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Effective results for Bacillus anthracis str. Sterne (eggnog40)

Summary

Number of putative secreted proteins: 173
- Predicted by T4SEpre: 0
- Predicted by EffectiveELD: 48 eukaryotic-like domains, contained in 173 proteins (10 high, 163 medium Z-score)
Predicted protein secretion systems (parentheses indicate weak positive predictions lacking more than 50% of core proteins of a secretion system): None

Protein based results

Putative secreted proteins (weak evidence indicated by parentheses)

ProteinEffectiveT3EffectiveCCBDT4SEpreEffectiveELDPredotar
260799.BAS1755(PF01773) (PF07662)ER
260799.BAS0757(PF08239) (PF06725)ER
260799.BAS5085(PF01773) (PF07662)ER
260799.BAS5090(PF06725) (PF08239)ER
260799.BAS3190PF03272 (PF13402)ER
260799.BAS3189(PF07504) (PF01447)ER
260799.BAS2756(PF06725) (PF08239)(ER)
260799.BAS3562(PF08239) (PF06725)ER
260799.BAS2780(PF01773) (PF07662)ER
260799.BAS0317(PF01773) (PF07662)ER
260799.BAS0567(PF07504) (PF01447)ER
260799.BAS0573(PF01773) (PF07662)ER
260799.BAS4922(PF01773) (PF07662)ER
260799.BAS4923(PF01773) (PF07662)ER
260799.BAS3077(PF06245)(mitochondrial)
260799.BAS0911(PF02517)ER
260799.BAS2624(PF02517)ER
260799.BAS2325(PF03717)ER
260799.BAS5083(PF08239)mitochondrial
260799.BAS0603(PF02517)ER
260799.BAS4959(PF04172)ER
260799.BAS2467(PF03717)ER
260799.BAS0251(PF02517)ER
260799.BAS1276(PF02517)ER
260799.BAS4960(PF03788)ER
260799.BAS2258(PF02517)ER
260799.BAS2703(PF02517)ER
260799.BAS0130(PF00344)mitochondrial
260799.BAS3720(PF04127)ER; (ER)
260799.BAS1041(PF02517)ER
260799.BAS2393(PF01447)(ER)
260799.BAS2392(PF07504) (PF01447)(ER)
260799.BAS0651(PF06725)ER
260799.BAS5293(PF04172)ER
260799.BAS5294(PF03788)ER
260799.BAS2729(PF13420)mitochondrial
260799.BAS0640(PF03209)ER
260799.BAS0690(PF08239)(ER)
260799.BAS0520PF14580ER
260799.BAS3767(PF03717)ER
260799.BAS3766(PF03717)ER
260799.BAS3163(PF13673)mitochondrial
260799.BAS0198(PF14748)(mitochondrial)
260799.BAS3970(PF13673)mitochondrial
260799.BAS2028(PF07504)ER
260799.BAS4684(PF12606)mitochondrial
260799.BAS0234(PF03851)mitochondrial; (mitochondrial)
260799.BAS3363(PF06463)(mitochondrial)
260799.BAS4251(PF08662)ER
260799.BAS3316(PF11070)ER
260799.BAS2401(PF14526)(mitochondrial)
260799.BAS1812(PF08239)ER
260799.BAS2547(PF00344)mitochondrial
260799.BAS3233(PF02517)ER
260799.BAS2326(PF03717)(ER)
260799.BAS3051PF06268ER; mitochondrial
260799.BAS2084(PF03717)ER
260799.BAS3598(PF04172)ER
260799.BAS3599(PF03788)ER
260799.BAS4461(PF02517)(mitochondrial); mitochondrial
260799.BAS5196(PF03851)ER
260799.BAS0749(PF03209)(mitochondrial); plastid
260799.BAS4929(PF13402)ER
260799.BAS3459(PF04172)ER
260799.BAS3458(PF03788)ER
260799.BAS2457(PF03717)(ER); ER
260799.BAS2543(PF07504) (PF01447)
260799.BAS2872(PF03717)(ER)
260799.BAS2531(PF00797)(mitochondrial)
260799.BAS2248(PF13673)(mitochondrial)
260799.BAS4622(PF06463)(ER)
260799.BAS2002(PF00797)(mitochondrial)
260799.BAS4907(PF07504) (PF01447)
260799.BAS3076(PF06245)
260799.BAS4295(PF13921)
260799.BAS4937(PF02873)
260799.BAS2327(PF03717)
