Effective results for Ralstonia eutropha JMP134 (eggnog40)
Summary
Number of putative secreted proteins: 1077
- Predicted by EffectiveT3: 331 (high confidence), 428 (low confidence)
- Predicted by EffectiveCCBD: 28 within, 15 before, 50 behind expected region 25..70aa
- Predicted by T4SEpre: 83
- Predicted by EffectiveELD: 32 eukaryotic-like domains, contained in 195 proteins (0 high, 195 medium Z-score)
Predicted protein secretion systems (parentheses indicate weak positive predictions lacking more than 50% of core proteins of a secretion system): (Type III), (Type IV), Type VI
Protein based results
Putative secreted proteins (weak evidence indicated by parentheses)
| Protein | EffectiveT3 | EffectiveCCBD | T4SEpre | EffectiveELD | Predotar |
|---|---|---|---|---|---|
| 264198.Reut_B4556 | (PF13607) (PF13380) (PF13549) | (mitochondrial) | |||
| 264198.Reut_B3496 | (PF06863) (PF06742) | ER | |||
| 264198.Reut_B4247 | (PF06863) (PF06742) | ER | |||
| 264198.Reut_A0269 | (PF01614) (PF09339) | mitochondrial | |||
| 264198.Reut_B5159 | (PF06863) (PF06742) | (ER) | |||
| 264198.Reut_B5158 | (PF06742) (PF06863) | ER | |||
| 264198.Reut_A2728 | + | (ER) | |||
| 264198.Reut_B5466 | (PF06863) (PF06742) | (mitochondrial) | |||
| 264198.Reut_B5465 | (PF06742) (PF06863) | (mitochondrial) | |||
| 264198.Reut_B4596 | + | (PF13607) (PF13380) (PF13549) | |||
| 264198.Reut_B5569 | (PF01614) (PF09339) | (mitochondrial); plastid | |||
| 264198.Reut_A0382 | (PF06742) (PF06863) | ER | |||
| 264198.Reut_B5543 | (PF01614) (PF09339) | (mitochondrial); (plastid) | |||
| 264198.Reut_B4627 | (PF01614) (PF09339) | mitochondrial; (mitochondrial) | |||
| 264198.Reut_B4608 | (>) | mitochondrial | |||
| 264198.Reut_B3653 | + | ER | |||
| 264198.Reut_A0535 | (PF13436) | ER | |||
| 264198.Reut_A0537 | + | (mitochondrial) | |||
| 264198.Reut_A2875 | (>) | ER | |||
| 264198.Reut_A0702 | + | ER | |||
| 264198.Reut_A2418 | (<) | ER | |||
| 264198.Reut_A1398 | (>) | (ER) | |||
| 264198.Reut_B4958 | (PF02515) | (ER) | |||
| 264198.Reut_B4225 | (+) | + | ER | ||
| 264198.Reut_A2474 | + | (mitochondrial); plastid | |||
| 264198.Reut_B4206 | + | (ER) | |||
| 264198.Reut_A2620 | + | (mitochondrial) | |||
| 264198.Reut_A2626 | + | ER | |||
| 264198.Reut_B5092 | + | mitochondrial | |||
| 264198.Reut_A1907 | (PF13607) (PF13380) (PF13549) | ||||
| 264198.Reut_B3573 | (+) | (PF01614) (PF09339) | (plastid) | ||
| 264198.Reut_B4791 | (+) | (PF13607) (PF13380) (PF13549) | |||
| 264198.Reut_A0842 | (>) | ER | |||
| 264198.Reut_A0849 | (PF02515) | ER | |||
| 264198.Reut_A1522 | + | ER | |||
| 264198.Reut_A0041 | + | (mitochondrial); (plastid) | |||
| 264198.Reut_A0868 | (PF01614) (PF09339) | (ER) | |||
| 264198.Reut_A0675 | (PF13441) | ER | |||
| 264198.Reut_B5344 | + | (mitochondrial) | |||
| 264198.Reut_A1330 | + | (ER) | |||
| 264198.Reut_B4573 | + | (ER) | |||
| 264198.Reut_B5483 | + | (mitochondrial) | |||
| 264198.Reut_A0806 | + | (PF01614) (PF09339) | |||
| 264198.Reut_B3889 | (PF01614) (PF09339) | (mitochondrial) | |||
| 264198.Reut_B3868 | (PF13607) (PF13380) (PF13549) | ||||
| 264198.Reut_B3866 | (PF01614) (PF09339) | (plastid) | |||
| 264198.Reut_A3321 | (PF13441) | ER | |||
| 264198.Reut_A0289 | + | (mitochondrial) | |||
| 264198.Reut_B5669 | + | ER; (ER) | |||
| 264198.Reut_A1800 | + | (mitochondrial) | |||
| 264198.Reut_B5376 | + | ER; (mitochondrial) | |||
| 264198.Reut_A2052 | + | ER | |||
| 264198.Reut_B3827 | (PF13607) (PF13380) (PF13549) | ||||
| 264198.Reut_A1235 | + | (mitochondrial) | |||
| 264198.Reut_A0792 | (>) | (ER) | |||
| 264198.Reut_A0794 | + | mitochondrial | |||
| 264198.Reut_A0796 | + | ER | |||
| 264198.Reut_B4419 | (>) | ER | |||
| 264198.Reut_A2954 | + | ER | |||
| 264198.Reut_A3335 | (PF13441) | ER | |||
| 264198.Reut_B3883 | (PF13607) (PF13380) (PF13549) | ||||
| 264198.Reut_A3379 | (PF14863) | ER | |||
| 264198.Reut_B3686 | + | (mitochondrial); plastid | |||
| 264198.Reut_A0108 | + | mitochondrial; (mitochondrial) | |||
| 264198.Reut_A2241 | + | ER; (ER) | |||
| 264198.Reut_B5211 | (PF00175) | ER | |||
| 264198.Reut_B5040 | + | ER | |||
| 264198.Reut_A3436 | + | mitochondrial | |||
| 264198.Reut_B3660 | + | (ER) | |||
| 264198.Reut_B5721 | (PF12769) | ER | |||
| 264198.Reut_B5722 | (PF02233) | ER | |||
| 264198.Reut_B4552 | (PF02515) | (ER) | |||
| 264198.Reut_B4906 | (>) | ER | |||
| 264198.Reut_B5290 | (PF02233) | ER | |||
| 264198.Reut_B5291 | (PF12769) | ER | |||
| 264198.Reut_A2615 | + | ER | |||
| 264198.Reut_A2825 | (PF12769) | ER | |||
| 264198.Reut_A2826 | (PF02233) | ER | |||
| 264198.Reut_A3189 | (>) | (mitochondrial) | |||
| 264198.Reut_A1343 | + | ER | |||
| 264198.Reut_B3549 | + | (ER) | |||
| 264198.Reut_A3217 | + | ER; (ER) | |||
| 264198.Reut_B3560 | (PF02515) | (ER) | |||
| 264198.Reut_A0214 | (<) | ER | |||
| 264198.Reut_B3504 | + | ER | |||
| 264198.Reut_B4568 | + | ER | |||
| 264198.Reut_B5165 | (PF00175) | ER | |||
| 264198.Reut_B5161 | + | mitochondrial; (mitochondrial) | |||
| 264198.Reut_A1615 | + | ER | |||
| 264198.Reut_A0649 | + | ER; (ER) | |||
| 264198.Reut_B3702 | (PF13607) (PF13380) (PF13549) | ||||
| 264198.Reut_A1858 | + | + | (plastid) | ||
| 264198.Reut_B5822 | (PF01614) (PF09339) | (mitochondrial) | |||
| 264198.Reut_B3879 | (PF02515) | mitochondrial | |||
| 264198.Reut_B3872 | (PF01614) (PF09339) | (plastid) | |||
| 264198.Reut_A2293 | (>) | ER | |||
| 264198.Reut_A2078 | + | ER | |||
| 264198.Reut_B5572 | + | mitochondrial | |||
| 264198.Reut_B3850 | (PF07110) | (mitochondrial) | |||
| 264198.Reut_B5862 | (>) | (mitochondrial) | |||
| 264198.Reut_A0376 | (PF03945) | (mitochondrial); mitochondrial | |||
| 264198.Reut_A3090 | + | (mitochondrial) | |||
| 264198.Reut_B4464 | (PF09339) | ER; (ER) | |||
| 264198.Reut_A0438 | + | ER | |||
| 264198.Reut_A2144 | + | (mitochondrial); (plastid) | |||
| 264198.Reut_B4666 | (PF02233) | ER | |||
| 264198.Reut_B4667 | (PF12769) (PF01262) (PF05222) | ||||
| 264198.Reut_B5203 | (+) | (PF13607) (PF13380) (PF13549) | |||
| 264198.Reut_A2949 | (>) | ER | |||
| 264198.Reut_A3307 | (>) | ER | |||
| 264198.Reut_B5757 | + | (mitochondrial) | |||
| 264198.Reut_A0916 | (>) | ER | |||
| 264198.Reut_B5011 | + | ER; (ER) | |||
| 264198.Reut_B4993 | + | (ER) | |||
| 264198.Reut_A1606 | + | mitochondrial; (mitochondrial) | |||
| 264198.Reut_A0498 | (>) | ER | |||
| 264198.Reut_B3471 | + | + | |||
| 264198.Reut_A0700 | + | (plastid) | |||
