Effective results for Herpetosiphon aurantiacus DSM 785 (eggnog40)

Summary

Number of putative secreted proteins: 453
- Predicted by T4SEpre: 0
- Predicted by EffectiveELD: 78 eukaryotic-like domains, contained in 453 proteins (69 high, 384 medium Z-score)
Predicted protein secretion systems (parentheses indicate weak positive predictions lacking more than 50% of core proteins of a secretion system): None

Protein based results

Putative secreted proteins (weak evidence indicated by parentheses)

ProteinEffectiveT3EffectiveCCBDT4SEpreEffectiveELDPredotar
316274.Haur_3228(PF00931) (PF13424)mitochondrial
316274.Haur_4492(PF00534) (PF13579)(ER); ER
316274.Haur_0249(PF00092) (PF13519)ER
316274.Haur_2249(PF00534) (PF13439)(mitochondrial)
316274.Haur_0822(PF01344) PF13964ER
316274.Haur_4282(PF00534) (PF13579)(ER)
316274.Haur_4512(PF00534) (PF13439)ER
316274.Haur_3739(PF00931) (PF13424)(mitochondrial)
316274.Haur_0284(PF00534) (PF13439)(mitochondrial)
316274.Haur_1032(PF00534) (PF13439)ER
316274.Haur_4083(PF00534) (PF13439)ER
316274.Haur_4279(PF00534) (PF13579)(ER)
316274.Haur_4460(PF02844) (PF02843)mitochondrial
316274.Haur_1597(PF00931) (PF13424)mitochondrial; (mitochondrial)
316274.Haur_1572(PF00668) (PF13745)mitochondrial
316274.Haur_2812(PF01344) PF13964ER
316274.Haur_0946(PF02844) (PF02843)(mitochondrial)
316274.Haur_0935(PF01344) PF13964ER
316274.Haur_1942(PF11028)ER
316274.Haur_0052PF01740(ER)
316274.Haur_3162PF01740mitochondrial; (mitochondrial)
316274.Haur_3163(PF13519)ER
316274.Haur_1094(PF01609)mitochondrial
316274.Haur_1093(PF13231)ER
316274.Haur_1098PF01740(mitochondrial); mitochondrial
316274.Haur_1522(PF08239)ER
316274.Haur_1759(PF07676)ER
316274.Haur_0214(PF07676)ER
316274.Haur_4375(PF13185)ER
316274.Haur_4807(PF13439) (PF00534)(ER)
316274.Haur_3825(PF13231)(mitochondrial)
316274.Haur_3007(PF16317)ER
316274.Haur_1889(PF12698)mitochondrial; ER
316274.Haur_1886(PF00201)(ER)
316274.Haur_2206PF01740mitochondrial
316274.Haur_2195(PF14312)mitochondrial; (mitochondrial)
316274.Haur_2197PF01347ER
316274.Haur_2998(PF10672)mitochondrial; (mitochondrial)
316274.Haur_1316PF01740(mitochondrial)
316274.Haur_4216(PF13185)(mitochondrial)
316274.Haur_0137PF14329ER
316274.Haur_0263(PF02971) (PF07837) (PF04961)
316274.Haur_4367(PF08309)ER
316274.Haur_4361(PF01344)ER
316274.Haur_4812(PF07676)ER
316274.Haur_2210PF01740ER
316274.Haur_2181(PF00150)ER
316274.Haur_2986PF01740ER
316274.Haur_4772(PF09265)ER; (mitochondrial)
316274.Haur_0691(PF13519)ER
316274.Haur_4951(PF03160)ER
316274.Haur_0581(PF13391)(mitochondrial)
316274.Haur_2322PF01740ER
316274.Haur_3622(PF13231)mitochondrial; ER
316274.Haur_0056(PF07819)(mitochondrial)
316274.Haur_2421PF01740ER
316274.Haur_2424PF01740ER
316274.Haur_2425(PF12698)(mitochondrial)
316274.Haur_3609PF01740ER
316274.Haur_4767(PF13492)ER
316274.Haur_0064(PF00150)ER
316274.Haur_4547(PF13185)ER
316274.Haur_1421(PF13185)ER; (ER)
316274.Haur_4168(PF07676)ER
316274.Haur_0806(PF13231)ER
316274.Haur_0647(PF03160)ER
316274.Haur_3124PF01740ER
316274.Haur_3630(PF13231)ER
316274.Haur_1855(PF00931)(mitochondrial)
316274.Haur_1857(PF00668) (PF13745)(ER)
316274.Haur_1077(PF13185)(mitochondrial); plastid
316274.Haur_4538(PF15891)(mitochondrial)
316274.Haur_4027(PF00950)ER
