Effective results for Haliscomenobacter hydrossis DSM 1100 (eggnog40)

Summary

Number of putative secreted proteins: 742
- Predicted by T4SEpre: 0
- Predicted by EffectiveELD: 110 eukaryotic-like domains, contained in 742 proteins (127 high, 615 medium Z-score)
Predicted protein secretion systems (parentheses indicate weak positive predictions lacking more than 50% of core proteins of a secretion system): None

Protein based results

Putative secreted proteins (weak evidence indicated by parentheses)

Protein	EffectiveT3	EffectiveCCBD	T4SEpre	EffectiveELD	Predotar
760192.Halhy_0653				(PF03572) PF14684 (PF07676)	ER
760192.Halhy_5399				(PF13181) (PF05036) (PF07676)	ER
760192.Halhy_0886				(PF03572) PF14684 (PF07676)	ER
760192.Halhy_0804				(PF03572) PF14684 (PF07676)	ER
760192.Halhy_6138				(PF06283) (PF00801) (PF07995)	ER
760192.Halhy_6428				(PF03572) PF14684 (PF07676)	ER
760192.Halhy_4010				(PF03572) PF14684 (PF07676)	ER
760192.Halhy_1130				(PF06283) (PF07995)	ER; (ER)
760192.Halhy_4061				(PF12704) (PF02687)	mitochondrial
760192.Halhy_4063				(PF12704) (PF02687)	mitochondrial
760192.Halhy_4062				(PF12704) (PF02687)	mitochondrial
760192.Halhy_4064				(PF12704) (PF02687)	mitochondrial
760192.Halhy_5382				(PF12770) (PF13181)	ER
760192.Halhy_4671				PF03781 PF00656	ER
760192.Halhy_4672				PF03781 PF00656	ER
760192.Halhy_4673				PF03781 PF00656	ER
760192.Halhy_3024				(PF12770) (PF13181)	ER
760192.Halhy_2088				(PF07995) PF12893	ER
760192.Halhy_3909				(PF12704) (PF02687)	mitochondrial
760192.Halhy_3908				(PF12704) (PF02687)	mitochondrial
760192.Halhy_3903				(PF12704) (PF02687)	mitochondrial
760192.Halhy_3902				(PF12704) (PF02687)	mitochondrial
760192.Halhy_3904				(PF12704) (PF02687)	mitochondrial
760192.Halhy_0250				(PF13365) PF03781	(ER)
760192.Halhy_3064				(PF12704) (PF02687)	mitochondrial
760192.Halhy_0446				(PF13365) PF03781	ER
760192.Halhy_6230				(PF06439) (PF07691)	ER
760192.Halhy_3501				(PF05036) (PF07676)	ER
760192.Halhy_5562				(PF12704) (PF02687)	mitochondrial
760192.Halhy_4210				PF14684 (PF03572)	ER
760192.Halhy_4100				(PF12704) (PF02687)	mitochondrial
760192.Halhy_4519				(PF13365) PF03781	ER
760192.Halhy_5588				(PF07691) (PF16656)	ER
760192.Halhy_1558				(PF13365) PF03781	ER
760192.Halhy_3153				(PF00930) (PF07676)	ER
760192.Halhy_6255				(PF12704) (PF02687)	mitochondrial
760192.Halhy_3839				(PF12704) (PF02687)	mitochondrial
760192.Halhy_4075				(PF12704) (PF02687)	mitochondrial
760192.Halhy_3857				(PF12704) (PF02687)	mitochondrial
760192.Halhy_2456				PF14684 (PF03572)	ER
760192.Halhy_1519				(PF07593) (PF13517)	ER
760192.Halhy_1517				(PF07593) (PF13517)	ER
760192.Halhy_0650				(PF07593) (PF13517)	ER
760192.Halhy_4103				(PF12704) (PF02687)	mitochondrial
760192.Halhy_3683				(PF12704) (PF02687)	mitochondrial
760192.Halhy_4661				(PF12704) (PF02687)	mitochondrial
760192.Halhy_4823				(PF07593) (PF13517)	ER
760192.Halhy_2151				(PF12704) (PF02687)	(mitochondrial)
760192.Halhy_3661				(PF12704) (PF02687)	(mitochondrial); mitochondrial
760192.Halhy_4121				PF12143 PF12142	ER
760192.Halhy_2017				(PF00801) PF03781	(ER)
760192.Halhy_1438				(PF07593) (PF13517)	ER
760192.Halhy_4373				PF14580 (PF12799) PF16095 PF08477
760192.Halhy_6288				PF14684 (PF03572)	ER
760192.Halhy_5254				(PF11954) (PF00144)	ER
760192.Halhy_2282				(PF12704) (PF02687)	mitochondrial
760192.Halhy_4447				(PF13365) PF03781	(mitochondrial); mitochondrial
760192.Halhy_3918				(PF12704) (PF02687)	mitochondrial
760192.Halhy_3917				(PF12704) (PF02687)	mitochondrial
760192.Halhy_3247				(PF11954) (PF00144)	ER
760192.Halhy_1222				(PF12770) PF16095 PF08477 (PF12799)
760192.Halhy_5576				(PF12704) (PF02687)	mitochondrial
760192.Halhy_4220				(PF07593) (PF13517)	ER
760192.Halhy_3162				(PF07593) (PF13517)	ER
760192.Halhy_5012				(PF12770) (PF13176)	ER
760192.Halhy_2368				(PF12704) (PF02687)	(ER)
760192.Halhy_2367				(PF12704) (PF02687)	mitochondrial
