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Effective results for Eggerthella sp. YY7918 (eggnog40)

Summary

Number of putative secreted proteins: 164
- Predicted by T4SEpre: 0
- Predicted by EffectiveELD: 23 eukaryotic-like domains, contained in 164 proteins (75 high, 89 medium Z-score)
Predicted protein secretion systems (parentheses indicate weak positive predictions lacking more than 50% of core proteins of a secretion system): None

Protein based results

Putative secreted proteins (weak evidence indicated by parentheses)

ProteinEffectiveT3EffectiveCCBDT4SEpreEffectiveELDPredotar
502558.EGYY_01910(PF00384) (PF04879) (PF01568)(mitochondrial)
502558.EGYY_27580(PF00384) (PF04879) (PF01568)mitochondrial
502558.EGYY_03840(PF00384) (PF04879) (PF01568)mitochondrial; (mitochondrial)
502558.EGYY_26070(PF00384) (PF04879) (PF01568)mitochondrial; (mitochondrial)
502558.EGYY_27260(PF00384) (PF04879) (PF01568)mitochondrial
502558.EGYY_24770(PF00384) (PF04879) (PF01568)(ER)
502558.EGYY_22490(PF00384) (PF01568)(mitochondrial)
502558.EGYY_18540(PF00384) (PF04879) (PF01568)
502558.EGYY_19010PF00890ER; (ER)
502558.EGYY_07400PF00890(mitochondrial)
502558.EGYY_05480(PF00384) (PF04879)plastid
502558.EGYY_05130(PF02361)(ER)
502558.EGYY_24050PF00890(mitochondrial)
502558.EGYY_06130PF00890mitochondrial; (mitochondrial)
502558.EGYY_05730PF00890ER
502558.EGYY_21500PF00890ER; (mitochondrial)
502558.EGYY_13270(PF00384) (PF04879) (PF01568)
502558.EGYY_27220(PF00037)(mitochondrial)
502558.EGYY_22790PF00890(ER); ER
502558.EGYY_03850(PF00037)ER
502558.EGYY_22930(PF00384) (PF04879) (PF01568)
502558.EGYY_26430PF00890(mitochondrial)
502558.EGYY_26330PF00890(mitochondrial); (ER)
502558.EGYY_07020(PF00384) (PF04879) (PF01568)
502558.EGYY_17280(PF00384) (PF04879) (PF01568)
502558.EGYY_19520PF00890mitochondrial; (mitochondrial)
502558.EGYY_06270(PF00037)ER
502558.EGYY_26680PF00890(mitochondrial)
502558.EGYY_26400PF00890ER; (ER)
502558.EGYY_03360PF00890mitochondrial
502558.EGYY_28410PF00890mitochondrial; (mitochondrial)
502558.EGYY_08210(PF00384) (PF04879) (PF01568)
502558.EGYY_16310PF00890ER
502558.EGYY_24720(PF00384) (PF04879) (PF01568)
502558.EGYY_14780(PF06541)ER
502558.EGYY_16890(PF06541)ER
502558.EGYY_05810(PF00384) (PF04879) (PF01568)
502558.EGYY_18190(PF00384) (PF04879) (PF01568)
502558.EGYY_20570PF00890(mitochondrial)
502558.EGYY_07950PF00890(ER)
502558.EGYY_01490PF00890(ER)
502558.EGYY_08100PF00890(mitochondrial)
502558.EGYY_27100PF00890(ER)
502558.EGYY_26720PF00890(mitochondrial)
502558.EGYY_11420(PF00766) (PF01012)
502558.EGYY_21970PF00890(ER)
502558.EGYY_06560(PF02361)(plastid)
502558.EGYY_02710PF00890(ER)
502558.EGYY_00170PF02407 PF00910
502558.EGYY_17800(PF00185) (PF02729)
502558.EGYY_18960(PF00185) (PF02729)
502558.EGYY_24610PF00890(mitochondrial)
502558.EGYY_10100(PF00384) (PF01568)
502558.EGYY_15770(PF00766) (PF01012)
502558.EGYY_27350(PF00766) (PF01012)
502558.EGYY_08400(PF00185) (PF02729)
502558.EGYY_27960(PF13597)(mitochondrial)
502558.EGYY_06780(PF00766) (PF01012)
502558.EGYY_05780PF00890(ER)
502558.EGYY_14710(PF00185) (PF02729)
502558.EGYY_15970(PF02361)(mitochondrial)
502558.EGYY_18280(PF00766) (PF01012)
502558.EGYY_00550(PF03432)(mitochondrial)
502558.EGYY_23260PF00890(ER)
502558.EGYY_02300(PF00185) (PF02729)
502558.EGYY_03310PF00890(ER)
502558.EGYY_24210PF00890(plastid)
502558.EGYY_17860(PF00766) (PF01012)
