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Effective results for Haliangium ochraceum DSM 14365 (eggnog40)

Summary

Number of putative secreted proteins: 802
- Predicted by T4SEpre: 0
- Predicted by EffectiveELD: 124 eukaryotic-like domains, contained in 802 proteins (419 high, 383 medium Z-score)
Predicted protein secretion systems (parentheses indicate weak positive predictions lacking more than 50% of core proteins of a secretion system): None

Protein based results

Putative secreted proteins (weak evidence indicated by parentheses)

ProteinEffectiveT3EffectiveCCBDT4SEpreEffectiveELDPredotar
502025.Hoch_5110(PF07719) (PF13432) (PF13424)ER
502025.Hoch_0754PF00147 PF12947 PF07645ER
502025.Hoch_3295(PF00400) (PF13191) PF00069(mitochondrial)
502025.Hoch_1393(PF13424) (PF13191) PF00069(mitochondrial); (plastid)
502025.Hoch_2645(PF13191) PF00069(mitochondrial)
502025.Hoch_3590(PF13646) PF12765(mitochondrial); (plastid)
502025.Hoch_6656(PF13432) (PF13424) PF00069(plastid)
502025.Hoch_0596PF14312 PF12733ER
502025.Hoch_3962(PF13174) (PF13424)ER
502025.Hoch_6665(PF00675) (PF05193)(mitochondrial); mitochondrial
502025.Hoch_6664(PF00675) (PF05193)ER
502025.Hoch_2269PF05922 PF01033ER
502025.Hoch_2268PF05922 PF01033ER
502025.Hoch_2267PF05922 PF01033ER
502025.Hoch_5625(PF07719) (PF13432)ER
502025.Hoch_0799(PF00698) (PF16197)mitochondrial; (mitochondrial)
502025.Hoch_0281(PF00675) (PF05193)(ER)
502025.Hoch_3487(PF13191) PF00069mitochondrial
502025.Hoch_1383PF00147 PF12947ER
502025.Hoch_0224(PF13191) PF00069mitochondrial; (mitochondrial)
502025.Hoch_0196(PF00400) (PF12894)mitochondrial
502025.Hoch_4842(PF13174) (PF13424)mitochondrial; ER
502025.Hoch_2332(PF13768) (PF08487)ER
502025.Hoch_0875PF05922 PF01033ER
502025.Hoch_1512(PF12256) (PF03534)mitochondrial
502025.Hoch_1182(PF14765) (PF00698) (PF16197)(ER)
502025.Hoch_1530(PF04885) PF14312 PF12733(ER)
502025.Hoch_0091(PF00675) (PF05193)ER
502025.Hoch_0892PF14312 PF12733ER
502025.Hoch_3167(PF10569) (PF07678)ER
502025.Hoch_1230PF14312 PF12733ER
502025.Hoch_4918(PF02844) (PF02843)(mitochondrial)
502025.Hoch_4615(PF13432) (PF13646)ER
502025.Hoch_1391PF00147 PF12947(mitochondrial)
502025.Hoch_2156PF02985 (PF13646)ER
502025.Hoch_6754PF14312 PF12733(mitochondrial)
502025.Hoch_0988PF00147 PF10577ER
502025.Hoch_0376(PF13432) (PF13174)ER
502025.Hoch_0686PF14312 PF12733ER
502025.Hoch_5108(PF00158) PF00498(mitochondrial)
502025.Hoch_0405(PF13176) (PF13191) (PF13424)
502025.Hoch_0882PF13948ER
502025.Hoch_2891PF06094mitochondrial
502025.Hoch_4838(PF09949)ER
502025.Hoch_4835(PF13307)(mitochondrial)
502025.Hoch_1193PF13948ER
502025.Hoch_1730PF13948 PF05735(ER)
502025.Hoch_1734(PF04885)ER
502025.Hoch_5312PF05922ER
502025.Hoch_4901PF02412ER
502025.Hoch_5428(PF05721)(mitochondrial)
502025.Hoch_3905PF02412ER
502025.Hoch_3570(PF13374) (PF13424) PF00069
502025.Hoch_3712(PF13646)ER
502025.Hoch_6874PF16697(mitochondrial)
502025.Hoch_0164(PF13432)mitochondrial
502025.Hoch_5408(PF13646)(mitochondrial)