316274.Haur_4153PF01740mitochondrial
316274.Haur_1458(PF13424)ER
316274.Haur_0250(PF13519)ER
316274.Haur_3359(PF05711)(mitochondrial)
316274.Haur_2532(PF07819)ER
316274.Haur_0961(PF13424)ER
316274.Haur_3910(PF13185)ER
316274.Haur_4524(PF00201) (PF03033)(mitochondrial)
316274.Haur_3726PF13813ER
316274.Haur_3384(PF00150)ER
316274.Haur_3383(PF00150)ER
316274.Haur_3926(PF13519)ER
316274.Haur_2096(PF00950)(ER)
316274.Haur_1270PF01740(ER)
316274.Haur_2671(PF01223)ER
316274.Haur_4192PF01740mitochondrial; (mitochondrial)
316274.Haur_4191PF01740(mitochondrial)
316274.Haur_1120(PF13439) (PF00534)(ER)
316274.Haur_1122(PF13231)ER
316274.Haur_0012(PF07676)ER
316274.Haur_3149(PF00931)(mitochondrial)
316274.Haur_1723(PF16158)ER
316274.Haur_4998(PF03160)(mitochondrial); (ER)
316274.Haur_4422PF01740ER
316274.Haur_0966(PF13583)ER
316274.Haur_3399PF01347ER
316274.Haur_3939(PF01609)mitochondrial
316274.Haur_1865(PF14312)ER
316274.Haur_3648(PF08239)mitochondrial
316274.Haur_3644(PF01223)ER
316274.Haur_2066(PF00950)ER
316274.Haur_2261(PF13185)ER
316274.Haur_2844(PF00950)ER; (ER)
316274.Haur_1393PF01740ER
316274.Haur_4299(PF00150)ER
316274.Haur_2114(PF13424)mitochondrial; (plastid)
316274.Haur_1138(PF01223)ER
316274.Haur_4056PF12768ER
316274.Haur_3709(PF13231)ER
316274.Haur_3701(PF10672)mitochondrial
316274.Haur_1815(PF03415)ER
316274.Haur_1811(PF13583)ER
316274.Haur_4665(PF00534) (PF13439)(mitochondrial)
316274.Haur_4065(PF00686)ER
316274.Haur_4061(PF13185)ER
316274.Haur_0030(PF14108)ER
316274.Haur_4088(PF02146)(mitochondrial); mitochondrial
316274.Haur_4089(PF01609)mitochondrial
316274.Haur_0614(PF12894)ER
316274.Haur_0345(PF05547)ER
316274.Haur_0344(PF05547)ER
316274.Haur_4880(PF13579)mitochondrial
316274.Haur_2256(PF13424)ER
316274.Haur_2449(PF09348)ER
316274.Haur_2590(PF13519)ER
316274.Haur_1931(PF14312)ER
316274.Haur_1930(PF00931) (PF13424)(plastid)
316274.Haur_0991(PF00534) (PF13439)(mitochondrial)
316274.Haur_2820(PF00150)ER
316274.Haur_4277(PF13231)ER
316274.Haur_1116(PF00092)ER
316274.Haur_4095(PF13231)ER
316274.Haur_0977(PF07676)ER
316274.Haur_2909(PF13231)(ER); ER
316274.Haur_2908(PF12483)ER
316274.Haur_2905(PF07676)ER
316274.Haur_1231(PF11721)ER
316274.Haur_1232(PF11721)ER
316274.Haur_1561(PF07676)ER
316274.Haur_1760(PF00534) (PF13439)(ER)
316274.Haur_4335(PF00686)ER
316274.Haur_0411(PF13366)(ER)
316274.Haur_3265(PF05547)ER
316274.Haur_3016PF01740(ER)
316274.Haur_3866(PF13231)mitochondrial; (mitochondrial)
316274.Haur_3993(PF03415)ER
316274.Haur_3044(PF00950)ER; (ER)
316274.Haur_2150(PF07676)ER
316274.Haur_1229(PF08309)ER
316274.Haur_0790(PF07676)ER
316274.Haur_3327(PF12698)ER
316274.Haur_3038(PF03160)ER
316274.Haur_3521(PF13492)ER
316274.Haur_2039(PF01609)mitochondrial
316274.Haur_2810PF13813ER
316274.Haur_4225(PF13231)ER
316274.Haur_0947(PF00931) (PF13424)(ER)
316274.Haur_0788(PF08309)ER
316274.Haur_3339(PF05547)ER
316274.Haur_3841PF12768ER
316274.Haur_2551(PF12698)ER; (mitochondrial)
316274.Haur_1970(PF13583)ER
316274.Haur_3158(PF13424)ER
316274.Haur_2178(PF00150)ER
316274.Haur_4230(PF12698)(mitochondrial)
316274.Haur_0203PF14329ER
316274.Haur_4901(PF00092)ER
316274.Haur_4900(PF13519)ER
316274.Haur_3232(PF07676)ER
316274.Haur_3300(PF00534)mitochondrial
316274.Haur_1894PF01740(ER)
316274.Haur_1890(PF12698)(mitochondrial)
