Effective results for Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10 (eggnog40)
Summary
Number of putative secreted proteins: 256
- Predicted by T4SEpre: 0
- Predicted by EffectiveELD: 28 eukaryotic-like domains, contained in 256 proteins (49 high, 207 medium Z-score)
Predicted protein secretion systems (parentheses indicate weak positive predictions lacking more than 50% of core proteins of a secretion system): None
Protein based results
Putative secreted proteins (weak evidence indicated by parentheses)
Protein | EffectiveT3 | EffectiveCCBD | T4SEpre | EffectiveELD | Predotar |
---|---|---|---|---|---|
262316.MAP2115c | (PF02470) | ER | |||
262316.MAP2033 | (PF00067) | mitochondrial | |||
262316.MAP1850 | (PF02405) | (ER); plastid | |||
262316.MAP1856 | (PF02470) | mitochondrial | |||
262316.MAP1854 | (PF02470) | ER | |||
262316.MAP4083 | (PF02405) | mitochondrial | |||
262316.MAP4087 | (PF02470) | mitochondrial | |||
262316.MAP4085 | (PF02470) | ER | |||
262316.MAP4088 | (PF02470) | ER | |||
262316.MAP4089 | (PF02470) | ER | |||
262316.MAP0868c | (PF13772) | mitochondrial | |||
262316.MAP4272c | (PF00080) | ER | |||
262316.MAP0210c | (PF01744) | ER | |||
262316.MAP2862 | PF04072 | (ER) | |||
262316.MAP2117c | (PF02405) | (ER) | |||
262316.MAP2131c | (PF00080) | ER | |||
262316.MAP4320 | (PF03176) | ER; (ER) | |||
262316.MAP1852 | (PF02470) | ER | |||
262316.MAP1373c | (PF00067) | mitochondrial | |||
262316.MAP1855 | (PF02470) | ER | |||
262316.MAP2111c | (PF02470) | ER | |||
262316.MAP3637c | (PF03176) | ER | |||
262316.MAP1680c | (PF01083) | ER | |||
262316.MAP2112c | (PF02470) | ER | |||
262316.MAP2192 | (PF02470) | ER | |||
262316.MAP2190 | (PF02470) | ER | |||
262316.MAP2191 | (PF02470) | mitochondrial | |||
262316.MAP2194 | (PF02470) | ER | |||
262316.MAP0758 | (PF02405) | mitochondrial | |||
262316.MAP0111 | (PF02470) | ER | |||
262316.MAP2113c | (PF02470) | (ER) | |||
262316.MAP2189 | (PF02470) | (mitochondrial) | |||
262316.MAP2232 | (PF03176) | ER | |||
262316.MAP0109 | (PF02470) | ER | |||
262316.MAP0108 | (PF02470) | ER | |||
262316.MAP0107 | (PF02405) | ER | |||
262316.MAP2324c | (PF03176) | mitochondrial | |||
262316.MAP0569 | (PF02470) | ER | |||
262316.MAP0568 | (PF02470) | mitochondrial; (mitochondrial) | |||
262316.MAP0565 | (PF02470) | (ER) | |||
262316.MAP0564 | (PF02470) | ER | |||
262316.MAP0567 | (PF02470) | mitochondrial | |||
262316.MAP3605 | (PF02470) | ER | |||
262316.MAP3607 | (PF02470) | (mitochondrial) | |||
262316.MAP3606 | (PF02470) | (ER) | |||
262316.MAP3609 | (PF02470) | ER | |||
262316.MAP3608 | (PF02470) | mitochondrial | |||
262316.MAP3921 | (PF00080) | ER | |||
262316.MAP4254 | PF14494 | ER | |||
262316.MAP4237c | (PF01083) | (ER) | |||
262316.MAP0765 | (PF02470) | ER | |||
262316.MAP0762 | (PF02470) | ER | |||
262316.MAP0761 | (PF02470) | ER | |||
262316.MAP0760 | (PF02470) | ER | |||
262316.MAP4236c | (PF01083) | ER | |||
262316.MAP3641c | (PF03176) | (mitochondrial) | |||
262316.MAP3890 | (PF03176) | (ER); ER | |||
262316.MAP2233 | (PF03176) | ER | |||
262316.MAP3080 | (PF03176) | (ER) | |||
262316.MAP1662c | (PF01083) | ER | |||
262316.MAP1239c | (PF03176) | (mitochondrial) | |||
262316.MAP0218 | (PF01083) | ER | |||
262316.MAP1476c | (PF01083) | (ER) | |||
262316.MAP2114c | (PF02470) | (ER); (mitochondrial) | |||
262316.MAP4086 | (PF02470) | (mitochondrial) | |||
262316.MAP4084 | (PF02470) | (ER) | |||
262316.MAP4175 | PF14494 | (mitochondrial) | |||
262316.MAP2642 | (PF00195) (PF02797) | ||||