502025.Hoch_3961(PF13432)(mitochondrial)
502025.Hoch_2384(PF13176)ER
502025.Hoch_2386PF00069(mitochondrial)
502025.Hoch_2972(PF14765) (PF00698) (PF16197)
502025.Hoch_2974(PF14765) (PF00698) (PF16197)
502025.Hoch_5912(PF00400)(mitochondrial); (plastid)
502025.Hoch_2015PF05922ER
502025.Hoch_2953(PF00698) (PF16197)(mitochondrial)
502025.Hoch_2955(PF14765) (PF00698) (PF16197)
502025.Hoch_2954(PF14765) (PF00698) (PF16197)
502025.Hoch_2957(PF14765) (PF00698) (PF16197)
502025.Hoch_2956(PF14765) (PF00698) (PF16197)
502025.Hoch_1281(PF16861) (PF02543)(mitochondrial)
502025.Hoch_1024(PF12705)(mitochondrial); mitochondrial
502025.Hoch_5079PF14312 PF12733(ER)
502025.Hoch_6131(PF13558)mitochondrial
502025.Hoch_6342(PF12706)mitochondrial
502025.Hoch_3070PF00058ER
502025.Hoch_3078PF13540ER
502025.Hoch_4090(PF13519)ER
502025.Hoch_1005PF06094(mitochondrial)
502025.Hoch_2054PF05922ER
502025.Hoch_3093(PF13768)ER
502025.Hoch_3094(PF00030)mitochondrial
502025.Hoch_0229PF05922ER
502025.Hoch_2915PF06094mitochondrial
502025.Hoch_5053(PF12705)mitochondrial
502025.Hoch_3304(PF13432)ER
502025.Hoch_6173(PF14518)(mitochondrial)
502025.Hoch_6795(PF11617)mitochondrial
502025.Hoch_0798(PF14765) (PF00698) (PF16197)
502025.Hoch_1262(PF13374) (PF13191) (PF13424)
502025.Hoch_5974PF13948ER
502025.Hoch_6152(PF06452)ER
502025.Hoch_5567(PF13519)(mitochondrial)
502025.Hoch_3174(PF13432)ER
502025.Hoch_3177(PF13519)ER
502025.Hoch_1438(PF16861) (PF02543)(plastid)
502025.Hoch_1432(PF00400) (PF13191) PF00069
502025.Hoch_2169PF13948ER
502025.Hoch_6058PF02412ER
502025.Hoch_6053(PF16561)ER
502025.Hoch_6709PF13540ER
502025.Hoch_0547PF00069mitochondrial
502025.Hoch_1419(PF03109)mitochondrial
502025.Hoch_4490PF06094(mitochondrial)
502025.Hoch_0738PF13948ER
502025.Hoch_6079(PF09822)ER
502025.Hoch_1167(PF03109)ER
502025.Hoch_5268PF06094ER; (ER)
502025.Hoch_6712PF05922ER
502025.Hoch_0715(PF12705)(mitochondrial); mitochondrial
502025.Hoch_0978PF06094mitochondrial; (mitochondrial)
502025.Hoch_2826PF13948ER
502025.Hoch_0363(PF13432)ER
502025.Hoch_0364(PF06452)ER
502025.Hoch_1100(PF13374) (PF13424) PF00069
502025.Hoch_0777(PF12705)(mitochondrial)
502025.Hoch_5659(PF07719)ER
502025.Hoch_3465(PF13432)(ER)
502025.Hoch_1348(PF01419)(ER)
502025.Hoch_5011(PF02128)ER
502025.Hoch_3878PF00069(mitochondrial)
502025.Hoch_1806(PF13646)ER
502025.Hoch_3406(PF00368)mitochondrial; (mitochondrial)
502025.Hoch_0573PF13948mitochondrial
502025.Hoch_2677PF13540ER
502025.Hoch_3233(PF13374) (PF13424) PF00069
502025.Hoch_6772(PF07719) (PF13432)(mitochondrial)
502025.Hoch_2085PF13948ER
502025.Hoch_2084(PF13646)ER
502025.Hoch_6435(PF03109)ER
502025.Hoch_0873(PF07819)ER
502025.Hoch_2436(PF11028)ER
502025.Hoch_3193(PF13528)mitochondrial
502025.Hoch_0442(PF06884)ER
502025.Hoch_6451(PF07719)ER
502025.Hoch_0675PF06094mitochondrial
502025.Hoch_4803PF13948ER
502025.Hoch_1186(PF14765) (PF00698) (PF16197)
502025.Hoch_2183(PF00400) (PF12894)(plastid)
502025.Hoch_3763PF00069mitochondrial; (mitochondrial)
