Effective results for Mesorhizobium opportunistum WSM2075 (eggnog40)
Summary
Number of putative secreted proteins: 950
- Predicted by EffectiveT3: 162 (high confidence), 310 (low confidence)
- Predicted by EffectiveCCBD: 38 within, 17 before, 44 behind expected region 25..70aa
- Predicted by T4SEpre: 96
- Predicted by EffectiveELD: 54 eukaryotic-like domains, contained in 356 proteins (5 high, 351 medium Z-score)
Predicted protein secretion systems (parentheses indicate weak positive predictions lacking more than 50% of core proteins of a secretion system): (Type III), Type IV, (Type VI)
Protein based results
Putative secreted proteins (weak evidence indicated by parentheses)
| Protein | EffectiveT3 | EffectiveCCBD | T4SEpre | EffectiveELD | Predotar |
|---|---|---|---|---|---|
| 536019.Mesop_6323 | (PF08669) (PF01571) (PF16350) | (ER) | |||
| 536019.Mesop_3464 | (PF08669) (PF01571) (PF16350) | ER | |||
| 536019.Mesop_3820 | (PF08669) (PF01571) (PF16350) | (mitochondrial) | |||
| 536019.Mesop_2336 | + | + | (PF09587) | (mitochondrial) | |
| 536019.Mesop_3949 | (PF14295) (PF00656) (PF00024) | mitochondrial | |||
| 536019.Mesop_5916 | (PF08669) (PF01571) (PF16350) | (ER) | |||
| 536019.Mesop_3782 | (PF08669) (PF01571) (PF16350) | (ER) | |||
| 536019.Mesop_0158 | (PF08669) (PF01571) (PF16350) | (ER) | |||
| 536019.Mesop_3570 | (PF08669) (PF01571) (PF16350) | ER | |||
| 536019.Mesop_3876 | (PF08669) (PF01571) (PF16350) | (ER) | |||
| 536019.Mesop_0585 | + | (PF02653) | ER | ||
| 536019.Mesop_0160 | + | (PF01633) | (ER) | ||
| 536019.Mesop_1747 | + | (PF09587) | ER | ||
| 536019.Mesop_1103 | + | (PF13407) | ER | ||
| 536019.Mesop_2663 | (>) | (PF02653) | (ER); plastid | ||
| 536019.Mesop_2660 | + | (PF13407) | ER | ||
| 536019.Mesop_0498 | + | (PF02653) | ER | ||
| 536019.Mesop_1993 | + | (>) | (mitochondrial); plastid | ||
| 536019.Mesop_1860 | (PF08669) (PF01571) | (mitochondrial) | |||
| 536019.Mesop_4020 | (PF13407) | ER; mitochondrial | |||
| 536019.Mesop_6308 | (<) | ER | |||
| 536019.Mesop_1843 | (<) | ER | |||
| 536019.Mesop_4495 | (PF02653) | ER | |||
| 536019.Mesop_4494 | (PF02653) | mitochondrial | |||
| 536019.Mesop_1678 | (PF13407) | ER | |||
| 536019.Mesop_1679 | + | (>) | (PF02653) | ||
| 536019.Mesop_0674 | (PF02653) | ER | |||
| 536019.Mesop_5757 | (PF02653) | ER | |||
| 536019.Mesop_5756 | (PF13407) | ER | |||
| 536019.Mesop_3693 | (PF06455) | ER | |||
| 536019.Mesop_6321 | + | mitochondrial | |||
| 536019.Mesop_5982 | (PF08402) | (mitochondrial) | |||
| 536019.Mesop_0586 | (PF02653) | ER | |||
| 536019.Mesop_0053 | + | (mitochondrial); (plastid) | |||
| 536019.Mesop_0056 | + | ER | |||
| 536019.Mesop_2753 | + | ER | |||
| 536019.Mesop_3823 | (PF08669) (PF01571) (PF16350) | ||||
| 536019.Mesop_0260 | PF03452 | (mitochondrial) | |||
| 536019.Mesop_2285 | (PF00112) | mitochondrial | |||
| 536019.Mesop_2773 | (PF02653) | ER | |||
| 536019.Mesop_2774 | (PF02653) | mitochondrial | |||
| 536019.Mesop_2776 | (PF13407) | ER | |||
| 536019.Mesop_2368 | (PF04752) | (ER); (mitochondrial) | |||
| 536019.Mesop_5719 | + | ER | |||
| 536019.Mesop_1151 | (>) | ER | |||
| 536019.Mesop_4012 | (PF02653) | (mitochondrial); plastid | |||
| 536019.Mesop_4010 | (PF13407) | ER | |||
| 536019.Mesop_5260 | PF06482 | ER | |||
| 536019.Mesop_5869 | (PF02653) | ER | |||
| 536019.Mesop_4678 | (PF04828) | (mitochondrial) | |||
| 536019.Mesop_5901 | (PF08402) | (mitochondrial) | |||
| 536019.Mesop_2227 | + | ER; (ER) | |||
| 536019.Mesop_3831 | (>) | ER | |||
| 536019.Mesop_3064 | (PF02653) | ER | |||
| 536019.Mesop_3050 | (PF13407) | ER | |||
| 536019.Mesop_3616 | + | ER | |||
| 536019.Mesop_1751 | (PF00656) | mitochondrial | |||
| 536019.Mesop_0502 | (PF13407) | ER | |||
| 536019.Mesop_0507 | (PF02746) | ER | |||
| 536019.Mesop_0501 | (PF13407) | ER | |||
| 536019.Mesop_4693 | + | (mitochondrial) | |||
| 536019.Mesop_4692 | + | mitochondrial; (mitochondrial) | |||
| 536019.Mesop_1324 | + | ER | |||
| 536019.Mesop_2676 | (PF02653) | (ER); (plastid) | |||
| 536019.Mesop_2679 | (PF02653) | ER | |||
| 536019.Mesop_0933 | (PF01321) | (mitochondrial) | |||
| 536019.Mesop_0522 | (PF13407) | ER | |||
| 536019.Mesop_0520 | (PF02653) | ER | |||
| 536019.Mesop_4458 | + | ER; (ER) | |||
| 536019.Mesop_6476 | (+) | + | (mitochondrial); (plastid) | ||
| 536019.Mesop_1492 | (PF08402) | (mitochondrial) | |||
| 536019.Mesop_4159 | + | ER | |||
| 536019.Mesop_5879 | (PF02653) | ER | |||
| 536019.Mesop_2521 | (PF02653) | ER | |||
| 536019.Mesop_2650 | (PF04191) | ER | |||
| 536019.Mesop_3404 | (PF13407) | ER | |||
| 536019.Mesop_2884 | (PF13407) | ER | |||
| 536019.Mesop_6599 | (PF02653) | ER | |||
| 536019.Mesop_1516 | + | ER; (ER) | |||
| 536019.Mesop_6597 | (PF13407) | ER | |||
| 536019.Mesop_1474 | + | ER | |||
| 536019.Mesop_6623 | (+) | (PF13407) | mitochondrial; (mitochondrial) | ||
| 536019.Mesop_1106 | (PF02653) | ER | |||
| 536019.Mesop_1105 | (PF02653) | (ER); (plastid) | |||
| 536019.Mesop_2403 | (>) | (ER) | |||
| 536019.Mesop_5187 | + | mitochondrial | |||
| 536019.Mesop_1533 | (PF13407) | ER | |||
| 536019.Mesop_6182 | + | ER | |||
| 536019.Mesop_0722 | + | ER; (ER) | |||
| 536019.Mesop_4774 | + | ER | |||
| 536019.Mesop_3564 | (PF06736) | ER; (ER) | |||
| 536019.Mesop_5935 | + | (mitochondrial); (plastid) | |||
| 536019.Mesop_5878 | (PF02653) | ER | |||
| 536019.Mesop_3840 | (PF08669) (PF01571) (PF16350) | ||||
| 536019.Mesop_2003 | + | (mitochondrial); plastid | |||
| 536019.Mesop_2140 | (PF02653) | ER; (ER) | |||
| 536019.Mesop_1387 | (PF07931) | (mitochondrial) | |||
| 536019.Mesop_5061 | + | ER | |||
| 536019.Mesop_5700 | (PF13407) | ER | |||
| 536019.Mesop_6006 | (PF08402) | (mitochondrial) | |||
| 536019.Mesop_6000 | (PF13407) | ER | |||