316274.Haur_1300(PF06013) PF00648
316274.Haur_3826(PF00534) (PF13579)
316274.Haur_2683PF01740(ER)
316274.Haur_1882(PF00668) (PF13745)
316274.Haur_2207(PF00931) (PF13424)
316274.Haur_4210(PF00092)(ER)
316274.Haur_1530(PF13439) (PF00534)
316274.Haur_0136(PF00931) (PF13424)
316274.Haur_0269(PF13424)(mitochondrial)
316274.Haur_3581(PF00534) (PF13439)
316274.Haur_3582(PF13439) (PF00534)
316274.Haur_3586(PF12773) (PF13424)
316274.Haur_0050(PF09414)(mitochondrial)
316274.Haur_4486(PF13185)(plastid)
316274.Haur_4489(PF00534) (PF13439)
316274.Haur_3576(PF00534) (PF13439)
316274.Haur_3570(PF13185)(ER)
316274.Haur_3597(PF08239)(plastid)
316274.Haur_3973(PF00668) (PF13745)
316274.Haur_3972(PF00668) (PF13745)
316274.Haur_4768(PF13185) (PF13492)
316274.Haur_1608(PF00931) (PF13424)
316274.Haur_4385(PF13439) (PF00534)
316274.Haur_1442(PF00931) (PF13424)
316274.Haur_3294(PF13579)ER
316274.Haur_3129(PF00668) (PF13745)
316274.Haur_1858(PF00668) (PF13745)
316274.Haur_4532(PF07676)(mitochondrial)
316274.Haur_1450(PF13185) (PF13492)
316274.Haur_0103(PF00931) (PF12894)
316274.Haur_1707(PF13424)(ER)
316274.Haur_0497(PF12773)(ER)
316274.Haur_3354(PF13579)(ER)
316274.Haur_2403(PF14312)(plastid)
316274.Haur_2083(PF00201) (PF03033)
316274.Haur_2089(PF00668) (PF13745)
316274.Haur_0397(PF13519)(plastid)
316274.Haur_2413(PF00668) (PF13745)
316274.Haur_2415(PF00668) (PF13745)
316274.Haur_2091(PF00668) (PF13745)
316274.Haur_2090(PF00668) (PF13745)
316274.Haur_2257(PF00931) (PF13424)
316274.Haur_1879(PF00668) (PF13745)
316274.Haur_1874(PF00668) (PF13745)
316274.Haur_2673(PF12698)(ER)
316274.Haur_4604(PF13439) (PF00534)
316274.Haur_4043(PF00092)(plastid)
316274.Haur_4519(PF06013) (PF07819)
316274.Haur_4049(PF14413) (PF04446)
316274.Haur_1761(PF13439)(mitochondrial)
316274.Haur_3735(PF00534) (PF13439)
316274.Haur_3937(PF13185)(ER)
316274.Haur_1861(PF00668) (PF13745)
316274.Haur_1866(PF00931) (PF13424)
316274.Haur_1881(PF00668) (PF13745)
316274.Haur_0602(PF13185)(mitochondrial)
316274.Haur_3898(PF00534) (PF13439)
316274.Haur_2853(PF06013) PF00648
316274.Haur_2107(PF00668) (PF13745)
316274.Haur_2108(PF00668) (PF13745)
316274.Haur_1878(PF00668)(ER)
316274.Haur_3243(PF14108)(mitochondrial)
316274.Haur_4273(PF00534) (PF13439)
316274.Haur_4271(PF00534) (PF13439)
316274.Haur_1027(PF00534) (PF13439)
316274.Haur_1903PF01740(ER)
316274.Haur_1582(PF00534) (PF13439)
316274.Haur_0362(PF00201) (PF03033)
316274.Haur_2729(PF13185) (PF13492)
316274.Haur_3865(PF13231)(mitochondrial)
316274.Haur_2937PF01740(ER)
316274.Haur_2931PF01740(plastid)
316274.Haur_4781(PF13391)(ER)
316274.Haur_1574(PF00668) (PF13745)
316274.Haur_4328(PF00534) (PF13439)
316274.Haur_4438(PF00534) (PF13439)
316274.Haur_1217(PF13185)(mitochondrial)
316274.Haur_0234(PF00534) (PF13439)
316274.Haur_3448(PF06013) PF00648
316274.Haur_2740PF01740 (PF13185)
316274.Haur_3848(PF00931) (PF13424)
316274.Haur_2957(PF00534) (PF13579)
316274.Haur_4009(PF00534) (PF13439)
316274.Haur_1896PF14329
316274.Haur_2161(PF13185)
316274.Haur_4114(PF13185)
316274.Haur_1308(PF13185)
316274.Haur_0926(PF12698)
316274.Haur_0216(PF06013)
316274.Haur_0852(PF13185)
316274.Haur_4376(PF00183)
316274.Haur_4377(PF00183)
316274.Haur_0323(PF09414)
316274.Haur_0451PF01740
316274.Haur_3220(PF01609)