760192.Halhy_5633				(PF11954) (PF00144)	ER
760192.Halhy_1049				(PF12770) (PF13176)	ER
760192.Halhy_1039				(PF13365) PF03781	ER
760192.Halhy_4095				(PF12704) (PF02687)	mitochondrial
760192.Halhy_2193				(PF12704) (PF02687)	mitochondrial
760192.Halhy_2275				(PF12704) (PF02687)	mitochondrial
760192.Halhy_3840				(PF12704) (PF02687)	mitochondrial; (mitochondrial)
760192.Halhy_3841				(PF12704) (PF02687)	mitochondrial
760192.Halhy_0341				(PF07593) (PF13517)	ER
760192.Halhy_1524				(PF07593) (PF13517)	ER
760192.Halhy_3883				(PF12704) (PF02687)	mitochondrial; (mitochondrial)
760192.Halhy_0186				(PF13365) PF12812	ER
760192.Halhy_2762				(PF13474) PF12893	ER
760192.Halhy_4343				(PF05036) (PF13899)	ER
760192.Halhy_0700				(PF11954) (PF00144)	ER
760192.Halhy_1132				PF12893	ER; (ER)
760192.Halhy_0557				(PF01433)	ER
760192.Halhy_0556				(PF00144)	ER
760192.Halhy_4418				(PF13431)	ER
760192.Halhy_4414				(PF00756)	ER
760192.Halhy_2951				(PF03321)	(mitochondrial); mitochondrial
760192.Halhy_2950				(PF00801)	ER
760192.Halhy_0949				(PF01569)	ER
760192.Halhy_3944				(PF13565)	(mitochondrial)
760192.Halhy_4065				(PF08570)	ER
760192.Halhy_3238				(PF00144)	ER
760192.Halhy_4658				(PF13175)	(mitochondrial)
760192.Halhy_4654				(PF03575)	ER
760192.Halhy_5385				(PF00756)	ER
760192.Halhy_0960				PF15902	ER
760192.Halhy_0962				(PF03572)	ER
760192.Halhy_3925				(PF07995)	ER
760192.Halhy_3927				(PF07691)	ER; (mitochondrial)
760192.Halhy_3929				(PF00756)	ER
760192.Halhy_0742				(PF01408)	(ER)
760192.Halhy_2292				(PF01433)	ER
760192.Halhy_6199				(PF01433)	ER
760192.Halhy_6190				(PF00144)	ER
760192.Halhy_5509				(PF13181)	ER
760192.Halhy_0905				(PF00144)	ER
760192.Halhy_0909				(PF05592)	ER
760192.Halhy_1234				(PF01408)	(ER)
760192.Halhy_1233				(PF13365)	ER
760192.Halhy_5260				(PF00756)	ER
760192.Halhy_5267				(PF01408)	(ER)
760192.Halhy_3901				(PF12704)	mitochondrial
760192.Halhy_5693				(PF13650)	ER
760192.Halhy_4612				(PF12770)	ER
760192.Halhy_4920				(PF13565)	(mitochondrial)
760192.Halhy_4922				(PF05592)	ER
760192.Halhy_5967				(PF05036)	ER
760192.Halhy_0469				(PF00756)	ER
760192.Halhy_3291				(PF13088)	ER
760192.Halhy_0254				(PF00578)	ER
760192.Halhy_0072				(PF03190)	ER
760192.Halhy_3780				PF00656	ER
760192.Halhy_3522				(PF15071)	ER
760192.Halhy_2786				(PF09295)	ER
760192.Halhy_4634				PF15902	ER
760192.Halhy_4949				(PF05592)	ER
760192.Halhy_4942				(PF05448)	ER
760192.Halhy_4799				PF03781	ER
760192.Halhy_0058				(PF01569)	ER
760192.Halhy_6069				(PF00144)	ER
760192.Halhy_1484				(PF00144)	ER
760192.Halhy_1483				(PF00930)	ER
760192.Halhy_4966				(PF00756)	ER
760192.Halhy_4968				(PF00144)	ER
760192.Halhy_4212				(PF00756)	ER
760192.Halhy_4219				(PF00144)	ER
760192.Halhy_6210				(PF07676)	ER
760192.Halhy_1074				(PF02012)	ER
760192.Halhy_4775				(PF14870)	ER
760192.Halhy_3745				(PF07995)	ER
760192.Halhy_1927				(PF00144)	ER
760192.Halhy_5581				PF03781	ER
760192.Halhy_5584				(PF13181)	ER
760192.Halhy_5586				PF01400	ER
760192.Halhy_4234				(PF00135)	ER
760192.Halhy_2378				(PF00144)	ER
760192.Halhy_6275				(PF14498)	ER
760192.Halhy_6270				(PF13088)	ER
760192.Halhy_4030				(PF13181)	ER
760192.Halhy_6491				(PF00144)	ER
760192.Halhy_5008				(PF00144)	ER
760192.Halhy_3766				(PF00135)	ER
760192.Halhy_3765				(PF13181)	ER
760192.Halhy_3763				(PF02687)	ER
760192.Halhy_2149				(PF00801)	ER
760192.Halhy_6392				(PF06439)	ER
760192.Halhy_1400				(PF03575)	ER
760192.Halhy_1402				(PF13415)	ER
760192.Halhy_6025				(PF01408)	ER
760192.Halhy_0394				(PF14498)	ER
760192.Halhy_5706				(PF13181)	ER
760192.Halhy_4651				(PF03575)	ER
760192.Halhy_3150				(PF05592)	(mitochondrial)
760192.Halhy_6252				PF16401	ER
760192.Halhy_1705				(PF03321)	mitochondrial
760192.Halhy_4735				(PF01844)	(mitochondrial)
760192.Halhy_4737				(PF05685)	(mitochondrial)
760192.Halhy_4887				(PF14534)	ER
760192.Halhy_4730				(PF00801)	ER
760192.Halhy_4732				(PF08487)	ER