| 264198.Reut_B4959 | + | (PF00285) | |||
| 264198.Reut_A1131 | + | (mitochondrial) | |||
| 264198.Reut_B4036 | (+) | ER | |||
| 264198.Reut_B5074 | + | (mitochondrial) | |||
| 264198.Reut_A3075 | (<) | (PF00111) | |||
| 264198.Reut_A3079 | (+) | mitochondrial; plastid | |||
| 264198.Reut_B4057 | (+) | mitochondrial; (mitochondrial) | |||
| 264198.Reut_B5090 | + | (plastid) | |||
| 264198.Reut_A1684 | (+) | mitochondrial | |||
| 264198.Reut_A0551 | + | (mitochondrial); (plastid) | |||
| 264198.Reut_B5136 | (+) | (mitochondrial) | |||
| 264198.Reut_B3662 | (+) | (PF01614) (PF09339) | |||
| 264198.Reut_A1546 | (PF00175) (PF00111) | ||||
| 264198.Reut_B3579 | (PF00175) (PF00111) | ||||
| 264198.Reut_A0763 | + | (mitochondrial) | |||
| 264198.Reut_B5309 | + | (mitochondrial) | |||
| 264198.Reut_A3448 | + | plastid | |||
| 264198.Reut_B4797 | (PF00175) (PF00111) | ||||
| 264198.Reut_A3200 | (+) | (mitochondrial); plastid | |||
| 264198.Reut_A1656 | + | (plastid) | |||
| 264198.Reut_A2552 | + | (ER) | |||
| 264198.Reut_B5320 | + | (PF03169) | |||
| 264198.Reut_A3223 | (>) | (ER) | |||
| 264198.Reut_B4517 | (PF01614) (PF09339) | ||||
| 264198.Reut_B3759 | + | (PF00111) | |||
| 264198.Reut_B3754 | (PF01614) (PF09339) | ||||
| 264198.Reut_B4164 | + | (mitochondrial) | |||
| 264198.Reut_A1194 | + | (PF00285) | |||
| 264198.Reut_B3739 | (PF00175) (PF00111) | ||||
| 264198.Reut_A1296 | (+) | (mitochondrial); (plastid) | |||
| 264198.Reut_A2722 | (PF00175) (PF00111) | ||||
| 264198.Reut_B5605 | (+) | (mitochondrial); plastid | |||
| 264198.Reut_B5830 | (PF00175) (PF00111) | ||||
| 264198.Reut_A1489 | (PF02233) | (mitochondrial) | |||
| 264198.Reut_A3396 | + | + | |||
| 264198.Reut_B3841 | (+) | mitochondrial | |||
| 264198.Reut_B3598 | (PF01614) (PF09339) | ||||
| 264198.Reut_A1035 | + | (plastid) | |||
| 264198.Reut_B4459 | (>) | (PF07287) | |||
| 264198.Reut_B5856 | + | (plastid) | |||
| 264198.Reut_A0611 | (+) | mitochondrial | |||
| 264198.Reut_B5276 | (PF01614) (PF09339) | ||||
| 264198.Reut_B5278 | (+) | (PF00175) (PF00111) | |||
| 264198.Reut_A1042 | (+) | ER | |||
| 264198.Reut_B4595 | (PF01614) (PF09339) | ||||
| 264198.Reut_B3927 | + | (ER) | |||
| 264198.Reut_B3826 | (PF14863) | (mitochondrial) | |||
| 264198.Reut_A1239 | (PF01614) (PF09339) | ||||
| 264198.Reut_B5878 | (PF01262) (PF05222) | ||||
| 264198.Reut_A2938 | + | (mitochondrial) | |||
| 264198.Reut_A1827 | (PF02515) | (mitochondrial) | |||
| 264198.Reut_B3947 | (+) | mitochondrial | |||
| 264198.Reut_B4961 | (PF01614) (PF09339) | ||||
| 264198.Reut_A2955 | (>) | (mitochondrial) | |||
| 264198.Reut_A3337 | (+) | ER; (ER) | |||
| 264198.Reut_B5685 | (PF00175) (PF00111) | ||||
| 264198.Reut_B3880 | (+) | (PF01614) (PF09339) | |||
| 264198.Reut_B4653 | (>) | (ER) | |||
| 264198.Reut_A1704 | (PF00175) (PF00111) | ||||
| 264198.Reut_B4814 | (PF00175) (PF00111) | ||||
| 264198.Reut_B5810 | (PF01614) (PF09339) | ||||
| 264198.Reut_B5761 | (PF00175) (PF00111) | ||||
| 264198.Reut_B4968 | (+) | (mitochondrial); plastid | |||
| 264198.Reut_B5563 | (+) | ER | |||
| 264198.Reut_B4391 | + | ||||
| 264198.Reut_B3890 | + | (plastid) | |||
| 264198.Reut_B5741 | + | (mitochondrial) | |||
| 264198.Reut_B4499 | (PF09825) | (mitochondrial) | |||
| 264198.Reut_B5545 | (PF01614) (PF09339) | ||||
| 264198.Reut_B4235 | (+) | ER | |||
| 264198.Reut_B5720 | (PF01262) (PF05222) | ||||
| 264198.Reut_A2672 | (+) | (ER) | |||
| 264198.Reut_B3600 | (PF01614) (PF09339) | ||||
| 264198.Reut_B4216 | (PF01614) (PF09339) | ||||
| 264198.Reut_B4215 | (PF01614) (PF09339) | ||||
| 264198.Reut_B5292 | (PF01262) (PF05222) | ||||
| 264198.Reut_A1692 | + | (plastid) | |||
| 264198.Reut_A2823 | (PF01262) (PF05222) | ||||
| 264198.Reut_A2202 | + | (mitochondrial) | |||
| 264198.Reut_B5089 | + | plastid | |||
| 264198.Reut_A1930 | + | (mitochondrial) | |||
| 264198.Reut_B3626 | (+) | mitochondrial; (mitochondrial) | |||
| 264198.Reut_A1340 | + | (mitochondrial) | |||
| 264198.Reut_A1168 | (PF01262) (PF05222) | ||||
| 264198.Reut_A1699 | + | (plastid) | |||
| 264198.Reut_B3546 | (PF02515) | (ER) | |||
| 264198.Reut_B4049 | + | + | |||
| 264198.Reut_A0779 | (+) | ER | |||
| 264198.Reut_A0773 | + | plastid | |||
| 264198.Reut_A0774 | + | (mitochondrial) | |||
| 264198.Reut_B5311 | (PF01614) (PF09339) | ||||
| 264198.Reut_A2890 | + | (plastid) | |||
| 264198.Reut_A3210 | (PF00175) (PF00111) | ||||
| 264198.Reut_A0097 | + | (>) | |||
| 264198.Reut_A3219 | (PF00175) | (mitochondrial) | |||
| 264198.Reut_A2309 | (+) | (ER) | |||
| 264198.Reut_A1309 | (PF01614) (PF09339) | ||||
| 264198.Reut_A2543 | + | (plastid) | |||
| 264198.Reut_B3765 | (PF00175) (PF00111) | ||||
| 264198.Reut_B3507 | (<) | (mitochondrial) | |||
| 264198.Reut_B3524 | (+) | (ER) | |||
| 264198.Reut_A2733 | (+) | (mitochondrial); (plastid) | |||
| 264198.Reut_B5630 | (+) | (mitochondrial) | |||
| 264198.Reut_B3898 | (PF06742) (PF06863) | ||||
| 264198.Reut_A2710 | (+) | (ER); ER | |||
| 264198.Reut_A1499 | + | (plastid) | |||
| 264198.Reut_A0010 | + | (>) | |||
| 264198.Reut_B4832 | + | plastid | |||
| 264198.Reut_A1877 | + | (plastid) | |||
| 264198.Reut_A0834 | (+) | (PF02515) | (ER) | ||
| 264198.Reut_B4625 | + | (PF07287) | |||
| 264198.Reut_A0298 | (>) | (ER) | |||
| 264198.Reut_B5450 | (+) | ER | |||
| 264198.Reut_B5674 | (PF00175) (PF00111) | ||||
| 264198.Reut_B5181 | (PF14588) | (ER) | |||
| 264198.Reut_A0377 | (+) | (ER) | |||
| 264198.Reut_B5398 | (>) | (PF07287) | |||
| 264198.Reut_A1764 | + | (PF00175) | |||
| 264198.Reut_A1595 | (+) | (PF01614) (PF09339) | |||
| 264198.Reut_B4463 | + | + | |||
| 264198.Reut_A0172 | + | (plastid) | |||
| 264198.Reut_B4405 | (PF00175) (PF00111) | ||||
| 264198.Reut_A2944 | (+) | (mitochondrial) | |||
| 264198.Reut_A1416 | + | (mitochondrial) | |||
| 264198.Reut_B4341 | (PF00175) (PF00111) | ||||
| 264198.Reut_A1670 | (PF01614) (PF09339) | ||||
| 264198.Reut_B5777 | (PF00175) (PF00111) | ||||
| 264198.Reut_A3173 | (+) | mitochondrial; (mitochondrial) | |||
| 264198.Reut_B4365 | + | (ER) | |||
| 264198.Reut_A1983 | + | (plastid) | |||
| 264198.Reut_A0113 | (PF01614) (PF09339) | ||||
| 264198.Reut_B3704 | (+) | (PF06742) (PF06863) | |||
| 264198.Reut_A3347 | (<) | + | |||
| 264198.Reut_A0491 | + | (mitochondrial) | |||
| 264198.Reut_B5034 | (PF01614) (PF09339) | ||||
| 264198.Reut_A0429 | + | (plastid) | |||
| 264198.Reut_A1665 | + | ||||
| 264198.Reut_B3477 | (PF14588) | ||||