316274.Haur_3319(PF08239)
316274.Haur_3488(PF12867)
316274.Haur_2576(PF06013)
316274.Haur_2577(PF06013)
316274.Haur_2570(PF13240)
316274.Haur_3179(PF04423)
316274.Haur_3171(PF02146)
316274.Haur_3172(PF02146)
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316274.Haur_3251(PF06013)
316274.Haur_3257(PF06013)
316274.Haur_3071(PF01609)
316274.Haur_2279(PF13424)
316274.Haur_2273(PF13492)
316274.Haur_2296PF01740
316274.Haur_0042(PF00534)
316274.Haur_2106(PF00668)
316274.Haur_3085(PF13366)not used
316274.Haur_3086(PF13366)not used
316274.Haur_3712(PF13579)
316274.Haur_3402(PF00454)
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316274.Haur_1938(PF01609)
316274.Haur_1934(PF01609)
316274.Haur_0997(PF12867)
316274.Haur_2674(PF12698)
316274.Haur_0501(PF15588)
316274.Haur_1113(PF13424)
316274.Haur_1112(PF00931)
316274.Haur_4077(PF13424)
316274.Haur_0373(PF03033)
316274.Haur_0571(PF12867)
316274.Haur_0402PF11978
316274.Haur_2459(PF02146)not used
316274.Haur_2458(PF02146)
316274.Haur_2450(PF09348)
316274.Haur_0322(PF00183)
316274.Haur_1839(PF00534)
316274.Haur_3508(PF13424)
316274.Haur_2586(PF06013)
316274.Haur_2584(PF06013)
316274.Haur_1902(PF00150)
316274.Haur_4421PF01740
316274.Haur_0410(PF13366)not used
316274.Haur_0636(PF13579)
316274.Haur_3995(PF13424)
316274.Haur_3511(PF03033)
316274.Haur_3684(PF12867)
316274.Haur_2805PF01740
316274.Haur_2158(PF00931)
316274.Haur_2154(PF13424)
316274.Haur_4656(PF13185)
316274.Haur_0888(PF00150)
316274.Haur_4259(PF13492)
316274.Haur_4325PF01740
316274.Haur_4437(PF12867)
316274.Haur_0773(PF11028)
316274.Haur_0775(PF00534)
316274.Haur_0221(PF07676)
316274.Haur_0223(PF08239)
316274.Haur_0428(PF12698)
316274.Haur_4026(PF08239)
316274.Haur_3852(PF14388)
316274.Haur_3851(PF06013)
316274.Haur_3458(PF13185)
316274.Haur_3459(PF13185)
316274.Haur_3527PF01740
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316274.Haur_1212(PF00534)
316274.Haur_2141(PF00092)
316274.Haur_0897(PF13240)
316274.Haur_0898(PF13240)
316274.Haur_2040(PF13424)
316274.Haur_1787(PF09458)
316274.Haur_1145(PF13424)
316274.Haur_0783(PF13911)
316274.Haur_2741(PF13185)
316274.Haur_3442PF01740
316274.Haur_3845(PF10672)
316274.Haur_3530(PF06013)
316274.Haur_2008(PF00668)
316274.Haur_3532(PF01609)
316274.Haur_1209(PF01609)
316274.Haur_2953PF01740
316274.Haur_1201(PF12867)
316274.Haur_4698PF01740
316274.Haur_0150(PF13391)
316274.Haur_0848(PF01609)
316274.Haur_3427(PF01609)
316274.Haur_3492(PF10672)
316274.Haur_3831(PF01609)

Detailed merged results for each protein sequence

Individual results for each protein sequence

Genome based results

Summary

  • Gram negative: YES (FDR = 0.5 %)
  • Functional Type III secretion system: NO (FDR = 12.5 %)
  • Functional Type IV secretion system: NO (FDR = 7.2 %)
  • Functional Type VI secretion system: NO (FDR = 7.7 %)

Individual results for each secretion system

Parameters:

==========================================================
EFFECTIVE_T3_OLD=selective
EFFECTIVE_T3_NEW=selective
PREDOTAR_ANIMAL_OR_PLANT=a
PROTEINS=INPUT PROTEINS
MODUS=genome
RUN_PREDOTAR=T
RUN_EFFECTIVE_T3=T
RUN_T4SEpre=0.5
RUN_EFFECTIVE_CCBD=T
RUN_EFFECTIVE_ELD=4
CheckM_COMPLETENESS=
RUN_EffectiveS346=T
GENOTYPE=COG Profile
EMAIL=
==========================================================