Effective results for Citrobacter rodentium ICC168 (eggnog40)

Summary

Number of putative secreted proteins: 791
- Predicted by EffectiveT3: 188 (high confidence), 279 (low confidence)
- Predicted by EffectiveCCBD: 34 within, 22 before, 43 behind expected region 25..70aa
- Predicted by T4SEpre: 103
- Predicted by EffectiveELD: 24 eukaryotic-like domains, contained in 181 proteins (23 high, 158 medium Z-score)
Predicted protein secretion systems (parentheses indicate weak positive predictions lacking more than 50% of core proteins of a secretion system): Type III, (Type IV)

Protein based results

Putative secreted proteins (weak evidence indicated by parentheses)

ProteinEffectiveT3EffectiveCCBDT4SEpreEffectiveELDPredotar
637910.ROD_11911+(PF03797)(mitochondrial)
637910.ROD_16841+(PF03797)(mitochondrial)
637910.ROD_28861(>)ER
637910.ROD_15481(>)mitochondrial; (mitochondrial)
637910.ROD_23591+ER
637910.ROD_22641(>)(mitochondrial)
637910.ROD_21421(PF10662)mitochondrial
637910.ROD_10051+(mitochondrial); plastid
637910.ROD_42591(PF03797)(mitochondrial); (ER)
637910.ROD_03641(>)ER
637910.ROD_18691(>)ER
637910.ROD_20811+(PF03797)(ER)
637910.ROD_42691+ER; (ER)
637910.ROD_02091+mitochondrial
637910.ROD_14601+ER
637910.ROD_05201+mitochondrial
637910.ROD_38761(PF03797)(mitochondrial)
637910.ROD_06971+(PF01609)(plastid)
637910.ROD_27931+(PF01609)(plastid)
637910.ROD_35871(PF05935)ER
637910.ROD_43171+(mitochondrial); plastid
637910.ROD_33441+ER
637910.ROD_35411(<)(ER)
637910.ROD_15731(PF03797)(mitochondrial)
637910.ROD_39171+ER
637910.ROD_10671+ER
637910.ROD_36081(PF00939)ER
637910.ROD_18451+ER
637910.ROD_29381(PF00577)(ER)
637910.ROD_46711(PF03222)ER
637910.ROD_48711(>)(ER)
637910.ROD_04151(PF03797)ER; (ER)
637910.ROD_03891(PF03797)ER
637910.ROD_16391(+)(PF03797)ER
637910.ROD_19621(PF03222)(ER)
637910.ROD_03661(PF00345)ER
637910.ROD_29241(PF00345)ER
637910.ROD_41281(PF00577)ER
637910.ROD_28751(<)(ER)
637910.ROD_01241+ER
637910.ROD_02111(PF03797)ER
637910.ROD_48531(>)ER
637910.ROD_42391+ER
637910.ROD_24461(PF05231)ER
637910.ROD_29071+ER
637910.ROD_11991+(mitochondrial); (plastid)
637910.ROD_28991(PF03222)(ER)
637910.ROD_11771(PF00345)ER
637910.ROD_19351(PF00577)mitochondrial; ER
637910.ROD_38291(PF00939)ER
637910.ROD_40421+(mitochondrial)
637910.ROD_19281+(mitochondrial)
637910.ROD_14761(>)ER
637910.ROD_41241+ER
637910.ROD_40441(>)ER
637910.ROD_49731(PF03797)(mitochondrial)
637910.ROD_45881(>)ER
637910.ROD_04181(>)ER
637910.ROD_23871(>)(mitochondrial)
637910.ROD_41271(PF00345)ER
637910.ROD_50621(PF00345)ER
637910.ROD_15771+(mitochondrial)
637910.ROD_36561+ER
637910.ROD_41781+(mitochondrial)
637910.ROD_22331(PF00345)ER
637910.ROD_29371(PF00345)ER
637910.ROD_06611+ER
637910.ROD_24091(PF10662)(mitochondrial)
637910.ROD_09661(PF00456)(ER)
637910.ROD_29891++(plastid)
