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Effective results for Clostridium butyricum E4 str. BoNT E BL5262 (eggnog40)

Summary

Number of putative secreted proteins: 210
- Predicted by T4SEpre: 0
- Predicted by EffectiveELD: 44 eukaryotic-like domains, contained in 210 proteins (30 high, 180 medium Z-score)
Predicted protein secretion systems (parentheses indicate weak positive predictions lacking more than 50% of core proteins of a secretion system): None

Protein based results

Putative secreted proteins (weak evidence indicated by parentheses)

ProteinEffectiveT3EffectiveCCBDT4SEpreEffectiveELDPredotar
632245.CLP_0909(PF02690) (PF01895)ER
632245.CLP_1993(PF02690) (PF01895)ER
632245.CLP_2133(PF02690) (PF01895)(ER)
632245.CLP_3995(PF02690) (PF01895)ER
632245.CLP_1919PF17112mitochondrial
632245.CLP_1680(PF01554)ER
632245.CLP_3338(PF05704)(ER); (mitochondrial)
632245.CLP_0338(PF01554)(ER)
632245.CLP_0756(PF01228) (PF02901)(mitochondrial)
632245.CLP_1332PF14566ER
632245.CLP_3300PF12733ER
632245.CLP_0778(PF01228) (PF02901)(mitochondrial)
632245.CLP_1350(PF00163)mitochondrial
632245.CLP_0005PF12733ER
632245.CLP_0002PF12733ER
632245.CLP_3293PF12733ER
632245.CLP_3292PF12733ER
632245.CLP_3291PF12733ER
632245.CLP_3290PF12733ER
632245.CLP_0014(PF01520)ER
632245.CLP_0017PF12733ER
632245.CLP_4004(PF00163)mitochondrial
632245.CLP_1572(PF09992)ER
632245.CLP_2419(PF01554)ER
632245.CLP_0491(PF01554)(ER)
632245.CLP_4390(PF01520)ER
632245.CLP_2399(PF11852)ER
632245.CLP_0738(PF00543)(mitochondrial)
632245.CLP_3098PF12733ER
632245.CLP_1947(PF01554)ER
632245.CLP_2283PF13518(mitochondrial)
632245.CLP_2289(PF00882)mitochondrial
632245.CLP_0534PF14566ER
632245.CLP_1735(PF16760)ER
632245.CLP_3994(PF01520)ER
632245.CLP_2000(PF01554)(ER)
632245.CLP_1059(PF00543)(mitochondrial)
632245.CLP_1058(PF00543)(mitochondrial)
632245.CLP_2017PF12733ER
632245.CLP_1265(PF01554)(ER)
632245.CLP_0792(PF01228) (PF02901)
632245.CLP_0781(PF09992)(ER)
632245.CLP_1336(PF03460) (PF01077)
632245.CLP_4122(PF03796) (PF00772)
632245.CLP_0924(PF01554)(ER)
632245.CLP_0321(PF03460) (PF01077)
632245.CLP_2845(PF01228) (PF02901)
632245.CLP_2422(PF09992)(ER)
632245.CLP_2216(PF03796) (PF00772)
632245.CLP_1846(PF01228) (PF02901)
632245.CLP_3665(PF00488) (PF05192)
632245.CLP_0368(PF06968)(mitochondrial)
632245.CLP_0569(PF03460) (PF01077)
632245.CLP_1683(PF03460) (PF01077)
632245.CLP_1152(PF03460) (PF01077)
632245.CLP_4389(PF00465)(mitochondrial)
632245.CLP_3388(PF03460) (PF01077)
632245.CLP_2942(PF03796) (PF00772)
632245.CLP_1838(PF00488) (PF05192)
632245.CLP_1012(PF03460) (PF01077)
632245.CLP_3973(PF01554)(ER)
632245.CLP_1999(PF03460) (PF01077)
632245.CLP_1136(PF01228) (PF02901)
632245.CLP_0840(PF01554)(ER)
632245.CLP_2011(PF00488) (PF05192)
632245.CLP_2651(PF01895)(ER)
632245.CLP_1875(PF03796) (PF00772)
632245.CLP_0253(PF01554)(ER)
632245.CLP_4370(PF00465)
632245.CLP_3752(PF01633)
632245.CLP_3756(PF01633)
632245.CLP_3754(PF01633)
632245.CLP_3354(PF02811)
632245.CLP_3350PF13518not used
632245.CLP_2482PF04184
632245.CLP_1913(PF12681)
632245.CLP_1917(PF01554)
632245.CLP_1042(PF14336)
632245.CLP_2462(PF00543)
632245.CLP_0220(PF02811)
632245.CLP_1313(PF02915)
632245.CLP_2074(PF12681)
632245.CLP_2678(PF01520)
632245.CLP_2475(PF02915)
632245.CLP_0934(PF13276)
632245.CLP_1098(PF00923)
632245.CLP_0782(PF09992)not used
632245.CLP_0783(PF01418)
632245.CLP_4223(PF12646)
632245.CLP_2319PF13518
632245.CLP_2318(PF13276)
632245.CLP_2269(PF00465)
632245.CLP_1240(PF02915)
632245.CLP_2442(PF01554)
632245.CLP_0687(PF01554)
632245.CLP_1087(PF00923)
632245.CLP_0758(PF00465)
