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Effective results for Desulfotomaculum kuznetsovii DSM 6115 (eggnog40)

Summary

Number of putative secreted proteins: 198
- Predicted by T4SEpre: 0
- Predicted by EffectiveELD: 39 eukaryotic-like domains, contained in 198 proteins (7 high, 191 medium Z-score)
Predicted protein secretion systems (parentheses indicate weak positive predictions lacking more than 50% of core proteins of a secretion system): None

Protein based results

Putative secreted proteins (weak evidence indicated by parentheses)

ProteinEffectiveT3EffectiveCCBDT4SEpreEffectiveELDPredotar
760568.Desku_2995(PF10588) (PF00037) (PF13510) (PF02906) (PF02256)
760568.Desku_2934(PF10588) (PF13510) (PF02256) (PF12838) (PF02906)
760568.Desku_0995(PF10588) (PF00037) (PF13510) (PF02906) (PF02256)
760568.Desku_2307(PF10588) (PF13510) (PF02906) (PF02256)
760568.Desku_3325(PF01966)ER
760568.Desku_3134(PF10588) (PF13510) (PF14697)
760568.Desku_3232(PF00939)ER
760568.Desku_3231(PF02910)ER; (ER)
760568.Desku_0061(PF12838)(mitochondrial)
760568.Desku_2989(PF10588) (PF13510) (PF14697)
760568.Desku_2988(PF10588) (PF13510) (PF12838)
760568.Desku_1057(PF08797)mitochondrial
760568.Desku_1528(PF01257) (PF10589) (PF12838)
760568.Desku_3103(PF02910)(ER)
760568.Desku_0866(PF01966)(mitochondrial)
760568.Desku_1952(PF00939)(ER)
760568.Desku_3484(PF01656)(mitochondrial); mitochondrial
760568.Desku_0142(PF01656)(mitochondrial)
760568.Desku_0721(PF01966)(mitochondrial)
760568.Desku_2368(PF01656)mitochondrial
760568.Desku_2380(PF01966)ER
760568.Desku_2370(PF01656)mitochondrial
760568.Desku_2393(PF02754)mitochondrial
760568.Desku_0385(PF01171)(mitochondrial)
760568.Desku_2816(PF01909) (PF05168)(mitochondrial)
760568.Desku_2800(PF01966)ER
760568.Desku_1353(PF02910)ER
760568.Desku_1350(PF13607)(mitochondrial)
760568.Desku_3285(PF13187)ER; (ER)
760568.Desku_3511(PF01966)ER
760568.Desku_0961(PF01909)(mitochondrial)
760568.Desku_0187(PF12838) (PF00037)(ER)
760568.Desku_1765(PF01656)mitochondrial; (mitochondrial)
760568.Desku_0358(PF00882)mitochondrial
760568.Desku_2635(PF01966)mitochondrial
760568.Desku_2990(PF01257) (PF10589) (PF00037)
760568.Desku_2449(PF01656)mitochondrial
760568.Desku_1649(PF01966)mitochondrial
760568.Desku_3243(PF00939)ER
760568.Desku_2899(PF01966)ER
760568.Desku_3227(PF01729) (PF02749)
760568.Desku_3133(PF13187)(mitochondrial)
760568.Desku_1478(PF13187) (PF00037)
760568.Desku_1078(PF13534)(mitochondrial)
760568.Desku_1500(PF13187) (PF13510)
760568.Desku_2750(PF10589) (PF00037)
760568.Desku_0873(PF01966)(ER)
760568.Desku_3107(PF13510) (PF12838)
760568.Desku_2994(PF02906) (PF12838)
760568.Desku_2996(PF10589) (PF00037)
760568.Desku_2429(PF01966)(ER)
760568.Desku_0614(PF01729) (PF02749)
760568.Desku_1432(PF04432) (PF13534)
760568.Desku_1092(PF13415)plastid
760568.Desku_1897(PF00037) (PF01656)
760568.Desku_1898(PF00037) (PF01656)
760568.Desku_1352(PF04432) (PF00037)
760568.Desku_2156(PF02754) (PF13534)
760568.Desku_0188(PF13187) (PF12838)
760568.Desku_0190(PF13534)(mitochondrial)
760568.Desku_1248(PF01729) (PF02749)
760568.Desku_3089(PF01171)(mitochondrial)
760568.Desku_1493(PF01656)(mitochondrial)
760568.Desku_1104(PF07646)plastid
760568.Desku_2450(PF01656)(plastid)
760568.Desku_1482(PF04432) (PF13534)
760568.Desku_1489(PF01656)(mitochondrial)
760568.Desku_2308(PF01257) (PF10589)
760568.Desku_2303(PF13607)(plastid)
760568.Desku_0535(PF13187)
760568.Desku_0222(PF01909)
760568.Desku_0225(PF01637)
760568.Desku_1257(PF13607)
760568.Desku_2467(PF01656)
760568.Desku_2312(PF07085)
760568.Desku_2313(PF02906)
760568.Desku_2311(PF01257)
760568.Desku_2315(PF07085)
760568.Desku_3228(PF02910)
760568.Desku_2794(PF01966)
760568.Desku_3135(PF10589)
760568.Desku_3136(PF01257)
760568.Desku_0815(PF02910)
760568.Desku_0674(PF01966)
760568.Desku_1951(PF02910)