637910.ROD_15411(PF06884)ER
637910.ROD_11781(PF00577)ER
637910.ROD_19361(PF00345)ER
637910.ROD_22321(PF00577)ER
637910.ROD_22031(PF05231)ER
637910.ROD_06271(PF00939)ER
637910.ROD_42171+(ER)
637910.ROD_28141(PF05231)(mitochondrial)
637910.ROD_27781(PF00577)(ER)
637910.ROD_04081(PF05231)ER
637910.ROD_18171(PF00345)ER
637910.ROD_07041(>)ER
637910.ROD_40361+(mitochondrial)
637910.ROD_40631(PF05231)ER
637910.ROD_07341+ER
637910.ROD_00511(PF03797)mitochondrial; (mitochondrial)
637910.ROD_00601(<)ER
637910.ROD_05551+(mitochondrial)
637910.ROD_28431+ER
637910.ROD_27791(PF00345)ER
637910.ROD_19891+ER
637910.ROD_43111(PF00939)ER
637910.ROD_35821+ER
637910.ROD_32351+ER
637910.ROD_29141(PF00345)mitochondrial
637910.ROD_34981(PF00577)ER
637910.ROD_24351+ER
637910.ROD_38181+(PF01609)(plastid)
637910.ROD_09921+(mitochondrial)
637910.ROD_14641+ER
637910.ROD_27671+(ER)
637910.ROD_07661(PF00939)ER
637910.ROD_34991(PF00345)ER
637910.ROD_43771(>)ER
637910.ROD_05091(>)ER
637910.ROD_27811+(mitochondrial)
637910.ROD_11321(>)mitochondrial
637910.ROD_41441(>)ER
637910.ROD_23851+ER
637910.ROD_44031(>)ER
637910.ROD_19211(<)(mitochondrial); mitochondrial
637910.ROD_03211++(plastid)
637910.ROD_29201+ER
637910.ROD_20271+ER; (ER)
637910.ROD_03921(PF03797)ER
637910.ROD_29741+(plastid)
637910.ROD_02981+(PF05704)
637910.ROD_15141(<)
637910.ROD_13361+ER; not used
637910.ROD_03201(<)(mitochondrial); not used
637910.ROD_42441(<)
637910.ROD_04611+(plastid)
637910.ROD_27281+(mitochondrial)
637910.ROD_23121(+)(mitochondrial)
637910.ROD_30151+(mitochondrial)
637910.ROD_00331(+)mitochondrial
637910.ROD_11021(+)ER; (ER)
637910.ROD_08761(+)(mitochondrial)
637910.ROD_07681(+)ER
637910.ROD_20091++
637910.ROD_08001(PF00456)(mitochondrial)
637910.ROD_03071+(mitochondrial)
637910.ROD_33331(+)(mitochondrial)
637910.ROD_15181+(plastid)
637910.ROD_30311(+)(mitochondrial)
637910.ROD_23491(+)(ER)
637910.ROD_46781(+)(mitochondrial)
637910.ROD_33371(>)+
637910.ROD_47611+(PF03222)
637910.ROD_03061+(plastid)
637910.ROD_13841(+)ER
637910.ROD_43831++
637910.ROD_26771+(PF01609)
637910.ROD_40071(<)+
637910.ROD_48861+(mitochondrial)
637910.ROD_14111+(mitochondrial)
637910.ROD_44541+(>)
637910.ROD_47121+(plastid)
637910.ROD_11981+(PF05935)
637910.ROD_42821+(mitochondrial)
637910.ROD_40911+(plastid)
637910.ROD_00191+(PF13347)
637910.ROD_15881+(mitochondrial)
637910.ROD_33431(+)ER
637910.ROD_48691+(mitochondrial)
637910.ROD_47711(>)(mitochondrial)
637910.ROD_47131++
637910.ROD_11971+(PF03797)
637910.ROD_37941(PF01228)(mitochondrial)
637910.ROD_10201+(plastid)
637910.ROD_16751(+)ER
637910.ROD_38951+(mitochondrial)
637910.ROD_42601(+)ER; (ER)
637910.ROD_29761++
637910.ROD_41691(+)ER
637910.ROD_34241(+)(ER); plastid
637910.ROD_01051(<)(mitochondrial)
637910.ROD_30731(+)ER
637910.ROD_09131++
637910.ROD_25271(+)mitochondrial; (mitochondrial)