260799.BAS2843(PF14526)
260799.BAS5084(PF08239)
260799.BAS2612(PF13673)
260799.BAS2616(PF13673)
260799.BAS2619(PF13420)
260799.BAS2514(PF13673)
260799.BAS3271PF01166
260799.BAS4616(PF02391)
260799.BAS5094PF10508
260799.BAS1395(PF02517)
260799.BAS0429(PF03819)
260799.BAS1268PF07460
260799.BAS2603(PF13673)
260799.BAS2281(PF01391)
260799.BAS2465(PF04229)
260799.BAS2864(PF08713)
260799.BAS4423(PF01391)
260799.BAS1472(PF13420)
260799.BAS3247(PF03819)
260799.BAS2671(PF13673)
260799.BAS2676(PF01432)
260799.BAS4045(PF14748)
260799.BAS2702(PF03630)
260799.BAS2921(PF14748)
260799.BAS0246(PF13673)
260799.BAS1441(PF03819)
260799.BAS2483(PF13673)
260799.BAS2240(PF13673)
260799.BAS2390(PF13673)
260799.BAS3532(PF08761)
260799.BAS4623(PF01391)
260799.BAS4621(PF06463)
260799.BAS1727(PF13673)
260799.BAS5118(PF08239)
260799.BAS2721(PF04127)
260799.BAS2726(PF13673)
260799.BAS3293(PF01432)
260799.BAS3292(PF00797)
260799.BAS2904(PF08892)
260799.BAS1934(PF13673)
260799.BAS1114(PF01432)
260799.BAS2732(PF08713)
260799.BAS3359(PF02391)
260799.BAS4175(PF03717)
260799.BAS3773(PF13921)
260799.BAS4515(PF12746)
260799.BAS4918(PF03819)
260799.BAS1922(PF13673)
260799.BAS1036(PF14526)
260799.BAS3760(PF02873)
260799.BAS3167PF09295
260799.BAS0663(PF13673)
260799.BAS4234(PF09419)
260799.BAS1130(PF01391)
260799.BAS2026PF09295
260799.BAS2591(PF04229)
260799.BAS2681(PF12746)
260799.BAS2970(PF12746)
260799.BAS3089(PF08239)
260799.BAS0055(PF03819)
260799.BAS4225(PF14748)
260799.BAS1944(PF13673)
260799.BAS4818(PF02517)
260799.BAS2783(PF14748)
260799.BAS3091(PF08713)
260799.BAS4783(PF08713)
260799.BAS0318(PF02475)
260799.BAS0555(PF13420)
260799.BAS5310(PF01432)
260799.BAS2577(PF13420)
260799.BAS2570(PF00797)
260799.BAS2176(PF00386)
260799.BAS3557(PF01391)
260799.BAS3312(PF04229)
260799.BAS2407(PF01432)
260799.BAS4944(PF13127)
260799.BAS4793(PF06725)
260799.BAS4799(PF14526)
260799.BAS4245(PF13673)
260799.BAS1147(PF13673)
260799.BAS2096(PF13673)
260799.BAS4872(PF02517)
260799.BAS3236(PF14526)
260799.BAS3057(PF02517)
260799.BAS0791(PF13673)
260799.BAS1513(PF08892)
260799.BAS4007(PF04229)
260799.BAS4468(PF08761)
260799.BAS4460(PF02517)
260799.BAS1765(PF08239)
260799.BAS1503(PF13673)
260799.BAS1985(PF06463)
260799.BAS1988(PF02391)
260799.BAS2634(PF01432)
260799.BAS4928PF03272
260799.BAS4927PF03272

Detailed merged results for each protein sequence

Individual results for each protein sequence

Genome based results

Summary

  • Gram negative: NO (FDR = 0.5 %)
  • Functional Type III secretion system: N.D.
  • Functional Type IV secretion system: NO (FDR = 7.2 %)
  • Functional Type VI secretion system: N.D.

Individual results for each secretion system

Parameters:

==========================================================
EFFECTIVE_T3_OLD=selective
EFFECTIVE_T3_NEW=selective
PREDOTAR_ANIMAL_OR_PLANT=a
PROTEINS=INPUT PROTEINS
MODUS=genome
RUN_PREDOTAR=T
RUN_EFFECTIVE_T3=T
RUN_T4SEpre=0.5
RUN_EFFECTIVE_CCBD=T
RUN_EFFECTIVE_ELD=4
CheckM_COMPLETENESS=
RUN_EffectiveS346=T
GENOTYPE=COG Profile
EMAIL=
==========================================================