Metamenu

Effective results for Vibrio sp. EJY3 (eggnog40)

Summary

Number of putative secreted proteins: 721
- Predicted by EffectiveT3: 205 (high confidence), 345 (low confidence)
- Predicted by EffectiveCCBD: 34 within, 25 before, 70 behind expected region 25..70aa
- Predicted by T4SEpre: 0
- Predicted by EffectiveELD: 26 eukaryotic-like domains, contained in 66 proteins (0 high, 66 medium Z-score)
Predicted protein secretion systems (parentheses indicate weak positive predictions lacking more than 50% of core proteins of a secretion system): (Type III), Type VI

Protein based results

Putative secreted proteins (weak evidence indicated by parentheses)

ProteinEffectiveT3EffectiveCCBDT4SEpreEffectiveELDPredotar
1116375.VEJY3_08125++(mitochondrial); (plastid)
1116375.VEJY3_15485+(mitochondrial)
1116375.VEJY3_23861(>)(PF03222)ER; (ER)
1116375.VEJY3_24021+(PF02278) (PF08124)(mitochondrial)
1116375.VEJY3_05820(>)ER
1116375.VEJY3_13465+ER
1116375.VEJY3_17011(>)ER
1116375.VEJY3_04680+(mitochondrial)
1116375.VEJY3_24221(PF17186)ER
1116375.VEJY3_21841(>)ER
1116375.VEJY3_14165(>)(mitochondrial)
1116375.VEJY3_01795(>)mitochondrial
1116375.VEJY3_07415(>)ER
1116375.VEJY3_04990+(ER); (mitochondrial)
1116375.VEJY3_17961(PF03553)ER
1116375.VEJY3_18421+ER; (ER)
1116375.VEJY3_10485+ER
1116375.VEJY3_22066(PF03222)ER
1116375.VEJY3_02115(<)mitochondrial; (mitochondrial)
1116375.VEJY3_05465(>)ER
1116375.VEJY3_03225(>)ER
1116375.VEJY3_07955+ER
1116375.VEJY3_22721(>)ER
1116375.VEJY3_07620(PF08180)ER
1116375.VEJY3_08720(<)ER
1116375.VEJY3_06835(>)(mitochondrial); (ER)
1116375.VEJY3_05930(PF17186)ER
1116375.VEJY3_13405(PF00438) (PF02773) (PF02772)
1116375.VEJY3_12665+(ER)
1116375.VEJY3_19361+ER
1116375.VEJY3_11025(PF03553)ER
1116375.VEJY3_02010+ER
1116375.VEJY3_00870+(mitochondrial)
1116375.VEJY3_14055(<)ER
1116375.VEJY3_23736+(mitochondrial); mitochondrial
1116375.VEJY3_14615(>)(mitochondrial)
1116375.VEJY3_05540(PF03553)(ER)
1116375.VEJY3_05760(>)ER
1116375.VEJY3_09090(+)(PF00438) (PF02773) (PF02772)
1116375.VEJY3_11035+ER
1116375.VEJY3_13090(>)ER
1116375.VEJY3_16451(<)ER
1116375.VEJY3_19011(>)ER
1116375.VEJY3_19541(PF05548)ER
1116375.VEJY3_12605+ER
1116375.VEJY3_13955+ER
1116375.VEJY3_19941+ER
1116375.VEJY3_16381+ER
1116375.VEJY3_10970(PF03553)ER
1116375.VEJY3_05965(PF00465)(mitochondrial)
1116375.VEJY3_03955+ER
1116375.VEJY3_15255+ER
1116375.VEJY3_04635(>)ER
1116375.VEJY3_23546(PF06468)ER
1116375.VEJY3_11640+(mitochondrial); plastid