637910.ROD_47301(>)(mitochondrial)
637910.ROD_40981+plastid
637910.ROD_23421+(plastid)
637910.ROD_23301(+)ER; (mitochondrial)
637910.ROD_23721+(mitochondrial)
637910.ROD_29092(+)mitochondrial
637910.ROD_18851+plastid
637910.ROD_15921(+)ER; (plastid)
637910.ROD_27801(+)ER
637910.ROD_49211(+)(mitochondrial)
637910.ROD_20451+(ER)
637910.ROD_18201(+)+(mitochondrial)
637910.ROD_48901(+)++
637910.ROD_07061+(PF01609)
637910.ROD_17191+(plastid)
637910.ROD_32161+(mitochondrial)
637910.ROD_32901+(ER)
637910.ROD_45241+(mitochondrial)
637910.ROD_50021+
637910.ROD_08421+
637910.ROD_48781(PF01527)
637910.ROD_41941+
637910.ROD_26451(PF01527)
637910.ROD_10841+
637910.ROD_38831(PF01527)
637910.ROD_40351+
637910.ROD_08291(PF00923)
637910.ROD_46921+
637910.ROD_07731+
637910.ROD_24741(>)
637910.ROD_18301+
637910.ROD_42121+
637910.ROD_41801(PF01609)
637910.ROD_22981+
637910.ROD_33421(+)(PF13910)
637910.ROD_01171(PF13347)
637910.ROD_25561(+)+
637910.ROD_42681+
637910.ROD_21601+
637910.ROD_01201(PF00456)
637910.ROD_04851+
637910.ROD_40511(>)
637910.ROD_36661+
637910.ROD_31811+
637910.ROD_34311+
637910.ROD_17701(<)
637910.ROD_45911+
637910.ROD_09511+
637910.ROD_40691(PF01527)
637910.ROD_24951(PF02371)
637910.ROD_48681+
637910.ROD_10871(+)(ER)
637910.ROD_23631(PF01527)
637910.ROD_19871+
637910.ROD_32071(+)(plastid)
637910.ROD_02501+
637910.ROD_47351+
637910.ROD_29261(+)(>)
637910.ROD_28391(PF02371)
637910.ROD_49661+
637910.ROD_50131(PF01527)
637910.ROD_15381+
637910.ROD_50591(PF00923)
637910.ROD_27631(PF03797)
637910.ROD_35301(PF01527)
637910.ROD_01351(PF02371)
637910.ROD_38491+
637910.ROD_14891+
637910.ROD_17121+
637910.ROD_36301+
637910.ROD_03871+
637910.ROD_18991(+)(plastid)
637910.ROD_39361(PF02371)
637910.ROD_42321(PF13347)
637910.ROD_47631(PF01228)
637910.ROD_15391+
637910.ROD_00481(PF02371)
637910.ROD_22661+
637910.ROD_46581+
637910.ROD_14971+
637910.ROD_46161+
637910.ROD_38021(PF02371)
637910.ROD_41191+
637910.ROD_01531+
637910.ROD_13741+
637910.ROD_30011(PF07720)
637910.ROD_17381+
637910.ROD_50071+
637910.ROD_31301(>)
637910.ROD_11381+
637910.ROD_00321+
637910.ROD_32411+
637910.ROD_17611+
637910.ROD_08131(PF01609)
637910.ROD_22521+
637910.ROD_30161PF03050
637910.ROD_19071+
637910.ROD_47751(PF01527)
637910.ROD_14101+
637910.ROD_00251+
637910.ROD_07561+
637910.ROD_21871+
637910.ROD_47281+
637910.ROD_34671(PF02371)
637910.ROD_47371+
637910.ROD_41321+
637910.ROD_13911PF03050
637910.ROD_41921(PF06176)
637910.ROD_29661(PF01527)
637910.ROD_20701+
637910.ROD_50111PF03050
637910.ROD_29151(PF00577)
637910.ROD_05951+
637910.ROD_36251PF03050
637910.ROD_39691(>)
637910.ROD_15611+
637910.ROD_18841+
637910.ROD_25241(PF01228)
637910.ROD_04571(>)
637910.ROD_10391+
637910.ROD_35691(+)(mitochondrial)
637910.ROD_36741(+)(mitochondrial)
637910.ROD_36541+
637910.ROD_15281(>)