502025.Hoch_3762(PF13191) PF07714 (PF13424)
502025.Hoch_5699(PF13432)(mitochondrial)
502025.Hoch_3395(PF13432)ER
502025.Hoch_3020(PF11617)ER
502025.Hoch_4753(PF00158)ER
502025.Hoch_2968(PF14765) (PF00698) (PF16197)
502025.Hoch_2969(PF14765) (PF00698) (PF16197)
502025.Hoch_2961PF13540ER; (ER)
502025.Hoch_3956(PF00158) PF16697(plastid)
502025.Hoch_6671(PF07819)ER
502025.Hoch_6495(PF13432)ER
502025.Hoch_0636(PF12705)(mitochondrial)
502025.Hoch_2100(PF08326)(mitochondrial)
502025.Hoch_1947PF02412(mitochondrial)
502025.Hoch_2490(PF13174)ER
502025.Hoch_2491(PF13174)ER
502025.Hoch_4120(PF07819)ER
502025.Hoch_1045PF13540ER
502025.Hoch_3062(PF08757)ER
502025.Hoch_3063PF08685ER
502025.Hoch_1965(PF03109)ER
502025.Hoch_1966(PF13646)(ER); ER
502025.Hoch_2927PF00057(mitochondrial); mitochondrial
502025.Hoch_3296(PF00400) (PF13191) PF00069
502025.Hoch_1821(PF13558)(mitochondrial)
502025.Hoch_0033(PF08757)ER
502025.Hoch_4201(PF00965)ER
502025.Hoch_1078(PF03417)(mitochondrial)
502025.Hoch_1781PF00147ER
502025.Hoch_2783PF00069(mitochondrial)
502025.Hoch_2523PF00069(mitochondrial)
502025.Hoch_2525PF00069(mitochondrial)
502025.Hoch_6319(PF01030)ER
502025.Hoch_1272(PF00400) (PF13191) PF00069
502025.Hoch_4224PF00069(mitochondrial)
502025.Hoch_1055PF14312(ER); ER
502025.Hoch_5575(PF05090)mitochondrial
502025.Hoch_0903(PF12705)(mitochondrial); mitochondrial
502025.Hoch_6085PF00069mitochondrial; (mitochondrial)
502025.Hoch_2971(PF14765) (PF00698) (PF16197)
502025.Hoch_6551(PF16561) (PF13191) PF00069
502025.Hoch_5961(PF13519)ER
502025.Hoch_0074(PF07719) (PF13432) PF00069
502025.Hoch_5779PF02412ER
502025.Hoch_4979PF13948ER; (ER)
502025.Hoch_4797(PF13424) (PF13191) PF00069
502025.Hoch_4796PF12248ER
502025.Hoch_0523(PF13519)ER
502025.Hoch_1157(PF13374) (PF13424) PF00069
502025.Hoch_2172PF00069(mitochondrial)
502025.Hoch_0051(PF11028)ER
502025.Hoch_1094PF13948ER
502025.Hoch_2818PF06094mitochondrial
502025.Hoch_3639(PF00158)(mitochondrial)
502025.Hoch_6514PF14312ER
502025.Hoch_1397PF08123(mitochondrial)
502025.Hoch_0984PF13948ER
502025.Hoch_1173(PF14765) (PF00698) (PF16197)
502025.Hoch_5252(PF01739)(ER)
502025.Hoch_3827PF13948ER
502025.Hoch_2158PF00498(mitochondrial)
502025.Hoch_6701PF05922ER
502025.Hoch_0965(PF12705)(mitochondrial); mitochondrial
502025.Hoch_4733PF00498mitochondrial
502025.Hoch_1615(PF12706)ER
502025.Hoch_3611PF16697mitochondrial
502025.Hoch_3613PF16697ER
502025.Hoch_3612PF16697mitochondrial; (mitochondrial)
502025.Hoch_1373(PF06452)mitochondrial
502025.Hoch_1375PF14312ER
502025.Hoch_1745(PF13646)ER
502025.Hoch_2138(PF10569)ER
502025.Hoch_3260(PF13768)ER
502025.Hoch_3261(PF13519)ER
502025.Hoch_5869(PF13646)ER
502025.Hoch_2723(PF03109)ER
502025.Hoch_2856PF13540ER
502025.Hoch_3453(PF08757)ER
502025.Hoch_3457PF00058ER
502025.Hoch_3677(PF13432)ER
502025.Hoch_3676(PF13646)ER
502025.Hoch_3184PF00498mitochondrial
502025.Hoch_4651PF02412ER
502025.Hoch_4467(PF13432)ER
502025.Hoch_5337PF13540(ER)
502025.Hoch_6020(PF13424) (PF13191) PF00069