1116375.VEJY3_08925(PF00465)(mitochondrial)
1116375.VEJY3_19451(PF00031)ER
1116375.VEJY3_07460(>)(mitochondrial)
1116375.VEJY3_08510(PF00438) (PF02773) (PF02772)
1116375.VEJY3_16996(>)ER
1116375.VEJY3_23551(PF06468)ER
1116375.VEJY3_13360(>)ER
1116375.VEJY3_13745(>)plastid
1116375.VEJY3_18801(>)(ER)
1116375.VEJY3_09330(<)ER
1116375.VEJY3_01485+mitochondrial
1116375.VEJY3_00150(PF02386)ER
1116375.VEJY3_17596(>)ER
1116375.VEJY3_17591(>)mitochondrial
1116375.VEJY3_09545(PF10544)ER
1116375.VEJY3_02885(PF03553)ER
1116375.VEJY3_23251(>)ER
1116375.VEJY3_20986+(ER); (mitochondrial)
1116375.VEJY3_15170+(ER)
1116375.VEJY3_01145(>)(ER)
1116375.VEJY3_06930(PF03222)(ER)
1116375.VEJY3_20726(PF02386)ER
1116375.VEJY3_08795(PF02278) (PF08124) (PF02884)
1116375.VEJY3_15340(PF02386)ER
1116375.VEJY3_01445(>)ER
1116375.VEJY3_15165(>)ER
1116375.VEJY3_08575(PF03553)ER
1116375.VEJY3_01205(PF05686)(ER)
1116375.VEJY3_08570(PF00465)(mitochondrial); mitochondrial
1116375.VEJY3_11250(+)(PF02278) (PF08124) (PF02884)
1116375.VEJY3_16446(PF10013)(mitochondrial); not used
1116375.VEJY3_21061+(>)
1116375.VEJY3_04690(+)ER
1116375.VEJY3_17371+(>)
1116375.VEJY3_23301+(ER)
1116375.VEJY3_23306(+)(ER)
1116375.VEJY3_22496(+)(mitochondrial)
1116375.VEJY3_22786(PF03315)(plastid)
1116375.VEJY3_00690+plastid
1116375.VEJY3_20321(PF08883)(mitochondrial)
1116375.VEJY3_03055(+)ER
1116375.VEJY3_05475(>)plastid
1116375.VEJY3_05900+(ER)
1116375.VEJY3_14890(+)ER
1116375.VEJY3_08535+(ER)
1116375.VEJY3_10340(+)(mitochondrial)
1116375.VEJY3_18886+(plastid)
1116375.VEJY3_21461(PF16875) (PF02065)
1116375.VEJY3_06960+(plastid)
1116375.VEJY3_15936(+)ER
1116375.VEJY3_22516(<)(ER)
1116375.VEJY3_22846+(mitochondrial)
1116375.VEJY3_17221++
1116375.VEJY3_03600+plastid
1116375.VEJY3_21051+(plastid)
1116375.VEJY3_20691(+)(<)(mitochondrial)
1116375.VEJY3_20521(+)ER
1116375.VEJY3_14985(PF05706)(ER)
1116375.VEJY3_14980(+)(ER); (mitochondrial)
1116375.VEJY3_01620(+)(ER); (plastid)
1116375.VEJY3_02000(+)(mitochondrial)
1116375.VEJY3_09135(PF16875) (PF02065)
1116375.VEJY3_20961+
1116375.VEJY3_22051(+)(ER)
1116375.VEJY3_16616(PF03315)plastid
1116375.VEJY3_03305(+)ER
1116375.VEJY3_20491(+)ER
1116375.VEJY3_02380+(ER)
1116375.VEJY3_23161+(ER)
1116375.VEJY3_18991(+)(mitochondrial)
1116375.VEJY3_18601(+)(ER)
1116375.VEJY3_11565(>)(mitochondrial)
1116375.VEJY3_12540(>)(ER)
1116375.VEJY3_10960(+)ER
1116375.VEJY3_22951(+)mitochondrial; (mitochondrial)
1116375.VEJY3_11630+(plastid)
1116375.VEJY3_11635+plastid