637910.ROD_26411PF03050
637910.ROD_48431+
637910.ROD_25151(>)
637910.ROD_41421+
637910.ROD_22461(PF13347)
637910.ROD_26361(PF01527)
637910.ROD_08271(PF01228)
637910.ROD_49971+
637910.ROD_46031(+)(ER)
637910.ROD_29751+
637910.ROD_22841(PF01609)
637910.ROD_21391(>)
637910.ROD_02201+
637910.ROD_27881+
637910.ROD_09201+
637910.ROD_29481+
637910.ROD_37801(>)
637910.ROD_27861(PF11397)
637910.ROD_00061(PF00923)
637910.ROD_31691+
637910.ROD_35531+
637910.ROD_10231(+)(<)
637910.ROD_36621(+)(plastid)
637910.ROD_49911+
637910.ROD_47811+
637910.ROD_11421+
637910.ROD_39241+
637910.ROD_03401+
637910.ROD_28251(PF01527)
637910.ROD_37371(PF02371)
637910.ROD_47771+
637910.ROD_24861+
637910.ROD_12881(PF01527)
637910.ROD_12861PF03050
637910.ROD_19501+
637910.ROD_03651(PF00577)
637910.ROD_01901(PF01527)
637910.ROD_24121(PF00923)
637910.ROD_06431PF03050
637910.ROD_24511(+)(PF16485)
637910.ROD_13931(PF01527)
637910.ROD_13591+
637910.ROD_42651+
637910.ROD_05021+
637910.ROD_30771+
637910.ROD_29731+
637910.ROD_05791+
637910.ROD_23381(+)+
637910.ROD_30591+
637910.ROD_05371+
637910.ROD_30601+
637910.ROD_31731+
637910.ROD_38721+
637910.ROD_09011(PF01527)
637910.ROD_40711PF03050
637910.ROD_05771(PF01527)
637910.ROD_06841(PF01527)
637910.ROD_10351PF03050
637910.ROD_48671(>)
637910.ROD_47701+
637910.ROD_03501+
637910.ROD_12071+
637910.ROD_16511+
637910.ROD_25581+
637910.ROD_28281+
637910.ROD_48871+
637910.ROD_24501(+)(mitochondrial)
637910.ROD_40601+
637910.ROD_38111+
637910.ROD_14841(PF13347)
637910.ROD_30291(PF02371)
637910.ROD_00991+
637910.ROD_05901(PF00456)
637910.ROD_09821(+)+
637910.ROD_27751+
637910.ROD_09221+
637910.ROD_39771+
637910.ROD_36421+
637910.ROD_05581+
637910.ROD_35551(>)
637910.ROD_49421+
637910.ROD_38421+
637910.ROD_19421+
637910.ROD_20401+
637910.ROD_14691+
637910.ROD_11501+
637910.ROD_48061+
637910.ROD_14941+
637910.ROD_33101+
637910.ROD_34391+
637910.ROD_23501+
637910.ROD_18741+
637910.ROD_16521(PF01527)
637910.ROD_07631+
637910.ROD_12201(PF02371)
637910.ROD_08991PF03050
637910.ROD_01921PF03050
637910.ROD_06451(PF01527)
637910.ROD_21691+
637910.ROD_50081(+)(plastid)
637910.ROD_27211(PF13347)
637910.ROD_05351+
637910.ROD_30131+
637910.ROD_12541+
637910.ROD_20561+
637910.ROD_31391+
637910.ROD_33301(>)
637910.ROD_31881(PF01527)
637910.ROD_10111+
637910.ROD_38411+
637910.ROD_29971+
637910.ROD_18931+
637910.ROD_41621+
637910.ROD_04401(PF02371)
637910.ROD_10371(PF01527)
637910.ROD_49071+
637910.ROD_44361+
637910.ROD_45981(+)(mitochondrial)
637910.ROD_33821(PF01527)
637910.ROD_44741(+)(mitochondrial)
637910.ROD_03191+
637910.ROD_45761+
637910.ROD_43641(+)(PF03222)
637910.ROD_02571+
637910.ROD_14861+
637910.ROD_01061+
637910.ROD_05471+
637910.ROD_03371(>)
637910.ROD_02391+
637910.ROD_01591+
637910.ROD_02151+
637910.ROD_31891PF03050
637910.ROD_13771+
637910.ROD_49711+