760192.Halhy_0020				PF12893	ER
760192.Halhy_0618				(PF13899)	ER
760192.Halhy_0619				(PF03572)	ER
760192.Halhy_2610				(PF07676)	ER
760192.Halhy_2611				(PF01062)	(mitochondrial); mitochondrial
760192.Halhy_1396				(PF12704) (PF02687)	(mitochondrial)
760192.Halhy_1392				(PF06439)	ER
760192.Halhy_1579				(PF13181)	(ER)
760192.Halhy_0376				(PF13365) PF03781	(ER)
760192.Halhy_4826				(PF12799)	ER
760192.Halhy_4270				(PF01408)	ER
760192.Halhy_4272				(PF12867)	(mitochondrial)
760192.Halhy_3138				(PF01408)	(mitochondrial)
760192.Halhy_3130				(PF06439)	ER
760192.Halhy_0496				(PF00756)	ER
760192.Halhy_1185				(PF01408)	(mitochondrial)
760192.Halhy_4717				(PF00144)	ER
760192.Halhy_5402				PF15902	ER
760192.Halhy_3851				(PF05036)	ER
760192.Halhy_0632				(PF01844)	(mitochondrial)
760192.Halhy_6354				(PF07995)	mitochondrial; (mitochondrial)
760192.Halhy_1512				(PF13650)	ER
760192.Halhy_0223				PF15902	ER
760192.Halhy_0222				(PF01433)	ER
760192.Halhy_0131				(PF13899)	ER
760192.Halhy_1281				(PF13205)	ER
760192.Halhy_3444				(PF00930)	ER
760192.Halhy_4508				(PF07676)	(ER)
760192.Halhy_4507				PF01400	ER
760192.Halhy_0083				(PF00135)	ER
760192.Halhy_6160				(PF00578)	ER
760192.Halhy_6161				(PF00578)	ER
760192.Halhy_4842				PF15902	ER
760192.Halhy_4335				(PF00078)	(ER)
760192.Halhy_3301				(PF07676)	ER
760192.Halhy_6089				(PF07676)	ER
760192.Halhy_1350				(PF07676)	ER
760192.Halhy_1356				(PF07676)	ER
760192.Halhy_0336				(PF13181)	ER
760192.Halhy_1535				(PF01408)	ER
760192.Halhy_1533				(PF06283)	ER
760192.Halhy_5242				(PF05036)	ER
760192.Halhy_6146				(PF16656)	ER
760192.Halhy_5195				(PF00578)	ER
760192.Halhy_5193				(PF14534)	ER
760192.Halhy_5190				(PF07168)	ER
760192.Halhy_0810				(PF07676)	ER
760192.Halhy_2157				(PF07995)	ER
760192.Halhy_2413				(PF01569)	ER
760192.Halhy_2411				(PF00144)	ER
760192.Halhy_3894				(PF07676)	ER
760192.Halhy_3094				(PF03572)	ER
760192.Halhy_6313				(PF08757)	ER
760192.Halhy_1337				(PF12770)	(mitochondrial); (plastid)
760192.Halhy_1335				(PF00801)	ER
760192.Halhy_2757				(PF07995)	ER
760192.Halhy_4371				(PF13088)	ER
760192.Halhy_5845				(PF14534)	ER
760192.Halhy_5812				(PF13415)	ER
760192.Halhy_5765				(PF00144)	ER
760192.Halhy_5769				(PF00801)	ER
760192.Halhy_2594				(PF13181)	ER
760192.Halhy_2599				(PF00578)	ER
760192.Halhy_0730				(PF00756)	ER
760192.Halhy_0739				PF15902	ER
760192.Halhy_2777				(PF06439)	ER
760192.Halhy_6457				(PF00756)	ER
760192.Halhy_6458				(PF00756)	ER
760192.Halhy_6459				(PF00144)	ER
760192.Halhy_5159				(PF13205)	ER
760192.Halhy_1450				PF03781	ER
760192.Halhy_0853				(PF01408)	(mitochondrial)
760192.Halhy_4682				(PF01569)	ER
760192.Halhy_4350				PF12893	ER
760192.Halhy_4426				(PF00756)	ER
760192.Halhy_4531				PF02077	ER
760192.Halhy_2908				(PF05036)	ER
760192.Halhy_3816				(PF01408)	ER; (ER)
760192.Halhy_4813				(PF05036)	ER
760192.Halhy_5741				PF00112	ER
760192.Halhy_5740				PF00656	ER
760192.Halhy_3996				(PF01433)	ER
760192.Halhy_4160				(PF13517)	ER
760192.Halhy_0713				(PF14534)	ER; (ER)
760192.Halhy_0712				(PF00135)	ER
760192.Halhy_0710				(PF14534)	ER
760192.Halhy_2714				(PF16656)	ER
760192.Halhy_2717				(PF12770)	ER
760192.Halhy_6470				(PF00578)	ER
760192.Halhy_6473				PF03781	(mitochondrial)
760192.Halhy_1439				(PF01569)	ER; (ER)
760192.Halhy_1124				(PF01844)	(mitochondrial)
760192.Halhy_1431				PF00112	ER; (ER)
760192.Halhy_1650				(PF00144)	ER
760192.Halhy_4405				(PF16871)	ER
760192.Halhy_4409				(PF12770)	ER
760192.Halhy_4408				(PF12770)	ER
760192.Halhy_2038				(PF13688)	ER
760192.Halhy_2039				(PF13688)	ER
760192.Halhy_1605				PF15902	ER
760192.Halhy_0958				(PF08570)	ER
760192.Halhy_0957				(PF05684)	ER
760192.Halhy_0777				(PF06241)	(mitochondrial)
760192.Halhy_5118				(PF08570)	ER
760192.Halhy_4391				(PF14870)	ER
760192.Halhy_3019				(PF13181)	ER
760192.Halhy_3016				(PF05572)	ER
760192.Halhy_2943				PF01400	ER; (ER)
760192.Halhy_4374				(PF01408)	ER; (ER)