| 264198.Reut_A3284 | (>) | ||||
| 264198.Reut_A3283 | (>) | ||||
| 264198.Reut_A0536 | + | ||||
| 264198.Reut_A0539 | + | ||||
| 264198.Reut_B5732 | + | ||||
| 264198.Reut_B5731 | + | ||||
| 264198.Reut_A2662 | (PF00111) | ||||
| 264198.Reut_A2668 | + | ||||
| 264198.Reut_A2255 | (>) | ||||
| 264198.Reut_B4605 | + | ||||
| 264198.Reut_A2877 | (<) | ||||
| 264198.Reut_A0709 | + | ||||
| 264198.Reut_B5556 | + | ||||
| 264198.Reut_A3420 | + | ||||
| 264198.Reut_A1396 | + | ||||
| 264198.Reut_B4485 | + | ||||
| 264198.Reut_B4488 | + | ||||
| 264198.Reut_B4227 | (+) | plastid | |||
| 264198.Reut_A0512 | + | ||||
| 264198.Reut_B5281 | (>) | ||||
| 264198.Reut_A2607 | (+) | (plastid) | |||
| 264198.Reut_A2855 | + | ||||
| 264198.Reut_A2857 | + | ||||
| 264198.Reut_B4037 | + | ||||
| 264198.Reut_B4033 | + | ||||
| 264198.Reut_A2476 | + | ||||
| 264198.Reut_A2475 | (+) | + | |||
| 264198.Reut_A2473 | (+) | (ER) | |||
| 264198.Reut_A2479 | (+) | (plastid) | |||
| 264198.Reut_B5075 | + | ||||
| 264198.Reut_B5071 | + | ||||
| 264198.Reut_A3078 | (+) | (ER) | |||
| 264198.Reut_A1924 | + | ||||
| 264198.Reut_B4939 | (<) | ||||
| 264198.Reut_B4201 | + | ||||
| 264198.Reut_A0574 | (>) | ||||
| 264198.Reut_A0572 | + | ||||
| 264198.Reut_B5470 | + | ||||
| 264198.Reut_A1760 | (PF00285) | ||||
| 264198.Reut_A2625 | + | ||||
| 264198.Reut_A2831 | (>) | ||||
| 264198.Reut_A1830 | (PF02515) | ||||
| 264198.Reut_B4050 | + | ||||
| 264198.Reut_A3055 | + | ||||
| 264198.Reut_A1905 | + | ||||
| 264198.Reut_A1904 | + | ||||
| 264198.Reut_B4914 | + | ||||
| 264198.Reut_B4917 | + | ||||
| 264198.Reut_A1359 | + | ||||
| 264198.Reut_A1355 | + | ||||
| 264198.Reut_A1175 | + | ||||
| 264198.Reut_B5791 | + | ||||
| 264198.Reut_A0556 | + | ||||
| 264198.Reut_A0559 | (>) | ||||
| 264198.Reut_B5138 | (<) | ||||
| 264198.Reut_A0593 | + | ||||
| 264198.Reut_A2819 | + | ||||
| 264198.Reut_A1542 | + | ||||
| 264198.Reut_B4073 | + | ||||
| 264198.Reut_B4072 | + | ||||
| 264198.Reut_B5306 | (PF02515) | ||||
| 264198.Reut_B5304 | + | ||||
| 264198.Reut_A3030 | + | ||||
| 264198.Reut_A1963 | (PF03737) | ||||
| 264198.Reut_A2317 | (+) | (mitochondrial) | |||
| 264198.Reut_A1370 | + | ||||
| 264198.Reut_A1371 | (+) | (mitochondrial) | |||
| 264198.Reut_B5542 | (+) | (PF03169) | |||
| 264198.Reut_B4536 | + | ||||
| 264198.Reut_B4534 | + | ||||
| 264198.Reut_B4249 | + | ||||
| 264198.Reut_A2558 | + | ||||
| 264198.Reut_A0202 | + | ||||
| 264198.Reut_B5112 | (PF00111) | ||||
| 264198.Reut_B5118 | + | ||||
| 264198.Reut_A0841 | + | ||||
| 264198.Reut_B3773 | + | ||||
| 264198.Reut_B3774 | + | ||||
| 264198.Reut_A1521 | + | ||||
| 264198.Reut_A3016 | + | ||||
| 264198.Reut_A3015 | + | ||||
| 264198.Reut_A2769 | + | ||||
| 264198.Reut_A2375 | + | ||||
| 264198.Reut_A2370 | + | ||||
| 264198.Reut_B4518 | (PF02515) | ||||
| 264198.Reut_A0048 | + | ||||
| 264198.Reut_A0040 | + | ||||
| 264198.Reut_A1829 | (PF02515) | ||||
| 264198.Reut_B3757 | (+) | (PF00111) | |||
| 264198.Reut_B3752 | + | ||||
| 264198.Reut_B3536 | + | ||||
| 264198.Reut_B3538 | + | ||||
| 264198.Reut_A1501 | + | ||||
| 264198.Reut_A1058 | (+) | (>) | |||
| 264198.Reut_B4162 | (PF02515) | ||||
| 264198.Reut_B4166 | (>) | ||||
| 264198.Reut_B5343 | (<) | ||||
| 264198.Reut_B5349 | + | ||||
| 264198.Reut_A2746 | + | ||||
| 264198.Reut_A2350 | (+) | (mitochondrial) | |||
| 264198.Reut_B4564 | (PF02515) | ||||
| 264198.Reut_A1339 | + | ||||
| 264198.Reut_A1334 | + | ||||
| 264198.Reut_A1199 | + | ||||
| 264198.Reut_B4759 | + | ||||
| 264198.Reut_B4751 | + | ||||
| 264198.Reut_B4576 | + | ||||
| 264198.Reut_B4575 | + | ||||
| 264198.Reut_A0068 | + | ||||
| 264198.Reut_B5487 | + | ||||
| 264198.Reut_A2516 | (+) | (PF00111) | |||
| 264198.Reut_B4281 | + | ||||
| 264198.Reut_A0246 | + | ||||
| 264198.Reut_B5623 | + | ||||
| 264198.Reut_B5627 | + | ||||
| 264198.Reut_B5628 | + | ||||
| 264198.Reut_A0809 | + | ||||
| 264198.Reut_B4956 | + | ||||
| 264198.Reut_A1297 | (>) | ||||
| 264198.Reut_B5364 | + | ||||
| 264198.Reut_A0009 | + | ||||
| 264198.Reut_A1845 | + | ||||
| 264198.Reut_A2093 | + | ||||
| 264198.Reut_B3719 | + | ||||
| 264198.Reut_B3867 | (PF00285) | ||||
| 264198.Reut_A1016 | + | ||||
| 264198.Reut_A1013 | + | ||||
| 264198.Reut_B4121 | + | ||||
| 264198.Reut_A0636 | (+) | (plastid) | |||
| 264198.Reut_B5831 | + | ||||
| 264198.Reut_B4714 | + | ||||
| 264198.Reut_A0023 | + | ||||
| 264198.Reut_A3390 | + | ||||
| 264198.Reut_A1864 | + | ||||
| 264198.Reut_A1865 | + | ||||
| 264198.Reut_A1866 | (>) | ||||
| 264198.Reut_A2118 | + | ||||
| 264198.Reut_B3596 | (PF00111) | ||||
| 264198.Reut_B3592 | + | ||||
| 264198.Reut_A1030 | + | ||||
| 264198.Reut_A3094 | + | ||||
| 264198.Reut_B5855 | (+) | (PF04444) | |||
| 264198.Reut_A0348 | + | ||||
| 264198.Reut_B5275 | + | ||||
| 264198.Reut_A2910 | + | ||||
| 264198.Reut_A1809 | (PF00285) | ||||
| 264198.Reut_B5641 | + | ||||
| 264198.Reut_A2136 | + | ||||
| 264198.Reut_A2135 | + | ||||
| 264198.Reut_A2132 | + | ||||
| 264198.Reut_A2053 | + | ||||
| 264198.Reut_A2059 | + | ||||
| 264198.Reut_B3928 | + | ||||
| 264198.Reut_B3924 | + | ||||
| 264198.Reut_B3824 | (PF02515) | ||||
| 264198.Reut_B3822 | (<) | ||||
| 264198.Reut_A1231 | (PF04970) | ||||
| 264198.Reut_B4697 | (PF00285) | ||||
| 264198.Reut_B4696 | + | ||||
| 264198.Reut_A1587 | (PF04444) | ||||
| 264198.Reut_B4474 | + | ||||
| 264198.Reut_B5872 | + | ||||
| 264198.Reut_A0368 | + | ||||
| 264198.Reut_A1103 | + | ||||
| 264198.Reut_A1109 | + | ||||
| 264198.Reut_B4866 | + | ||||
| 264198.Reut_B4867 | + | ||||
| 264198.Reut_B4861 | + | ||||
| 264198.Reut_B4863 | + | ||||
| 264198.Reut_A1770 | + | ||||
| 264198.Reut_A0425 | (PF00111) | ||||
| 264198.Reut_A0422 | + | ||||
| 264198.Reut_A1820 | (PF02515) | ||||
| 264198.Reut_A2156 | (PF01176) | ||||
| 264198.Reut_A2032 | + | ||||
| 264198.Reut_A0880 | + | ||||
| 264198.Reut_A0889 | + | ||||
| 264198.Reut_A0888 | + | ||||
| 264198.Reut_B3942 | + | ||||
| 264198.Reut_B3805 | + | ||||
| 264198.Reut_A1219 | + | ||||
| 264198.Reut_B4670 | + | ||||
| 264198.Reut_A0168 | (+) | + | |||
| 264198.Reut_B5238 | + | ||||
| 264198.Reut_A3145 | + | ||||
| 264198.Reut_A0943 | (+) | plastid | |||
| 264198.Reut_B4889 | + | ||||
| 264198.Reut_B4885 | + | ||||
| 264198.Reut_B4336 | (+) | (mitochondrial) | |||
| 264198.Reut_A0448 | + | ||||
| 264198.Reut_B5686 | (PF00111) | ||||
| 264198.Reut_A1091 | + | ||||
| 264198.Reut_B3689 | + | ||||