1116375.VEJY3_23966(+)(mitochondrial); plastid
1116375.VEJY3_24006+(ER)
1116375.VEJY3_08595(+)(ER)
1116375.VEJY3_06985(+)ER
1116375.VEJY3_16621(>)(mitochondrial)
1116375.VEJY3_11835(PF10544)(ER)
1116375.VEJY3_09985(PF03315)(plastid)
1116375.VEJY3_09980+(PF03222)
1116375.VEJY3_11285(+)ER
1116375.VEJY3_09535(PF16875) (PF02065)
1116375.VEJY3_08005+(ER)
1116375.VEJY3_12360(+)mitochondrial; plastid
1116375.VEJY3_14905(+)ER
1116375.VEJY3_16866+(plastid)
1116375.VEJY3_23411(+)ER; (ER)
1116375.VEJY3_19261(+)(ER)
1116375.VEJY3_13035(+)(mitochondrial)
1116375.VEJY3_05205+(>)
1116375.VEJY3_21126+(plastid)
1116375.VEJY3_22581(PF16875) (PF02065)
1116375.VEJY3_07440+(plastid)
1116375.VEJY3_21131(+)ER
1116375.VEJY3_22606(>)(mitochondrial)
1116375.VEJY3_03560+(plastid)
1116375.VEJY3_07710+(>)
1116375.VEJY3_06920+
1116375.VEJY3_17826(+)(plastid)
1116375.VEJY3_21046+
1116375.VEJY3_17136(>)
1116375.VEJY3_07270+
1116375.VEJY3_17001+
1116375.VEJY3_17496+
1116375.VEJY3_04015+
1116375.VEJY3_17316+
1116375.VEJY3_23126+
1116375.VEJY3_02840+
1116375.VEJY3_09815+
1116375.VEJY3_03550(+)plastid
1116375.VEJY3_14110+
1116375.VEJY3_08130+
1116375.VEJY3_18676+
1116375.VEJY3_05790+
1116375.VEJY3_13665+
1116375.VEJY3_11310+
1116375.VEJY3_21456+
1116375.VEJY3_00675+
1116375.VEJY3_01490+
1116375.VEJY3_22256+
1116375.VEJY3_12220(+)(>)
1116375.VEJY3_01165(PF01238)
1116375.VEJY3_16946+
1116375.VEJY3_20276(+)(PF03222)
1116375.VEJY3_17946(>)
1116375.VEJY3_09575(+)(mitochondrial)
1116375.VEJY3_07645+
1116375.VEJY3_08355(<)
1116375.VEJY3_13060+
1116375.VEJY3_01660(+)(ER)
1116375.VEJY3_16886+
1116375.VEJY3_03525(+)(plastid)
1116375.VEJY3_13910+
1116375.VEJY3_23331(>)
1116375.VEJY3_05670(PF02065)
1116375.VEJY3_15410+
1116375.VEJY3_01475+
1116375.VEJY3_22006(+)(mitochondrial)
1116375.VEJY3_01040(>)
1116375.VEJY3_08280+
1116375.VEJY3_11230+
1116375.VEJY3_05105+
1116375.VEJY3_22266(PF00465)
1116375.VEJY3_21206+
1116375.VEJY3_20646(PF10063)
1116375.VEJY3_22866(>)
1116375.VEJY3_07325(<)
1116375.VEJY3_10890(<)
1116375.VEJY3_16556+
1116375.VEJY3_16551(>)
1116375.VEJY3_23521+
1116375.VEJY3_24231(+)(mitochondrial)
1116375.VEJY3_20601+
1116375.VEJY3_03535(>)
1116375.VEJY3_14570(>)
1116375.VEJY3_18006+
1116375.VEJY3_09005(PF01238)
1116375.VEJY3_22916+
1116375.VEJY3_10240(<)
1116375.VEJY3_23991+
1116375.VEJY3_01100+
1116375.VEJY3_17811(+)plastid
1116375.VEJY3_01740(>)
1116375.VEJY3_20786+
1116375.VEJY3_16496+
1116375.VEJY3_07400(>)
1116375.VEJY3_09750(>)
1116375.VEJY3_09590+