| 536019.Mesop_1835 | (PF02653) | ER | |||
| 536019.Mesop_3291 | (PF02653) | ER | |||
| 536019.Mesop_3293 | (PF13407) | ER | |||
| 536019.Mesop_5628 | + | mitochondrial | |||
| 536019.Mesop_1629 | + | (mitochondrial) | |||
| 536019.Mesop_2820 | (PF02653) | (ER) | |||
| 536019.Mesop_3883 | (<) | + | (PF08695) | ||
| 536019.Mesop_3271 | (PF13407) | ER | |||
| 536019.Mesop_4262 | + | ER; (mitochondrial) | |||
| 536019.Mesop_5743 | (PF08669) (PF01571) | (plastid) | |||
| 536019.Mesop_5221 | + | mitochondrial | |||
| 536019.Mesop_4852 | (PF02653) | ER | |||
| 536019.Mesop_4851 | (PF13407) | ER | |||
| 536019.Mesop_1643 | (PF00656) | ER | |||
| 536019.Mesop_6541 | (>) | (ER); ER | |||
| 536019.Mesop_1784 | + | ER | |||
| 536019.Mesop_2867 | (PF08402) | (ER) | |||
| 536019.Mesop_2860 | (PF13407) | ER | |||
| 536019.Mesop_4018 | (PF02653) | ER | |||
| 536019.Mesop_5766 | (PF02653) | mitochondrial; (mitochondrial) | |||
| 536019.Mesop_5764 | (PF13407) | ER | |||
| 536019.Mesop_5768 | (PF13407) | ER | |||
| 536019.Mesop_3355 | + | mitochondrial | |||
| 536019.Mesop_4483 | (PF06472) | mitochondrial | |||
| 536019.Mesop_2747 | (PF05990) | ER | |||
| 536019.Mesop_0274 | (PF02653) | ER | |||
| 536019.Mesop_4560 | (PF05368) | (mitochondrial) | |||
| 536019.Mesop_1231 | (>) | ER | |||
| 536019.Mesop_3004 | + | mitochondrial | |||
| 536019.Mesop_5235 | + | ER | |||
| 536019.Mesop_0854 | (PF06764) | ER | |||
| 536019.Mesop_1727 | (PF13407) | (mitochondrial); mitochondrial | |||
| 536019.Mesop_1725 | (PF02653) | ER | |||
| 536019.Mesop_5393 | (PF13407) | ER | |||
| 536019.Mesop_3501 | (PF04191) | ER | |||
| 536019.Mesop_4420 | (>) | ER | |||
| 536019.Mesop_3454 | (PF00024) | ER | |||
| 536019.Mesop_3044 | + | (ER); (mitochondrial) | |||
| 536019.Mesop_1359 | (PF05368) | (mitochondrial) | |||
| 536019.Mesop_0323 | (PF02653) | (mitochondrial) | |||
| 536019.Mesop_4056 | (PF04191) | ER | |||
| 536019.Mesop_2215 | + | (ER); ER | |||
| 536019.Mesop_0514 | (PF13407) | ER | |||
| 536019.Mesop_5157 | (>) | ER | |||
| 536019.Mesop_5899 | (>) | ER | |||
| 536019.Mesop_5894 | (PF02653) | ER | |||
| 536019.Mesop_5895 | (PF02653) | mitochondrial | |||
| 536019.Mesop_5892 | (PF13407) | ER | |||
| 536019.Mesop_1314 | + | ER | |||
| 536019.Mesop_0309 | (PF00656) | ER | |||
| 536019.Mesop_0308 | + | (ER) | |||
| 536019.Mesop_2661 | (PF02653) | (ER) | |||
| 536019.Mesop_6468 | (PF00656) | mitochondrial; (mitochondrial) | |||
| 536019.Mesop_1128 | (PF02653) | ER | |||
| 536019.Mesop_1129 | (PF02653) | (ER) | |||
| 536019.Mesop_2788 | + | (mitochondrial) | |||
| 536019.Mesop_3431 | (PF13407) | ER | |||
| 536019.Mesop_3439 | (PF13407) | ER | |||
| 536019.Mesop_4945 | PF05686 | mitochondrial; (mitochondrial) | |||
| 536019.Mesop_4946 | PF05686 | mitochondrial | |||
| 536019.Mesop_0495 | + | ER | |||
| 536019.Mesop_4169 | (PF02653) | mitochondrial; (mitochondrial) | |||
| 536019.Mesop_4168 | (PF02653) | ER | |||
| 536019.Mesop_4434 | (PF00656) | ER | |||
| 536019.Mesop_5970 | (PF02653) | ER | |||
| 536019.Mesop_1697 | (PF08402) | (mitochondrial) | |||
| 536019.Mesop_5969 | (PF02653) | ER | |||
| 536019.Mesop_1447 | + | ER | |||
| 536019.Mesop_1444 | (PF13407) | ER | |||
| 536019.Mesop_0473 | (PF13407) | (mitochondrial) | |||
| 536019.Mesop_0475 | (PF13407) | ER | |||
| 536019.Mesop_0282 | (PF02653) | ER | |||
| 536019.Mesop_0286 | (PF02746) | (ER) | |||
| 536019.Mesop_0921 | (PF04191) | (mitochondrial) | |||
| 536019.Mesop_5868 | (PF02653) | (ER) | |||
| 536019.Mesop_1090 | + | ER | |||
| 536019.Mesop_0153 | (+) | (PF08402) | (mitochondrial) | ||
| 536019.Mesop_4920 | + | ER | |||
| 536019.Mesop_0434 | + | (ER) | |||
| 536019.Mesop_4720 | (PF05990) | ER | |||
| 536019.Mesop_5090 | + | (mitochondrial); (plastid) | |||
| 536019.Mesop_5093 | (PF13407) | ER; (mitochondrial) | |||
| 536019.Mesop_3140 | (PF13407) | ER | |||
| 536019.Mesop_3142 | (PF02653) | (ER) | |||
| 536019.Mesop_5847 | + | (PF02653) | (plastid) | ||
| 536019.Mesop_3704 | (<) | ER | |||
| 536019.Mesop_3907 | (PF00656) | (mitochondrial) | |||
| 536019.Mesop_3576 | (PF13407) | ER | |||
| 536019.Mesop_0882 | + | mitochondrial; (mitochondrial) | |||
| 536019.Mesop_4704 | + | ER | |||
| 536019.Mesop_5618 | (PF00656) | ER | |||
| 536019.Mesop_1002 | (PF06764) | ER | |||
| 536019.Mesop_4886 | (PF16387) | ER | |||
| 536019.Mesop_1615 | (PF08402) | (mitochondrial) | |||
| 536019.Mesop_4063 | + | ER | |||
| 536019.Mesop_4276 | (PF02653) | ER; (ER) | |||
| 536019.Mesop_4441 | + | (mitochondrial); (plastid) | |||
| 536019.Mesop_4861 | (PF08402) | (mitochondrial) | |||
| 536019.Mesop_3415 | (PF13407) | ER | |||
| 536019.Mesop_6571 | + | mitochondrial; plastid | |||
| 536019.Mesop_2116 | + | (mitochondrial); (plastid) | |||
| 536019.Mesop_5492 | + | mitochondrial | |||
| 536019.Mesop_3307 | (PF05368) | mitochondrial; (mitochondrial) | |||
| 536019.Mesop_0017 | (>) | (mitochondrial) | |||
| 536019.Mesop_4674 | + | (plastid) | |||
| 536019.Mesop_5771 | (PF02653) | (plastid) | |||
| 536019.Mesop_3327 | + | (ER) | |||
| 536019.Mesop_3225 | (PF05368) | plastid | |||
| 536019.Mesop_3177 | + | (PF13480) | |||
| 536019.Mesop_0671 | + | (plastid) | |||
| 536019.Mesop_0247 | (+) | mitochondrial | |||
| 536019.Mesop_4001 | + | (plastid) | |||
| 536019.Mesop_3344 | (+) | (ER); (plastid) | |||
| 536019.Mesop_5988 | (+) | mitochondrial; (mitochondrial) | |||
| 536019.Mesop_0266 | (PF08669) (PF01571) | ||||
| 536019.Mesop_5222 | (>) | (mitochondrial) | |||
| 536019.Mesop_0861 | + | (PF00112) | |||
| 536019.Mesop_0638 | + | plastid | |||
| 536019.Mesop_1715 | + | (PF08975) | |||
| 536019.Mesop_1712 | + | (plastid) | |||
| 536019.Mesop_6269 | (PF05034) (PF07476) | ||||
| 536019.Mesop_1776 | + | (mitochondrial) | |||
| 536019.Mesop_4676 | (PF05368) | (plastid) | |||
