Metamenu

Effective results for Pantoea sp. aB (eggnog40)

Summary

Number of putative secreted proteins: 592
- Predicted by EffectiveT3: 167 (high confidence), 317 (low confidence)
- Predicted by EffectiveCCBD: 25 within, 22 before, 40 behind expected region 25..70aa
- Predicted by T4SEpre: 0
- Predicted by EffectiveELD: 13 eukaryotic-like domains, contained in 30 proteins (0 high, 30 medium Z-score)
Predicted protein secretion systems (parentheses indicate weak positive predictions lacking more than 50% of core proteins of a secretion system): (Type III)

Protein based results

Putative secreted proteins (weak evidence indicated by parentheses)

ProteinEffectiveT3EffectiveCCBDT4SEpreEffectiveELDPredotar
517433.PanABDRAFT_1443(>)ER
517433.PanABDRAFT_3178+mitochondrial; (mitochondrial)
517433.PanABDRAFT_1932+(mitochondrial); (plastid)
517433.PanABDRAFT_1849(>)ER
517433.PanABDRAFT_0302(>)ER
517433.PanABDRAFT_0371+(mitochondrial)
517433.PanABDRAFT_1323(>)ER
517433.PanABDRAFT_1686+(mitochondrial)
517433.PanABDRAFT_0336+(ER)
517433.PanABDRAFT_0608(PF00328)ER
517433.PanABDRAFT_2349+(mitochondrial); (plastid)
517433.PanABDRAFT_2635+ER
517433.PanABDRAFT_3880(PF08332)ER
517433.PanABDRAFT_1713(<)mitochondrial
517433.PanABDRAFT_0650+mitochondrial
517433.PanABDRAFT_3263(>)(ER)
517433.PanABDRAFT_4146+(mitochondrial)
517433.PanABDRAFT_1606(+)(PF05704)(mitochondrial)
517433.PanABDRAFT_3602(>)mitochondrial; (mitochondrial)
517433.PanABDRAFT_3278+ER
517433.PanABDRAFT_4025(>)ER
517433.PanABDRAFT_3471(<)(mitochondrial)
517433.PanABDRAFT_3617(>)ER
517433.PanABDRAFT_2407+mitochondrial
517433.PanABDRAFT_2885+ER
517433.PanABDRAFT_3977(>)ER; (ER)
517433.PanABDRAFT_2479(>)(ER)
517433.PanABDRAFT_0133(>)ER
517433.PanABDRAFT_1417(>)(mitochondrial)
517433.PanABDRAFT_3635(<)(ER)
517433.PanABDRAFT_0901(PF06884)ER
517433.PanABDRAFT_3079(>)ER
517433.PanABDRAFT_2146+ER; (ER)
517433.PanABDRAFT_2265(PF00328)ER
517433.PanABDRAFT_1082+(mitochondrial); (plastid)
517433.PanABDRAFT_2453+ER
517433.PanABDRAFT_3929(PF08332)ER
517433.PanABDRAFT_0457(>)ER
517433.PanABDRAFT_2030+ER
517433.PanABDRAFT_1973+ER
517433.PanABDRAFT_2536(>)(mitochondrial)
517433.PanABDRAFT_1299+ER
517433.PanABDRAFT_0741+(ER)
517433.PanABDRAFT_1441(+)ER; (ER)
517433.PanABDRAFT_1206+(>)
517433.PanABDRAFT_0977(+)(mitochondrial)
517433.PanABDRAFT_3945(PF10908)(plastid)
517433.PanABDRAFT_0923(>)(plastid)
517433.PanABDRAFT_1131+(plastid)
517433.PanABDRAFT_1044(+)ER
517433.PanABDRAFT_1041(<)(plastid)
517433.PanABDRAFT_1582(+)(mitochondrial)
517433.PanABDRAFT_1902(+)(ER)
517433.PanABDRAFT_2596+(plastid)
