Effective results for Clostridium ljungdahlii DSM 13528 (eggnog40)
Summary
Number of putative secreted proteins: 187
- Predicted by T4SEpre: 0
- Predicted by EffectiveELD: 47 eukaryotic-like domains, contained in 187 proteins (31 high, 156 medium Z-score)
Predicted protein secretion systems (parentheses indicate weak positive predictions lacking more than 50% of core proteins of a secretion system): None
Protein based results
Putative secreted proteins (weak evidence indicated by parentheses)
Protein | EffectiveT3 | EffectiveCCBD | T4SEpre | EffectiveELD | Predotar |
---|---|---|---|---|---|
748727.CLJU_c17280 | (PF00037) (PF02906) (PF02256) | ||||
748727.CLJU_c22330 | (PF14478) | ER | |||
748727.CLJU_c39330 | (PF13205) | ER | |||
748727.CLJU_c08990 | (PF13205) | ER | |||
748727.CLJU_c24460 | (PF00079) | ER | |||
748727.CLJU_c14700 | (PF02906) (PF00037) (PF02256) | ||||
748727.CLJU_c29580 | (PF13187) | ER | |||
748727.CLJU_c25590 | PF06662 | ER | |||
748727.CLJU_c15000 | (PF00465) | mitochondrial; (mitochondrial) | |||
748727.CLJU_c27980 | (PF13205) | ER | |||
748727.CLJU_c22340 | (PF14478) | ER | |||
748727.CLJU_c22290 | (PF14478) | ER | |||
748727.CLJU_c27090 | (PF00488) | mitochondrial; (mitochondrial) | |||
748727.CLJU_c15690 | (PF00079) | ER | |||
748727.CLJU_c28010 | (PF00185) (PF02729) | (mitochondrial) | |||
748727.CLJU_c29630 | (PF13237) | ER | |||
748727.CLJU_c01880 | (PF13205) | ER | |||
748727.CLJU_c11410 | (PF13187) | ER | |||
748727.CLJU_c22390 | (PF14478) | ER | |||
748727.CLJU_c04880 | (PF08367) | ER | |||
748727.CLJU_c38430 | PF14566 | ER | |||
748727.CLJU_c07070 | (PF00037) (PF02906) (PF02256) | ||||
748727.CLJU_c22180 | (PF00488) | ER | |||
748727.CLJU_c01670 | (PF13205) | ER | |||
748727.CLJU_c12560 | (PF01327) | (mitochondrial); mitochondrial | |||
748727.CLJU_c21960 | (PF01327) | (mitochondrial) | |||
748727.CLJU_c05900 | (PF03442) | ER | |||
748727.CLJU_c08660 | PF06662 | mitochondrial; (mitochondrial) | |||
748727.CLJU_c23000 | (PF09370) | (mitochondrial) | |||
748727.CLJU_c40610 | (PF05034) (PF07476) | ||||
748727.CLJU_c25230 | (PF00185) (PF02729) | ||||
748727.CLJU_c42560 | (PF00185) (PF02729) | ||||
748727.CLJU_c20400 | (PF07991) (PF01450) | ||||
748727.CLJU_c06650 | (PF02607) (PF00809) | ||||
748727.CLJU_c37920 | (PF00037) | (mitochondrial) | |||
748727.CLJU_c20290 | (PF00037) (PF02906) | ||||
748727.CLJU_c20710 | PF01208 | (mitochondrial) | |||
748727.CLJU_c37220 | (PF00037) (PF02906) | ||||
748727.CLJU_c13640 | (PF01327) | (mitochondrial) | |||
748727.CLJU_c23840 | (PF00185) (PF02729) | ||||
748727.CLJU_c20390 | (PF07991) (PF01450) | ||||
748727.CLJU_c15310 | (PF07991) (PF01450) | ||||
748727.CLJU_c21500 | (PF02971) (PF07837) | ||||
748727.CLJU_c09280 | (PF00185) (PF02729) | ||||
748727.CLJU_c11880 | (PF00465) | (mitochondrial) | |||
748727.CLJU_c22510 | (PF00037) (PF13187) | ||||