1116375.VEJY3_13275(>)
1116375.VEJY3_11680+
1116375.VEJY3_08430(>)
1116375.VEJY3_18891(+)(plastid)
1116375.VEJY3_10650(<)
1116375.VEJY3_01910+
1116375.VEJY3_15235+
1116375.VEJY3_13455+
1116375.VEJY3_23001(+)(ER)
1116375.VEJY3_19221+
1116375.VEJY3_16626+
1116375.VEJY3_14275+
1116375.VEJY3_11100+
1116375.VEJY3_21311+
1116375.VEJY3_07430+
1116375.VEJY3_16571+
1116375.VEJY3_07610+
1116375.VEJY3_17426(<)
1116375.VEJY3_02805+
1116375.VEJY3_19636+
1116375.VEJY3_10500+
1116375.VEJY3_23671+
1116375.VEJY3_14085+
1116375.VEJY3_11745(+)(PF03031)
1116375.VEJY3_07845+
1116375.VEJY3_05595+
1116375.VEJY3_17076+
1116375.VEJY3_19411+
1116375.VEJY3_22216(PF00465)
1116375.VEJY3_22211+
1116375.VEJY3_21526+
1116375.VEJY3_11175+
1116375.VEJY3_22501(PF03553)
1116375.VEJY3_15921+
1116375.VEJY3_00725+
1116375.VEJY3_11000(PF00465)
1116375.VEJY3_06820+
1116375.VEJY3_00435+
1116375.VEJY3_19901+
1116375.VEJY3_19906+
1116375.VEJY3_00650+
1116375.VEJY3_00655+
1116375.VEJY3_22731+
1116375.VEJY3_23481+
1116375.VEJY3_02815+
1116375.VEJY3_14525(+)(ER)
1116375.VEJY3_18406+
1116375.VEJY3_03700+
1116375.VEJY3_15455+
1116375.VEJY3_09125(PF01238)
1116375.VEJY3_08460(>)
1116375.VEJY3_13980+
1116375.VEJY3_21246(+)(>)
1116375.VEJY3_11945+
1116375.VEJY3_04545+
1116375.VEJY3_20116(+)(PF00465)
1116375.VEJY3_01640(>)
1116375.VEJY3_20001+
1116375.VEJY3_19296+
1116375.VEJY3_08495(PF00465)
1116375.VEJY3_05515+
1116375.VEJY3_11760+
1116375.VEJY3_08890+not used
1116375.VEJY3_14190(+)(plastid)
1116375.VEJY3_18296(+)(mitochondrial)
1116375.VEJY3_21961+
1116375.VEJY3_09130(+)plastid
1116375.VEJY3_14845+
1116375.VEJY3_08470+
1116375.VEJY3_09620(+)(mitochondrial); not used
1116375.VEJY3_12280+
1116375.VEJY3_20216+
1116375.VEJY3_22816+
1116375.VEJY3_20566(>)
1116375.VEJY3_06625+
1116375.VEJY3_23916(>)
1116375.VEJY3_23261+
1116375.VEJY3_08725(>)
1116375.VEJY3_05430(<)
1116375.VEJY3_02385(+)(ER)
1116375.VEJY3_19881+
1116375.VEJY3_17036(+)(mitochondrial)
1116375.VEJY3_14290(<)
1116375.VEJY3_18771(+)(ER)
1116375.VEJY3_15270+
1116375.VEJY3_13700+
1116375.VEJY3_08915+
1116375.VEJY3_11495+
1116375.VEJY3_20951+
1116375.VEJY3_09650(+)mitochondrial; not used
1116375.VEJY3_12430(>)
1116375.VEJY3_22551(<)
1116375.VEJY3_17736(+)plastid
1116375.VEJY3_21511(+)(PF03315)
1116375.VEJY3_21516+
1116375.VEJY3_17641+
1116375.VEJY3_17081+
1116375.VEJY3_06630+
1116375.VEJY3_14260+
1116375.VEJY3_05080+not used
1116375.VEJY3_19546+
1116375.VEJY3_07930+
1116375.VEJY3_04170(>)
1116375.VEJY3_00665(>)
