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Effective results for Opitutus terrae PB90-1 (eggnog40)

Summary

Number of putative secreted proteins: 271
- Predicted by T4SEpre: 0
- Predicted by EffectiveELD: 57 eukaryotic-like domains, contained in 271 proteins (100 high, 171 medium Z-score)
Predicted protein secretion systems (parentheses indicate weak positive predictions lacking more than 50% of core proteins of a secretion system): None

Protein based results

Putative secreted proteins (weak evidence indicated by parentheses)

ProteinEffectiveT3EffectiveCCBDT4SEpreEffectiveELDPredotar
452637.Oter_2208(PF09284) (PF14686) (PF05345) (PF14683)mitochondrial
452637.Oter_2184PF13895 PF13927 PF07679ER
452637.Oter_0312PF13927 (PF05345) PF07679ER
452637.Oter_0071PF12704 (PF02687)mitochondrial
452637.Oter_1828PF12704 (PF02687)mitochondrial; (mitochondrial)
452637.Oter_1827PF12704 (PF02687)mitochondrial
452637.Oter_1640PF12704 (PF02687)ER
452637.Oter_1795PF07593 (PF13517)(mitochondrial); plastid
452637.Oter_1797PF07593 (PF13517)mitochondrial
452637.Oter_1874PF12704 (PF02687)(mitochondrial)
452637.Oter_1876PF12704 (PF02687)(mitochondrial)
452637.Oter_1873PF12704 (PF02687)(mitochondrial)
452637.Oter_1878PF12704 (PF02687)(mitochondrial)
452637.Oter_2945PF07593 (PF13517)ER
452637.Oter_2946PF12904 PF13204ER
452637.Oter_2942PF07593 (PF13517)(ER); (plastid)
452637.Oter_1855PF12704 (PF02687)(mitochondrial)
452637.Oter_3350PF12704 (PF02687)(mitochondrial); (plastid)
452637.Oter_2854(PF01436) PF07679ER
452637.Oter_3155PF12704 (PF02687)(mitochondrial)
452637.Oter_3156PF12704 (PF02687)(mitochondrial)
452637.Oter_0597PF07593 (PF13517)ER
452637.Oter_2514PF13927 (PF13570)(mitochondrial); (plastid)
452637.Oter_3938PF12704 (PF02687)mitochondrial
452637.Oter_1896PF12704 (PF02687)mitochondrial
452637.Oter_1894PF12704 (PF02687)ER
452637.Oter_1895PF12704 (PF02687)ER
452637.Oter_1892PF12704 (PF02687)ER; mitochondrial
452637.Oter_1893PF12704 (PF02687)mitochondrial
452637.Oter_1898PF12704 (PF02687)ER; mitochondrial
452637.Oter_1899PF12704 (PF02687)mitochondrial; (mitochondrial)
452637.Oter_1368PF12704 (PF02687)(mitochondrial); (plastid)
452637.Oter_0760PF12704 (PF02687)mitochondrial; (mitochondrial)
452637.Oter_3233PF07593 (PF13517)ER
452637.Oter_3237(PF04616) (PF03664)ER
452637.Oter_1889PF12704 (PF02687)mitochondrial
452637.Oter_1888PF12704 (PF02687)(ER); (mitochondrial)
452637.Oter_1883PF12704 (PF02687)(mitochondrial)
452637.Oter_1887PF12704 (PF02687)mitochondrial; (mitochondrial)
452637.Oter_1886PF12704 (PF02687)(ER)
452637.Oter_0021PF12704 (PF02687)(mitochondrial)
452637.Oter_4610PF13927 (PF00331)ER
452637.Oter_2084PF12704 (PF02687)ER