517433.PanABDRAFT_4299+(plastid)
517433.PanABDRAFT_3511(+)mitochondrial
517433.PanABDRAFT_1243+(plastid)
517433.PanABDRAFT_3421+(ER)
517433.PanABDRAFT_3233(+)(mitochondrial)
517433.PanABDRAFT_2833(PF13438)(mitochondrial); not used
517433.PanABDRAFT_4359(+)(mitochondrial); mitochondrial
517433.PanABDRAFT_3727+(>)
517433.PanABDRAFT_1814(+)(mitochondrial)
517433.PanABDRAFT_4162(+)(>)(mitochondrial)
517433.PanABDRAFT_0062+(>)
517433.PanABDRAFT_2726(+)(mitochondrial); plastid
517433.PanABDRAFT_2928+(>)
517433.PanABDRAFT_0274(+)(mitochondrial)
517433.PanABDRAFT_2649(+)(ER)
517433.PanABDRAFT_2418+(ER)
517433.PanABDRAFT_3784(+)(mitochondrial)
517433.PanABDRAFT_3960+plastid
517433.PanABDRAFT_2252(+)ER; (ER)
517433.PanABDRAFT_1610+(mitochondrial)
517433.PanABDRAFT_2365+(plastid)
517433.PanABDRAFT_0029(<)(mitochondrial)
517433.PanABDRAFT_2069+(mitochondrial)
517433.PanABDRAFT_3131(+)ER; (ER)
517433.PanABDRAFT_4048(+)mitochondrial
517433.PanABDRAFT_0167+(plastid)
517433.PanABDRAFT_1639(+)(ER); (mitochondrial)
517433.PanABDRAFT_2264(+)(mitochondrial); (plastid)
517433.PanABDRAFT_1366(+)(ER)
517433.PanABDRAFT_2518+(ER)
517433.PanABDRAFT_0352(+)(ER)
517433.PanABDRAFT_0918(+)ER
517433.PanABDRAFT_3301(+)ER
517433.PanABDRAFT_1542(+)(mitochondrial); (plastid)
517433.PanABDRAFT_4275+
517433.PanABDRAFT_4308+
517433.PanABDRAFT_4307(+)+
517433.PanABDRAFT_4303(>)
517433.PanABDRAFT_4300+
517433.PanABDRAFT_4094(+)(plastid)
517433.PanABDRAFT_0550(>)
517433.PanABDRAFT_1157(+)(mitochondrial)
517433.PanABDRAFT_2338+
517433.PanABDRAFT_3557+
517433.PanABDRAFT_1446+
517433.PanABDRAFT_1205+
517433.PanABDRAFT_4437+
517433.PanABDRAFT_0978(<)
517433.PanABDRAFT_2158(PF14328)
517433.PanABDRAFT_3774(>)
517433.PanABDRAFT_2787(+)(>)
517433.PanABDRAFT_2941(PF00834)
517433.PanABDRAFT_1930(PF10685)not used
517433.PanABDRAFT_4263(PF13438)
517433.PanABDRAFT_3949(PF10685)not used
517433.PanABDRAFT_1848+
517433.PanABDRAFT_0090(>)
517433.PanABDRAFT_0789+
517433.PanABDRAFT_4316(+)(plastid)
517433.PanABDRAFT_0306(PF09347)
517433.PanABDRAFT_0307(PF09347)
517433.PanABDRAFT_0370+
517433.PanABDRAFT_1328+
517433.PanABDRAFT_2208+
517433.PanABDRAFT_0945(+)(mitochondrial)
517433.PanABDRAFT_2169+
517433.PanABDRAFT_3765+
517433.PanABDRAFT_3763+
517433.PanABDRAFT_2823+
517433.PanABDRAFT_2825+
517433.PanABDRAFT_2829(PF13438)
517433.PanABDRAFT_2798(+)(mitochondrial)
517433.PanABDRAFT_4252+
517433.PanABDRAFT_3995+
517433.PanABDRAFT_4329(<)
517433.PanABDRAFT_1638+
517433.PanABDRAFT_0319+
517433.PanABDRAFT_3331+
517433.PanABDRAFT_0533+
517433.PanABDRAFT_3520+
517433.PanABDRAFT_0122+not used