1116375.VEJY3_12550+
1116375.VEJY3_05130(>)
1116375.VEJY3_01085(<)
1116375.VEJY3_16706+
1116375.VEJY3_22466+
1116375.VEJY3_04285+
1116375.VEJY3_11955+
1116375.VEJY3_17271+
1116375.VEJY3_16186(+)(mitochondrial)
1116375.VEJY3_02030+
1116375.VEJY3_15866+
1116375.VEJY3_17071+
1116375.VEJY3_11735+
1116375.VEJY3_09880+
1116375.VEJY3_18376(+)(PF08883)
1116375.VEJY3_19156(<)
1116375.VEJY3_07900+
1116375.VEJY3_13945+
1116375.VEJY3_10235+
1116375.VEJY3_12560(>)
1116375.VEJY3_17716+
1116375.VEJY3_21711(PF00465)
1116375.VEJY3_04585+
1116375.VEJY3_20716(PF02386)
1116375.VEJY3_21001(<)
1116375.VEJY3_03020+
1116375.VEJY3_06610+
1116375.VEJY3_06385+
1116375.VEJY3_04830+
1116375.VEJY3_02190(>)
1116375.VEJY3_03110+
1116375.VEJY3_11555+
1116375.VEJY3_21811+
1116375.VEJY3_05990(>)
1116375.VEJY3_08585+
1116375.VEJY3_13595+
1116375.VEJY3_20151(+)(ER)
1116375.VEJY3_10005(+)(mitochondrial)
1116375.VEJY3_18726+
1116375.VEJY3_22701(+)+
1116375.VEJY3_08620(PF00465)
1116375.VEJY3_21141(PF00465)
1116375.VEJY3_21491(PF00465)
1116375.VEJY3_01055(PF01238)
1116375.VEJY3_20946(>)
1116375.VEJY3_21546+
1116375.VEJY3_11060+
1116375.VEJY3_01185+
1116375.VEJY3_20141(+)(ER)
1116375.VEJY3_00055+
1116375.VEJY3_03235+
1116375.VEJY3_03900(+)(<)
1116375.VEJY3_08000+
1116375.VEJY3_13110(+)(ER)
1116375.VEJY3_20416+
1116375.VEJY3_22641+
1116375.VEJY3_03165+
1116375.VEJY3_20516+
1116375.VEJY3_20411+
1116375.VEJY3_14650+
1116375.VEJY3_14655+
1116375.VEJY3_23986+
1116375.VEJY3_02560+
1116375.VEJY3_14345+
1116375.VEJY3_10210+
1116375.VEJY3_19041+
1116375.VEJY3_14900(+)(ER)
1116375.VEJY3_11270+
1116375.VEJY3_11475(<)
1116375.VEJY3_21716(>)
1116375.VEJY3_10580+
1116375.VEJY3_17111(<)
1116375.VEJY3_21026+
1116375.VEJY3_07695+
1116375.VEJY3_08840+
1116375.VEJY3_03590+
1116375.VEJY3_08305(PF03553)
1116375.VEJY3_03570+
1116375.VEJY3_21836(PF00465)
1116375.VEJY3_07840+
1116375.VEJY3_15350+
1116375.VEJY3_20166+
1116375.VEJY3_13645+
1116375.VEJY3_18901+
1116375.VEJY3_22761+
1116375.VEJY3_19506+
1116375.VEJY3_19051+
1116375.VEJY3_10200+
1116375.VEJY3_22456(+)plastid
1116375.VEJY3_08330+
1116375.VEJY3_16211+
1116375.VEJY3_07110(>)
1116375.VEJY3_16321+
1116375.VEJY3_20051(+)(plastid)
1116375.VEJY3_17921(<)
1116375.VEJY3_00810(<)
1116375.VEJY3_03250+
1116375.VEJY3_08860+
1116375.VEJY3_21706+
1116375.VEJY3_19126(+)(>)
1116375.VEJY3_17326+
1116375.VEJY3_06335+
1116375.VEJY3_14210+
1116375.VEJY3_12595(<)
1116375.VEJY3_08975+
1116375.VEJY3_12340+
1116375.VEJY3_07495+
1116375.VEJY3_20881+