452637.Oter_0327PF07679 (PF03664)ER
452637.Oter_0320PF12704 (PF02687)mitochondrial; (mitochondrial)
452637.Oter_0518PF07593 (PF13517)mitochondrial
452637.Oter_3645PF12704 (PF02687)mitochondrial
452637.Oter_2275PF07593 (PF13517)(ER); (mitochondrial)
452637.Oter_0313PF13927 (PF05345)ER
452637.Oter_0319PF12704 (PF02687)mitochondrial
452637.Oter_3064PF12904 PF13204mitochondrial; (mitochondrial)
452637.Oter_2932PF07593 (PF13517)(mitochondrial); mitochondrial
452637.Oter_4159PF12704 (PF02687)mitochondrial
452637.Oter_2324PF07593 (PF13517)ER
452637.Oter_2327PF07593 (PF13517)(ER); (mitochondrial)
452637.Oter_1513PF12704 (PF02687)mitochondrial
452637.Oter_1839PF12904 PF13204ER
452637.Oter_3224(PF04616)ER
452637.Oter_0854PF07679ER
452637.Oter_2122PF07632ER
452637.Oter_2344(PF03544)ER
452637.Oter_1829PF12704 (PF02687)(mitochondrial)
452637.Oter_2218(PF03571)ER
452637.Oter_1009(PF03544)ER
452637.Oter_1002(PF03544)ER
452637.Oter_3228(PF04616)ER
452637.Oter_0992(PF16355)ER
452637.Oter_3336(PF11175)ER
452637.Oter_2205(PF02687)(mitochondrial)
452637.Oter_3220(PF05345)ER
452637.Oter_1817(PF06964)mitochondrial
452637.Oter_1251(PF04616)ER
452637.Oter_2972(PF16757)ER
452637.Oter_1101(PF00331)ER
452637.Oter_2319PF07593 (PF13517)(mitochondrial)
452637.Oter_2587(PF05140)(ER)
452637.Oter_1489(PF13441)ER
452637.Oter_1875PF12704 (PF02687)(mitochondrial)
452637.Oter_1877PF12704 (PF02687)(mitochondrial)
452637.Oter_2954(PF13517)ER
452637.Oter_1618PF07679(mitochondrial)
452637.Oter_1271(PF12708)mitochondrial
452637.Oter_1906PF12704 (PF02687)(mitochondrial)
452637.Oter_2822(PF05140)ER
452637.Oter_4336(PF06964)ER
452637.Oter_4220(PF06165) (PF17167)(plastid)
452637.Oter_3704(PF00331)ER
452637.Oter_1869PF12704 (PF02687)(mitochondrial)
452637.Oter_4438(PF09990)(ER)
452637.Oter_4344(PF15979)ER
452637.Oter_3171(PF13441)ER
452637.Oter_0974PF13204ER
452637.Oter_3718(PF04616)ER
452637.Oter_3378(PF16355)ER
452637.Oter_2156PF07632ER
452637.Oter_2440(PF01128)(mitochondrial)
452637.Oter_2447(PF12483)ER
452637.Oter_1852PF12704 (PF02687)(mitochondrial)
452637.Oter_3218(PF16757)ER
452637.Oter_3212(PF06964)(mitochondrial); (plastid)
452637.Oter_0385(PF03544)ER
452637.Oter_4405(PF05140)ER
452637.Oter_4248(PF05345)ER
452637.Oter_2704(PF07470)ER
452637.Oter_2457(PF00146)ER
452637.Oter_3925(PF13518)(mitochondrial); (plastid)
452637.Oter_1154(PF05345)ER
452637.Oter_4520(PF11175)ER
452637.Oter_0359(PF04616)ER
452637.Oter_0593(PF13517)ER
452637.Oter_3024PF03151ER
452637.Oter_2464(PF00329) (PF00346)(ER)
452637.Oter_2461(PF00146)ER
452637.Oter_1093(PF03544)ER
452637.Oter_1366(PF04616)ER
452637.Oter_1369(PF15979)ER
452637.Oter_0345(PF12617)ER
452637.Oter_4289(PF04616)ER