632245.CLP_0750(PF00465)
632245.CLP_4306(PF13276)
632245.CLP_4430(PF00543)
632245.CLP_2879(PF00488)
632245.CLP_2273(PF00488)
632245.CLP_2452(PF00465)
632245.CLP_0320(PF00465)
632245.CLP_0102(PF02915)
632245.CLP_0118(PF00465)
632245.CLP_2209(PF00465)
632245.CLP_2513(PF02811)
632245.CLP_2190PF13518
632245.CLP_0599(PF13276)
632245.CLP_0779(PF00923)
632245.CLP_3675PF13518
632245.CLP_3676(PF13276)
632245.CLP_2984(PF14691)
632245.CLP_2988(PF00543)
632245.CLP_3079(PF12224)
632245.CLP_3859(PF00882)
632245.CLP_2189(PF13276)
632245.CLP_1749(PF00690)
632245.CLP_0341(PF13276)
632245.CLP_0342PF13518
632245.CLP_0346PF13518
632245.CLP_0347(PF13276)
632245.CLP_1293(PF01520)
632245.CLP_0585(PF02915)
632245.CLP_0161(PF01418)
632245.CLP_0019(PF01633)
632245.CLP_0012(PF01520)
632245.CLP_3061(PF14691)
632245.CLP_2156(PF12513)
632245.CLP_0620(PF01418)
632245.CLP_0028(PF01418)
632245.CLP_2894(PF01520)
632245.CLP_0811(PF01418)
632245.CLP_0567(PF01418)
632245.CLP_0492(PF01554)
632245.CLP_0495(PF01418)
632245.CLP_0496(PF01418)
632245.CLP_0499(PF13276)
632245.CLP_0140(PF01418)
632245.CLP_4392(PF14691)
632245.CLP_4391(PF00465)
632245.CLP_4395(PF00465)
632245.CLP_0035(PF00488)
632245.CLP_4243(PF01554)
632245.CLP_3600(PF02915)
632245.CLP_3048(PF14691)
632245.CLP_3134PF13518
632245.CLP_3135(PF13276)
632245.CLP_1802(PF01554)
632245.CLP_0553(PF02811)
632245.CLP_0952(PF14691)
632245.CLP_0739(PF00543)
632245.CLP_1394(PF07892)
632245.CLP_4384(PF00302)
632245.CLP_0044(PF00543)
632245.CLP_0933PF13518
632245.CLP_3414(PF00690)
632245.CLP_0546(PF00923)
632245.CLP_0542(PF00465)
632245.CLP_1018(PF11852)
632245.CLP_0835(PF01554)
632245.CLP_1234(PF02811)
632245.CLP_0052(PF01418)
632245.CLP_3087(PF14691)
632245.CLP_3080(PF12224)not used
632245.CLP_3403(PF00690)
632245.CLP_3882(PF06968)
632245.CLP_2371(PF00465)
632245.CLP_2282(PF13276)
632245.CLP_2286(PF02811)
632245.CLP_2284PF13518
632245.CLP_2288(PF02811)
632245.CLP_2593(PF01520)
632245.CLP_2592(PF13276)
632245.CLP_2591PF13518
632245.CLP_1486(PF01418)
632245.CLP_1139(PF00465)
632245.CLP_0845(PF01554)
632245.CLP_0663(PF00923)
632245.CLP_0062(PF01418)
632245.CLP_0262(PF02811)
632245.CLP_3502(PF10371)
632245.CLP_3163PF13518
632245.CLP_3162(PF13276)
632245.CLP_3218(PF02811)
632245.CLP_0500PF13518
632245.CLP_1728(PF10371)
632245.CLP_1856(PF01554)
632245.CLP_2749PF06597
632245.CLP_2746PF06597
632245.CLP_2747PF06597
632245.CLP_0290(PF01418)
632245.CLP_1216(PF01991)
632245.CLP_0277(PF06968)
632245.CLP_1736(PF00690)
632245.CLP_1738(PF00690)
632245.CLP_2130(PF00690)
632245.CLP_1937(PF10371)
632245.CLP_1841(PF00302)
632245.CLP_1845(PF01520)
632245.CLP_1440(PF01554)
632245.CLP_0862(PF01418)
632245.CLP_0081(PF00690)
632245.CLP_4187(PF07892)
632245.CLP_3349(PF13276)
632245.CLP_2835(PF09992)
632245.CLP_2123(PF01418)
632245.CLP_0502(PF00465)
632245.CLP_1692(PF06968)

Detailed merged results for each protein sequence

Individual results for each protein sequence

Genome based results

Summary

  • Gram negative: NO (FDR = 0.5 %)
  • Functional Type III secretion system: N.D.
  • Functional Type IV secretion system: NO (FDR = 7.2 %)
  • Functional Type VI secretion system: N.D.

Individual results for each secretion system

Parameters:

==========================================================
EFFECTIVE_T3_OLD=selective
EFFECTIVE_T3_NEW=selective
PREDOTAR_ANIMAL_OR_PLANT=a
PROTEINS=INPUT PROTEINS
MODUS=genome
RUN_PREDOTAR=T
RUN_EFFECTIVE_T3=T
RUN_T4SEpre=0.5
RUN_EFFECTIVE_CCBD=T
RUN_EFFECTIVE_ELD=4
CheckM_COMPLETENESS=
RUN_EffectiveS346=T
GENOTYPE=COG Profile
EMAIL=
==========================================================