| 264198.Reut_B3685 | + | ||||
| 264198.Reut_B3682 | + | ||||
| 264198.Reut_A0145 | + | ||||
| 264198.Reut_A1635 | + | ||||
| 264198.Reut_B5747 | + | ||||
| 264198.Reut_A1404 | + | ||||
| 264198.Reut_A1705 | (PF04444) | ||||
| 264198.Reut_A3313 | + | ||||
| 264198.Reut_A3315 | + | ||||
| 264198.Reut_A2018 | + | ||||
| 264198.Reut_A0467 | (>) | ||||
| 264198.Reut_B5000 | + | ||||
| 264198.Reut_B5003 | (<) | ||||
| 264198.Reut_A2194 | + | ||||
| 264198.Reut_B3986 | (PF07958) | ||||
| 264198.Reut_B3985 | (+) | (PF12471) | |||
| 264198.Reut_B3617 | + | ||||
| 264198.Reut_B5144 | + | ||||
| 264198.Reut_B5143 | + | ||||
| 264198.Reut_A1619 | + | ||||
| 264198.Reut_B4182 | + | ||||
| 264198.Reut_A0699 | + | ||||
| 264198.Reut_A0907 | + | ||||
| 264198.Reut_B4617 | (PF09339) | ||||
| 264198.Reut_B4616 | (PF03737) | ||||
| 264198.Reut_A2226 | + | ||||
| 264198.Reut_A2221 | + | ||||
| 264198.Reut_A1652 | (+) | (mitochondrial) | |||
| 264198.Reut_A3376 | + | ||||
| 264198.Reut_B4374 | (PF08857) | ||||
| 264198.Reut_B4378 | (PF08857) | ||||
| 264198.Reut_B4379 | + | ||||
| 264198.Reut_A2422 | (+) | (PF04970) | |||
| 264198.Reut_A2425 | (PF00111) | ||||
| 264198.Reut_B5704 | + | ||||
| 264198.Reut_A3126 | + | ||||
| 264198.Reut_B4987 | + | ||||
| 264198.Reut_B4118 | + | ||||
| 264198.Reut_B3715 | + | ||||
| 264198.Reut_A2867 | + | ||||
| 264198.Reut_A1441 | + | ||||
| 264198.Reut_A1448 | + | ||||
| 264198.Reut_B4398 | + | ||||
| 264198.Reut_B4395 | + | ||||
| 264198.Reut_A2400 | + | ||||
| 264198.Reut_B3725 | + | ||||
| 264198.Reut_B5742 | (PF01176) | ||||
| 264198.Reut_A2388 | + | ||||
| 264198.Reut_A1381 | + | ||||
| 264198.Reut_B4490 | + | ||||
| 264198.Reut_B4237 | + | ||||
| 264198.Reut_A0522 | + | ||||
| 264198.Reut_A0523 | + | ||||
| 264198.Reut_A0520 | (PF02515) | ||||
| 264198.Reut_A2263 | (>) | ||||
| 264198.Reut_A2842 | + | ||||
| 264198.Reut_A1467 | + | ||||
| 264198.Reut_A0739 | + | ||||
| 264198.Reut_A0736 | + | ||||
| 264198.Reut_A3254 | + | ||||
| 264198.Reut_A1100 | + | ||||
| 264198.Reut_B4210 | + | ||||
| 264198.Reut_A2618 | + | ||||
| 264198.Reut_A0754 | + | ||||
| 264198.Reut_A2441 | + | ||||
| 264198.Reut_B5086 | + | ||||
| 264198.Reut_A3060 | + | ||||
| 264198.Reut_B3627 | + | ||||
| 264198.Reut_A1342 | (+) | (mitochondrial) | |||
| 264198.Reut_B3480 | + | ||||
| 264198.Reut_A3277 | + | ||||
| 264198.Reut_B5508 | (+) | (>) | |||
| 264198.Reut_A1160 | (+) | (mitochondrial) | |||
| 264198.Reut_B4274 | + | ||||
| 264198.Reut_B4272 | + | ||||
| 264198.Reut_A2584 | + | ||||
| 264198.Reut_A2585 | (PF13549) | ||||
| 264198.Reut_A2580 | + | ||||
| 264198.Reut_A2630 | + | ||||
| 264198.Reut_A0985 | + | ||||
| 264198.Reut_A1627 | + | ||||
| 264198.Reut_A1577 | + | ||||
| 264198.Reut_B3541 | (PF02515) | ||||
| 264198.Reut_B3545 | + | ||||
| 264198.Reut_A1916 | (PF02515) | ||||
| 264198.Reut_A2329 | (+) | (PF00285) | |||
| 264198.Reut_A2320 | (+) | (PF00285) | |||
| 264198.Reut_A2326 | (+) | (plastid) | |||
| 264198.Reut_B4785 | (PF02515) | ||||
| 264198.Reut_B4786 | + | ||||
| 264198.Reut_B4781 | (PF03737) | ||||
| 264198.Reut_B4783 | (PF03737) | ||||
| 264198.Reut_B4782 | (PF03737) | ||||
| 264198.Reut_A1149 | + | ||||
| 264198.Reut_B4528 | + | ||||
| 264198.Reut_A0546 | + | ||||
| 264198.Reut_A0547 | + | ||||
| 264198.Reut_A0238 | + | ||||
| 264198.Reut_B5125 | (PF14588) | ||||
| 264198.Reut_A1556 | (PF07110) | ||||
| 264198.Reut_B5339 | + | ||||
| 264198.Reut_A3025 | + | ||||
| 264198.Reut_A1977 | + | ||||
| 264198.Reut_A1970 | + | ||||
| 264198.Reut_B4918 | (+) | (mitochondrial) | |||
| 264198.Reut_B3636 | + | ||||
| 264198.Reut_A2771 | + | ||||
| 264198.Reut_A3237 | + | ||||
| 264198.Reut_A3234 | + | ||||
| 264198.Reut_B4505 | (PF00111) | ||||
| 264198.Reut_B4047 | (+) | (mitochondrial) | |||
| 264198.Reut_B4042 | + | ||||
| 264198.Reut_B3766 | + | ||||
| 264198.Reut_A1532 | (PF06742) | ||||
| 264198.Reut_B5351 | + | ||||
| 264198.Reut_A1950 | + | ||||
| 264198.Reut_A2755 | + | ||||
| 264198.Reut_A0225 | + | ||||
| 264198.Reut_A1323 | (PF00175) | ||||
| 264198.Reut_A1322 | + | ||||
| 264198.Reut_A1327 | + | ||||
| 264198.Reut_B4740 | + | ||||
| 264198.Reut_A1185 | + | ||||
| 264198.Reut_A0053 | + | ||||
| 264198.Reut_A0056 | + | ||||
| 264198.Reut_A0054 | + | ||||
| 264198.Reut_A0274 | + | ||||
| 264198.Reut_A0273 | + | ||||
| 264198.Reut_A0871 | (+) | (mitochondrial) | |||
| 264198.Reut_A0872 | (>) | ||||
| 264198.Reut_A1513 | + | ||||
| 264198.Reut_A1048 | (>) | ||||
| 264198.Reut_A1049 | (+) | (mitochondrial) | |||
| 264198.Reut_A0645 | + | ||||
| 264198.Reut_A0643 | + | ||||
| 264198.Reut_B3706 | (PF14863) | ||||
| 264198.Reut_B5377 | (>) | ||||
| 264198.Reut_B5807 | + | ||||
| 264198.Reut_B3701 | (PF09339) | ||||
| 264198.Reut_A2213 | + | ||||
| 264198.Reut_A2737 | + | ||||
| 264198.Reut_A2348 | (PF14588) | ||||
| 264198.Reut_B5491 | + | ||||
| 264198.Reut_A2508 | (+) | + | |||
| 264198.Reut_B4548 | + | ||||
| 264198.Reut_B5632 | (+) | (ER) | |||
| 264198.Reut_B5636 | (PF01175) | ||||
| 264198.Reut_B5634 | + | ||||
| 264198.Reut_B5635 | + | ||||
| 264198.Reut_A1739 | + | ||||
| 264198.Reut_A2080 | + | ||||
| 264198.Reut_B3893 | (PF02515) | ||||
| 264198.Reut_A1064 | (PF00111) | ||||
| 264198.Reut_B4151 | (PF02515) | ||||
| 264198.Reut_B4153 | + | ||||
| 264198.Reut_A0625 | (+) | (plastid) | |||
| 264198.Reut_A0627 | + | ||||
| 264198.Reut_A2717 | + | ||||
| 264198.Reut_A2716 | + | ||||
| 264198.Reut_A2715 | (PF01175) | ||||
| 264198.Reut_A2718 | + | ||||
| 264198.Reut_B5661 | + | ||||
| 264198.Reut_A0356 | + | ||||
| 264198.Reut_B3792 | (+) | (PF00111) | |||
| 264198.Reut_B4700 | (<) | ||||
| 264198.Reut_A0017 | + | ||||
| 264198.Reut_A1724 | + | ||||
| 264198.Reut_A3387 | + | ||||
| 264198.Reut_A3382 | + | ||||
| 264198.Reut_A1871 | (>) | ||||
| 264198.Reut_B3575 | + | ||||
| 264198.Reut_A2066 | + | ||||
| 264198.Reut_B3707 | (PF02515) | ||||
| 264198.Reut_B3876 | (PF02515) | ||||
| 264198.Reut_B3874 | (PF02515) | ||||
| 264198.Reut_B4521 | + | ||||
| 264198.Reut_B4137 | (PF04444) | ||||
| 264198.Reut_A0600 | + | ||||
| 264198.Reut_B5261 | + | ||||
| 264198.Reut_B5266 | + | ||||
| 264198.Reut_B5268 | + | ||||
| 264198.Reut_A0543 | + | ||||
| 264198.Reut_A2292 | + | ||||
| 264198.Reut_A2296 | + | ||||
| 264198.Reut_A0038 | + | ||||
| 264198.Reut_A1741 | + | ||||
| 264198.Reut_A1743 | (PF00111) | ||||
| 264198.Reut_A1819 | (PF04970) | ||||
| 264198.Reut_B5188 | (PF01176) | ||||