| 536019.Mesop_3068 | (>) | (mitochondrial) | |||
| 536019.Mesop_1111 | + | (PF05899) | |||
| 536019.Mesop_0698 | (PF02371) | (plastid) | |||
| 536019.Mesop_1922 | + | (plastid) | |||
| 536019.Mesop_0332 | (+) | ER | |||
| 536019.Mesop_5791 | (<) | (PF08402) | |||
| 536019.Mesop_2885 | (+) | (mitochondrial); plastid | |||
| 536019.Mesop_5302 | (PF08669) (PF01571) | ||||
| 536019.Mesop_5164 | (PF04800) | (mitochondrial) | |||
| 536019.Mesop_0294 | (+) | (ER) | |||
| 536019.Mesop_3828 | (PF08669) (PF01571) | ||||
| 536019.Mesop_3416 | (PF02653) | (mitochondrial) | |||
| 536019.Mesop_3540 | (+) | (ER) | |||
| 536019.Mesop_2002 | (+) | mitochondrial; plastid | |||
| 536019.Mesop_0424 | (PF04191) | (ER) | |||
| 536019.Mesop_5068 | + | (mitochondrial) | |||
| 536019.Mesop_4075 | (PF08669) (PF01571) | ||||
| 536019.Mesop_4079 | + | (>) | |||
| 536019.Mesop_3290 | + | (PF02653) | |||
| 536019.Mesop_2821 | (PF02653) | (ER) | |||
| 536019.Mesop_2107 | + | plastid | |||
| 536019.Mesop_2842 | (PF02371) | (plastid) | |||
| 536019.Mesop_6540 | (+) | ER | |||
| 536019.Mesop_4142 | + | (PF01442) | |||
| 536019.Mesop_2314 | (PF00050) (PF07648) | ||||
| 536019.Mesop_5765 | (PF02653) | (plastid) | |||
| 536019.Mesop_3351 | + | (PF04828) | |||
| 536019.Mesop_5993 | + | plastid | |||
| 536019.Mesop_5998 | (PF02653) | (mitochondrial) | |||
| 536019.Mesop_0273 | (PF02653) | (ER) | |||
| 536019.Mesop_0270 | + | (plastid) | |||
| 536019.Mesop_5745 | (PF08669) (PF01571) | ||||
| 536019.Mesop_5502 | (+) | (mitochondrial) | |||
| 536019.Mesop_3967 | (+) | ER | |||
| 536019.Mesop_4243 | (PF07931) | (plastid) | |||
| 536019.Mesop_2767 | (PF02371) | (plastid) | |||
| 536019.Mesop_2976 | (+) | (mitochondrial) | |||
| 536019.Mesop_5728 | (+) | (mitochondrial) | |||
| 536019.Mesop_5729 | (PF08669) (PF01571) | ||||
| 536019.Mesop_1898 | + | (plastid) | |||
| 536019.Mesop_5395 | + | (PF02653) | |||
| 536019.Mesop_2498 | (PF08402) | (plastid) | |||
| 536019.Mesop_3049 | + | (PF02653) | |||
| 536019.Mesop_2930 | (+) | (mitochondrial) | |||
| 536019.Mesop_1762 | + | + | |||
| 536019.Mesop_5536 | + | (>) | |||
| 536019.Mesop_1933 | (+) | mitochondrial | |||
| 536019.Mesop_5457 | (PF13407) | (ER) | |||
| 536019.Mesop_1102 | + | (plastid) | |||
| 536019.Mesop_5891 | + | (mitochondrial) | |||
| 536019.Mesop_0307 | (PF02371) | (plastid) | |||
| 536019.Mesop_0534 | + | plastid | |||
| 536019.Mesop_1469 | (PF08669) (PF01571) | ||||
| 536019.Mesop_1693 | (+) | (mitochondrial); (plastid) | |||
| 536019.Mesop_6358 | (+) | (mitochondrial) | |||
| 536019.Mesop_5964 | (+) | (ER) | |||
| 536019.Mesop_1992 | + | plastid | |||
| 536019.Mesop_4766 | + | (mitochondrial) | |||
| 536019.Mesop_2622 | (+) | ER | |||
| 536019.Mesop_6427 | (PF13407) | (plastid) | |||
| 536019.Mesop_6195 | (PF09587) | (plastid) | |||
| 536019.Mesop_0731 | (>) | (PF06472) | |||
| 536019.Mesop_5362 | + | (mitochondrial) | |||
| 536019.Mesop_6445 | + | (PF04299) | |||
| 536019.Mesop_0711 | (PF08669) (PF01571) | ||||
| 536019.Mesop_6189 | + | (PF02902) | |||
| 536019.Mesop_4887 | (+) | (mitochondrial); (plastid) | |||
| 536019.Mesop_5343 | (+) | (mitochondrial) | |||
| 536019.Mesop_1587 | (PF04752) | (plastid) | |||
| 536019.Mesop_2587 | (PF08669) (PF01571) | ||||
| 536019.Mesop_4395 | (>) | (mitochondrial) | |||
| 536019.Mesop_2854 | (PF02371) | (plastid) | |||
| 536019.Mesop_5348 | + | (plastid) | |||
| 536019.Mesop_0208 | (+) | (ER) | |||
| 536019.Mesop_1170 | (+) | (mitochondrial); (plastid) | |||
| 536019.Mesop_1263 | (>) | (PF02653) | |||
| 536019.Mesop_5276 | + | ||||
| 536019.Mesop_0652 | + | ||||
| 536019.Mesop_6558 | (PF13480) | ||||
| 536019.Mesop_3566 | + | ||||
| 536019.Mesop_6044 | + | ||||
| 536019.Mesop_6048 | + | ||||
| 536019.Mesop_3917 | + | ||||
| 536019.Mesop_0077 | (PF01068) | ||||
| 536019.Mesop_4826 | (PF04828) | ||||
| 536019.Mesop_0673 | (PF02653) | ||||
| 536019.Mesop_0242 | + | ||||
| 536019.Mesop_4007 | + | ||||
| 536019.Mesop_1079 | (PF01755) | ||||
| 536019.Mesop_5751 | + | ||||
| 536019.Mesop_6187 | + | ||||
| 536019.Mesop_3206 | + | ||||
| 536019.Mesop_6324 | (+) | (mitochondrial) | |||
| 536019.Mesop_6106 | (>) | ||||
| 536019.Mesop_5562 | + | ||||
| 536019.Mesop_5694 | (PF08402) | ||||
| 536019.Mesop_0057 | + | ||||
| 536019.Mesop_5328 | (PF01192) | ||||
| 536019.Mesop_5432 | + | ||||
| 536019.Mesop_2345 | (PF02746) | ||||
| 536019.Mesop_2340 | + | ||||
| 536019.Mesop_2348 | (PF02371) | ||||
| 536019.Mesop_6512 | (PF01068) | ||||
| 536019.Mesop_3362 | (>) | ||||
| 536019.Mesop_0863 | + | ||||
| 536019.Mesop_1887 | (+) | (PF08402) | |||
| 536019.Mesop_3959 | (PF01068) | ||||
| 536019.Mesop_4637 | (+) | plastid | |||
| 536019.Mesop_1430 | (+) | + | |||
| 536019.Mesop_2779 | (+) | + | |||
| 536019.Mesop_2862 | (<) | ||||
| 536019.Mesop_0639 | + | ||||
| 536019.Mesop_1940 | (+) | (PF11927) | |||
| 536019.Mesop_6283 | (PF09587) | ||||
| 536019.Mesop_5241 | + | ||||
| 536019.Mesop_0845 | + | ||||
| 536019.Mesop_1714 | (+) | (mitochondrial) | |||
| 536019.Mesop_4387 | + | ||||
| 536019.Mesop_5388 | (PF08402) | ||||
| 536019.Mesop_5544 | (PF00834) | ||||
| 536019.Mesop_2921 | + | ||||
| 536019.Mesop_2923 | + | ||||
| 536019.Mesop_2922 | (PF08402) | ||||
| 536019.Mesop_2549 | + | ||||
| 536019.Mesop_0376 | (PF08402) | ||||
| 536019.Mesop_3632 | + | ||||
| 536019.Mesop_3634 | + | ||||
| 536019.Mesop_0706 | + | ||||
| 536019.Mesop_4417 | + | ||||
| 536019.Mesop_5908 | (PF08402) | ||||
| 536019.Mesop_5100 | + | ||||
| 536019.Mesop_5104 | + | ||||
| 536019.Mesop_5105 | + | ||||
| 536019.Mesop_5902 | (PF02746) | ||||
| 536019.Mesop_3063 | (PF02653) | ||||
| 536019.Mesop_3468 | (PF04752) | ||||
| 536019.Mesop_1908 | + | ||||
| 536019.Mesop_3054 | (>) | ||||
| 536019.Mesop_4081 | + | ||||
| 536019.Mesop_4082 | (PF04828) | ||||
