Metamenu

Effective results for Bacteroides salanitronis DSM 18170 (eggnog40)

Summary

Number of putative secreted proteins: 165
- Predicted by T4SEpre: 0
- Predicted by EffectiveELD: 46 eukaryotic-like domains, contained in 165 proteins (30 high, 135 medium Z-score)
Predicted protein secretion systems (parentheses indicate weak positive predictions lacking more than 50% of core proteins of a secretion system): None

Protein based results

Putative secreted proteins (weak evidence indicated by parentheses)

ProteinEffectiveT3EffectiveCCBDT4SEpreEffectiveELDPredotar
667015.Bacsa_2932PF08011 (PF09820)(mitochondrial)
667015.Bacsa_1607(PF07470) (PF10022)ER
667015.Bacsa_2603(PF01095) (PF07470)ER
667015.Bacsa_1563(PF03051)ER
667015.Bacsa_1415(PF02057)ER
667015.Bacsa_1984(PF16355)ER
667015.Bacsa_2277(PF16355)ER
667015.Bacsa_0316(PF13173)(mitochondrial)
667015.Bacsa_2248PF00077ER
667015.Bacsa_2245(PF14684)ER
667015.Bacsa_1509(PF16355)ER
667015.Bacsa_3303(PF00295)ER
667015.Bacsa_2656(PF14684)ER
667015.Bacsa_2321(PF01095)ER
667015.Bacsa_2324(PF17132)ER
667015.Bacsa_1331(PF12437)(mitochondrial)
667015.Bacsa_3004(PF17132)ER
667015.Bacsa_3328(PF14684)ER
667015.Bacsa_2624(PF01095)ER
667015.Bacsa_0686(PF12437)(mitochondrial)
667015.Bacsa_3644(PF03051)ER
667015.Bacsa_3265(PF13173)mitochondrial
667015.Bacsa_2682(PF09471)ER
667015.Bacsa_2228(PF07081)ER
667015.Bacsa_2449(PF13431)ER
667015.Bacsa_2691(PF00295)ER
667015.Bacsa_2692(PF01095)ER
667015.Bacsa_2693(PF14498)ER
667015.Bacsa_0228(PF02544)ER
667015.Bacsa_2207(PF13905)ER
667015.Bacsa_2974PF08011 (PF09820)(mitochondrial)
667015.Bacsa_2976PF08011 (PF09820)(mitochondrial)
667015.Bacsa_2802(PF16338)ER
667015.Bacsa_1483(PF00295)ER
667015.Bacsa_1661(PF00295)ER
667015.Bacsa_2960(PF01095)ER
667015.Bacsa_0883(PF16338)ER
667015.Bacsa_0882(PF16355)ER
667015.Bacsa_3350(PF09471)ER
667015.Bacsa_2391(PF00295)ER
667015.Bacsa_2392(PF07971)ER
667015.Bacsa_1613(PF10022)ER
667015.Bacsa_1612(PF10022)ER
667015.Bacsa_0892(PF14498)ER
667015.Bacsa_1468(PF13173)ER
667015.Bacsa_1590(PF16338)ER
667015.Bacsa_1732PF08011 (PF09820)(mitochondrial)
667015.Bacsa_0974(PF07470)ER
667015.Bacsa_0973(PF14498)ER
667015.Bacsa_2710(PF07470)ER
667015.Bacsa_3397(PF07470)ER
667015.Bacsa_3398(PF00295)ER
667015.Bacsa_3399(PF14498)ER
667015.Bacsa_3006(PF07470)(ER)
667015.Bacsa_3007(PF00295)ER
667015.Bacsa_2448(PF13905)ER
667015.Bacsa_3548PF12812ER
667015.Bacsa_0912(PF00295)ER
667015.Bacsa_0828(PF07971)ER
667015.Bacsa_2605(PF16355)ER
667015.Bacsa_2999(PF07470)ER; (ER)
667015.Bacsa_1099(PF03432)mitochondrial; (mitochondrial)
667015.Bacsa_0589(PF13431)ER
667015.Bacsa_0830(PF07971)ER
667015.Bacsa_0831(PF07971)ER
667015.Bacsa_0834(PF07971)ER
667015.Bacsa_2618(PF00295)ER
667015.Bacsa_2478(PF03432)(mitochondrial)
667015.Bacsa_2987(PF16355)ER
667015.Bacsa_2988(PF00295)ER
667015.Bacsa_2873(PF13905)ER
667015.Bacsa_1395(PF16117)(ER); (mitochondrial)
667015.Bacsa_1170(PF03432)(mitochondrial)
667015.Bacsa_0112(PF07971)ER
667015.Bacsa_0626(PF13905)ER
667015.Bacsa_0806(PF03051)ER
667015.Bacsa_1183(PF13304)(plastid)
667015.Bacsa_1746PF08011 (PF09820)
667015.Bacsa_0503PF01807 PF13155
667015.Bacsa_2411PF08011 (PF09820)
667015.Bacsa_1640PF08011 (PF09820)
667015.Bacsa_2625PF08011 (PF09820)