| 264198.Reut_B5571 | + | ||||
| 264198.Reut_A2966 | (PF03169) | ||||
| 264198.Reut_A2108 | (PF02515) | ||||
| 264198.Reut_B3936 | + | ||||
| 264198.Reut_B3933 | + | ||||
| 264198.Reut_B3588 | (>) | ||||
| 264198.Reut_B3589 | (+) | + | |||
| 264198.Reut_A1242 | + | ||||
| 264198.Reut_A1026 | + | ||||
| 264198.Reut_A1023 | + | ||||
| 264198.Reut_A1029 | + | ||||
| 264198.Reut_A3087 | (PF02515) | ||||
| 264198.Reut_A0195 | + | ||||
| 264198.Reut_B5863 | + | ||||
| 264198.Reut_A0373 | + | ||||
| 264198.Reut_B5243 | (PF02515) | ||||
| 264198.Reut_A2908 | (PF02515) | ||||
| 264198.Reut_A2901 | + | ||||
| 264198.Reut_B4303 | (+) | (plastid) | |||
| 264198.Reut_B4309 | (>) | ||||
| 264198.Reut_A0415 | + | ||||
| 264198.Reut_B4977 | (>) | ||||
| 264198.Reut_A2127 | + | ||||
| 264198.Reut_A2024 | + | ||||
| 264198.Reut_A2023 | + | ||||
| 264198.Reut_B3957 | + | ||||
| 264198.Reut_B3950 | + | ||||
| 264198.Reut_B3834 | (>) | ||||
| 264198.Reut_A3092 | + | ||||
| 264198.Reut_A1222 | (>) | ||||
| 264198.Reut_B4682 | + | ||||
| 264198.Reut_B4469 | + | ||||
| 264198.Reut_B4467 | + | ||||
| 264198.Reut_A0173 | (+) | (plastid) | |||
| 264198.Reut_A0318 | + | ||||
| 264198.Reut_A0316 | (>) | ||||
| 264198.Reut_B5229 | + | ||||
| 264198.Reut_B5224 | + | ||||
| 264198.Reut_B5227 | + | not used | |||
| 264198.Reut_A2642 | + | ||||
| 264198.Reut_A0951 | (>) | ||||
| 264198.Reut_A2928 | + | ||||
| 264198.Reut_B4898 | (>) | ||||
| 264198.Reut_B4892 | + | ||||
| 264198.Reut_B5416 | (+) | (ER) | |||
| 264198.Reut_B4329 | + | ||||
| 264198.Reut_A2497 | + | ||||
| 264198.Reut_A2009 | (+) | (mitochondrial); not used | |||
| 264198.Reut_A0896 | (PF01175) | ||||
| 264198.Reut_A0895 | + | ||||
| 264198.Reut_A1200 | (+) | plastid | |||
| 264198.Reut_A1201 | + | ||||
| 264198.Reut_B4669 | (PF02515) | ||||
| 264198.Reut_B4663 | (PF02515) | ||||
| 264198.Reut_B4402 | (PF04444) | ||||
| 264198.Reut_A0154 | + | ||||
| 264198.Reut_A0150 | + | ||||
| 264198.Reut_A0337 | + | ||||
| 264198.Reut_B5202 | + | ||||
| 264198.Reut_A2798 | (<) | ||||
| 264198.Reut_A2431 | + | ||||
| 264198.Reut_B4453 | (+) | (ER) | |||
| 264198.Reut_A0939 | + | ||||
| 264198.Reut_A0934 | + | ||||
| 264198.Reut_A2941 | + | ||||
| 264198.Reut_A3309 | (+) | (<) | |||
| 264198.Reut_A3306 | (+) | (plastid) | |||
| 264198.Reut_B5439 | (PF02515) | ||||
| 264198.Reut_B5437 | + | ||||
| 264198.Reut_A0456 | + | ||||
| 264198.Reut_B5694 | (PF07110) | ||||
| 264198.Reut_B4064 | + | ||||
| 264198.Reut_A2165 | + | ||||
| 264198.Reut_B4066 | + | ||||
| 264198.Reut_A1673 | (PF02515) | ||||
| 264198.Reut_B3695 | + | ||||
| 264198.Reut_A0133 | + | ||||
| 264198.Reut_B4420 | (PF02515) | ||||
| 264198.Reut_B5774 | (PF03737) | ||||
| 264198.Reut_B5773 | (PF03737) | ||||
| 264198.Reut_B5772 | (PF03737) | ||||
| 264198.Reut_A2430 | + | ||||
| 264198.Reut_A0911 | + | ||||
| 264198.Reut_A0917 | + | ||||
| 264198.Reut_A0919 | + | ||||
| 264198.Reut_A1754 | + | ||||
| 264198.Reut_A1604 | + | ||||
| 264198.Reut_B4199 | + | ||||
| 264198.Reut_B5717 | + | ||||
| 264198.Reut_A2239 | (>) | ||||
| 264198.Reut_A3344 | (PF13380) | ||||
| 264198.Reut_B4388 | (>) | ||||
| 264198.Reut_A2432 | + | ||||
| 264198.Reut_A2436 | + | ||||
| 264198.Reut_A0531 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A2251 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A2873 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A1470 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A0703 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A0704 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A3424 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A1391 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B3676 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B4482 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B4483 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A0516 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A2278 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A2274 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A2270 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A2859 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B5079 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A3071 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A3072 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A3240 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B5517 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B4209 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B5477 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A2623 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A2834 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A2458 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B5096 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B5094 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A2331 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A0086 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A0081 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A0082 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A1687 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A3194 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A0552 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A0227 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A0558 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B3661 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A2815 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B3798 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A1540 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B3572 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B4070 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A0764 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B5300 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B3833 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A3039 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A3033 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A1374 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A3206 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A3205 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A3208 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B4537 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A1525 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B5321 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A1948 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A2765 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A2373 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A3226 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A3227 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A2575 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A1889 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B3753 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B3751 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B4169 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A0672 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A0670 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A2359 | + | ||||