| 536019.Mesop_0353 | (<) | ||||
| 536019.Mesop_1110 | (+) | (PF05899) | |||
| 536019.Mesop_1112 | (>) | ||||
| 536019.Mesop_4322 | (PF06202) | ||||
| 536019.Mesop_4999 | + | ||||
| 536019.Mesop_6165 | + | ||||
| 536019.Mesop_3674 | (>) | ||||
| 536019.Mesop_2672 | (PF16952) | ||||
| 536019.Mesop_5923 | (>) | ||||
| 536019.Mesop_1131 | + | not used | |||
| 536019.Mesop_1075 | + | ||||
| 536019.Mesop_1073 | + | ||||
| 536019.Mesop_2449 | + | ||||
| 536019.Mesop_5577 | + | ||||
| 536019.Mesop_6148 | (+) | + | |||
| 536019.Mesop_6208 | + | ||||
| 536019.Mesop_6206 | + | ||||
| 536019.Mesop_6207 | (+) | (PF06325) | |||
| 536019.Mesop_5876 | + | ||||
| 536019.Mesop_0316 | + | ||||
| 536019.Mesop_0311 | + | ||||
| 536019.Mesop_1113 | (PF08402) | ||||
| 536019.Mesop_2653 | + | ||||
| 536019.Mesop_5940 | + | ||||
| 536019.Mesop_3405 | (PF02653) | ||||
| 536019.Mesop_3401 | (PF08402) | ||||
| 536019.Mesop_1687 | (PF01321) | ||||
| 536019.Mesop_2883 | (+) | (PF02653) | |||
| 536019.Mesop_3134 | (>) | ||||
| 536019.Mesop_2469 | (+) | (mitochondrial) | |||
| 536019.Mesop_4959 | + | ||||
| 536019.Mesop_4792 | (>) | ||||
| 536019.Mesop_6625 | (+) | (PF02653) | |||
| 536019.Mesop_2564 | + | ||||
| 536019.Mesop_1109 | (PF05899) | ||||
| 536019.Mesop_4361 | (+) | (>) | |||
| 536019.Mesop_2406 | + | ||||
| 536019.Mesop_0120 | (PF06325) | ||||
| 536019.Mesop_0128 | + | ||||
| 536019.Mesop_1535 | (PF05899) | ||||
| 536019.Mesop_1534 | + | ||||
| 536019.Mesop_1532 | (PF02653) | ||||
| 536019.Mesop_1538 | + | ||||
| 536019.Mesop_4976 | (PF02371) | ||||
| 536019.Mesop_1984 | (>) | ||||
| 536019.Mesop_1989 | + | ||||
| 536019.Mesop_2185 | (<) | ||||
| 536019.Mesop_0720 | (PF08402) | ||||
| 536019.Mesop_6600 | (PF02653) | ||||
| 536019.Mesop_6607 | (>) | ||||
| 536019.Mesop_4119 | (+) | (ER) | |||
| 536019.Mesop_4114 | (>) | ||||
| 536019.Mesop_2618 | (PF04828) | ||||
| 536019.Mesop_0910 | (PF02371) | ||||
| 536019.Mesop_0911 | + | ||||
| 536019.Mesop_4340 | (PF01068) | ||||
| 536019.Mesop_6466 | (PF00656) | ||||
| 536019.Mesop_1082 | (PF06325) | ||||
| 536019.Mesop_3779 | (PF01068) | ||||
| 536019.Mesop_4915 | + | ||||
| 536019.Mesop_2162 | + | ||||
| 536019.Mesop_0701 | (PF06792) | ||||
| 536019.Mesop_4286 | + | ||||
| 536019.Mesop_4753 | (PF04828) | ||||
| 536019.Mesop_4136 | (PF02746) | ||||
| 536019.Mesop_5848 | + | ||||
| 536019.Mesop_3544 | (PF07478) | ||||
| 536019.Mesop_5921 | (PF01321) | ||||
| 536019.Mesop_0936 | + | ||||
| 536019.Mesop_3152 | + | ||||
| 536019.Mesop_4320 | (PF06202) | ||||
| 536019.Mesop_0683 | (+) | (plastid) | |||
| 536019.Mesop_1570 | + | ||||
| 536019.Mesop_1577 | (PF06472) | ||||
| 536019.Mesop_0164 | + | ||||
| 536019.Mesop_1416 | (PF00162) | ||||
| 536019.Mesop_0891 | (PF01321) | ||||
| 536019.Mesop_6398 | + | ||||
| 536019.Mesop_0428 | (PF04828) | ||||
| 536019.Mesop_0390 | + | ||||
| 536019.Mesop_1380 | + | ||||
| 536019.Mesop_5066 | (<) | ||||
| 536019.Mesop_5600 | (+) | plastid | |||
| 536019.Mesop_5703 | (PF13407) | ||||
| 536019.Mesop_6008 | + | ||||
| 536019.Mesop_3522 | (+) | (PF00112) | |||
| 536019.Mesop_1139 | + | ||||
| 536019.Mesop_6338 | (PF02746) | ||||
| 536019.Mesop_4455 | (+) | plastid | |||
| 536019.Mesop_5477 | (>) | ||||
| 536019.Mesop_0189 | (PF01755) | ||||
| 536019.Mesop_0188 | (PF01755) | ||||
| 536019.Mesop_0184 | + | ||||
| 536019.Mesop_5290 | (PF04828) | ||||
| 536019.Mesop_2020 | (>) | ||||
| 536019.Mesop_2025 | (+) | (plastid) | |||
| 536019.Mesop_0747 | (PF07478) | ||||
| 536019.Mesop_0746 | (<) | ||||
| 536019.Mesop_0745 | + | ||||
| 536019.Mesop_1832 | + | ||||
| 536019.Mesop_1834 | (PF02653) | ||||
| 536019.Mesop_0405 | + | ||||
| 536019.Mesop_0401 | + | ||||
| 536019.Mesop_4719 | (PF05990) | ||||
| 536019.Mesop_4715 | + | ||||
| 536019.Mesop_4716 | + | ||||
| 536019.Mesop_4710 | + | ||||
| 536019.Mesop_5044 | + | ||||
| 536019.Mesop_4894 | (PF13480) | ||||
| 536019.Mesop_4870 | + | ||||
| 536019.Mesop_4876 | (+) | (PF05899) | |||
| 536019.Mesop_4574 | (>) | ||||
| 536019.Mesop_4057 | (PF06241) | ||||
| 536019.Mesop_1028 | + | ||||
| 536019.Mesop_4507 | + | ||||
| 536019.Mesop_5458 | + | ||||
| 536019.Mesop_0213 | (PF08402) | ||||
| 536019.Mesop_0212 | (PF08402) | ||||
| 536019.Mesop_3937 | (>) | ||||
| 536019.Mesop_2590 | (PF01321) | ||||
| 536019.Mesop_3313 | + | ||||
| 536019.Mesop_3270 | (PF02653) | ||||
| 536019.Mesop_4609 | + | ||||
| 536019.Mesop_3429 | (+) | (PF02653) | |||
| 536019.Mesop_5225 | + | ||||
| 536019.Mesop_0023 | + | ||||
| 536019.Mesop_4550 | + | ||||
| 536019.Mesop_4850 | (>) | ||||
| 536019.Mesop_1648 | + | not used | |||
| 536019.Mesop_5953 | + | ||||
| 536019.Mesop_6546 | + | ||||
| 536019.Mesop_0231 | (+) | (<) | |||
| 536019.Mesop_2064 | + | ||||
| 536019.Mesop_1781 | (PF08402) | ||||
| 536019.Mesop_3337 | (PF07478) | ||||
| 536019.Mesop_3254 | + | ||||
| 536019.Mesop_1879 | + | ||||
| 536019.Mesop_4835 | + | ||||
| 536019.Mesop_4836 | (PF04299) | ||||
| 536019.Mesop_1668 | + | ||||
| 536019.Mesop_1663 | + | ||||
| 536019.Mesop_1667 | (PF06736) | ||||
| 536019.Mesop_1120 | + | ||||
| 536019.Mesop_2861 | (PF02653) | ||||
| 536019.Mesop_6529 | + | ||||
| 536019.Mesop_4019 | (PF02653) | ||||
| 536019.Mesop_2087 | + | ||||
| 536019.Mesop_3687 | (>) | ||||
| 536019.Mesop_3513 | (>) | ||||
| 536019.Mesop_0815 | (PF01068) | ||||
| 536019.Mesop_0812 | + | ||||
| 536019.Mesop_3359 | + | ||||
| 536019.Mesop_1306 | + | ||||
| 536019.Mesop_5996 | + | ||||
| 536019.Mesop_6294 | (PF02371) | ||||
| 536019.Mesop_5570 | + | ||||
| 536019.Mesop_2026 | (PF07787) | ||||
| 536019.Mesop_1218 | + | ||||
| 536019.Mesop_1212 | + | ||||
| 536019.Mesop_1211 | + | ||||
| 536019.Mesop_4816 | + | ||||
| 536019.Mesop_2330 | + | ||||
| 536019.Mesop_0660 | (PF06736) | ||||