760192.Halhy_2920				(PF13899)	ER
760192.Halhy_2059				PF15902	ER
760192.Halhy_2056				(PF01433)	ER
760192.Halhy_2052				PF00656	ER
760192.Halhy_2053				(PF13431)	ER
760192.Halhy_6538				PF15902	ER
760192.Halhy_1883				(PF13181)	ER
760192.Halhy_5708				(PF13517)	ER
760192.Halhy_3957				(PF13365)	ER
760192.Halhy_0284				(PF14534)	ER
760192.Halhy_4073				(PF00756)	ER
760192.Halhy_3482				(PF06439)	ER
760192.Halhy_3483				PF15902	mitochondrial
760192.Halhy_2742				(PF02494)	ER
760192.Halhy_2740				(PF07676)	ER
760192.Halhy_5137				(PF06439)	ER
760192.Halhy_4669				(PF00930)	ER
760192.Halhy_3036				(PF00578)	ER
760192.Halhy_4914				(PF05036)	ER
760192.Halhy_0228				PF00656	ER
760192.Halhy_2077				PF15902	ER
760192.Halhy_2070				(PF07676)	ER
760192.Halhy_2072				(PF02687)	(mitochondrial)
760192.Halhy_2079				(PF13304)	(mitochondrial)
760192.Halhy_6518				(PF00930)	ER
760192.Halhy_5890				(PF08487)	ER
760192.Halhy_0227				(PF00144)	ER
760192.Halhy_5091				(PF07678)	ER
760192.Halhy_5097				(PF12704) (PF02687)	(mitochondrial)
760192.Halhy_5268				(PF06283)	ER
760192.Halhy_0911				(PF00756)	ER
760192.Halhy_5278				(PF13517)	ER
760192.Halhy_3936				PF01400	ER
760192.Halhy_0004				(PF08757)	ER
760192.Halhy_2512				(PF12006)	ER
760192.Halhy_0782				PF03781	ER
760192.Halhy_0156				(PF05592)	ER
760192.Halhy_6443				(PF00144)	ER
760192.Halhy_1316				(PF01408)	(mitochondrial); mitochondrial
760192.Halhy_4605				PF01400	ER
760192.Halhy_4938				(PF00930)	ER
760192.Halhy_1463				(PF01408)	(mitochondrial)
760192.Halhy_0241				PF00656	(mitochondrial); (plastid)
760192.Halhy_5367				(PF03190)	ER
760192.Halhy_5789				(PF00756)	(mitochondrial)
760192.Halhy_2798				(PF00144)	ER
760192.Halhy_3266				(PF07676)	ER
760192.Halhy_3073				(PF13650)	ER
760192.Halhy_4488				(PF07676)	ER
760192.Halhy_2918				(PF00930)	ER; (ER)
760192.Halhy_6227				(PF01569)	ER
760192.Halhy_1242				(PF09414)	(mitochondrial)
760192.Halhy_1490				(PF04784)	ER
760192.Halhy_4209				(PF00144)	ER
760192.Halhy_6208				PF15902	ER
760192.Halhy_6202				PF15902	ER
760192.Halhy_1005				(PF13565)	(mitochondrial)
760192.Halhy_5032				(PF13181)	ER
760192.Halhy_1008				(PF13565)	(mitochondrial)
760192.Halhy_0204				(PF13205)	(ER)
760192.Halhy_0201				(PF06439)	ER
760192.Halhy_5782				(PF06439)	ER
760192.Halhy_3517				(PF03572)	ER
760192.Halhy_2176				PF03781	ER
760192.Halhy_2173				(PF00144)	ER
760192.Halhy_6078				PF16095 PF08477 (PF12799)
760192.Halhy_6105				(PF05036)	ER
760192.Halhy_6450				(PF00144)	ER
760192.Halhy_5573				(PF13565)	(mitochondrial)
760192.Halhy_2349				(PF13899)	ER
760192.Halhy_5809				PF00656	ER
760192.Halhy_4003				PF03781	ER
760192.Halhy_0082				PF16095 PF08477 (PF12799)
760192.Halhy_3759				(PF06439)	ER
760192.Halhy_3750				(PF00578)	ER
760192.Halhy_3576				(PF14534)	ER
760192.Halhy_3573				(PF16332)	ER
760192.Halhy_5775				(PF13365) PF03781	(ER)
760192.Halhy_6018				(PF13088)	ER
760192.Halhy_6017				(PF10142)	ER
760192.Halhy_6015				(PF08843)	ER; (ER)
760192.Halhy_6010				(PF13565)	(mitochondrial)
760192.Halhy_5595				(PF12770)	ER
760192.Halhy_2819				(PF13565)	(mitochondrial)
760192.Halhy_0022				(PF13088)	ER
760192.Halhy_1573				(PF01433)	(mitochondrial); (plastid)
760192.Halhy_6246				(PF00144)	ER
760192.Halhy_3774				(PF12006)	ER
760192.Halhy_4524				(PF01082)	ER
760192.Halhy_3809				(PF00578)	ER
760192.Halhy_0604				(PF11175)	ER
760192.Halhy_5416				PF03781	ER
760192.Halhy_1977				(PF00756)	ER
760192.Halhy_6031				(PF13565)	(mitochondrial)
760192.Halhy_1566				(PF05572)	ER
760192.Halhy_5608				(PF00578)	ER
760192.Halhy_0382				(PF11175)	ER
760192.Halhy_2830				PF03781	ER
760192.Halhy_1710				(PF03572)	ER
760192.Halhy_1712				PF12893	ER
760192.Halhy_4727				(PF03572)	(ER); ER
760192.Halhy_4721				(PF00801)	ER
760192.Halhy_4729				(PF00801)	(mitochondrial)
760192.Halhy_5419				(PF00144)	ER
760192.Halhy_3824				(PF08757)	ER
760192.Halhy_2995				(PF01433)	ER
760192.Halhy_0620				(PF05448)	ER