748727.CLJU_c15290 | (PF00185) (PF02729) | ||||
748727.CLJU_c35730 | (PF00185) (PF02729) | ||||
748727.CLJU_c20580 | PF01208 | ||||
748727.CLJU_c37670 | (PF03063) | ||||
748727.CLJU_c17840 | (PF01327) | ||||
748727.CLJU_c14710 | (PF00037) | ||||
748727.CLJU_c08690 | (PF14691) | ||||
748727.CLJU_c21440 | (PF04961) | ||||
748727.CLJU_c22020 | (PF00882) | ||||
748727.CLJU_c17540 | PF03483 | ||||
748727.CLJU_c16520 | (PF00465) | ||||
748727.CLJU_c18470 | (PF00465) | ||||
748727.CLJU_c08680 | (PF00037) | ||||
748727.CLJU_c01630 | PF03483 | ||||
748727.CLJU_c26810 | PF06662 | ||||
748727.CLJU_c34380 | (PF00488) | ||||
748727.CLJU_c21820 | (PF00488) | ||||
748727.CLJU_c34410 | PF03483 | ||||
748727.CLJU_c35930 | (PF00465) | ||||
748727.CLJU_c05870 | (PF08950) | ||||
748727.CLJU_c20620 | (PF00809) | ||||
748727.CLJU_c39750 | (PF06249) | ||||
748727.CLJU_c19070 | (PF12513) | ||||
748727.CLJU_c17140 | (PF03266) | ||||
748727.CLJU_c37730 | (PF00037) | ||||
748727.CLJU_c37640 | (PF04961) | ||||
748727.CLJU_c06340 | (PF00809) | ||||
748727.CLJU_c34460 | (PF00707) | ||||
748727.CLJU_c16510 | (PF00465) | ||||
748727.CLJU_c20370 | (PF02906) | ||||
748727.CLJU_c17380 | (PF14691) | ||||
748727.CLJU_c39340 | (PF02915) | ||||
748727.CLJU_c37740 | (PF00037) | ||||
748727.CLJU_c37460 | (PF07892) | ||||
748727.CLJU_c17910 | (PF03063) | ||||
748727.CLJU_c21110 | PF01208 | ||||
748727.CLJU_c35880 | (PF14691) | ||||
748727.CLJU_c21060 | PF01208 | ||||
748727.CLJU_c26180 | (PF13237) | ||||
748727.CLJU_c39670 | (PF00465) | ||||
748727.CLJU_c23510 | (PF00148) | ||||
748727.CLJU_c21240 | (PF00488) | ||||
748727.CLJU_c30580 | (PF01946) | ||||
748727.CLJU_c37240 | (PF14691) | ||||
748727.CLJU_c19120 | PF01208 | ||||
748727.CLJU_c38930 | (PF00465) | ||||
748727.CLJU_c17980 | (PF13187) | ||||
748727.CLJU_c38800 | (PF04961) | ||||
748727.CLJU_c24190 | (PF14691) | ||||
748727.CLJU_c00160 | (PF07892) | ||||
748727.CLJU_c24990 | PF01208 | ||||
748727.CLJU_c24970 | PF01208 | ||||
748727.CLJU_c20670 | (PF02607) | ||||
748727.CLJU_c21070 | PF01208 | ||||
748727.CLJU_c25950 | (PF02915) | ||||
748727.CLJU_c20700 | (PF02607) | ||||
748727.CLJU_c04930 | (PF00148) | ||||
748727.CLJU_c07570 | PF01208 | ||||
748727.CLJU_c22750 | PF01208 | ||||
748727.CLJU_c37560 | (PF00809) | ||||
748727.CLJU_c02050 | (PF01633) | ||||
748727.CLJU_c20680 | PF01208 | ||||
748727.CLJU_c30740 | (PF00465) | ||||
748727.CLJU_c11360 | (PF13237) | ||||
748727.CLJU_c30250 | (PF13187) | ||||
748727.CLJU_c04940 | (PF00148) | ||||
748727.CLJU_c07560 | (PF02607) | ||||
748727.CLJU_c01240 | (PF03662) | ||||
748727.CLJU_c19100 | PF01208 | ||||
748727.CLJU_c32090 | PF14566 | ||||
748727.CLJU_c15050 | (PF00488) | ||||
748727.CLJU_c07500 | (PF00809) | ||||
748727.CLJU_c23520 | (PF00148) | ||||
748727.CLJU_c30310 | (PF03442) | ||||
748727.CLJU_c26430 | (PF13237) | ||||
748727.CLJU_c30260 | (PF14691) | ||||