760568.Desku_1950(PF13187)
760568.Desku_1479(PF02754)
760568.Desku_1671PF16760
760568.Desku_1076(PF13187)
760568.Desku_1077(PF02754)
760568.Desku_1074(PF02910)
760568.Desku_1075(PF00037)
760568.Desku_1073(PF13187)
760568.Desku_1502(PF13534)
760568.Desku_3122(PF13187)
760568.Desku_3349(PF02754)
760568.Desku_0481PF03148
760568.Desku_0802(PF13607)
760568.Desku_2404(PF05168)
760568.Desku_2405(PF01909)
760568.Desku_3119(PF13187)
760568.Desku_3118(PF02754)
760568.Desku_3111PF16114
760568.Desku_0475(PF13607)
760568.Desku_0279(PF01964)
760568.Desku_0278(PF01964)
760568.Desku_2969(PF01930)
760568.Desku_2180(PF01909)
760568.Desku_1527(PF01257)
760568.Desku_2611(PF01966)
760568.Desku_2614(PF01966)
760568.Desku_3101(PF02754)
760568.Desku_3102(PF13187)
760568.Desku_3109(PF13607)
760568.Desku_2997(PF01257)
760568.Desku_0598(PF01966)
760568.Desku_2972(PF08797)
760568.Desku_0136(PF01909)
760568.Desku_2350(PF13607)
760568.Desku_2519(PF12838)
760568.Desku_3391(PF01966)
760568.Desku_3486(PF02754)
760568.Desku_0456(PF01930)
760568.Desku_0853(PF01656)
760568.Desku_0850(PF01656)
760568.Desku_0700(PF05168)
760568.Desku_2947(PF00037)
760568.Desku_1436(PF13534)
760568.Desku_1435(PF02754)
760568.Desku_1646(PF12838)
760568.Desku_1949(PF00037)
760568.Desku_2015(PF00037)
760568.Desku_3010(PF02754)
760568.Desku_3494(PF14697)
760568.Desku_2339(PF01966)
760568.Desku_1710(PF01909)
760568.Desku_1374(PF00882)
760568.Desku_2177(PF01909)
760568.Desku_2574(PF01909)
760568.Desku_3151(PF02754)
760568.Desku_0435(PF02910)
760568.Desku_0544(PF01964)
760568.Desku_2720(PF14697)
760568.Desku_2034(PF01966)
760568.Desku_2039(PF01966)
760568.Desku_0958(PF01966)
760568.Desku_2935(PF01257)
760568.Desku_2932(PF02906)
760568.Desku_2150(PF03063)
760568.Desku_2557(PF00037)not used
760568.Desku_1914(PF12838)
760568.Desku_3281(PF01966)
760568.Desku_0417(PF01656)
760568.Desku_0962(PF05168)
760568.Desku_2837(PF01966)
760568.Desku_0185(PF02754)
760568.Desku_1349PF16114
760568.Desku_1905(PF13187)
760568.Desku_2053(PF01656)
760568.Desku_3475(PF00939)
760568.Desku_3477(PF00037)
760568.Desku_0978PF07889
760568.Desku_0192(PF02754)
760568.Desku_0191(PF13534)
760568.Desku_1501(PF02754)
760568.Desku_2131(PF12838)
760568.Desku_2048PF02002
760568.Desku_1804(PF03161)
760568.Desku_1800(PF01909)
760568.Desku_0606(PF01930)
760568.Desku_2991(PF01257)
760568.Desku_0218(PF01966)
760568.Desku_2857(PF00037)
760568.Desku_0212(PF01171)
760568.Desku_0699(PF01909)
760568.Desku_0033(PF00037)
760568.Desku_1108(PF01442)
760568.Desku_2107(PF01656)
760568.Desku_1256(PF07085)
760568.Desku_2699(PF01656)
760568.Desku_2679(PF00037)
760568.Desku_2678(PF13510)
760568.Desku_0685(PF00939)
760568.Desku_0024(PF01966)
760568.Desku_1486(PF12838)
760568.Desku_1484(PF02754)
760568.Desku_1263(PF14697)
760568.Desku_3246(PF02910)
760568.Desku_2872(PF01909)
760568.Desku_2871(PF01637)
760568.Desku_0306(PF03063)
760568.Desku_1496(PF00037)
760568.Desku_1492(PF03063)
760568.Desku_2650(PF01637)
760568.Desku_2302(PF07085)
760568.Desku_2304(PF01171)
760568.Desku_2787(PF03063)
760568.Desku_1874PF16760

Detailed merged results for each protein sequence

Individual results for each protein sequence

Genome based results

Summary

  • Gram negative: NO (FDR = 0.5 %)
  • Functional Type III secretion system: N.D.
  • Functional Type IV secretion system: NO (FDR = 7.2 %)
  • Functional Type VI secretion system: N.D.

Individual results for each secretion system

Parameters:

==========================================================
EFFECTIVE_T3_OLD=selective
EFFECTIVE_T3_NEW=selective
PREDOTAR_ANIMAL_OR_PLANT=a
PROTEINS=INPUT PROTEINS
MODUS=genome
RUN_PREDOTAR=T
RUN_EFFECTIVE_T3=T
RUN_T4SEpre=0.5
RUN_EFFECTIVE_CCBD=T
RUN_EFFECTIVE_ELD=4
CheckM_COMPLETENESS=
RUN_EffectiveS346=T
GENOTYPE=COG Profile
EMAIL=
==========================================================