452637.Oter_0583(PF03544)ER
452637.Oter_4115(PF00146)ER
452637.Oter_2189(PF13570)(ER); plastid
452637.Oter_1394PF13895(ER); ER
452637.Oter_1390(PF04616)ER
452637.Oter_1376(PF07470)ER
452637.Oter_1374(PF06964)ER; (ER)
452637.Oter_0330(PF06964)ER
452637.Oter_4270(PF07470)ER
452637.Oter_4272(PF13518)(mitochondrial); (plastid)
452637.Oter_3225(PF06964)ER
452637.Oter_4617PF07679(mitochondrial)
452637.Oter_4616PF13927(mitochondrial); mitochondrial
452637.Oter_4612PF13927ER
452637.Oter_3823PF07679ER
452637.Oter_4100(PF03544)ER
452637.Oter_1344(PF07470)ER
452637.Oter_1743(PF13518)(mitochondrial); (plastid)
452637.Oter_0747(PF00146)(ER); ER
452637.Oter_3219(PF11721)(ER)
452637.Oter_3215PF07632ER
452637.Oter_3673(PF11721)ER
452637.Oter_2277PF13204ER
452637.Oter_2414(PF13518)(mitochondrial); (plastid)
452637.Oter_1993PF12704 (PF02687)(ER)
452637.Oter_1999PF13927 (PF15979)plastid
452637.Oter_1355(PF16355)ER
452637.Oter_0134PF13204ER
452637.Oter_0487(PF13517)ER
452637.Oter_0316(PF07470)ER
452637.Oter_3662(PF00331)ER
452637.Oter_3842(PF03544)ER
452637.Oter_3207(PF04616)ER
452637.Oter_3209(PF00331)ER
452637.Oter_2647(PF03544)ER
452637.Oter_3065PF13927 PF07679(mitochondrial)
452637.Oter_2426(PF13518)(mitochondrial); (plastid)
452637.Oter_1508(PF03544)ER
452637.Oter_0491PF07593 (PF13517)mitochondrial
452637.Oter_0493(PF13517)ER
452637.Oter_4487(PF13441)ER
452637.Oter_2256PF07679ER
452637.Oter_3096(PF06071)(mitochondrial)
452637.Oter_2320(PF13517)(ER); ER
452637.Oter_3897PF12904ER
452637.Oter_1201(PF13441)ER
452637.Oter_1681PF12704 (PF02687)(ER)
452637.Oter_2929(PF16355)ER
452637.Oter_4322(PF04616)ER
452637.Oter_2227(PF00331)ER
452637.Oter_2229(PF11721)ER
452637.Oter_1782(PF03544)ER
452637.Oter_1012(PF03544)ER
452637.Oter_1010(PF03544)ER
452637.Oter_4290(PF13518)(mitochondrial); (plastid)
452637.Oter_4618(PF01436)plastid
452637.Oter_3635(PF08392)plastid
452637.Oter_1814PF12704 (PF02687)
452637.Oter_0556(PF01436) PF13927
452637.Oter_2953PF07593 (PF13517)
452637.Oter_2951PF07593 (PF13517)
452637.Oter_2167PF13927 (PF00059)
452637.Oter_0571PF12704 (PF02687)
452637.Oter_1856PF12704 (PF02687)
452637.Oter_1639PF12704 (PF02687)
452637.Oter_2466(PF00329) (PF00346)
452637.Oter_1897PF12704 (PF02687)
452637.Oter_1890PF12704 (PF02687)
452637.Oter_3235(PF13517)(mitochondrial)
452637.Oter_1885PF12704 (PF02687)
452637.Oter_1393(PF04616) PF13927
452637.Oter_2265(PF01436)(plastid)
452637.Oter_2310(PF06165) (PF17167)
452637.Oter_2312(PF06165) (PF17167)
452637.Oter_1744(PF06165) (PF17167)
452637.Oter_1745(PF06165) (PF17167)
452637.Oter_1995PF12704 (PF02687)
452637.Oter_3201PF07593 (PF13517)
452637.Oter_2331PF07593 (PF13517)
452637.Oter_0124(PF09990)(ER)