262316.MAP3783 | (PF06013) | (plastid) | |||
262316.MAP3347c | (PF06974) (PF03007) | ||||
262316.MAP3657 | (PF03007) (PF06974) | ||||
262316.MAP2010 | (PF03492) | (mitochondrial) | |||
262316.MAP0131c | (PF06974) (PF03007) | ||||
262316.MAP0904 | (PF08310) | (plastid) | |||
262316.MAP0757 | (PF02405) | (mitochondrial) | |||
262316.MAP0112 | (PF02470) | (ER) | |||
262316.MAP0113 | (PF02470) | (mitochondrial) | |||
262316.MAP0347c | (PF03007) (PF06974) | ||||
262316.MAP3603 | (PF02405) | (plastid) | |||
262316.MAP3604 | (PF02470) | (ER) | |||
262316.MAP3131 | (PF03176) | (ER) | |||
262316.MAP0774c | (PF00067) | (plastid) | |||
262316.MAP2300c | (PF06974) (PF03007) | ||||
262316.MAP1369 | (PF00195) (PF02797) | ||||
262316.MAP3428c | (PF01083) | (mitochondrial) | |||
262316.MAP1453c | (PF06974) (PF03007) | ||||
262316.MAP1372 | (PF00195) (PF02797) | ||||
262316.MAP1969c | (PF06974) (PF03007) | ||||
262316.MAP2261c | (PF00067) | (plastid) | |||
262316.MAP1827c | (PF08148) | (mitochondrial) | |||
262316.MAP1156 | (PF03007) (PF06974) | ||||
262316.MAP0159c | PF02371 | ||||
262316.MAP2108 | PF02371 | ||||
262316.MAP4064c | PF04072 | ||||
262316.MAP2030 | (PF00067) | ||||
262316.MAP3748c | PF02371 | ||||
262316.MAP2204c | (PF03405) | ||||
262316.MAP1853 | (PF02470) | ||||
262316.MAP1851 | (PF02470) | ||||
262316.MAP4082 | (PF02405) | ||||
262316.MAP0093 | (PF02405) | ||||
262316.MAP0092 | (PF02405) | ||||
262316.MAP4173 | PF14494 | ||||
262316.MAP1771c | PF02371 | ||||
262316.MAP2183c | (PF00067) | ||||
262316.MAP1782c | (PF00067) | ||||
262316.MAP2076c | PF04072 | ||||
262316.MAP2340c | (PF13452) | ||||
262316.MAP2116c | (PF02470) | ||||
262316.MAP0344c | (PF00067) | ||||
262316.MAP2525c | (PF00067) | ||||
262316.MAP1849 | (PF02405) | ||||
262316.MAP1660 | PF04072 | ||||
262316.MAP2635c | (PF03176) | ||||
262316.MAP4306 | (PF13469) | ||||
262316.MAP0333 | (PF01083) | ||||
262316.MAP3784 | (PF06013) | ||||
262316.MAP3964c | (PF02353) | ||||
262316.MAP2015 | (PF00067) | ||||
262316.MAP2304 | (PF01083) | ||||
262316.MAP1785 | PF02371 | ||||
262316.MAP0256 | PF04072 | ||||
262316.MAP0321 | (PF02353) | ||||
262316.MAP0600c | (PF00067) | ||||
262316.MAP3495c | (PF01083) | ||||
262316.MAP3479c | (PF13452) | ||||
262316.MAP2444c | PF02371 | ||||
262316.MAP1460 | (PF13452) | ||||
262316.MAP2332c | (PF08354) | ||||
262316.MAP1311 | PF02551 | ||||
262316.MAP2518 | (PF00067) | ||||
262316.MAP3327c | (PF13469) | ||||
262316.MAP0076 | (PF03176) | ||||
262316.MAP0135 | (PF02353) | ||||
262316.MAP4190c | PF04072 | ||||
262316.MAP1603c | (PF00067) | ||||
262316.MAP0730c | (PF00067) | ||||
262316.MAP3818 | (PF00067) | ||||
262316.MAP2051c | (PF00067) | ||||
262316.MAP3109 | (PF00067) | ||||
262316.MAP0832c | PF02371 | ||||
262316.MAP0284c | (PF13810) | ||||
262316.MAP4191c | PF04072 | ||||
262316.MAP3480 | PF02371 | ||||
262316.MAP2034c | PF02371 | ||||
262316.MAP1469c | (PF00067) | ||||
262316.MAP0759 | (PF02470) | ||||
262316.MAP0110 | (PF02470) | ||||
262316.MAP3477 | (PF03007) | ||||
262316.MAP0222c | PF04072 | ||||
262316.MAP2050 | PF02371 | ||||
262316.MAP0598c | (PF00067) | ||||
262316.MAP2239 | (PF03176) | ||||
262316.MAP1508 | (PF06013) | ||||
262316.MAP4197c | PF04072 | ||||
262316.MAP1344 | (PF00067) | ||||
262316.MAP1622c | PF04072 | ||||
262316.MAP2371c | (PF00067) | ||||
262316.MAP4066 | PF02371 | ||||
262316.MAP0566 | (PF02470) | ||||
262316.MAP0563 | (PF02405) | ||||
262316.MAP0562 | (PF02405) | ||||
262316.MAP3590 | (PF00067) | ||||
262316.MAP0967 | PF02371 | ||||
