Burkholderia cepacia Bu72 s 4 198
Achromobacter xylosoxidans X02736 s 4 188
Burkholderia lata s 6 266
Burkholderia ambifaria AMMD s 4 199
Burkholderia cenocepacia AU 1054 s 4 205
Burkholderia ambifaria MC40-6 s 4 181
Paraburkholderia phytofirmans PsJN s 4 179
Burkholderia cenocepacia MC0-3 s 5 225
Burkholderia gladioli BSR3 s 5 221
Burkholderia cenocepacia s 5 222
Burkholderia cenocepacia PT15 s 4 213
Burkholderia cenocepacia D2AES s 4 210
Burkholderia cenocepacia S2AES s 4 202
Burkholderia cepacia s 4 182
Burkholderia cepacia s 5 232
Burkholderia cenocepacia s 4 209
Burkholderia cepacia s 5 233
Burkholderia cepacia s 6 254
Burkholderia pyrrocinia s 4 188
Achromobacter xylosoxidans C54 s 4 178
Burkholderia ambifaria AMMD s 4 198
Burkholderia cepacia s 5 225
Burkholderia sp. NFACC33-1 s 4 184
Burkholderia sp. NFPP32 s 4 184
Burkholderia cepacia s 5 223
Burkholderia cepacia s 5 224
Burkholderia cenocepacia s 5 217
Burkholderia cenocepacia s 5 217
Burkholderia cenocepacia s 4 200
Burkholderia cenocepacia s 4 208
Burkholderia cenocepacia s 5 220
Burkholderia cenocepacia s 5 219
Burkholderia cenocepacia s 4 187
Burkholderia cenocepacia s 4 200
Burkholderia cenocepacia s 5 215
Burkholderia cenocepacia s 4 214
Burkholderia cenocepacia s 5 219
Achromobacter xylosoxidans s 4 182
Burkholderia cenocepacia s 4 212
Burkholderia cenocepacia s 5 216
Burkholderia cenocepacia s 4 195
Burkholderia cenocepacia s 5 215
Burkholderia cenocepacia s 5 217
Burkholderia cenocepacia s 5 225
Burkholderia cenocepacia s 5 224
Burkholderia cenocepacia s 5 225
Burkholderia cenocepacia s 5 224
Burkholderia cenocepacia s 5 223
Burkholderia cenocepacia s 5 225
Burkholderia cepacia s 5 225
Burkholderia cepacia s 5 225
Burkholderia cepacia s 5 231
Burkholderia cepacia s 5 231
Burkholderia cepacia s 5 229
Burkholderia cepacia s 5 232
Burkholderia cepacia s 5 232
Burkholderia cepacia s 5 232
Burkholderia cepacia s 5 232
Burkholderia cepacia s 5 232
Burkholderia cepacia s 5 232
Burkholderia cepacia s 5 232
Burkholderia cepacia s 5 232
Burkholderia cepacia s 5 232
Burkholderia cepacia s 5 232
Burkholderia cepacia s 5 232
Burkholderia cepacia s 5 232
Burkholderia cepacia s 5 232
Burkholderia cepacia s 5 232
Burkholderia cepacia s 5 232
Burkholderia cepacia s 5 232
Burkholderia cepacia s 5 232
Burkholderia cepacia s 5 232
Burkholderia cepacia s 5 232
Burkholderia cepacia s 4 188
Burkholderia cepacia s 5 232
Burkholderia cepacia s 5 228
Burkholderia cepacia s 5 225
Burkholderia cepacia s 5 239
Burkholderia cenocepacia s 5 216
Burkholderia cepacia s 5 228
Burkholderia lata s 5 223
Burkholderia cepacia s 4 212
Burkholderia cepacia s 5 226
Burkholderia cepacia s 5 237
Burkholderia cepacia s 5 219
Burkholderia cepacia s 5 218
Burkholderia cepacia s 5 224
Burkholderia cepacia s 4 212
Burkholderia cepacia s 5 226
Burkholderia cepacia s 5 224
Burkholderia cepacia s 5 225
Burkholderia cepacia s 4 191
Burkholderia cepacia s 5 238
Burkholderia cepacia s 4 185