502025.Hoch_1333PF14312 PF12733(ER)
502025.Hoch_0825(PF12705)(mitochondrial); mitochondrial
502025.Hoch_6760(PF13424) PF00069
502025.Hoch_2096PF00069(mitochondrial)
502025.Hoch_2406(PF13191) (PF13424)
502025.Hoch_5073(PF16861) (PF02543)
502025.Hoch_1753(PF00158) PF16697
502025.Hoch_5379(PF09822)(mitochondrial)
502025.Hoch_6424(PF13191) PF00069
502025.Hoch_2647(PF00158) PF16697
502025.Hoch_1732(PF13424) PF00069
502025.Hoch_1736PF00191(plastid)
502025.Hoch_4159(PF05066)(plastid)
502025.Hoch_1508PF00069(ER)
502025.Hoch_1504(PF13424) PF00069
502025.Hoch_2362(PF13424) PF00069
502025.Hoch_1717PF00147 PF00200
502025.Hoch_6292(PF16861) (PF02543)
502025.Hoch_4352(PF13191) PF00069
502025.Hoch_5407(PF00158) PF16697
502025.Hoch_2970(PF00698) (PF16197)
502025.Hoch_1775PF14312 PF12733
502025.Hoch_5914(PF13174)(plastid)
502025.Hoch_3945(PF13191) PF00069
502025.Hoch_6480(PF00675) (PF05193)
502025.Hoch_2951(PF00698)(ER)
502025.Hoch_1755(PF13191) PF00069
502025.Hoch_1566PF02985 (PF13646)
502025.Hoch_4396(PF01154) (PF08540)
502025.Hoch_2035(PF13191) PF00069
502025.Hoch_4099(PF13424) PF00069
502025.Hoch_2934(PF16861) (PF02543)
502025.Hoch_2939PF13384(mitochondrial)
502025.Hoch_5605(PF00400) PF00069
502025.Hoch_5606PF00069(mitochondrial)
502025.Hoch_5601(PF13424) PF00069
502025.Hoch_3099(PF00400) PF00069
502025.Hoch_3091(PF02844) (PF02843)
502025.Hoch_4074(PF13191) PF07714
502025.Hoch_1938(PF13191) PF07714
502025.Hoch_6560(PF13424) PF00069
502025.Hoch_6308(PF13191) PF00069
502025.Hoch_5627PF00498(mitochondrial)
502025.Hoch_4058PF00069(mitochondrial)
502025.Hoch_4057(PF13191) PF00069
502025.Hoch_4054(PF13191) PF07714
502025.Hoch_4055(PF05721)(ER)
502025.Hoch_1046(PF13539)(plastid)
502025.Hoch_1060(PF13374) (PF13424)
502025.Hoch_1063PF13384(mitochondrial)
502025.Hoch_0491(PF13191) PF00069
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502025.Hoch_2501(PF13424) PF00069
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502025.Hoch_4792(PF02190)(ER)
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502025.Hoch_0943PF13384(mitochondrial)
502025.Hoch_3632(PF13191) PF00069
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502025.Hoch_2691(PF12006)
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502025.Hoch_3250(PF01739)
502025.Hoch_3256(PF01739)
502025.Hoch_6206(PF03109)
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502025.Hoch_1325(PF00400)
502025.Hoch_1324(PF05066)
502025.Hoch_1322PF00069
502025.Hoch_4667(PF07382)
502025.Hoch_2676PF00069
502025.Hoch_0819(PF04851)
502025.Hoch_5893(PF13672)
502025.Hoch_6773(PF13672)
502025.Hoch_5302PF00069
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502025.Hoch_6193(PF11987)
502025.Hoch_3681PF00069
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502025.Hoch_1305(PF00282)
502025.Hoch_1306PF08123
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502025.Hoch_3747PF00069
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502025.Hoch_0440PF00069