637910.ROD_11361(PF01609)
637910.ROD_39041+not used
637910.ROD_27021(PF00456)
637910.ROD_35971(PF02371)
637910.ROD_18161(PF00577)
637910.ROD_41501(>)
637910.ROD_10781(+)(>)
637910.ROD_47731PF03050
637910.ROD_26481PF03050
637910.ROD_03611(PF03797)
637910.ROD_46631(<)
637910.ROD_17921+
637910.ROD_02711(PF01609)
637910.ROD_22921+
637910.ROD_21211+
637910.ROD_17811(<)
637910.ROD_24251+
637910.ROD_02361+
637910.ROD_07231+
637910.ROD_23961(>)
637910.ROD_42841+
637910.ROD_42611(PF01609)
637910.ROD_20761(<)
637910.ROD_38501(<)
637910.ROD_27841+
637910.ROD_12551+
637910.ROD_29771(+)(<)
637910.ROD_41461(>)
637910.ROD_45531+
637910.ROD_14201+
637910.ROD_21541+
637910.ROD_25871+not used
637910.ROD_50601(PF00456)
637910.ROD_50511(PF00456)
637910.ROD_03961(<)
637910.ROD_09721(PF01228)
637910.ROD_41891(<)
637910.ROD_32461+
637910.ROD_33361+
637910.ROD_23201(+)(ER)
637910.ROD_11041+
637910.ROD_46871+
637910.ROD_28321PF03050
637910.ROD_38891(PF13347)
637910.ROD_00391+
637910.ROD_19221(PF13347)
637910.ROD_12961(PF02371)
637910.ROD_32731(PF13347)
637910.ROD_21361+
637910.ROD_14511(+)(<)
637910.ROD_06241+
637910.ROD_45691+
637910.ROD_13561(PF13347)
637910.ROD_46421+
637910.ROD_03151+
637910.ROD_24321+
637910.ROD_30251+
637910.ROD_41201+
637910.ROD_42401+
637910.ROD_40551(>)
637910.ROD_41051+
637910.ROD_49861(PF01527)
637910.ROD_15431+
637910.ROD_36731+
637910.ROD_34501+
637910.ROD_37041+
637910.ROD_40121(PF01609)
637910.ROD_45821(PF01527)
637910.ROD_33031(PF02371)
637910.ROD_49681+
637910.ROD_43401+
637910.ROD_11431+
637910.ROD_23011(PF02371)
637910.ROD_38881(PF13347)
637910.ROD_07821(<)
637910.ROD_28301(PF01527)
637910.ROD_28231PF03050
637910.ROD_05291+
637910.ROD_24131(PF00456)
637910.ROD_01701+
637910.ROD_34341(PF01527)
637910.ROD_37981(PF00923)
637910.ROD_15701(<)
637910.ROD_30081+
637910.ROD_40941+
637910.ROD_09411+
637910.ROD_16181+
637910.ROD_43941+
637910.ROD_41301(PF03797)
637910.ROD_06821PF03050
637910.ROD_38691+
637910.ROD_36231(PF01527)
637910.ROD_49031+
637910.ROD_16861+
637910.ROD_11331(PF02371)
637910.ROD_11441+
637910.ROD_00571+
637910.ROD_23001(PF02371)
637910.ROD_08141(+)(mitochondrial)
637910.ROD_19931(+)+
637910.ROD_38851PF03050
637910.ROD_12161(PF02371)
637910.ROD_47091(PF01609)
637910.ROD_21951+
637910.ROD_37251+
637910.ROD_34181+
637910.ROD_12741+
637910.ROD_33541+
637910.ROD_30501(+)mitochondrial
637910.ROD_30181(PF01527)
637910.ROD_05271+
637910.ROD_27661+
637910.ROD_28921(+)+
637910.ROD_25311(PF01609)
637910.ROD_29851+
637910.ROD_11691+
637910.ROD_32341+
637910.ROD_45801PF03050
637910.ROD_28361+
637910.ROD_26441(PF01527)
637910.ROD_23611PF03050
637910.ROD_12911PF15612
637910.ROD_19321(+)plastid
637910.ROD_41021+
637910.ROD_25331+
637910.ROD_03031+
637910.ROD_08821+
637910.ROD_18321(<)
637910.ROD_34321PF03050
637910.ROD_41591(PF13347)
637910.ROD_26311+
637910.ROD_09431+