517433.PanABDRAFT_2170+
517433.PanABDRAFT_3193+
517433.PanABDRAFT_3755(>)
517433.PanABDRAFT_0885+
517433.PanABDRAFT_2817(>)
517433.PanABDRAFT_4409(>)
517433.PanABDRAFT_2587(+)(mitochondrial)
517433.PanABDRAFT_1860+
517433.PanABDRAFT_3215(<)
517433.PanABDRAFT_4242(PF13438)
517433.PanABDRAFT_4244+
517433.PanABDRAFT_3985+
517433.PanABDRAFT_0189+
517433.PanABDRAFT_0182(PF05870)
517433.PanABDRAFT_0878+
517433.PanABDRAFT_1587+
517433.PanABDRAFT_2100+
517433.PanABDRAFT_2267(+)(<)
517433.PanABDRAFT_2266+
517433.PanABDRAFT_2612+
517433.PanABDRAFT_3043+
517433.PanABDRAFT_1790+
517433.PanABDRAFT_0173+
517433.PanABDRAFT_0176(PF13438)
517433.PanABDRAFT_2598+
517433.PanABDRAFT_3229+
517433.PanABDRAFT_4180(<)
517433.PanABDRAFT_4344+
517433.PanABDRAFT_4345+
517433.PanABDRAFT_0194+
517433.PanABDRAFT_0511(+)(plastid)
517433.PanABDRAFT_0040(>)
517433.PanABDRAFT_3510+
517433.PanABDRAFT_1488(<)
517433.PanABDRAFT_2298(+)(ER)
517433.PanABDRAFT_2291+
517433.PanABDRAFT_1226+
517433.PanABDRAFT_2933(<)
517433.PanABDRAFT_0292+
517433.PanABDRAFT_0298+
517433.PanABDRAFT_1109+
517433.PanABDRAFT_1108(+)(ER)
517433.PanABDRAFT_2348+
517433.PanABDRAFT_0074+
517433.PanABDRAFT_0075+
517433.PanABDRAFT_1838(<)
517433.PanABDRAFT_1602+
517433.PanABDRAFT_0850+
517433.PanABDRAFT_2632+
517433.PanABDRAFT_0578+
517433.PanABDRAFT_2911(+)(mitochondrial)
517433.PanABDRAFT_0615(>)
517433.PanABDRAFT_3243+
517433.PanABDRAFT_2086+
517433.PanABDRAFT_3721+
517433.PanABDRAFT_4164+
517433.PanABDRAFT_3867+
517433.PanABDRAFT_0445(<)
517433.PanABDRAFT_0447+
517433.PanABDRAFT_0448+
517433.PanABDRAFT_1393+
517433.PanABDRAFT_4013+
517433.PanABDRAFT_1006+
517433.PanABDRAFT_4491+not used
517433.PanABDRAFT_3539+
517433.PanABDRAFT_2137+
517433.PanABDRAFT_2134+
517433.PanABDRAFT_3710(PF16485)
517433.PanABDRAFT_2625+
517433.PanABDRAFT_2723+
517433.PanABDRAFT_1673+
517433.PanABDRAFT_3384+
517433.PanABDRAFT_4172+
517433.PanABDRAFT_1381+
517433.PanABDRAFT_0723+
517433.PanABDRAFT_2232+
517433.PanABDRAFT_3703+
517433.PanABDRAFT_3700+
517433.PanABDRAFT_0875+
517433.PanABDRAFT_2657(+)(ER)
517433.PanABDRAFT_3621+
517433.PanABDRAFT_3599+
517433.PanABDRAFT_2423(+)(plastid)
517433.PanABDRAFT_2879+
517433.PanABDRAFT_3063(>)
517433.PanABDRAFT_4492+not used
517433.PanABDRAFT_1230+
517433.PanABDRAFT_3282+
517433.PanABDRAFT_0467+
517433.PanABDRAFT_0485(PF10908)
517433.PanABDRAFT_0482+
517433.PanABDRAFT_0489+
517433.PanABDRAFT_4036(+)(mitochondrial)
517433.PanABDRAFT_0005+not used
517433.PanABDRAFT_2473(<)
517433.PanABDRAFT_0738+
517433.PanABDRAFT_0736(+)(ER); not used
517433.PanABDRAFT_1739+