502025.Hoch_2356(PF00158)
502025.Hoch_6186(PF13432)
502025.Hoch_6182PF00069
502025.Hoch_6180(PF00158)
502025.Hoch_6452PF00069
502025.Hoch_5074(PF13480)
502025.Hoch_0674PF12224
502025.Hoch_1985PF00069
502025.Hoch_4804PF13948
502025.Hoch_1183(PF00698)
502025.Hoch_2187PF00069
502025.Hoch_1728(PF00158)
502025.Hoch_6845(PF13672)
502025.Hoch_6341(PF12706)
502025.Hoch_5348(PF02128)
502025.Hoch_2371PF16697
502025.Hoch_6611(PF13307)
502025.Hoch_3396PF00069
502025.Hoch_6476PF00069
502025.Hoch_6479(PF01695)
502025.Hoch_1709PF00069
502025.Hoch_3706PF05764
502025.Hoch_2862PF07173
502025.Hoch_6866(PF00025)
502025.Hoch_0986PF00069
502025.Hoch_0426PF00069
502025.Hoch_0424(PF00012)
502025.Hoch_0792PF06094
502025.Hoch_5417(PF13672)
502025.Hoch_5416PF00069
502025.Hoch_6494(PF13432)
502025.Hoch_0630(PF08275)
502025.Hoch_2453(PF06745)
502025.Hoch_0896(PF04851)
502025.Hoch_4730(PF00158)
502025.Hoch_3543PF00069
502025.Hoch_1768(PF13480)
502025.Hoch_2232PF00069
502025.Hoch_0400(PF00158)
502025.Hoch_0151(PF00012)
502025.Hoch_0159(PF00282)
502025.Hoch_1578PF00498
502025.Hoch_1579PF00069
502025.Hoch_1577PF00069
502025.Hoch_5478PF00498
502025.Hoch_6653(PF13528)
502025.Hoch_6123PF00069
502025.Hoch_1963PF00069
502025.Hoch_1968PF14736
502025.Hoch_0219PF16697
502025.Hoch_1032(PF04851)
502025.Hoch_2219PF00069
502025.Hoch_0172(PF13519)
502025.Hoch_5672PF16697
502025.Hoch_4508PF00069
502025.Hoch_3883PF00069
502025.Hoch_0231(PF13519)
502025.Hoch_2278(PF13672)
502025.Hoch_2274(PF03169)
502025.Hoch_6374PF00069
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502025.Hoch_2047PF00498
502025.Hoch_2044(PF00158)
502025.Hoch_5926(PF02190)
502025.Hoch_6162(PF13480)
502025.Hoch_6789(PF01739)
502025.Hoch_4065(PF00282)
502025.Hoch_0258(PF13432)
502025.Hoch_1071(PF01695)
502025.Hoch_5004(PF03169)
502025.Hoch_5557PF00498
502025.Hoch_1271PF00069
502025.Hoch_5791PF00498
502025.Hoch_2788PF08357
502025.Hoch_2789PF13540
502025.Hoch_2782PF00498
502025.Hoch_4227PF16697
502025.Hoch_4220(PF07958)
502025.Hoch_4222PF00069
502025.Hoch_3789PF00069
502025.Hoch_3788(PF07719)
502025.Hoch_0279PF00069
502025.Hoch_3120(PF06745)
502025.Hoch_1051(PF01695)
502025.Hoch_4540(PF10014)
502025.Hoch_2062PF00069
502025.Hoch_5499PF00069
502025.Hoch_3331PF00069
502025.Hoch_0018(PF00158)
502025.Hoch_0013(PF04851)
502025.Hoch_5792PF00069
502025.Hoch_5797PF00069
502025.Hoch_5794PF00069
502025.Hoch_0275(PF13480)
502025.Hoch_4229(PF12706)
502025.Hoch_4228(PF12706)
502025.Hoch_2507(PF11617)
502025.Hoch_2500PF00069
502025.Hoch_6086PF00498
502025.Hoch_2606(PF00158)
502025.Hoch_6550PF08221
502025.Hoch_6336(PF13519)
502025.Hoch_6332PF00069
502025.Hoch_0484(PF00685)
502025.Hoch_4569PF00069
502025.Hoch_1422PF00069
502025.Hoch_1210PF00069
502025.Hoch_1218(PF04851)
502025.Hoch_0290PF00069
502025.Hoch_4793(PF00012)
502025.Hoch_4860(PF12588)
502025.Hoch_5518PF00069
502025.Hoch_5516PF00069
502025.Hoch_5873(PF00158)
502025.Hoch_2745(PF00685)
502025.Hoch_0921PF12224
502025.Hoch_0928PF00069
502025.Hoch_1036PF08357