637910.ROD_37321+
637910.ROD_13241+
637910.ROD_18951(PF01609)
637910.ROD_35321PF03050
637910.ROD_17531(PF01609)
637910.ROD_27051(+)
637910.ROD_40171(+)
637910.ROD_04021(+)
637910.ROD_19911(+)
637910.ROD_25501(+)
637910.ROD_06991(+)
637910.ROD_34351(+)
637910.ROD_03111(+)
637910.ROD_07751(+)
637910.ROD_09771(+)
637910.ROD_25961(+)
637910.ROD_21371(+)
637910.ROD_12111(+)
637910.ROD_42111(+)
637910.ROD_17891(+)
637910.ROD_26551(+)
637910.ROD_26881(+)
637910.ROD_02471(+)
637910.ROD_34301(+)
637910.ROD_46171(+)
637910.ROD_46771(+)
637910.ROD_45261(+)
637910.ROD_24391(+)
637910.ROD_36891(+)
637910.ROD_04331(+)
637910.ROD_37781(+)
637910.ROD_31341(+)
637910.ROD_16131(+)
637910.ROD_02891(+)
637910.ROD_19641(+)
637910.ROD_39701(+)
637910.ROD_13091(+)
637910.ROD_00661(+)
637910.ROD_22861(+)
637910.ROD_07971(+)
637910.ROD_50691(+)
637910.ROD_15321(+)
637910.ROD_39681(+)
637910.ROD_06961(+)
637910.ROD_15541(+)
637910.ROD_35511(+)
637910.ROD_36641(+)
637910.ROD_49111(+)
637910.ROD_10921(+)
637910.ROD_25171(+)
637910.ROD_26571(+)
637910.ROD_32501(+)
637910.ROD_38011(+)
637910.ROD_24021(+)
637910.ROD_46021(+)
637910.ROD_03321(+)
637910.ROD_38161(+)
637910.ROD_27541(+)
637910.ROD_10661(+)
637910.ROD_29931(+)
637910.ROD_17751(+)
637910.ROD_40481(+)
637910.ROD_08831(+)
637910.ROD_08011(+)
637910.ROD_43471(+)
637910.ROD_40061(+)
637910.ROD_02421(+)
637910.ROD_38001(+)
637910.ROD_15991(+)
637910.ROD_30581(+)
637910.ROD_25251(+)
637910.ROD_36751(+)
637910.ROD_18381(+)
637910.ROD_49131(+)
637910.ROD_45831(+)
637910.ROD_33871(+)
637910.ROD_33691(+)
637910.ROD_48221(+)
637910.ROD_07541(+)
637910.ROD_26121(+)
637910.ROD_06231(+)
637910.ROD_31321(+)
637910.ROD_00451(+)
637910.ROD_44951(+)
637910.ROD_40891(+)
637910.ROD_30801(+)
637910.ROD_20611(+)
637910.ROD_03601(+)
637910.ROD_50261(+)
637910.ROD_09231(+)
637910.ROD_00871(+)
637910.ROD_13331(+)
637910.ROD_10001(+)
637910.ROD_23881(+)
637910.ROD_08471(+)
637910.ROD_08071(+)
637910.ROD_49301(+)
637910.ROD_47231(+)
637910.ROD_11571(+)
637910.ROD_02171(+)
637910.ROD_09641(+)
637910.ROD_16781(+)
637910.ROD_37771(+)
637910.ROD_45081(+)
637910.ROD_29961(+)
637910.ROD_41721(+)
637910.ROD_03631(+)
637910.ROD_22761(+)
637910.ROD_32671(+)
637910.ROD_16231(+)
637910.ROD_08221(+)
637910.ROD_48841(+)
637910.ROD_03741(+)not used
637910.ROD_40381(+)not used
637910.ROD_13001(+)
637910.ROD_40871(+)not used
637910.ROD_34171(+)
637910.ROD_03161(+)
637910.ROD_28161(+)
637910.ROD_01101(+)
637910.ROD_14871(+)
637910.ROD_27501(+)
637910.ROD_50401(+)
637910.ROD_38631(+)
637910.ROD_40901(+)not used
637910.ROD_43011(+)
637910.ROD_39121(+)
637910.ROD_07531(+)
637910.ROD_40021(+)
637910.ROD_23991(+)
637910.ROD_32541(+)
637910.ROD_28771(+)
637910.ROD_08231+
637910.ROD_21591(+)
637910.ROD_46671(+)
637910.ROD_43731(+)
637910.ROD_13491(+)
637910.ROD_03171(+)