517433.PanABDRAFT_1732(>)
517433.PanABDRAFT_1735(PF05870)
517433.PanABDRAFT_1283(+)(mitochondrial)
517433.PanABDRAFT_1609+
517433.PanABDRAFT_3548+
517433.PanABDRAFT_3927+
517433.PanABDRAFT_3115+
517433.PanABDRAFT_2642(+)(mitochondrial)
517433.PanABDRAFT_3523+
517433.PanABDRAFT_3607+
517433.PanABDRAFT_3527+
517433.PanABDRAFT_3073+
517433.PanABDRAFT_4480(PF01129)
517433.PanABDRAFT_0361+
517433.PanABDRAFT_1037+
517433.PanABDRAFT_1294+
517433.PanABDRAFT_2093+
517433.PanABDRAFT_0105+
517433.PanABDRAFT_1981+
517433.PanABDRAFT_3443+
517433.PanABDRAFT_2213(+)+
517433.PanABDRAFT_0113(>)
517433.PanABDRAFT_0929+
517433.PanABDRAFT_2717+
517433.PanABDRAFT_2715+
517433.PanABDRAFT_2350+
517433.PanABDRAFT_0999+
517433.PanABDRAFT_1237+
517433.PanABDRAFT_3104+
517433.PanABDRAFT_2887(<)
517433.PanABDRAFT_2884+
517433.PanABDRAFT_3975+
517433.PanABDRAFT_3531+
517433.PanABDRAFT_3826+
517433.PanABDRAFT_3914(<)
517433.PanABDRAFT_0243+
517433.PanABDRAFT_1970(>)
517433.PanABDRAFT_4054+
517433.PanABDRAFT_1872+
517433.PanABDRAFT_1623+
517433.PanABDRAFT_2081(>)
517433.PanABDRAFT_0114(PF00834)
517433.PanABDRAFT_3500(+)(plastid)
517433.PanABDRAFT_1946(PF09347)
517433.PanABDRAFT_3623(<)
517433.PanABDRAFT_0896(<)
517433.PanABDRAFT_3056(+)(plastid)
517433.PanABDRAFT_2871+
517433.PanABDRAFT_3839+
517433.PanABDRAFT_0347+
517433.PanABDRAFT_2272(>)
517433.PanABDRAFT_2274+
517433.PanABDRAFT_0346+
517433.PanABDRAFT_4045+
517433.PanABDRAFT_3457+
517433.PanABDRAFT_1364+
517433.PanABDRAFT_0832+
517433.PanABDRAFT_2482(+)(ER)
517433.PanABDRAFT_3120+
517433.PanABDRAFT_2513+
517433.PanABDRAFT_0697+
517433.PanABDRAFT_0221(<)
517433.PanABDRAFT_0229(>)
517433.PanABDRAFT_3802(PF00834)
517433.PanABDRAFT_2269(PF10685)not used
517433.PanABDRAFT_1171+not used
517433.PanABDRAFT_1420+
517433.PanABDRAFT_0821+
517433.PanABDRAFT_0826(<)
517433.PanABDRAFT_0911+
517433.PanABDRAFT_0768+
517433.PanABDRAFT_2452+
517433.PanABDRAFT_3151(<)
517433.PanABDRAFT_3155(>)
517433.PanABDRAFT_2851+
517433.PanABDRAFT_0128(+)(ER)
517433.PanABDRAFT_1968+
517433.PanABDRAFT_1344+
517433.PanABDRAFT_4209+
517433.PanABDRAFT_4117(PF10685)not used
517433.PanABDRAFT_2924+
517433.PanABDRAFT_0145+
517433.PanABDRAFT_0146+
517433.PanABDRAFT_1763(+)(plastid)
517433.PanABDRAFT_1023(>)
517433.PanABDRAFT_1543+
517433.PanABDRAFT_2443+
517433.PanABDRAFT_2537+
517433.PanABDRAFT_0758+
517433.PanABDRAFT_1945(PF09347)
517433.PanABDRAFT_1949(PF09347)
517433.PanABDRAFT_4270(+)
517433.PanABDRAFT_4099(+)
517433.PanABDRAFT_4093(+)
517433.PanABDRAFT_0796(+)
517433.PanABDRAFT_2026(+)
517433.PanABDRAFT_1343(+)
517433.PanABDRAFT_4468(+)