| 536019.Mesop_3442 | (PF02653) | ||||
| 536019.Mesop_0276 | + | ||||
| 536019.Mesop_0874 | (PF02371) | ||||
| 536019.Mesop_6151 | + | ||||
| 536019.Mesop_2295 | (PF01321) | ||||
| 536019.Mesop_2291 | + | ||||
| 536019.Mesop_2290 | + | ||||
| 536019.Mesop_5512 | (+) | (PF04299) | |||
| 536019.Mesop_1234 | + | ||||
| 536019.Mesop_4606 | + | ||||
| 536019.Mesop_0044 | + | ||||
| 536019.Mesop_0045 | + | ||||
| 536019.Mesop_3584 | + | ||||
| 536019.Mesop_4240 | + | ||||
| 536019.Mesop_2357 | + | ||||
| 536019.Mesop_3176 | (PF13480) | ||||
| 536019.Mesop_1954 | + | ||||
| 536019.Mesop_1957 | + | ||||
| 536019.Mesop_6291 | + | ||||
| 536019.Mesop_6297 | (+) | (PF01321) | |||
| 536019.Mesop_0606 | (PF04828) | ||||
| 536019.Mesop_2973 | + | ||||
| 536019.Mesop_5726 | (PF11927) | ||||
| 536019.Mesop_5722 | (+) | (PF04828) | |||
| 536019.Mesop_3393 | (PF08402) | ||||
| 536019.Mesop_3396 | (PF13407) | ||||
| 536019.Mesop_0859 | + | ||||
| 536019.Mesop_3879 | (>) | ||||
| 536019.Mesop_5539 | (PF00162) | ||||
| 536019.Mesop_5532 | + | ||||
| 536019.Mesop_6410 | (+) | + | |||
| 536019.Mesop_5392 | + | ||||
| 536019.Mesop_6274 | (PF02371) | ||||
| 536019.Mesop_2574 | (PF02746) | ||||
| 536019.Mesop_2571 | (PF02746) | ||||
| 536019.Mesop_5709 | (PF02746) | ||||
| 536019.Mesop_1701 | (PF04828) | ||||
| 536019.Mesop_1706 | (PF02746) | ||||
| 536019.Mesop_3507 | + | ||||
| 536019.Mesop_6029 | + | ||||
| 536019.Mesop_5308 | (+) | (plastid) | |||
| 536019.Mesop_6488 | (PF04800) | ||||
| 536019.Mesop_6489 | + | ||||
| 536019.Mesop_4426 | (PF06472) | ||||
| 536019.Mesop_1147 | (PF08402) | ||||
| 536019.Mesop_5119 | + | ||||
| 536019.Mesop_3040 | (PF08402) | ||||
| 536019.Mesop_2931 | (PF01068) | ||||
| 536019.Mesop_2554 | (PF08402) | ||||
| 536019.Mesop_0342 | + | ||||
| 536019.Mesop_3180 | (PF01068) | ||||
| 536019.Mesop_6346 | (PF07478) | ||||
| 536019.Mesop_4663 | (PF08402) | ||||
| 536019.Mesop_1477 | (PF08402) | ||||
| 536019.Mesop_5137 | + | ||||
| 536019.Mesop_5133 | PF05686 | ||||
| 536019.Mesop_5975 | (<) | ||||
| 536019.Mesop_4986 | + | ||||
| 536019.Mesop_2915 | (PF05899) | ||||
| 536019.Mesop_3084 | (+) | (PF04752) | |||
| 536019.Mesop_1330 | + | ||||
| 536019.Mesop_1748 | (PF00656) | ||||
| 536019.Mesop_1749 | + | ||||
| 536019.Mesop_1740 | (+) | (PF08402) | |||
| 536019.Mesop_3880 | (>) | ||||
| 536019.Mesop_5456 | (+) | (PF02653) | |||
| 536019.Mesop_0513 | (PF02653) | ||||
| 536019.Mesop_0511 | (PF02746) | ||||
| 536019.Mesop_4465 | + | ||||
| 536019.Mesop_3129 | + | ||||
| 536019.Mesop_5331 | + | ||||
| 536019.Mesop_5156 | + | ||||
| 536019.Mesop_5150 | + | ||||
| 536019.Mesop_0627 | + | ||||
| 536019.Mesop_0306 | + | ||||
| 536019.Mesop_3648 | (PF05368) | ||||
| 536019.Mesop_0531 | (PF00656) | ||||
| 536019.Mesop_1121 | + | ||||
| 536019.Mesop_3780 | + | ||||
| 536019.Mesop_0499 | (PF02653) | ||||
| 536019.Mesop_1150 | (PF02371) | ||||
| 536019.Mesop_4433 | + | ||||
| 536019.Mesop_2573 | (PF02746) | ||||
| 536019.Mesop_1690 | (PF06792) | ||||
| 536019.Mesop_5701 | (PF02653) | ||||
| 536019.Mesop_6443 | + | ||||
| 536019.Mesop_4313 | (PF01192) | ||||
| 536019.Mesop_4314 | (PF04800) | ||||
| 536019.Mesop_4315 | + | ||||
| 536019.Mesop_1503 | + | ||||
| 536019.Mesop_1445 | (PF02653) | ||||
| 536019.Mesop_6618 | (+) | (plastid) | |||
| 536019.Mesop_0476 | (PF02653) | ||||
| 536019.Mesop_6579 | + | ||||
| 536019.Mesop_4102 | (PF08402) | ||||
| 536019.Mesop_2627 | (+) | + | |||
| 536019.Mesop_4043 | (>) | ||||
| 536019.Mesop_3578 | (+) | (PF02653) | |||
| 536019.Mesop_0900 | + | ||||
| 536019.Mesop_6422 | (<) | ||||
| 536019.Mesop_5424 | (<) | ||||
| 536019.Mesop_1423 | (>) | ||||
| 536019.Mesop_1429 | (+) | (plastid) | |||
| 536019.Mesop_4555 | (PF13480) | ||||
| 536019.Mesop_2198 | (<) | ||||
| 536019.Mesop_3441 | (PF02653) | ||||
| 536019.Mesop_0733 | + | ||||
| 536019.Mesop_0734 | (PF00834) | ||||
| 536019.Mesop_4292 | + | ||||
| 536019.Mesop_6671 | (>) | ||||
| 536019.Mesop_4121 | (PF04828) | ||||
| 536019.Mesop_4120 | + | ||||
| 536019.Mesop_2537 | + | ||||
| 536019.Mesop_3557 | (PF06325) | ||||
| 536019.Mesop_3555 | (PF01321) | ||||
| 536019.Mesop_6071 | (PF00112) | ||||
| 536019.Mesop_0927 | (+) | + | |||
| 536019.Mesop_3800 | (PF04191) | ||||
| 536019.Mesop_2409 | (+) | + | |||
| 536019.Mesop_5867 | (<) | ||||
| 536019.Mesop_4350 | (<) | ||||
| 536019.Mesop_5404 | (+) | (plastid) | |||
| 536019.Mesop_3764 | + | ||||
| 536019.Mesop_0157 | (PF01633) | ||||
| 536019.Mesop_1545 | (PF08402) | ||||
| 536019.Mesop_2171 | + | ||||
| 536019.Mesop_2174 | + | ||||
| 536019.Mesop_6389 | + | ||||
| 536019.Mesop_5431 | + | ||||
| 536019.Mesop_3526 | + | ||||
| 536019.Mesop_5094 | (PF02653) | ||||
| 536019.Mesop_4427 | + | ||||
| 536019.Mesop_4425 | (+) | (mitochondrial) | |||
| 536019.Mesop_0947 | (PF02371) | ||||
| 536019.Mesop_3144 | + | ||||
| 536019.Mesop_5846 | (PF02653) | ||||
| 536019.Mesop_5843 | (PF06792) | ||||
| 536019.Mesop_5465 | + | ||||
| 536019.Mesop_5289 | (PF04828) | ||||
| 536019.Mesop_2030 | (PF08402) | ||||
| 536019.Mesop_2158 | + | ||||
| 536019.Mesop_6054 | + | ||||
| 536019.Mesop_0776 | (+) | (plastid) | |||
| 536019.Mesop_0773 | (+) | (plastid) | |||
| 536019.Mesop_0410 | + | ||||
| 536019.Mesop_5710 | (PF02746) | ||||
| 536019.Mesop_1001 | (>) | ||||
| 536019.Mesop_6421 | (+) | plastid | |||
| 536019.Mesop_3104 | (+) | (plastid) | |||
| 536019.Mesop_3922 | + | ||||
| 536019.Mesop_5823 | (PF00834) | ||||
| 536019.Mesop_4062 | + | ||||
| 536019.Mesop_2685 | + | ||||
| 536019.Mesop_3875 | (PF01321) | ||||
| 536019.Mesop_3870 | + | ||||
| 536019.Mesop_2580 | (PF02746) | ||||
| 536019.Mesop_2139 | (PF02653) | ||||
| 536019.Mesop_3804 | + | not used | |||
| 536019.Mesop_3264 | + | ||||
| 536019.Mesop_5580 | + | not used | |||
| 536019.Mesop_5581 | (PF01755) | ||||