637910.ROD_36951(+)
637910.ROD_06871(+)
637910.ROD_41071(+)
637910.ROD_48311(+)
637910.ROD_27331(+)
637910.ROD_36711(+)
637910.ROD_43001(+)
637910.ROD_04041(+)
637910.ROD_04201(+)
637910.ROD_11191(+)
637910.ROD_36851(+)
637910.ROD_19961(+)
637910.ROD_32491(+)
637910.ROD_48821(+)
637910.ROD_06671(+)
637910.ROD_06471(+)
637910.ROD_38241(+)
637910.ROD_38651(+)
637910.ROD_30391(+)
637910.ROD_13541(+)
637910.ROD_17261(+)not used
637910.ROD_16111(+)
637910.ROD_25891(+)
637910.ROD_35961(+)
637910.ROD_08881(+)
637910.ROD_09031(+)
637910.ROD_08431(+)
637910.ROD_13811(+)
637910.ROD_31101(+)
637910.ROD_07961(+)
637910.ROD_31911(+)
637910.ROD_48831(+)
637910.ROD_07261(+)
637910.ROD_34081(+)
637910.ROD_41491(+)
637910.ROD_20931(+)
637910.ROD_29401(+)
637910.ROD_03391(+)
637910.ROD_05101(+)
637910.ROD_09261(+)
637910.ROD_13211(+)
637910.ROD_31611(+)
637910.ROD_38461(+)
637910.ROD_10321(+)
637910.ROD_48481(+)
637910.ROD_47681(+)
637910.ROD_24911(+)
637910.ROD_47261(+)
637910.ROD_05921(+)
637910.ROD_21301(+)
637910.ROD_00761(+)
637910.ROD_34431(+)
637910.ROD_17161(+)
637910.ROD_15741(+)
637910.ROD_04911(+)
637910.ROD_23821(+)
637910.ROD_16641(+)
637910.ROD_49241(+)
637910.ROD_24591(+)
637910.ROD_19781(+)
637910.ROD_08381(+)
637910.ROD_34571(+)
637910.ROD_07831(+)
637910.ROD_26021(+)
637910.ROD_32271(+)
637910.ROD_13501(+)
637910.ROD_13691(+)
637910.ROD_24341(+)not used
637910.ROD_09091(+)
637910.ROD_30271(+)
637910.ROD_35751(+)
637910.ROD_42951(+)
637910.ROD_26011(+)
637910.ROD_37581(+)
637910.ROD_07701(+)
637910.ROD_36591(+)
637910.ROD_10631(+)
637910.ROD_10981(+)
637910.ROD_42341(+)not used
637910.ROD_50701(+)
637910.ROD_19141(+)
637910.ROD_28781(+)
637910.ROD_37431(+)
637910.ROD_26222(+)not used
637910.ROD_26221(+)not used
637910.ROD_23031(+)
637910.ROD_43891(+)
637910.ROD_01761(+)
637910.ROD_40611(+)
637910.ROD_04842(+)
637910.ROD_50551(+)
637910.ROD_29991(+)
637910.ROD_20671(+)

Detailed merged results for each protein sequence

Individual results for each protein sequence

Genome based results

Summary

  • Gram negative: YES (FDR = 0.5 %)
  • Functional Type III secretion system: YES (FDR = 12.5 %)
    Estimated copy number = 1.3 (13/10 KEGG proteins)
  • Functional Type IV secretion system: YES (FDR = 7.2 %)
    Estimated copy number = 0.0 (0/10 KEGG proteins)
  • Functional Type VI secretion system: NO (FDR = 7.7 %)

Individual results for each secretion system

Parameters:

==========================================================
EFFECTIVE_T3_OLD=selective
EFFECTIVE_T3_NEW=selective
PREDOTAR_ANIMAL_OR_PLANT=a
PROTEINS=INPUT PROTEINS
MODUS=genome
RUN_PREDOTAR=T
RUN_EFFECTIVE_T3=T
RUN_T4SEpre=0.5
RUN_EFFECTIVE_CCBD=T
RUN_EFFECTIVE_ELD=4
CheckM_COMPLETENESS=
RUN_EffectiveS346=T
GENOTYPE=COG Profile
EMAIL=
==========================================================