517433.PanABDRAFT_4260(+)
517433.PanABDRAFT_4266(+)
517433.PanABDRAFT_0300(+)
517433.PanABDRAFT_4086(+)not used
517433.PanABDRAFT_0529(+)
517433.PanABDRAFT_0524(+)
517433.PanABDRAFT_4152(+)
517433.PanABDRAFT_0416(+)
517433.PanABDRAFT_1145(+)
517433.PanABDRAFT_0379(+)
517433.PanABDRAFT_0634(+)
517433.PanABDRAFT_0635(+)
517433.PanABDRAFT_2010(+)
517433.PanABDRAFT_2012(+)
517433.PanABDRAFT_3547(+)
517433.PanABDRAFT_0941(+)
517433.PanABDRAFT_2163(+)
517433.PanABDRAFT_3160(+)
517433.PanABDRAFT_3168(+)
517433.PanABDRAFT_2550(+)
517433.PanABDRAFT_2554(+)
517433.PanABDRAFT_0924(+)
517433.PanABDRAFT_4413(+)
517433.PanABDRAFT_1922(+)not used
517433.PanABDRAFT_4322(+)
517433.PanABDRAFT_4325(+)
517433.PanABDRAFT_0404(+)
517433.PanABDRAFT_0406(+)
517433.PanABDRAFT_0401(+)
517433.PanABDRAFT_1130(+)
517433.PanABDRAFT_0120(+)
517433.PanABDRAFT_3685(+)
517433.PanABDRAFT_1463(+)
517433.PanABDRAFT_4194(+)
517433.PanABDRAFT_3197(+)
517433.PanABDRAFT_4217(+)not used
517433.PanABDRAFT_0887(+)
517433.PanABDRAFT_1918(+)
517433.PanABDRAFT_2583(+)
517433.PanABDRAFT_1866(+)
517433.PanABDRAFT_0161(+)
517433.PanABDRAFT_4336(+)
517433.PanABDRAFT_4331(+)
517433.PanABDRAFT_0321(+)
517433.PanABDRAFT_0431(+)
517433.PanABDRAFT_0437(+)
517433.PanABDRAFT_0350(+)
517433.PanABDRAFT_1051(+)
517433.PanABDRAFT_1053(+)
517433.PanABDRAFT_1629(+)
517433.PanABDRAFT_3568(+)
517433.PanABDRAFT_1275(+)
517433.PanABDRAFT_1276(+)
517433.PanABDRAFT_1581(+)
517433.PanABDRAFT_3697(+)
517433.PanABDRAFT_1474(+)
517433.PanABDRAFT_3962(+)
517433.PanABDRAFT_0771(+)
517433.PanABDRAFT_2344(+)
517433.PanABDRAFT_3309(+)
517433.PanABDRAFT_0982(+)not used
517433.PanABDRAFT_0983(+)not used
517433.PanABDRAFT_4435(+)
517433.PanABDRAFT_3357(+)
517433.PanABDRAFT_2979(+)
517433.PanABDRAFT_3329(+)not used
517433.PanABDRAFT_0174(+)
517433.PanABDRAFT_4290(+)
517433.PanABDRAFT_0333(+)
517433.PanABDRAFT_0193(+)
517433.PanABDRAFT_0425(+)
517433.PanABDRAFT_0421(+)
517433.PanABDRAFT_1114(+)
517433.PanABDRAFT_0429(+)
517433.PanABDRAFT_1060(+)
517433.PanABDRAFT_3505(+)
517433.PanABDRAFT_1481(+)
517433.PanABDRAFT_2765(+)
517433.PanABDRAFT_3459(+)
517433.PanABDRAFT_3349(+)
517433.PanABDRAFT_1809(+)
517433.PanABDRAFT_4288(+)
517433.PanABDRAFT_4192(+)not used
517433.PanABDRAFT_4198(+)
517433.PanABDRAFT_2793(+)
517433.PanABDRAFT_0294(+)
517433.PanABDRAFT_2935(+)not used
517433.PanABDRAFT_0676(+)
517433.PanABDRAFT_2342(+)
517433.PanABDRAFT_0078(+)
517433.PanABDRAFT_3260(+)
517433.PanABDRAFT_0707(+)
517433.PanABDRAFT_1659(+)
517433.PanABDRAFT_1651(+)
517433.PanABDRAFT_3654(+)
517433.PanABDRAFT_3658(+)
517433.PanABDRAFT_2145(+)