502558.EGYY_00320(PF02361)(ER)
502558.EGYY_17090PF00890(mitochondrial)
502558.EGYY_03010PF00890(ER)
502558.EGYY_08440(PF00185) (PF02729)
502558.EGYY_23140(PF00037)(mitochondrial)
502558.EGYY_08250PF00890(ER)
502558.EGYY_02730PF00890(mitochondrial)
502558.EGYY_08490(PF00185) (PF02729)
502558.EGYY_05490(PF00384) (PF01568)
502558.EGYY_05230(PF02361)(mitochondrial)
502558.EGYY_22730(PF00037)(ER)
502558.EGYY_23480(PF00384) (PF01568)
502558.EGYY_27030PF00890
502558.EGYY_22990PF00890
502558.EGYY_29520(PF14022)
502558.EGYY_01900(PF00037)
502558.EGYY_18490PF00890
502558.EGYY_23050PF00890
502558.EGYY_16160PF00890
502558.EGYY_22870(PF01568)
502558.EGYY_24440(PF05697)
502558.EGYY_08830PF00890
502558.EGYY_15220(PF03432)
502558.EGYY_15530(PF02361)
502558.EGYY_11430(PF01012)
502558.EGYY_23910PF00890
502558.EGYY_27340(PF01012)
502558.EGYY_29030PF00890
502558.EGYY_22880(PF00384)
502558.EGYY_28670PF00890
502558.EGYY_26980(PF13597)
502558.EGYY_24800(PF00958)
502558.EGYY_12510(PF00037)
502558.EGYY_26310(PF13151)
502558.EGYY_21330PF00890
502558.EGYY_23680(PF12437)
502558.EGYY_20790PF06355
502558.EGYY_22480(PF00037)
502558.EGYY_27540PF00890
502558.EGYY_28270PF00890
502558.EGYY_22000PF00890
502558.EGYY_18750(PF05697)
502558.EGYY_11060(PF06541)
502558.EGYY_03990PF00890
502558.EGYY_15760PF00890
502558.EGYY_29480(PF03432)
502558.EGYY_28510(PF03432)
502558.EGYY_13280(PF00037)
502558.EGYY_16950PF00890
502558.EGYY_23080PF00890
502558.EGYY_26140(PF02361)
502558.EGYY_29070PF00890
502558.EGYY_20670(PF06541)
502558.EGYY_15100(PF00958)
502558.EGYY_02970PF00890
502558.EGYY_12820(PF02873)
502558.EGYY_23400PF00890
502558.EGYY_20190(PF00037)
502558.EGYY_01330(PF00037)
502558.EGYY_11900(PF03432)
502558.EGYY_03810(PF00037)
502558.EGYY_04520PF00890
502558.EGYY_24560PF00890
502558.EGYY_04910(PF03432)
502558.EGYY_04590PF00890
502558.EGYY_20230(PF12437)
502558.EGYY_00580(PF14022)
502558.EGYY_23980PF00890
502558.EGYY_17870(PF01012)
502558.EGYY_21260(PF02361)
502558.EGYY_21600PF00890
502558.EGYY_28600(PF14249)
502558.EGYY_24230PF00890
502558.EGYY_23280PF00890
502558.EGYY_27070PF00890
502558.EGYY_05750PF00890
502558.EGYY_18180(PF00037)
502558.EGYY_22760PF00890
502558.EGYY_15780(PF01012)
502558.EGYY_09610(PF02873)
502558.EGYY_26390PF00890
502558.EGYY_08670PF00890
502558.EGYY_08270(PF00037)
502558.EGYY_22830PF00890
502558.EGYY_24710(PF00037)
502558.EGYY_04560(PF13597)
502558.EGYY_13420PF00890
502558.EGYY_18260(PF01012)
502558.EGYY_01040PF00890
502558.EGYY_16660PF00890
502558.EGYY_23710PF00890
502558.EGYY_06770(PF01012)
502558.EGYY_27690PF00890
502558.EGYY_27000PF00890
502558.EGYY_02640PF00890
502558.EGYY_10780PF00890

Detailed merged results for each protein sequence

Individual results for each protein sequence

Genome based results

Summary

  • Gram negative: NO (FDR = 0.5 %)
  • Functional Type III secretion system: N.D.
  • Functional Type IV secretion system: NO (FDR = 7.2 %)
  • Functional Type VI secretion system: N.D.

Individual results for each secretion system

Parameters:

==========================================================
EFFECTIVE_T3_OLD=selective
EFFECTIVE_T3_NEW=selective
PREDOTAR_ANIMAL_OR_PLANT=a
PROTEINS=INPUT PROTEINS
MODUS=genome
RUN_PREDOTAR=T
RUN_EFFECTIVE_T3=T
RUN_T4SEpre=0.5
RUN_EFFECTIVE_CCBD=T
RUN_EFFECTIVE_ELD=4
CheckM_COMPLETENESS=
RUN_EffectiveS346=T
GENOTYPE=COG Profile
EMAIL=
==========================================================