1116375.VEJY3_22626+
1116375.VEJY3_12520+
1116375.VEJY3_06095+
1116375.VEJY3_10300(+)(plastid)
1116375.VEJY3_04120(PF02386)
1116375.VEJY3_16206(+)
1116375.VEJY3_16201(+)
1116375.VEJY3_18256(+)
1116375.VEJY3_00895(+)
1116375.VEJY3_04785(+)
1116375.VEJY3_06785(+)
1116375.VEJY3_07095(+)
1116375.VEJY3_15886(+)
1116375.VEJY3_04875(+)
1116375.VEJY3_04870(+)
1116375.VEJY3_02930(+)
1116375.VEJY3_17311(+)
1116375.VEJY3_21851(+)
1116375.VEJY3_23216(+)
1116375.VEJY3_03555(+)
1116375.VEJY3_18101(+)
1116375.VEJY3_18856(+)
1116375.VEJY3_15085(+)
1116375.VEJY3_08560(+)
1116375.VEJY3_11225(+)
1116375.VEJY3_12895(+)
1116375.VEJY3_16941(+)
1116375.VEJY3_21671(+)
1116375.VEJY3_05150(+)
1116375.VEJY3_00305(+)
1116375.VEJY3_09570(+)
1116375.VEJY3_04515(+)
1116375.VEJY3_24176(+)
1116375.VEJY3_09900(+)
1116375.VEJY3_06685(+)
1116375.VEJY3_02925(+)
1116375.VEJY3_23201(+)
1116375.VEJY3_09050(+)
1116375.VEJY3_13255(+)
1116375.VEJY3_05490(+)
1116375.VEJY3_19996(+)
1116375.VEJY3_01790(+)
1116375.VEJY3_21556(+)
1116375.VEJY3_05100(+)
1116375.VEJY3_11800(+)
1116375.VEJY3_00685(+)
1116375.VEJY3_06105(+)
1116375.VEJY3_13310(+)
1116375.VEJY3_03085(+)
1116375.VEJY3_17376(+)
1116375.VEJY3_09265(+)
1116375.VEJY3_17206(+)
1116375.VEJY3_14310(+)
1116375.VEJY3_15135(+)
1116375.VEJY3_09000(+)
1116375.VEJY3_12335(+)
1116375.VEJY3_15040(+)
1116375.VEJY3_12790(+)
1116375.VEJY3_22651(+)
1116375.VEJY3_19436(+)
1116375.VEJY3_11200(+)
1116375.VEJY3_01365(+)
1116375.VEJY3_16966(+)
1116375.VEJY3_06975(+)
1116375.VEJY3_04045(+)
1116375.VEJY3_20656(+)
1116375.VEJY3_09755(+)
1116375.VEJY3_24031(+)
1116375.VEJY3_03985(+)
1116375.VEJY3_07330(+)
1116375.VEJY3_10880(+)
1116375.VEJY3_06755(+)
1116375.VEJY3_00235(+)
1116375.VEJY3_03500(+)
1116375.VEJY3_02870(+)
1116375.VEJY3_10530(+)
1116375.VEJY3_05275(+)
1116375.VEJY3_18641(+)
1116375.VEJY3_02670(+)
1116375.VEJY3_11320(+)
1116375.VEJY3_04375(+)
1116375.VEJY3_16026(+)
1116375.VEJY3_16021(+)
1116375.VEJY3_16796(+)
1116375.VEJY3_22511(+)
1116375.VEJY3_01600(+)
1116375.VEJY3_22686(+)
1116375.VEJY3_16576(+)
1116375.VEJY3_24141(+)
1116375.VEJY3_24146(+)
1116375.VEJY3_03330(+)
1116375.VEJY3_17681(+)
1116375.VEJY3_03420(+)
1116375.VEJY3_06585(+)
1116375.VEJY3_17146(+)
1116375.VEJY3_09360(+)
1116375.VEJY3_18636(+)
1116375.VEJY3_15200(+)
1116375.VEJY3_10450(+)
1116375.VEJY3_23071(+)
1116375.VEJY3_08520(+)
1116375.VEJY3_14425(+)
1116375.VEJY3_12645(+)
1116375.VEJY3_12310(+)
1116375.VEJY3_19231(+)
1116375.VEJY3_09115(+)
1116375.VEJY3_09110(+)