517433.PanABDRAFT_0283(+)
517433.PanABDRAFT_0660(+)
517433.PanABDRAFT_0714(+)
517433.PanABDRAFT_1718(+)
517433.PanABDRAFT_3940(+)
517433.PanABDRAFT_1714(+)
517433.PanABDRAFT_2138(+)
517433.PanABDRAFT_1532(+)
517433.PanABDRAFT_1674(+)
517433.PanABDRAFT_2623(+)
517433.PanABDRAFT_3150(+)
517433.PanABDRAFT_3664(+)
517433.PanABDRAFT_3668(+)
517433.PanABDRAFT_4070(+)
517433.PanABDRAFT_3032(+)
517433.PanABDRAFT_4459(+)
517433.PanABDRAFT_3097(+)
517433.PanABDRAFT_3096(+)
517433.PanABDRAFT_3388(+)
517433.PanABDRAFT_3385(+)
517433.PanABDRAFT_3899(+)
517433.PanABDRAFT_4372(+)
517433.PanABDRAFT_4377+
517433.PanABDRAFT_4393(+)
517433.PanABDRAFT_0383(+)
517433.PanABDRAFT_0278(+)
517433.PanABDRAFT_0471(+)
517433.PanABDRAFT_0496(+)
517433.PanABDRAFT_4005(+)
517433.PanABDRAFT_1013(+)
517433.PanABDRAFT_0652(+)
517433.PanABDRAFT_1523(+)
517433.PanABDRAFT_2381(+)
517433.PanABDRAFT_0876(+)
517433.PanABDRAFT_2424(+)
517433.PanABDRAFT_4445(+)
517433.PanABDRAFT_4143(+)
517433.PanABDRAFT_3322(+)
517433.PanABDRAFT_1027(+)
517433.PanABDRAFT_2343(+)
517433.PanABDRAFT_0641(+)
517433.PanABDRAFT_3529(+)
517433.PanABDRAFT_3892(+)
517433.PanABDRAFT_2390(+)
517433.PanABDRAFT_0869(+)
517433.PanABDRAFT_3926(+)
517433.PanABDRAFT_2640(+)
517433.PanABDRAFT_4366(+)
517433.PanABDRAFT_3887(+)
517433.PanABDRAFT_3606(+)
517433.PanABDRAFT_3780(+)
517433.PanABDRAFT_3114(+)
517433.PanABDRAFT_1457(+)
517433.PanABDRAFT_3275(+)
517433.PanABDRAFT_3526(+)
517433.PanABDRAFT_4486(+)
517433.PanABDRAFT_3856(+)
517433.PanABDRAFT_3297(+)
517433.PanABDRAFT_0362(+)
517433.PanABDRAFT_0035(+)not used
517433.PanABDRAFT_0030(+)
517433.PanABDRAFT_1033(+)
517433.PanABDRAFT_0749(+)
517433.PanABDRAFT_1613(+)
517433.PanABDRAFT_0817(+)
517433.PanABDRAFT_0814(+)
517433.PanABDRAFT_2077(+)
517433.PanABDRAFT_2078(+)
517433.PanABDRAFT_1263(+)
517433.PanABDRAFT_2357(+)
517433.PanABDRAFT_3611(+)
517433.PanABDRAFT_3613(+)
517433.PanABDRAFT_3530(+)
517433.PanABDRAFT_0779(+)
517433.PanABDRAFT_0248(+)
517433.PanABDRAFT_3358(+)
517433.PanABDRAFT_3220(+)
517433.PanABDRAFT_4371(+)
517433.PanABDRAFT_4059(+)
517433.PanABDRAFT_4051(+)
517433.PanABDRAFT_0020(+)
517433.PanABDRAFT_2245(+)
517433.PanABDRAFT_1196(+)
517433.PanABDRAFT_0116(+)
517433.PanABDRAFT_2663(+)
517433.PanABDRAFT_0541(+)
517433.PanABDRAFT_2061(+)
517433.PanABDRAFT_0937(+)
517433.PanABDRAFT_3509(+)
517433.PanABDRAFT_1864(+)
517433.PanABDRAFT_3361(+)
517433.PanABDRAFT_1236(+)
517433.PanABDRAFT_3837(+)
517433.PanABDRAFT_3900(+)
517433.PanABDRAFT_3372(+)
517433.PanABDRAFT_3371(+)
517433.PanABDRAFT_3377(+)
517433.PanABDRAFT_1974(+)