748727.CLJU_c04950 | (PF00148) | ||||
748727.CLJU_c07550 | (PF00809) | ||||
748727.CLJU_c19110 | (PF02607) | ||||
748727.CLJU_c37360 | (PF08367) | ||||
748727.CLJU_c07730 | (PF03063) | ||||
748727.CLJU_c07040 | (PF00037) | ||||
748727.CLJU_c31010 | PF03483 | ||||
748727.CLJU_c27560 | PF01208 | ||||
748727.CLJU_c28910 | (PF02915) | ||||
748727.CLJU_c00930 | (PF00037) | ||||
748727.CLJU_c30300 | PF01208 | ||||
748727.CLJU_c04960 | (PF00148) | ||||
748727.CLJU_c11940 | (PF06249) | ||||
748727.CLJU_c23460 | (PF00465) | ||||
748727.CLJU_c21600 | (PF09861) | ||||
748727.CLJU_c23110 | (PF00148) | ||||
748727.CLJU_c27770 | (PF02504) | ||||
748727.CLJU_c04620 | (PF09861) | ||||
748727.CLJU_c40210 | (PF01946) | ||||
748727.CLJU_c16270 | (PF01327) | ||||
748727.CLJU_c20030 | (PF13237) | ||||
748727.CLJU_c26960 | (PF13187) | ||||
748727.CLJU_c20740 | (PF02607) | ||||
748727.CLJU_c24880 | (PF00465) | ||||
748727.CLJU_c23100 | (PF00148) | ||||
748727.CLJU_c27290 | (PF02504) | ||||
748727.CLJU_c23040 | (PF00148) | ||||
748727.CLJU_c38500 | PF03483 | ||||
748727.CLJU_c03830 | (PF00465) | ||||
748727.CLJU_c24120 | (PF14691) | ||||
748727.CLJU_c15790 | (PF00882) | ||||
748727.CLJU_c40330 | (PF00037) | ||||
748727.CLJU_c29400 | (PF13187) | ||||
748727.CLJU_c26570 | (PF00465) | ||||
748727.CLJU_c07520 | PF01208 | ||||
748727.CLJU_c17010 | (PF02915) | ||||
748727.CLJU_c39660 | (PF01633) | ||||
748727.CLJU_c17270 | (PF00037) | ||||
748727.CLJU_c02000 | (PF01633) | ||||
748727.CLJU_c23830 | (PF14691) | ||||
748727.CLJU_c24040 | (PF14691) | ||||
748727.CLJU_c20560 | (PF02607) | ||||
748727.CLJU_c21180 | PF01208 | ||||
748727.CLJU_c20690 | (PF00809) | ||||
748727.CLJU_c20760 | (PF00707) | ||||
748727.CLJU_c07510 | (PF02607) | ||||
748727.CLJU_c09110 | (PF03063) | ||||
748727.CLJU_c12810 | (PF02504) | ||||
748727.CLJU_c02030 | (PF01633) | ||||
748727.CLJU_c23020 | (PF09370) | ||||
748727.CLJU_c07080 | (PF13237) | ||||
748727.CLJU_c40220 | (PF13187) | ||||
748727.CLJU_c20570 | PF01208 | ||||
748727.CLJU_c21080 | (PF02607) | ||||
748727.CLJU_c19090 | PF01208 | ||||
748727.CLJU_c22040 | (PF02915) | ||||
748727.CLJU_c14440 | (PF12646) | ||||
748727.CLJU_c37040 | PF03483 | ||||
748727.CLJU_c23030 | (PF00148) | ||||
748727.CLJU_c39460 | (PF02915) | ||||
748727.CLJU_c15560 | (PF09861) | ||||
748727.CLJU_c27260 | (PF03063) | ||||
748727.CLJU_c39950 | (PF00465) | ||||
748727.CLJU_c34730 | PF01208 | ||||
748727.CLJU_c04530 | PF00688 |
Detailed merged results for each protein sequence
- Detailed merged results as table (merge_results.html)
- Detailed merged results as tab delimited file (merge_results.csv)
Individual results for each protein sequence
- EffectiveELD predictions (PROTEINS.ELD.TXT)
- Predotar predictions using animal/human model (Predotar_output_modelANIMAL.TXT)
- Predotar predictions using plant model (Predotar_output_modelPLANT.TXT)