| 536019.Mesop_5059 | + | ||||
| 536019.Mesop_5635 | (+) | (mitochondrial) | |||
| 536019.Mesop_1246 | + | ||||
| 536019.Mesop_4864 | + | ||||
| 536019.Mesop_1635 | (PF02371) | ||||
| 536019.Mesop_1638 | (PF13480) | ||||
| 536019.Mesop_4397 | + | ||||
| 536019.Mesop_2859 | (PF02746) | ||||
| 536019.Mesop_2858 | + | ||||
| 536019.Mesop_3414 | (PF02653) | ||||
| 536019.Mesop_6575 | + | ||||
| 536019.Mesop_6578 | + | ||||
| 536019.Mesop_3305 | (PF05368) | ||||
| 536019.Mesop_6367 | (PF02371) | ||||
| 536019.Mesop_4215 | (PF06202) | ||||
| 536019.Mesop_5034 | (PF02746) | ||||
| 536019.Mesop_2689 | + | ||||
| 536019.Mesop_2680 | (PF04299) | ||||
| 536019.Mesop_0011 | + | ||||
| 536019.Mesop_1264 | (PF02653) | ||||
| 536019.Mesop_4844 | (PF13480) | ||||
| 536019.Mesop_4848 | (PF01321) | ||||
| 536019.Mesop_5274 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_0651 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_2302 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_6302 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_0798 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_1841 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_4491 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_4532 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_1207 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_1206 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_4828 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_6095 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_3170 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_1198 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_4804 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_3591 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_5913 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_2756 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_2963 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_6514 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_3360 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_3361 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_1739 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_5657 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_1885 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_2282 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_4404 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_2772 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_2568 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_1719 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_1716 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_4430 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_1154 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_5526 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_5542 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_3160 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_5384 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_1968 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_1772 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_3194 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_0564 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_3837 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_3460 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_6241 | (+) | not used | |||
| 536019.Mesop_6248 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_1902 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_2906 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_3615 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_3238 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_4694 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_4696 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_1408 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_6167 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_1924 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_3677 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_6061 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_0521 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_4324 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_1135 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_5576 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_6477 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_5145 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_1498 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_4155 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_0063 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_1680 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_2880 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_2467 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_2213 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_1510 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_5955 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_5954 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_3118 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_2851 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_3755 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_1536 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_1531 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_1981 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_5487 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_6019 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_0919 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_3821 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_6461 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_4914 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_5568 