452637.Oter_0490PF07593 (PF13517)
452637.Oter_4157(PF01128)(ER)
452637.Oter_3898(PF13570)(ER)
452637.Oter_1512PF12704 (PF02687)
452637.Oter_0479(PF00146)
452637.Oter_0072(PF13366)
452637.Oter_4313(PF13347)
452637.Oter_3747(PF01704)
452637.Oter_3045(PF03571)
452637.Oter_1225(PF01192)
452637.Oter_0192(PF00958)
452637.Oter_3334(PF12708)
452637.Oter_1254(PF00958)
452637.Oter_1102(PF06745)
452637.Oter_0455(PF01128)
452637.Oter_2589(PF02873)
452637.Oter_0080(PF03544)
452637.Oter_4359(PF02899)
452637.Oter_4357(PF02899)
452637.Oter_4221(PF13347)
452637.Oter_1269(PF13347)
452637.Oter_0375(PF04616)
452637.Oter_4235(PF06745)
452637.Oter_0970(PF13875)
452637.Oter_3719(PF12708)
452637.Oter_2718(PF01192)
452637.Oter_3545(PF04616)
452637.Oter_2529(PF04616)
452637.Oter_2637(PF02873)
452637.Oter_2142(PF14721)
452637.Oter_1620(PF13366)
452637.Oter_4524(PF13347)
452637.Oter_4418(PF02482)
452637.Oter_4385(PF02899)
452637.Oter_4387(PF02899)
452637.Oter_3550(PF02899)
452637.Oter_0820(PF06071)
452637.Oter_2602(PF13347)
452637.Oter_2049(PF13347)
452637.Oter_2992(PF13347)
452637.Oter_2993(PF13347)
452637.Oter_1439(PF02482)
452637.Oter_1360(PF07470)
452637.Oter_4117(PF00329)
452637.Oter_4118(PF00346)
452637.Oter_2617(PF02482)
452637.Oter_3903(PF04616)
452637.Oter_2051(PF16355)
452637.Oter_2982(PF02899)
452637.Oter_2984(PF02899)
452637.Oter_1391(PF13347)
452637.Oter_1392(PF04616)
452637.Oter_1170(PF12708)
452637.Oter_2315(PF13347)
452637.Oter_1568(PF13366)
452637.Oter_1564(PF01704)
452637.Oter_2883(PF07470)
452637.Oter_0745(PF00329)
452637.Oter_0746(PF00346)
452637.Oter_3109(PF04616)
452637.Oter_0483(PF00346)
452637.Oter_0484(PF00329)
452637.Oter_4583(PF02899)
452637.Oter_2642(PF02482)
452637.Oter_1215(PF02899)
452637.Oter_1217(PF02899)
452637.Oter_1692(PF13570)
452637.Oter_0125(PF09990)
452637.Oter_0126(PF02482)
452637.Oter_3274(PF12899)
452637.Oter_2357(PF13366)
452637.Oter_1234(PF06745)
452637.Oter_1017(PF12708)

Detailed merged results for each protein sequence

Individual results for each protein sequence

Genome based results

Summary

  • Gram negative: YES (FDR = 0.5 %)
  • Functional Type III secretion system: NO (FDR = 12.5 %)
  • Functional Type IV secretion system: NO (FDR = 7.2 %)
  • Functional Type VI secretion system: NO (FDR = 7.7 %)

Individual results for each secretion system

Parameters:

==========================================================
EFFECTIVE_T3_OLD=selective
EFFECTIVE_T3_NEW=selective
PREDOTAR_ANIMAL_OR_PLANT=a
PROTEINS=INPUT PROTEINS
MODUS=genome
RUN_PREDOTAR=T
RUN_EFFECTIVE_T3=T
RUN_T4SEpre=0.5
RUN_EFFECTIVE_CCBD=T
RUN_EFFECTIVE_ELD=4
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