1116375.VEJY3_22476(+)
1116375.VEJY3_16011(+)
1116375.VEJY3_19341(+)
1116375.VEJY3_08410(+)
1116375.VEJY3_08730(+)
1116375.VEJY3_01125(+)
1116375.VEJY3_07425(+)
1116375.VEJY3_07190(+)
1116375.VEJY3_17501(+)
1116375.VEJY3_09425(+)
1116375.VEJY3_04370(+)
1116375.VEJY3_16746(+)
1116375.VEJY3_17696(+)
1116375.VEJY3_06175(+)
1116375.VEJY3_08265(+)
1116375.VEJY3_02075(+)
1116375.VEJY3_02810(+)
1116375.VEJY3_01935(+)
1116375.VEJY3_11775(+)
1116375.VEJY3_14185(+)
1116375.VEJY3_14455(+)
1116375.VEJY3_15075(+)
1116375.VEJY3_10360(+)
1116375.VEJY3_08465(+)
1116375.VEJY3_01350(+)
1116375.VEJY3_16171+
1116375.VEJY3_18536(+)
1116375.VEJY3_21536(+)
1116375.VEJY3_19371(+)
1116375.VEJY3_21406(+)
1116375.VEJY3_01755(+)
1116375.VEJY3_11165(+)
1116375.VEJY3_00535(+)
1116375.VEJY3_20206(+)
1116375.VEJY3_06830(+)
1116375.VEJY3_21756(+)
1116375.VEJY3_24121(+)
1116375.VEJY3_20571(+)
1116375.VEJY3_24051(+)
1116375.VEJY3_07700(+)
1116375.VEJY3_00905(+)
1116375.VEJY3_18751(+)
1116375.VEJY3_22481(+)
1116375.VEJY3_09865(+)
1116375.VEJY3_23121(+)
1116375.VEJY3_20816(+)
1116375.VEJY3_19571(+)
1116375.VEJY3_00520(+)
1116375.VEJY3_19576(+)
1116375.VEJY3_19966(+)
1116375.VEJY3_17526(+)
1116375.VEJY3_07715(+)
1116375.VEJY3_03275(+)
1116375.VEJY3_01450(+)
1116375.VEJY3_07005(+)
1116375.VEJY3_00915(+)
1116375.VEJY3_05435(+)
1116375.VEJY3_12945(+)
1116375.VEJY3_14475(+)
1116375.VEJY3_18606(+)
1116375.VEJY3_02525(+)
1116375.VEJY3_08440(+)
1116375.VEJY3_08445(+)
1116375.VEJY3_15010(+)
1116375.VEJY3_10145(+)
1116375.VEJY3_04415(+)
1116375.VEJY3_20821(+)
1116375.VEJY3_21421(+)
1116375.VEJY3_01700(+)
1116375.VEJY3_12545(+)
1116375.VEJY3_22886(+)
1116375.VEJY3_17881(+)
1116375.VEJY3_17731(+)
1116375.VEJY3_20771(+)
1116375.VEJY3_23541(+)
1116375.VEJY3_04725(+)
1116375.VEJY3_24256(+)
1116375.VEJY3_17116(+)
1116375.VEJY3_13395(+)
1116375.VEJY3_11705(+)
1116375.VEJY3_20396(+)
1116375.VEJY3_18566(+)
1116375.VEJY3_21191(+)
1116375.VEJY3_19766(+)
1116375.VEJY3_05175(+)
1116375.VEJY3_05170(+)
1116375.VEJY3_12135+
1116375.VEJY3_06865(+)
1116375.VEJY3_07485(+)
1116375.VEJY3_20161(+)
1116375.VEJY3_12405(+)
1116375.VEJY3_08110(+)
1116375.VEJY3_21011(+)
1116375.VEJY3_06730(+)
1116375.VEJY3_08020(+)
1116375.VEJY3_16411(+)
1116375.VEJY3_04915(+)
1116375.VEJY3_02035(+)not used
1116375.VEJY3_07965(+)
1116375.VEJY3_00850(+)
1116375.VEJY3_08625(+)
1116375.VEJY3_11625(+)
1116375.VEJY3_19621(+)
1116375.VEJY3_06765(+)
1116375.VEJY3_05345(+)
1116375.VEJY3_14810(+)
1116375.VEJY3_12410(+)