| 264198.Reut_A1333 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A0069 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A0064 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A2514 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A2513 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B4282 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B4953 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A0801 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A0800 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A1077 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A1071 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A0656 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A1642 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A1649 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B4778 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A0003 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B4807 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B4809 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B4558 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B5607 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B5601 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A1847 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A1844 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A0820 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A2095 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A2097 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A2091 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B3869 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A1014 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A1012 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B4129 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B5835 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B5836 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B5838 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A2702 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A1487 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B4719 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B5196 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A3393 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B3903 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A2072 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B3848 | + | ||||
| 264198.Reut_B3594 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B3599 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B5853 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A1040 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A1045 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A2919 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B4848 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B4849 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B5645 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B5649 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B5801 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B5800 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A2054 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B3820 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A1238 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A1586 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A1585 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B4470 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B5871 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A1101 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A2930 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A0420 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A2482 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A2158 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A2037 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A0883 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A1211 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B4674 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A0162 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A0167 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A0307 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A2950 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B4883 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B4886 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A3338 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B3886 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B3966 | (+) | ||||
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| 264198.Reut_B4658 | (+) | ||||
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| 264198.Reut_A0325 | (+) | ||||
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| 264198.Reut_A3165 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A0929 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A0925 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A0460 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B5001 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B5009 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B5585 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B4187 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B4184 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A0695 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B5762 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A3102 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B4612 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A0909 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B5374 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B4376 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A2429 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B5021 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B4618 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B3647 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B5568 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B5709 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B5700 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A3296 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A3127 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A2244 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B4393 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A0716 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B5044 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B5215 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A2884 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B5212 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A3438 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A1389 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A1385 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A1386 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A0381 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A0521 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A0525 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A0529 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A2679 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A2268 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A2847 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A2849 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A1710 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A1464 | (+) | ||||
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| 264198.Reut_B5069 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B3625 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B3601 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B3608 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A3258 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B4219 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B5293 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A0758 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A0563 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A1938 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A1345 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A1344 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A1163 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A3187 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A0565 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A0988 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B3547 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A1913 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A1914 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A1366 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A1141 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B4258 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A0540 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B5122 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A2196 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B3786 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B3787 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B3569 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A2770 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B4506 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B5100 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A0084 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A1893 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A1892 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B4040 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A0851 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A0857 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A1539 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A2967 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B3509 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A3002 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A1957 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A2985 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A1321 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A1325 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A1188 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A1187 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B4985 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A0270 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A0587 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B5163 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A2692 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A2693 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A1047 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A2736 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A0071 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B5495 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B4542 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B4549 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A1733 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A1280 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B4157 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A0626 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B5829 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B5827 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B5825 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A1153 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A1984 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A1493 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A1494 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A0012 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A0013 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A0018 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A1726 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B4831 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A2065 