667015.Bacsa_0745(PF01715)(plastid)
667015.Bacsa_0519(PF03432)(mitochondrial)
667015.Bacsa_2578PF08011 (PF09820)
667015.Bacsa_2215PF01807 PF13155
667015.Bacsa_2561PF01807 PF13155
667015.Bacsa_2366PF08011 (PF09820)
667015.Bacsa_1063(PF13304)(plastid)
667015.Bacsa_3519(PF13304)(mitochondrial)
667015.Bacsa_2480PF01807 PF13155
667015.Bacsa_1617PF08011 (PF09820)
667015.Bacsa_2821PF01807 PF13155
667015.Bacsa_2168(PF03432)(mitochondrial)
667015.Bacsa_0158(PF16355)(ER)
667015.Bacsa_2154(PF03432)(mitochondrial)
667015.Bacsa_2444PF08011 (PF09820)
667015.Bacsa_2626PF08011 (PF09820)
667015.Bacsa_2192(PF01697)(mitochondrial)
667015.Bacsa_3133PF01807 PF13155
667015.Bacsa_2265(PF00302)(ER)
667015.Bacsa_1348(PF03050)
667015.Bacsa_1742(PF05637)
667015.Bacsa_1747(PF08660)
667015.Bacsa_0033(PF04326)
667015.Bacsa_0926(PF03050)
667015.Bacsa_0813PF16269
667015.Bacsa_1972(PF07081)
667015.Bacsa_0266(PF02357)
667015.Bacsa_3445(PF02357)
667015.Bacsa_0869PF09744
667015.Bacsa_3202(PF13173)
667015.Bacsa_1219(PF02357)
667015.Bacsa_0121(PF13151)
667015.Bacsa_0307(PF00686)
667015.Bacsa_2325(PF17132)
667015.Bacsa_3469(PF08660)
667015.Bacsa_2229(PF07081)
667015.Bacsa_1307(PF04326)
667015.Bacsa_0539(PF00302)
667015.Bacsa_2750(PF13304)
667015.Bacsa_2377(PF00302)
667015.Bacsa_2808(PF08843)
667015.Bacsa_1106(PF13304)
667015.Bacsa_0055(PF03050)
667015.Bacsa_0234PF07959
667015.Bacsa_2747(PF13304)
667015.Bacsa_0088(PF02357)
667015.Bacsa_3420PF13155
667015.Bacsa_3422(PF08843)
667015.Bacsa_3195(PF13173)
667015.Bacsa_1584(PF03050)
667015.Bacsa_1725(PF04326)
667015.Bacsa_1121PF13155
667015.Bacsa_3640(PF05693)
667015.Bacsa_2762(PF13173)
667015.Bacsa_3383(PF01715)
667015.Bacsa_2544(PF03432)
667015.Bacsa_1731(PF02357)
667015.Bacsa_1041(PF03050)
667015.Bacsa_0711(PF03050)
667015.Bacsa_3378(PF02689)
667015.Bacsa_0419(PF13173)
667015.Bacsa_0413PF13155
667015.Bacsa_2145(PF08843)
667015.Bacsa_2855(PF13151)
667015.Bacsa_1153PF13155
667015.Bacsa_0173(PF13173)
667015.Bacsa_0355(PF03050)
667015.Bacsa_3482PF13155
667015.Bacsa_0607(PF03050)
667015.Bacsa_3151(PF03432)
667015.Bacsa_2513(PF02357)
667015.Bacsa_1437(PF04326)
667015.Bacsa_2861(PF13173)
667015.Bacsa_2865(PF13173)
667015.Bacsa_1096(PF13304)
667015.Bacsa_1160(PF08843)
667015.Bacsa_0347(PF08843)
667015.Bacsa_0292(PF13173)
667015.Bacsa_2872(PF16314)
667015.Bacsa_1178(PF03050)
667015.Bacsa_0930PF07460not used
667015.Bacsa_2666(PF13304)
667015.Bacsa_2062(PF00686)

Detailed merged results for each protein sequence

Individual results for each protein sequence

Genome based results

Summary

  • Gram negative: YES (FDR = 0.5 %)
  • Functional Type III secretion system: NO (FDR = 12.5 %)
  • Functional Type IV secretion system: NO (FDR = 7.2 %)
  • Functional Type VI secretion system: NO (FDR = 7.7 %)

Individual results for each secretion system

Parameters:

==========================================================
EFFECTIVE_T3_OLD=selective
EFFECTIVE_T3_NEW=selective
PREDOTAR_ANIMAL_OR_PLANT=a
PROTEINS=INPUT PROTEINS
MODUS=genome
RUN_PREDOTAR=T
RUN_EFFECTIVE_T3=T
RUN_T4SEpre=0.5
RUN_EFFECTIVE_CCBD=T
RUN_EFFECTIVE_ELD=4
CheckM_COMPLETENESS=
RUN_EffectiveS346=T
GENOTYPE=COG Profile
EMAIL=
==========================================================