1116375.VEJY3_19446(+)
1116375.VEJY3_20846(+)
1116375.VEJY3_14920(+)
1116375.VEJY3_18956(+)
1116375.VEJY3_01080(+)
1116375.VEJY3_01405(+)
1116375.VEJY3_01575(+)
1116375.VEJY3_09695(+)
1116375.VEJY3_03065(+)
1116375.VEJY3_06725(+)
1116375.VEJY3_06050(+)
1116375.VEJY3_20501(+)
1116375.VEJY3_23946(+)
1116375.VEJY3_06180(+)
1116375.VEJY3_23091(+)
1116375.VEJY3_18141(+)
1116375.VEJY3_19036(+)
1116375.VEJY3_22966(+)
1116375.VEJY3_07180(+)
1116375.VEJY3_05075(+)not used
1116375.VEJY3_15275(+)
1116375.VEJY3_02550(+)
1116375.VEJY3_10930(+)
1116375.VEJY3_09220(+)
1116375.VEJY3_06210(+)
1116375.VEJY3_22096(+)
1116375.VEJY3_21701(+)
1116375.VEJY3_03665(+)
1116375.VEJY3_06665(+)
1116375.VEJY3_14620(+)
1116375.VEJY3_17351(+)
1116375.VEJY3_05325(+)
1116375.VEJY3_19946(+)
1116375.VEJY3_04740(+)
1116375.VEJY3_22336(+)
1116375.VEJY3_12185(+)
1116375.VEJY3_21686(+)
1116375.VEJY3_08015(+)
1116375.VEJY3_08010(+)
1116375.VEJY3_06705(+)
1116375.VEJY3_03595(+)
1116375.VEJY3_21036(+)
1116375.VEJY3_06405(+)
1116375.VEJY3_17021(+)
1116375.VEJY3_04815(+)
1116375.VEJY3_15265(+)
1116375.VEJY3_00830(+)
1116375.VEJY3_17336(+)
1116375.VEJY3_15816(+)
1116375.VEJY3_23741(+)
1116375.VEJY3_20711(+)
1116375.VEJY3_19616(+)
1116375.VEJY3_05330(+)
1116375.VEJY3_12170(+)
1116375.VEJY3_07555(+)
1116375.VEJY3_00495(+)
1116375.VEJY3_21951(+)
1116375.VEJY3_16396(+)
1116375.VEJY3_07685(+)
1116375.VEJY3_23571(+)
1116375.VEJY3_02760(+)
1116375.VEJY3_23751(+)
1116375.VEJY3_18221(+)
1116375.VEJY3_18226(+)
1116375.VEJY3_22021(+)
1116375.VEJY3_16991(+)
1116375.VEJY3_03035(+)

Detailed merged results for each protein sequence

Individual results for each protein sequence

Genome based results

Summary

  • Gram negative: YES (FDR = 0.5 %)
  • Functional Type III secretion system: YES (FDR = 12.5 %)
    Estimated copy number = 0.5 (5/10 KEGG proteins)
  • Functional Type IV secretion system: NO (FDR = 7.2 %)
  • Functional Type VI secretion system: YES (FDR = 7.7 %)
    Estimated copy number = 0.625 (5/8 KEGG proteins)

Individual results for each secretion system

Parameters:

==========================================================
EFFECTIVE_T3_OLD=selective
EFFECTIVE_T3_NEW=selective
PREDOTAR_ANIMAL_OR_PLANT=a
PROTEINS=INPUT PROTEINS
MODUS=genome
RUN_PREDOTAR=T
RUN_EFFECTIVE_T3=T
RUN_T4SEpre=0.5
RUN_EFFECTIVE_CCBD=T
RUN_EFFECTIVE_ELD=4
CheckM_COMPLETENESS=
RUN_EffectiveS346=T
GENOTYPE=COG Profile
EMAIL=
==========================================================