760192.Halhy_2660				(PF00144)	ER
760192.Halhy_2192				(PF12704) (PF02687)	(ER)
760192.Halhy_1363				(PF14498)	ER
760192.Halhy_1366				(PF13365)	ER
760192.Halhy_0368				(PF04784)	ER
760192.Halhy_0109				(PF05684)	ER
760192.Halhy_3458				(PF01569)	ER
760192.Halhy_1113				(PF00135)	mitochondrial
760192.Halhy_1194				(PF14534)	ER
760192.Halhy_1996				(PF03321)	mitochondrial
760192.Halhy_3732				(PF00756)	ER
760192.Halhy_3845				(PF13175) (PF13304)	(mitochondrial)
760192.Halhy_0649				(PF01569)	ER
760192.Halhy_0644				(PF13565)	(mitochondrial)
760192.Halhy_2641				(PF00801)	ER
760192.Halhy_1840				(PF01569)	ER
760192.Halhy_3622				(PF05572)	ER
760192.Halhy_6346				PF00112	ER
760192.Halhy_1699				(PF07676)	ER
760192.Halhy_0340				(PF13517)	ER
760192.Halhy_5646				(PF13205)	mitochondrial
760192.Halhy_1525				(PF14870)	ER
760192.Halhy_0123				(PF00756)	ER
760192.Halhy_4111				PF15902	ER
760192.Halhy_3699				(PF14534)	ER
760192.Halhy_1834				(PF05572)	ER
760192.Halhy_6409				(PF13175)	(mitochondrial)
760192.Halhy_1759				(PF05448)	ER
760192.Halhy_5984				(PF14870)	ER
760192.Halhy_5986				(PF12770)	ER
760192.Halhy_5981				(PF07728)	(mitochondrial)
760192.Halhy_1212				(PF02494)	ER
760192.Halhy_0663				PF15902	ER
760192.Halhy_4320				(PF13899)	ER
760192.Halhy_3866				(PF02494)	ER
760192.Halhy_3312				PF00656	ER
760192.Halhy_3313				PF00656	ER
760192.Halhy_6361				(PF13474)	ER
760192.Halhy_6367				(PF06439)	ER
760192.Halhy_6090				(PF05036)	ER
760192.Halhy_1321				(PF07676)	ER
760192.Halhy_0494				(PF00756)	ER
760192.Halhy_0495				(PF06283)	ER
760192.Halhy_0497				(PF00756)	ER
760192.Halhy_0490				(PF14498)	ER
760192.Halhy_3675				(PF00144)	ER
760192.Halhy_2234				(PF00144)	ER
760192.Halhy_2232				(PF00144)	ER
760192.Halhy_6429				(PF13474)	ER
760192.Halhy_6422				(PF08757)	ER
760192.Halhy_6421				(PF08757)	ER
760192.Halhy_6420				PF03781	ER
760192.Halhy_0867				(PF13565)	(mitochondrial)
760192.Halhy_4831				(PF13517)	ER
760192.Halhy_4838				(PF00578)	ER
760192.Halhy_4839				(PF00578)	ER
760192.Halhy_4300				(PF13365)	ER
760192.Halhy_2429				(PF05572)	ER
760192.Halhy_2934				(PF00578)	ER
760192.Halhy_3882				(PF00144)	ER
760192.Halhy_6307				(PF07691)	ER
760192.Halhy_1306				(PF01408)	ER; (ER)
760192.Halhy_0304				(PF05057) PF00656	(ER)
760192.Halhy_4547				(PF01569)	ER
760192.Halhy_3653				(PF06283)	ER
760192.Halhy_1878				(PF00756)	ER
760192.Halhy_1433				(PF06439)	ER
760192.Halhy_2210				(PF06283)	ER
760192.Halhy_5144				(PF00135)	ER
760192.Halhy_3354				(PF13474)	ER
760192.Halhy_2007				(PF01844)	mitochondrial
760192.Halhy_2008				(PF01433)	ER
760192.Halhy_1671				PF00656	ER
760192.Halhy_0981				(PF13181)	ER
760192.Halhy_5802				(PF00135)	ER
760192.Halhy_1854				PF01637	mitochondrial; (mitochondrial)
760192.Halhy_3982				PF00112	ER
760192.Halhy_3981				PF00656	ER
760192.Halhy_3989				(PF00144)	ER
760192.Halhy_4170				(PF13205)	ER
760192.Halhy_3186				(PF01569)	ER
760192.Halhy_2761				(PF01408)	(ER)
760192.Halhy_6469				(PF05592)	ER
760192.Halhy_4695				PF00656	ER; (ER)
760192.Halhy_4692				(PF01569)	ER
760192.Halhy_0532				(PF03575)	ER
760192.Halhy_2972				(PF08757)	ER
760192.Halhy_2395				PF16401	(ER)
760192.Halhy_5750				(PF08757)	ER
760192.Halhy_5754				(PF00801)	ER
760192.Halhy_2702				(PF00756)	ER
760192.Halhy_3926				(PF12704) (PF02687)
760192.Halhy_5505				(PF05057) PF00656
760192.Halhy_4925				PF16095 PF08477
760192.Halhy_2122				PF03781 PF00656
760192.Halhy_6541				PF16095 PF08477
760192.Halhy_6542				PF16095 PF08477
760192.Halhy_6543				PF16095 PF08477
760192.Halhy_1070				(PF00144)	(ER)
760192.Halhy_0099				(PF13181) (PF13176)
760192.Halhy_3819				(PF01433)	(ER)
760192.Halhy_1405				PF03781 PF00656
760192.Halhy_6144				(PF13650)	(ER)
760192.Halhy_4736				PF03781 PF00656
760192.Halhy_2612				(PF13175)	(ER)
760192.Halhy_2183				(PF13175) (PF13304)
760192.Halhy_2188				(PF12704) (PF02687)
760192.Halhy_2472				(PF07728)	(ER)