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B3873 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B4526 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A1009 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A1004 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B4622 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B4723 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B4727 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B5676 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A2079 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B3934 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B3932 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B3931 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A2043 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A1028 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B5860 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B5864 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B5399 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B4972 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B4300 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A1835 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B5657 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B4976 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A2022 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B4456 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A1597 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A0315 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B5220 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A0347 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A2926 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A3322 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B5411 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A0439 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B4060 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A0898 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B4533 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A1208 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A0159 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A0157 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A0155 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A0331 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A0335 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A3152 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B4455 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A2940 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A1419 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A0452 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B5690 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A2048 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B3996 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B4642 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B5594 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A0910 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A2211 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A1436 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A3366 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A0476 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A2182 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A1987 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A1758 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A0110 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A0115 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B4197 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B4190 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B5716 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A0405 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A1455 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A1456 | (+) | ||||
| 264198.Reut_A0495 | (+) | ||||
| 264198.Reut_B5036 | (+) |
Detailed merged results for each protein sequence
- Detailed merged results as table (merge_results.html)
- Detailed merged results as tab delimited file (merge_results.csv)
Individual results for each protein sequence
- EffectiveT3 predictions using new standard model 2.0.1 (PROTEINS.NEW.EFFECTIVET3)
- EffectiveT3 predictions using old standard model 1.0.1 (PROTEINS.OLD.EFFECTIVET3)
- EffectiveCCBD predictions (PROTEINS.CHAPERONES.TXT)
- T4SEpre bpbAac predictions (T4SEpre_bpbAac_FinalResult.csv)
- T4SEpre psAac predictions (T4SEpre_psAac_FinalResult.csv)
- EffectiveELD predictions (PROTEINS.ELD.TXT)
- Predotar predictions using animal/human model (Predotar_output_modelANIMAL.TXT)
- Predotar predictions using plant model (Predotar_output_modelPLANT.TXT)
Genome based results
Summary
- Gram negative: YES (FDR = 0.5 %)
- Functional Type III secretion system: YES (FDR = 12.5 %)
Estimated copy number = 0.4 (4/10 KEGG proteins)
- Functional Type IV secretion system: YES (FDR = 7.2 %)
Estimated copy number = 0.0 (0/10 KEGG proteins)
- Functional Type VI secretion system: YES (FDR = 7.7 %)
Estimated copy number = 2.0 (16/8 KEGG proteins)
Individual results for each secretion system
- List of 100 most important COGs/NOGs for prediction of functional Type III secretion system (T3_top100_COGS.xls)
- List of 100 most important COGs/NOGs for prediction of functional Type IV secretion system (T4_top100_COGS.xls)
- List of 100 most important COGs/NOGs for prediction of functional Type VI secretion system (T6_top100_COGS.xls)
- List of COGs assigned to Type III secretion system in KEGG (T3SS_KEGG_cmp.xls)
- List of COGs assigned to Type IV secretion system in KEGG (T4SS_KEGG_cmp.xls)
- List of COGs assigned to Type VI secretion system in KEGG (T6SS_KEGG_cmp.xls)
Parameters:
==========================================================
EFFECTIVE_T3_OLD=selective
EFFECTIVE_T3_NEW=selective
PREDOTAR_ANIMAL_OR_PLANT=a
PROTEINS=INPUT PROTEINS
MODUS=genome
RUN_PREDOTAR=T
RUN_EFFECTIVE_T3=T
RUN_T4SEpre=0.5
RUN_EFFECTIVE_CCBD=T
RUN_EFFECTIVE_ELD=4
CheckM_COMPLETENESS=
RUN_EffectiveS346=T
GENOTYPE=COG Profile
EMAIL=
==========================================================
Estimated copy number = 0.4 (4/10 KEGG proteins)
Estimated copy number = 0.0 (0/10 KEGG proteins)
Estimated copy number = 2.0 (16/8 KEGG proteins)
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