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_6668 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_6664 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_6660 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_5088 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_5412 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_1579 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_4934 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_2000 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_0898 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_6393 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_0422 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_6640 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_5607 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_0953 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_3217 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_3212 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_0185 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_3295 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_5049 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_5627 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_6566 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_3882 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_3312 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_3422 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_2800 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_5854 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_5025 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_5227 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_4551 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_4854 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_5956 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_6544 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_4529 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_1785 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_3330 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_0784 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_4207 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_5008 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_5002 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_1665 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_1664 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_4330 | (+) | not used | |||
| 536019.Mesop_2318 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_0642 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_1061 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_6315 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_6318 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_3909 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_0069 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_6087 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_3447 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_5748 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_3377 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_0876 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_3951 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_5500 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_1456 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_5513 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_0597 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_3582 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_4241 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_2766 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_3006 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_5720 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_0856 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_5449 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_5448 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_3133 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_6414 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_5390 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_5399 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_2708 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_2700 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_6032 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_2953 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_2957 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_6487 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_4428 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_1141 | (+) | not used | |||
| 536019.Mesop_0559 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_0082 | (+) | not used | |||
| 536019.Mesop_1354 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_2233 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_1299 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_4953 | (+) | not used | |||
| 536019.Mesop_4950 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_5973 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_6588 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_3065 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_3082 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_3088 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_1336 | + | ||||