760192.Halhy_5859				(PF12704) (PF02687)
760192.Halhy_5339				PF03781 PF00656
760192.Halhy_2751				(PF14249)	(mitochondrial)
760192.Halhy_3649				PF01637	(mitochondrial)
760192.Halhy_2906				(PF02971) (PF07837)
760192.Halhy_0879				(PF07676)	(ER)
760192.Halhy_5725				(PF12704) (PF02687)
760192.Halhy_0249				PF03781	(mitochondrial)
760192.Halhy_5536				(PF03538) (PF07691)
760192.Halhy_4975				(PF00144)	(mitochondrial)
760192.Halhy_6204				(PF13181) (PF13176)
760192.Halhy_2177				(PF12704) (PF02687)
760192.Halhy_5592				(PF05970) (PF02689)
760192.Halhy_1384				(PF01844)	(mitochondrial)
760192.Halhy_0169				PF15902	ER
760192.Halhy_0166				(PF12704) (PF02687)
760192.Halhy_5625				(PF13365)	(ER)
760192.Halhy_3846				(PF01408)	(ER)
760192.Halhy_2646				(PF01844)	(mitochondrial)
760192.Halhy_5869				(PF01408)	(mitochondrial)
760192.Halhy_2237				(PF01408)	(ER)
760192.Halhy_2682				(PF00578)	(ER)
760192.Halhy_3652				(PF01408)	(ER)
760192.Halhy_1877				(PF00697)	(mitochondrial)
760192.Halhy_2586				(PF12867) PF03781
760192.Halhy_3966				(PF12704) (PF02687)
760192.Halhy_1422				PF01637
760192.Halhy_1138				(PF05685)
760192.Halhy_1276				(PF01408)
760192.Halhy_0761				(PF12867)
760192.Halhy_1406				(PF01408)
760192.Halhy_5224				(PF05970)
760192.Halhy_4473				PF16401
760192.Halhy_4470				(PF05036)
760192.Halhy_3004				(PF00578)
760192.Halhy_2069				(PF05685)
760192.Halhy_1696				(PF12770)
760192.Halhy_1218				PF01637
760192.Halhy_3924				(PF08843)
760192.Halhy_3921				(PF02687)
760192.Halhy_3923				(PF08843)
760192.Halhy_3928				(PF07676)
760192.Halhy_0033				(PF12867)
760192.Halhy_0740				PF03781
760192.Halhy_0748				PF01637
760192.Halhy_2526				(PF01408)
760192.Halhy_1174				(PF12770)
760192.Halhy_5500				(PF00078)
760192.Halhy_3023				PF13366
760192.Halhy_6508				(PF08843)
760192.Halhy_1237				(PF05685)
760192.Halhy_5269				(PF13376)
760192.Halhy_1235				(PF05685)
760192.Halhy_3906				(PF08843)
760192.Halhy_3270				(PF13181)
760192.Halhy_5520				(PF12770)
760192.Halhy_4923				PF03781
760192.Halhy_4924				PF03781
760192.Halhy_5788				(PF00756)
760192.Halhy_1031				(PF00078)
760192.Halhy_1032				(PF12867)
760192.Halhy_0923				(PF08491)
760192.Halhy_2129				(PF13906)
760192.Halhy_6540				(PF12770)
760192.Halhy_1014				(PF01844)
760192.Halhy_5040				(PF13181)
760192.Halhy_1278				PF03781
760192.Halhy_1906				(PF08843)
760192.Halhy_3504				(PF01844)
760192.Halhy_5565				(PF13181)
760192.Halhy_4214				(PF13365)
760192.Halhy_5972				(PF05685)
760192.Halhy_6273				(PF01408)
760192.Halhy_6490				PF03781
760192.Halhy_1729				(PF10504)
760192.Halhy_1948				(PF13175)
760192.Halhy_1945				(PF01408)
760192.Halhy_1555				(PF05685)
760192.Halhy_4252				(PF00078)
760192.Halhy_3151				(PF01408)
760192.Halhy_6413				(PF05685)
760192.Halhy_5288				(PF07728)
760192.Halhy_1963				(PF13365)
760192.Halhy_4089				(PF13376)
760192.Halhy_0754				PF13366
760192.Halhy_0612				(PF00756)
760192.Halhy_0617				(PF05685)
760192.Halhy_2617				PF13366
760192.Halhy_2849				(PF00078)
760192.Halhy_2268				(PF08843)
760192.Halhy_1766				(PF13289)
760192.Halhy_1223				PF03781
760192.Halhy_2182				(PF01844)
760192.Halhy_5015				(PF05685)
760192.Halhy_6355				(PF00078)
760192.Halhy_0137				(PF00078)
760192.Halhy_4298				(PF07728)
760192.Halhy_2241				(PF02012)
760192.Halhy_4505				PF00112
760192.Halhy_1740				(PF05685)
760192.Halhy_4331				(PF13289)
760192.Halhy_4332				PF03781
760192.Halhy_2477				PF01637
760192.Halhy_1681				(PF13175)
760192.Halhy_1352				(PF05685)
760192.Halhy_0338				(PF13517)
760192.Halhy_1534				(PF01408)
760192.Halhy_3468				(PF01844)
760192.Halhy_2221				(PF13181)
760192.Halhy_6419				(PF01408)
760192.Halhy_5198				(PF01408)
760192.Halhy_0813				(PF12867)
760192.Halhy_2620				(PF09414)
760192.Halhy_2154				(PF05685)
760192.Halhy_3096				(PF13181)
760192.Halhy_1330				(PF13376)
760192.Halhy_5830				(PF05685)
760192.Halhy_1807				(PF00578)
760192.Halhy_6279				(PF12867)
760192.Halhy_2759				(PF07728)