Burkholderia cepacia s 5 224
Burkholderia cepacia s 5 228
Burkholderia cepacia s 5 229
Burkholderia cepacia s 5 222
Burkholderia cepacia s 5 223
Burkholderia cepacia s 4 185
Burkholderia cepacia s 4 185
Burkholderia cepacia s 5 223
Burkholderia cepacia s 5 223
Burkholderia cepacia s 5 217
Burkholderia cepacia s 5 223
Burkholderia cepacia s 5 223
Burkholderia cepacia s 5 230
Burkholderia cepacia s 5 223
Burkholderia cepacia s 4 185
Burkholderia cepacia s 5 228
Burkholderia cepacia s 5 232
Burkholderia cepacia s 5 228
Burkholderia cepacia s 4 191
Burkholderia cepacia s 5 228
Burkholderia cepacia s 5 227
Burkholderia cepacia s 5 226
Burkholderia cepacia s 5 237
Burkholderia cepacia s 5 231
Burkholderia cepacia s 5 229
Burkholderia cepacia s 4 193
Burkholderia cepacia s 5 231
Burkholderia cepacia s 5 231
Burkholderia cepacia s 5 233
Burkholderia cenocepacia s 5 223
Burkholderia cenocepacia s 5 227
Burkholderia cenocepacia s 5 227
Burkholderia cepacia s 5 236
Burkholderia cepacia s 5 224
Burkholderia cepacia s 5 232
Burkholderia cepacia s 5 229
Burkholderia cepacia s 5 223
Burkholderia cepacia s 5 225
Burkholderia pyrrocinia s 4 201
Burkholderia lata s 5 237
Burkholderia lata s 4 189
Burkholderia cepacia s 5 235
Achromobacter xylosoxidans s 4 184
Achromobacter xylosoxidans s 4 181
Achromobacter xylosoxidans s 4 185
Achromobacter xylosoxidans s 4 183
Achromobacter xylosoxidans s 4 183
Achromobacter xylosoxidans s 4 186
Achromobacter xylosoxidans s 4 186
Burkholderia cenocepacia s 4 192
Achromobacter xylosoxidans s 4 179
Achromobacter xylosoxidans s 4 184
Achromobacter xylosoxidans s 4 200
Burkholderia cepacia ATCC 25416 s 5 227
Burkholderia cenocepacia s 4 201
Achromobacter xylosoxidans s 4 187
Burkholderia cenocepacia s 5 224
Burkholderia cenocepacia s 5 235
Achromobacter sp. AR476-2 s 4 212
Achromobacter xylosoxidans s 4 187
Burkholderia cenocepacia s 5 215
Burkholderia cenocepacia s 5 219
Burkholderia cenocepacia s 5 215
Burkholderia cenocepacia s 4 205
Burkholderia cenocepacia s 4 211
Burkholderia cenocepacia s 4 210
Burkholderia cenocepacia s 4 206
Burkholderia cenocepacia s 4 208
Burkholderia cenocepacia s 4 200
Burkholderia cenocepacia s 4 204
Burkholderia cenocepacia s 4 200
Burkholderia cenocepacia s 4 204
Burkholderia cenocepacia s 4 212
Burkholderia cenocepacia s 4 210
Burkholderia cenocepacia s 4 204
Burkholderia cenocepacia s 4 208
Burkholderia cenocepacia s 4 206
Burkholderia cenocepacia s 4 204
Burkholderia cenocepacia s 4 209
Burkholderia cenocepacia s 4 212
Burkholderia cenocepacia s 4 204
Burkholderia cenocepacia s 4 210
Burkholderia cenocepacia s 5 221
Burkholderia cenocepacia s 5 221
Burkholderia cenocepacia s 5 221
Burkholderia cenocepacia s 4 211
Burkholderia cenocepacia s 5 221
Burkholderia cenocepacia s 5 221
Burkholderia cenocepacia s 5 220
Burkholderia cenocepacia s 4 180
Burkholderia cenocepacia s 5 217
Burkholderia cenocepacia s 5 221
Burkholderia cenocepacia s 5 217
Burkholderia cenocepacia s 5 220