262316.MAP4244 | (PF06013) | ||||
262316.MAP4243 | (PF06013) | ||||
262316.MAP3286 | PF02371 | ||||
262316.MAP3602 | (PF02405) | ||||
262316.MAP3996c | (PF13452) | ||||
262316.MAP1822c | (PF14021) | ||||
262316.MAP0058c | (PF13469) | ||||
262316.MAP4116c | (PF02353) | ||||
262316.MAP1287 | PF02371 | ||||
262316.MAP1503c | (PF00067) | ||||
262316.MAP4107 | (PF13452) | ||||
262316.MAP4109 | (PF13452) | ||||
262316.MAP1979 | (PF00067) | ||||
262316.MAP4079 | PF04072 | ||||
262316.MAP4078 | PF04072 | ||||
262316.MAP4095c | (PF02353) | ||||
262316.MAP0009 | (PF00067) | ||||
262316.MAP1614c | (PF00067) | ||||
262316.MAP0529c | (PF13452) | ||||
262316.MAP4117c | (PF02353) | ||||
262316.MAP3995c | (PF02353) | ||||
262316.MAP2202c | (PF03405) | ||||
262316.MAP0764 | (PF02470) | ||||
262316.MAP0161 | (PF06013) | ||||
262316.MAP0160 | (PF06013) | ||||
262316.MAP0547 | (PF00067) | ||||
262316.MAP1793c | PF02371 | ||||
262316.MAP0209c | (PF08310) | ||||
262316.MAP4189c | PF04072 | ||||
262316.MAP2157 | PF02371 | ||||
262316.MAP0882c | PF04072 | ||||
262316.MAP1378 | (PF13469) | ||||
262316.MAP3289c | (PF02470) | ||||
262316.MAP3881 | PF04072 | ||||
262316.MAP2203c | PF02371 | ||||
262316.MAP1717 | (PF08310) | ||||
262316.MAP0537 | (PF13469) | ||||
262316.MAP0027 | (PF14021) | ||||
262316.MAP3947 | (PF03176) | ||||
262316.MAP2698c | (PF03405) | ||||
262316.MAP0847 | (PF13810) | ||||
262316.MAP3385 | PF04072 | ||||
262316.MAP3549 | (PF13469) | ||||
262316.MAP2382 | (PF00067) | ||||
262316.MAP4068c | (PF00067) | ||||
262316.MAP3049c | (PF03176) | ||||
262316.MAP0704 | (PF00067) | ||||
262316.MAP2365 | (PF00067) | ||||
262316.MAP0309c | (PF13810) | ||||
262316.MAP2649c | (PF00067) | ||||
262316.MAP3814c | PF02371 | ||||
262316.MAP1722 | PF02371 | ||||
262316.MAP0034 | PF02371 | ||||
262316.MAP0752c | (PF00067) | ||||
262316.MAP0522 | (PF00067) | ||||
262316.MAP0525 | (PF13452) | ||||
262316.MAP1033 | PF02371 | ||||
262316.MAP4281 | PF02371 | ||||
262316.MAP3425 | (PF13772) | ||||
262316.MAP3553 | (PF00067) | ||||
262316.MAP0336c | (PF00067) | ||||
262316.MAP3777 | PF04072 | ||||
262316.MAP1738 | (PF03176) | ||||
262316.MAP2666c | (PF06974) | ||||
262316.MAP0289 | (PF14863) | ||||
262316.MAP0287 | (PF13469) | ||||
262316.MAP3963 | (PF02353) | ||||
262316.MAP3329c | (PF14863) | ||||
262316.MAP1240c | (PF03176) | ||||
262316.MAP3563 | PF04072 | ||||
262316.MAP3564 | PF04072 | ||||
262316.MAP3999c | (PF06013) | ||||
262316.MAP0727 | (PF00067) | ||||
262316.MAP2584 | (PF00067) | ||||
262316.MAP2586 | (PF13452) | ||||
262316.MAP2344 | (PF00067) | ||||
262316.MAP0612 | (PF00067) | ||||
262316.MAP1230 | (PF13469) | ||||
262316.MAP4000c | (PF06013) | ||||
262316.MAP1866c | (PF00067) | ||||
262316.MAP0658c | (PF03405) | ||||
262316.MAP1828c | (PF08148) | ||||
262316.MAP3998c | (PF14021) | ||||
262316.MAP3751 | (PF03176) | ||||
262316.MAP2020 | (PF01083) | ||||
262316.MAP0668 | (PF00067) | ||||
262316.MAP0663 | PF04072 | ||||
262316.MAP2837c | (PF08310) | ||||
262316.MAP0262 | (PF14863) | ||||
262316.MAP1952c | PF02371 | ||||
262316.MAP2577 | PF02371 | ||||
262316.MAP3216 | PF04072 |
Detailed merged results for each protein sequence
- Detailed merged results as table (merge_results.html)
- Detailed merged results as tab delimited file (merge_results.csv)
Individual results for each protein sequence
- EffectiveELD predictions (PROTEINS.ELD.TXT)
- Predotar predictions using animal/human model (Predotar_output_modelANIMAL.TXT)
- Predotar predictions using plant model (Predotar_output_modelPLANT.TXT)