760192.Halhy_0876				(PF05971)
760192.Halhy_3342				(PF13589)
760192.Halhy_5815				(PF12770)
760192.Halhy_0736				(PF13175)
760192.Halhy_6108				(PF00078)
760192.Halhy_1452				(PF03190)
760192.Halhy_5153				(PF05685)
760192.Halhy_5480				(PF05685)
760192.Halhy_3993				(PF00578)
760192.Halhy_3196				PF00656
760192.Halhy_2571				(PF13589)
760192.Halhy_6474				(PF01408)
760192.Halhy_0529				PF01637
760192.Halhy_0956				PF16401
760192.Halhy_5723				(PF13304)
760192.Halhy_3608				(PF13589)
760192.Halhy_3609				(PF01408)
760192.Halhy_3975				(PF05685)
760192.Halhy_0774				(PF01408)
760192.Halhy_1144				(PF05685)
760192.Halhy_1143				(PF00144)
760192.Halhy_0542				(PF07676)
760192.Halhy_4392				(PF12770)
760192.Halhy_0013				(PF05685)
760192.Halhy_0695				(PF12770)
760192.Halhy_2430				(PF07728)
760192.Halhy_1625				(PF13181)
760192.Halhy_5702				(PF07995)
760192.Halhy_3953				PF13366
760192.Halhy_4079				(PF05685)
760192.Halhy_3484				(PF05685)
760192.Halhy_3480				(PF01408)
760192.Halhy_2288				(PF05685)
760192.Halhy_3226				(PF01844)
760192.Halhy_3224				(PF13589)
760192.Halhy_3207				(PF13181)
760192.Halhy_0157				(PF16011)
760192.Halhy_5517				(PF01062)
760192.Halhy_3057				(PF05685)
760192.Halhy_3050				(PF00697)
760192.Halhy_1227				PF03781
760192.Halhy_0248				(PF00686)
760192.Halhy_4037				(PF07691)
760192.Halhy_3269				(PF05685)
760192.Halhy_4146				(PF05685)
760192.Halhy_5532				(PF13289)
760192.Halhy_5537				(PF12255)
760192.Halhy_4549				(PF13181)
760192.Halhy_4971				(PF05685)
760192.Halhy_6206				(PF00078)
760192.Halhy_6205				(PF13176)
760192.Halhy_1264				PF03781
760192.Halhy_4347				(PF05036)
760192.Halhy_6456				(PF00578)
760192.Halhy_5570				(PF05685)
760192.Halhy_4991				(PF00697)
760192.Halhy_6268				(PF12867)
760192.Halhy_1066				(PF12867)
760192.Halhy_5017				(PF07728)
760192.Halhy_1936				(PF05685)
760192.Halhy_5599				(PF05153)
760192.Halhy_3140				PF03781
760192.Halhy_5293				(PF05685)
760192.Halhy_5292				PF03781
760192.Halhy_4521				PF13366
760192.Halhy_3550				(PF04383)
760192.Halhy_0601				(PF01844)
760192.Halhy_0600				(PF13304)
760192.Halhy_1564				(PF07728)
760192.Halhy_5607				(PF13181)
760192.Halhy_4726				(PF05685)
760192.Halhy_4896				(PF04383)
760192.Halhy_5414				(PF01408)
760192.Halhy_5413				(PF06439)
760192.Halhy_3715				(PF00078)
760192.Halhy_2447				(PF05685)
760192.Halhy_0591				(PF12867)
760192.Halhy_0590				(PF05685)
760192.Halhy_1509				(PF13304)
760192.Halhy_0781				(PF12867)
760192.Halhy_0102				(PF05685)
760192.Halhy_4289				(PF12867)
760192.Halhy_3452				(PF13304)
760192.Halhy_1774				(PF00078)
760192.Halhy_1191				(PF00078)
760192.Halhy_0825				(PF13376)
760192.Halhy_5472				PF13366
760192.Halhy_3736				(PF01408)
760192.Halhy_3849				(PF13376)
760192.Halhy_2648				(PF13589)
760192.Halhy_3627				(PF01844)
760192.Halhy_1348				(PF01408)
760192.Halhy_1693				PF00656
760192.Halhy_1522				(PF01844)
760192.Halhy_3473				(PF05685)
760192.Halhy_3478				(PF05685)
760192.Halhy_5188				(PF13304)
760192.Halhy_5459				(PF05971)
760192.Halhy_4587				(PF12770)
760192.Halhy_4326				(PF00578)
760192.Halhy_3318				(PF01062)
760192.Halhy_6360				(PF13289)
760192.Halhy_6092				(PF13304)
760192.Halhy_4135				(PF00756)
760192.Halhy_3676				(PF09414)
760192.Halhy_1812				(PF06439)
760192.Halhy_0860				(PF00578)
760192.Halhy_0305				(PF05685)
760192.Halhy_5825				(PF05685)
760192.Halhy_0045				(PF00686)
760192.Halhy_1876				(PF05685)
760192.Halhy_1122				PF03781
760192.Halhy_2749				(PF03572)
760192.Halhy_6449				(PF12867)
760192.Halhy_1469				PF13366
760192.Halhy_4810				(PF05685)
760192.Halhy_2914				(PF01062)
760192.Halhy_3359				(PF13365)
760192.Halhy_1674				PF00112
760192.Halhy_5805				(PF01569)
760192.Halhy_1587				PF01637
760192.Halhy_5772				(PF12867)
760192.Halhy_6467				(PF05685)
760192.Halhy_0538				(PF13474)
760192.Halhy_2023				(PF07728)
760192.Halhy_3968				PF03781
760192.Halhy_2705				(PF13181)