Burkholderia cenocepacia s 5 218
Burkholderia cenocepacia s 5 217
Burkholderia cenocepacia s 5 217
Burkholderia cenocepacia s 5 216
Burkholderia cenocepacia s 4 210
Burkholderia cenocepacia s 5 221
Burkholderia cenocepacia s 5 217
Burkholderia cenocepacia s 5 220
Burkholderia cenocepacia s 5 220
Burkholderia cenocepacia s 5 220
Burkholderia cenocepacia s 5 219
Burkholderia cenocepacia s 4 211
Burkholderia cenocepacia s 4 211
Burkholderia cenocepacia s 4 211
Burkholderia cenocepacia s 5 219
Burkholderia cenocepacia s 4 204
Burkholderia cenocepacia s 4 204
Burkholderia cenocepacia s 4 210
Burkholderia cenocepacia s 5 220
Burkholderia cenocepacia s 4 211
Burkholderia cenocepacia s 4 210
Burkholderia cenocepacia s 4 207
Burkholderia cenocepacia s 4 206
Burkholderia cenocepacia s 4 206
Burkholderia cenocepacia s 4 202
Burkholderia cenocepacia s 4 208
Burkholderia cenocepacia s 4 204
Burkholderia cenocepacia s 4 208
Burkholderia cenocepacia s 4 205
Burkholderia cenocepacia s 4 202
Burkholderia cenocepacia s 4 209
Burkholderia cenocepacia s 4 206
Burkholderia cenocepacia s 4 206
Burkholderia cenocepacia s 4 207
Burkholderia cenocepacia s 4 203
Burkholderia cenocepacia s 4 202
Burkholderia cenocepacia s 4 207
Burkholderia cenocepacia s 5 224
Burkholderia cenocepacia s 5 224
Burkholderia cenocepacia s 5 221
Burkholderia cenocepacia s 5 223
Burkholderia cenocepacia s 4 210
Burkholderia cenocepacia s 5 220
Burkholderia cenocepacia s 5 215
Burkholderia cenocepacia s 5 221
Burkholderia cenocepacia s 5 220
Burkholderia cenocepacia s 5 224
Burkholderia cenocepacia s 5 224
Burkholderia cenocepacia s 5 222
Burkholderia cenocepacia s 5 221
Burkholderia cenocepacia s 5 224
Burkholderia cenocepacia s 4 209
Burkholderia cenocepacia s 4 209
Burkholderia cenocepacia s 4 210
Burkholderia cenocepacia s 4 210
Burkholderia cenocepacia s 4 210
Burkholderia cenocepacia s 4 206
Burkholderia cenocepacia s 4 210
Burkholderia cenocepacia s 4 210
Burkholderia cenocepacia s 5 226
Burkholderia cenocepacia s 5 225
Burkholderia cenocepacia s 5 222
Burkholderia cenocepacia s 5 221
Burkholderia cenocepacia s 5 225
Burkholderia cenocepacia s 5 220
Burkholderia cenocepacia s 5 223
Burkholderia cenocepacia s 5 225
Burkholderia cenocepacia s 5 224
Burkholderia cenocepacia s 5 226
Burkholderia cenocepacia s 4 182
Burkholderia cenocepacia s 5 219
Burkholderia cenocepacia s 5 217
Burkholderia cenocepacia s 4 214
Burkholderia cenocepacia s 5 219
Burkholderia cenocepacia s 5 219
Burkholderia cenocepacia s 5 219
Burkholderia cenocepacia s 5 219
Burkholderia cenocepacia s 5 219
Burkholderia cenocepacia s 4 198
Burkholderia cenocepacia s 4 213
Burkholderia cenocepacia s 4 191
Burkholderia cenocepacia s 5 217
Burkholderia cenocepacia s 4 212
Burkholderia cenocepacia s 4 202
Burkholderia cenocepacia s 5 216
Burkholderia cenocepacia s 5 216
Burkholderia cenocepacia s 5 217
Burkholderia cenocepacia s 4 212
Burkholderia cenocepacia s 4 212
Burkholderia cenocepacia s 4 213