502025.Hoch_3163PF00069
502025.Hoch_1129(PF01695)
502025.Hoch_5989(PF00158)
502025.Hoch_1404(PF01739)
502025.Hoch_1408(PF14518)
502025.Hoch_5188PF00069
502025.Hoch_0728PF12224
502025.Hoch_0729PF06094
502025.Hoch_0050(PF00158)
502025.Hoch_4916PF00498
502025.Hoch_1201PF00069
502025.Hoch_1092PF00069
502025.Hoch_1096(PF01695)
502025.Hoch_0944(PF01695)
502025.Hoch_2811(PF05721)
502025.Hoch_2817PF12224
502025.Hoch_4960(PF07382)
502025.Hoch_3494PF00069
502025.Hoch_3630PF00069
502025.Hoch_3638(PF12706)
502025.Hoch_6045PF00069
502025.Hoch_0550(PF12706)
502025.Hoch_4616PF00498
502025.Hoch_4617PF00498
502025.Hoch_1394PF00069
502025.Hoch_1395PF13540
502025.Hoch_3825PF00069
502025.Hoch_2159PF00069
502025.Hoch_2155PF00069
502025.Hoch_4114PF00069
502025.Hoch_0708(PF04851)
502025.Hoch_4282PF00069
502025.Hoch_4280(PF00158)
502025.Hoch_6755PF00069
502025.Hoch_5887PF00069
502025.Hoch_5885(PF13672)
502025.Hoch_0960(PF04851)
502025.Hoch_3614PF00498
502025.Hoch_6069PF00069
502025.Hoch_6392(PF08275)
502025.Hoch_0392(PF00012)
502025.Hoch_4639(PF01739)
502025.Hoch_1372(PF05721)
502025.Hoch_4981(PF13432)
502025.Hoch_5278PF00498
502025.Hoch_6728(PF06745)
502025.Hoch_4854(PF01695)
502025.Hoch_5860PF00069
502025.Hoch_4675(PF05193)
502025.Hoch_2725(PF12706)
502025.Hoch_2857(PF13539)
502025.Hoch_1588(PF01695)
502025.Hoch_1633(PF13539)
502025.Hoch_3670PF00069
502025.Hoch_4450(PF13646)
502025.Hoch_4327(PF00158)
502025.Hoch_0372PF00069
502025.Hoch_0516(PF12706)
502025.Hoch_4652(PF13672)
502025.Hoch_4878PF00069
502025.Hoch_4879(PF12705)
502025.Hoch_3248(PF03015)
502025.Hoch_6746PF14447
502025.Hoch_6749(PF00282)
502025.Hoch_0745(PF04851)
502025.Hoch_1839(PF13432)
502025.Hoch_5338(PF00158)
502025.Hoch_3473(PF03417)
502025.Hoch_3472PF00069
502025.Hoch_3475PF00069
502025.Hoch_4977(PF04851)
502025.Hoch_2872(PF09664)
502025.Hoch_2873(PF01695)
502025.Hoch_2871(PF13558)
502025.Hoch_6689(PF08757)
502025.Hoch_0681PF00069
502025.Hoch_0680PF00498
502025.Hoch_1335PF13948
502025.Hoch_4857(PF01695)
502025.Hoch_5103(PF13432)
502025.Hoch_5102PF00069
502025.Hoch_5101PF00069
502025.Hoch_2686(PF13480)
502025.Hoch_2681PF00069
502025.Hoch_2683PF00069
502025.Hoch_3222(PF00158)

Detailed merged results for each protein sequence

Individual results for each protein sequence

Genome based results

Summary

  • Gram negative: YES (FDR = 0.5 %)
  • Functional Type III secretion system: NO (FDR = 12.5 %)
  • Functional Type IV secretion system: NO (FDR = 7.2 %)
  • Functional Type VI secretion system: NO (FDR = 7.7 %)

Individual results for each secretion system

Parameters:

==========================================================
EFFECTIVE_T3_OLD=selective
EFFECTIVE_T3_NEW=selective
PREDOTAR_ANIMAL_OR_PLANT=a
PROTEINS=INPUT PROTEINS
MODUS=genome
RUN_PREDOTAR=T
RUN_EFFECTIVE_T3=T
RUN_T4SEpre=0.5
RUN_EFFECTIVE_CCBD=T
RUN_EFFECTIVE_ELD=4
CheckM_COMPLETENESS=
RUN_EffectiveS346=T
GENOTYPE=COG Profile
EMAIL=
==========================================================