Detailed merged results for each protein sequence

• Detailed merged results as table (merge_results.html)
• Detailed merged results as tab delimited file (merge_results.csv)

Individual results for each protein sequence

• EffectiveELD predictions (PROTEINS.ELD.TXT)
• Predotar predictions using animal/human model (Predotar_output_modelANIMAL.TXT)
• Predotar predictions using plant model (Predotar_output_modelPLANT.TXT)

Genome based results

Summary

• Gram negative: YES (FDR = 0.5 %)
• Functional Type III secretion system: NO (FDR = 12.5 %)
• Functional Type IV secretion system: NO (FDR = 7.2 %)
• Functional Type VI secretion system: NO (FDR = 7.7 %)

Individual results for each secretion system

• List of 100 most important COGs/NOGs for prediction of functional Type III secretion system (T3_top100_COGS.xls)
• List of 100 most important COGs/NOGs for prediction of functional Type IV secretion system (T4_top100_COGS.xls)
• List of 100 most important COGs/NOGs for prediction of functional Type VI secretion system (T6_top100_COGS.xls)
• List of COGs assigned to Type III secretion system in KEGG (T3SS_KEGG_cmp.xls)
• List of COGs assigned to Type IV secretion system in KEGG (T4SS_KEGG_cmp.xls)
• List of COGs assigned to Type VI secretion system in KEGG (T6SS_KEGG_cmp.xls)

Parameters:

==========================================================
EFFECTIVE_T3_OLD=selective
EFFECTIVE_T3_NEW=selective
PREDOTAR_ANIMAL_OR_PLANT=a
PROTEINS=INPUT PROTEINS
MODUS=genome
RUN_PREDOTAR=T
RUN_EFFECTIVE_T3=T
RUN_T4SEpre=0.5
RUN_EFFECTIVE_CCBD=T
RUN_EFFECTIVE_ELD=4
CheckM_COMPLETENESS=
RUN_EffectiveS346=T
GENOTYPE=COG Profile
EMAIL=
==========================================================