Burkholderia cenocepacia s 4 212
Burkholderia cenocepacia s 5 217
Burkholderia cenocepacia s 5 217
Burkholderia cenocepacia s 4 207
Burkholderia cenocepacia s 4 209
Burkholderia cenocepacia s 4 205
Burkholderia cenocepacia s 4 210
Burkholderia cenocepacia s 4 209
Burkholderia cenocepacia s 4 210
Burkholderia cenocepacia s 4 210
Burkholderia cenocepacia s 4 208
Burkholderia cenocepacia s 4 210
Burkholderia cenocepacia s 4 208
Burkholderia cenocepacia s 4 209
Burkholderia cenocepacia s 5 220
Burkholderia cenocepacia s 5 220
Burkholderia cenocepacia s 5 220
Burkholderia cenocepacia s 4 213
Burkholderia cenocepacia s 5 219
Burkholderia cenocepacia s 5 221
Burkholderia cenocepacia s 5 218
Burkholderia cenocepacia s 5 222
Burkholderia cenocepacia s 5 224
Burkholderia cenocepacia s 5 224
Burkholderia cenocepacia s 5 223
Burkholderia cenocepacia s 5 222
Burkholderia cenocepacia s 5 221
Burkholderia cenocepacia s 5 222
Burkholderia cenocepacia s 5 224
Burkholderia cenocepacia s 5 224
Burkholderia cenocepacia s 5 222
Burkholderia cenocepacia s 5 222
Burkholderia cenocepacia s 4 194
Burkholderia cenocepacia s 4 192
Burkholderia cenocepacia s 4 195
Burkholderia cenocepacia s 4 191
Burkholderia cenocepacia s 4 195
Burkholderia cenocepacia s 5 230
Burkholderia cenocepacia s 5 228
Burkholderia cenocepacia s 5 228
Burkholderia cenocepacia s 5 225
Burkholderia cenocepacia s 5 229
Burkholderia cenocepacia s 5 228
Burkholderia cenocepacia s 5 230
Burkholderia cenocepacia s 5 221
Burkholderia cenocepacia s 5 215
Burkholderia cenocepacia s 5 221
Burkholderia cenocepacia s 5 220
Burkholderia cenocepacia s 5 221
Burkholderia cenocepacia s 5 221
Burkholderia cenocepacia s 4 214
Burkholderia cenocepacia s 4 186
Burkholderia cenocepacia s 5 224
Burkholderia cenocepacia s 5 224
Burkholderia cenocepacia s 5 224
Burkholderia cenocepacia s 4 191
Burkholderia cenocepacia s 4 203
Burkholderia cenocepacia s 5 223
Burkholderia cenocepacia s 5 224
Burkholderia cenocepacia s 5 224
Burkholderia cenocepacia s 5 223
Burkholderia cenocepacia s 5 216
Burkholderia cenocepacia s 5 220
Burkholderia cenocepacia s 5 224
Burkholderia cenocepacia s 5 223
Burkholderia cenocepacia s 5 224
Burkholderia cenocepacia s 5 224
Burkholderia cenocepacia s 5 222
Burkholderia cenocepacia s 5 224
Burkholderia cenocepacia s 4 213
Burkholderia cenocepacia s 5 223
Burkholderia cenocepacia s 5 224
Burkholderia cenocepacia s 5 218
Burkholderia cenocepacia s 5 219
Burkholderia cenocepacia s 5 219
Burkholderia cenocepacia s 5 232
Burkholderia cenocepacia s 5 229
Burkholderia cenocepacia s 5 215
Achromobacter xylosoxidans s 4 210
Achromobacter xylosoxidans s 4 184
Achromobacter xylosoxidans s 4 190
Achromobacter xylosoxidans s 5 229
Achromobacter denitrificans s 5 217
Achromobacter xylosoxidans s 5 226
Burkholderia cepacia s 5 224
Achromobacter xylosoxidans s 5 220
Burkholderia sp. BT03 s 6 277
Burkholderia cenocepacia s 4 214
Achromobacter denitrificans s 5 222

*p=pathogen;s=symbiont