| 536019.Mesop_3667 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_4509 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_1107 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_5338 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_5968 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_1487 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_6173 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_0680 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_1291 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_3437 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_4948 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_2253 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_3120 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_3126 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_5256 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_5192 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_1997 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_4765 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_4105 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_4516 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_3573 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_0903 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_6425 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_6438 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_0135 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_0735 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_4294 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_4291 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_0451 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_4335 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_2015 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_0715 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_0716 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_5096 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_4977 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_2545 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_3856 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_2034 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_0888 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_0889 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_1824 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_3107 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_4882 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_0962 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_2838 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_4067 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_3721 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_0752 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_0753 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_1805 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_5737 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_4185 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_5633 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_1241 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_1242 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_5870 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_2073 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_1862 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_4219 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_5031 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_5039 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_1265 | (+) | ||||
| 536019.Mesop_2870 | (+) |
Detailed merged results for each protein sequence
- Detailed merged results as table (merge_results.html)
- Detailed merged results as tab delimited file (merge_results.csv)
Individual results for each protein sequence
- EffectiveT3 predictions using new standard model 2.0.1 (PROTEINS.NEW.EFFECTIVET3)
- EffectiveT3 predictions using old standard model 1.0.1 (PROTEINS.OLD.EFFECTIVET3)
- EffectiveCCBD predictions (PROTEINS.CHAPERONES.TXT)
- T4SEpre bpbAac predictions (T4SEpre_bpbAac_FinalResult.csv)
- T4SEpre psAac predictions (T4SEpre_psAac_FinalResult.csv)
- EffectiveELD predictions (PROTEINS.ELD.TXT)
- Predotar predictions using animal/human model (Predotar_output_modelANIMAL.TXT)
- Predotar predictions using plant model (Predotar_output_modelPLANT.TXT)
Genome based results
Summary
- Gram negative: YES (FDR = 0.5 %)
- Functional Type III secretion system: YES (FDR = 12.5 %)
Estimated copy number = 0.2 (2/10 KEGG proteins)
- Functional Type IV secretion system: YES (FDR = 7.2 %)
Estimated copy number = 2.1 (21/10 KEGG proteins)
- Functional Type VI secretion system: YES (FDR = 7.7 %)
Estimated copy number = 0.25 (2/8 KEGG proteins)
Individual results for each secretion system
- List of 100 most important COGs/NOGs for prediction of functional Type III secretion system (T3_top100_COGS.xls)
- List of 100 most important COGs/NOGs for prediction of functional Type IV secretion system (T4_top100_COGS.xls)
- List of 100 most important COGs/NOGs for prediction of functional Type VI secretion system (T6_top100_COGS.xls)
- List of COGs assigned to Type III secretion system in KEGG (T3SS_KEGG_cmp.xls)
- List of COGs assigned to Type IV secretion system in KEGG (T4SS_KEGG_cmp.xls)
- List of COGs assigned to Type VI secretion system in KEGG (T6SS_KEGG_cmp.xls)
Parameters:
==========================================================
EFFECTIVE_T3_OLD=selective
EFFECTIVE_T3_NEW=selective
PREDOTAR_ANIMAL_OR_PLANT=a
PROTEINS=INPUT PROTEINS
MODUS=genome
RUN_PREDOTAR=T
RUN_EFFECTIVE_T3=T
RUN_T4SEpre=0.5
RUN_EFFECTIVE_CCBD=T
RUN_EFFECTIVE_ELD=4
CheckM_COMPLETENESS=
RUN_EffectiveS346=T
GENOTYPE=COG Profile
EMAIL=
==========================================================
Estimated copy number = 0.2 (2/10 KEGG proteins)
Estimated copy number = 2.1 (21/10 KEGG proteins)
Estimated copy number = 0.25 (2/8 KEGG proteins)
Release announcements
News
Latest publications
Contact
- +43 1 4277 76681
- +43 1 4277 876681
- contact.cube@univie.ac.at