517433.PanABDRAFT_2275(+)
517433.PanABDRAFT_2276(+)
517433.PanABDRAFT_0560(+)not used
517433.PanABDRAFT_0568(+)
517433.PanABDRAFT_0162(+)
517433.PanABDRAFT_1742(+)
517433.PanABDRAFT_2690(+)
517433.PanABDRAFT_0837(+)
517433.PanABDRAFT_1112(+)
517433.PanABDRAFT_3585(+)
517433.PanABDRAFT_1642(+)
517433.PanABDRAFT_2481(+)
517433.PanABDRAFT_2463(+)
517433.PanABDRAFT_2467(+)
517433.PanABDRAFT_3074(+)
517433.PanABDRAFT_3021(+)
517433.PanABDRAFT_2993(+)
517433.PanABDRAFT_2867(+)
517433.PanABDRAFT_0042(+)
517433.PanABDRAFT_4453(+)
517433.PanABDRAFT_1063(+)
517433.PanABDRAFT_3933(+)
517433.PanABDRAFT_3809(+)
517433.PanABDRAFT_4079(+)
517433.PanABDRAFT_1177(+)
517433.PanABDRAFT_0689(+)
517433.PanABDRAFT_1318(+)
517433.PanABDRAFT_4053(+)
517433.PanABDRAFT_2680(+)
517433.PanABDRAFT_2049(+)
517433.PanABDRAFT_0915(+)
517433.PanABDRAFT_3144(+)
517433.PanABDRAFT_4106(+)
517433.PanABDRAFT_2451(+)
517433.PanABDRAFT_3159(+)
517433.PanABDRAFT_3034(+)
517433.PanABDRAFT_0259(+)
517433.PanABDRAFT_1844(+)
517433.PanABDRAFT_2521(+)
517433.PanABDRAFT_4449(+)
517433.PanABDRAFT_1955(+)
517433.PanABDRAFT_0450(+)
517433.PanABDRAFT_1840(+)
517433.PanABDRAFT_3921(+)
517433.PanABDRAFT_0211(+)
517433.PanABDRAFT_4065(+)
517433.PanABDRAFT_0545(+)
517433.PanABDRAFT_3572(+)
517433.PanABDRAFT_1096(+)
517433.PanABDRAFT_1169(+)
517433.PanABDRAFT_1766(+)
517433.PanABDRAFT_3252(+)
517433.PanABDRAFT_0510(+)
517433.PanABDRAFT_3257(+)
517433.PanABDRAFT_0783(+)
517433.PanABDRAFT_2226(+)
517433.PanABDRAFT_2059(+)
517433.PanABDRAFT_3584(+)
517433.PanABDRAFT_0037(+)
517433.PanABDRAFT_2149(+)
517433.PanABDRAFT_0692(+)
517433.PanABDRAFT_2442(+)
517433.PanABDRAFT_1899(+)
517433.PanABDRAFT_2843(+)
517433.PanABDRAFT_4470(+)
517433.PanABDRAFT_0624(+)

Detailed merged results for each protein sequence

Individual results for each protein sequence

Genome based results

Summary

  • Gram negative: YES (FDR = 0.5 %)
  • Functional Type III secretion system: YES (FDR = 12.5 %)
    Estimated copy number = 0.3 (3/10 KEGG proteins)
  • Functional Type IV secretion system: NO (FDR = 7.2 %)
  • Functional Type VI secretion system: NO (FDR = 7.7 %)

Individual results for each secretion system

Parameters:

==========================================================
EFFECTIVE_T3_OLD=selective
EFFECTIVE_T3_NEW=selective
PREDOTAR_ANIMAL_OR_PLANT=a
PROTEINS=INPUT PROTEINS
MODUS=genome
RUN_PREDOTAR=T
RUN_EFFECTIVE_T3=T
RUN_T4SEpre=0.5
RUN_EFFECTIVE_CCBD=T
RUN_EFFECTIVE_ELD=4
CheckM_COMPLETENESS=
RUN_EffectiveS346=T
GENOTYPE=COG Profile
EMAIL=
==========================================================