Effective results for Fibrobacter succinogenes subsp. succinogenes S85 (eggnog40)

Summary

Number of putative secreted proteins: 1120
- Predicted by T4SEpre: 0
- Predicted by EffectiveELD: 257 eukaryotic-like domains, contained in 1120 proteins (317 high, 803 medium Z-score)
Predicted protein secretion systems (parentheses indicate weak positive predictions lacking more than 50% of core proteins of a secretion system): None

Protein based results

Putative secreted proteins (weak evidence indicated by parentheses)

Protein	EffectiveT3	EffectiveCCBD	T4SEpre	EffectiveELD	Predotar
59374.FSU_1734				(PF04561) (PF10385) (PF04565) (PF00562) (PF04563) (PF04560)	(ER)
59374.Fisuc_1271				(PF04561) (PF10385) (PF04565) (PF00562) (PF04563) (PF04560)	(ER)
59374.FSU_2415				(PF00932) PF08757 (PF13287)	(ER)
59374.Fisuc_1907				(PF00932) PF08757 (PF13287)	(ER)
59374.FSU_1450				PF04998 PF04997 PF05000 PF00623 PF04983
59374.Fisuc_1004				PF04997 PF04998 PF00623 PF05000 PF04983
59374.FSU_1733				PF00623 PF04997 PF04998 PF05000 PF04983
59374.Fisuc_1270				PF00623 PF04997 PF04998 PF05000 PF04983
59374.FSU_0626				(PF13353) (PF04055)	(mitochondrial)
59374.Fisuc_0413				(PF00271) (PF04851)	ER; (ER)
59374.Fisuc_1688				PF02156 PF16990	ER
59374.FSU_2293				PF03422 PF00331	ER
59374.FSU_2290				PF00150 PF03422	ER
59374.Fisuc_2919				PF17189 (PF14587)	ER
59374.Fisuc_2623				PF03422 (PF04616)	ER
59374.FSU_2789				(PF14714) (PF01926)	(mitochondrial)
59374.FSU_1399				(PF13353) (PF04055)	(mitochondrial)
59374.Fisuc_3116				(PF02875) (PF08245)	ER
59374.FSU_2181				PF02156 PF16990	ER
59374.FSU_1985				(PF01346) (PF00254)	ER
59374.FSU_1165				PF02156 PF16990	ER
59374.FSU_1167				PF02156 PF16990	(mitochondrial)
59374.Fisuc_1769				PF03422 (PF04616)	ER
59374.Fisuc_1763				PF03422 (PF04616)	ER
59374.FSU_1318				(PF01346) (PF00254)	ER
59374.FSU_3192				PF03422 (PF04616)	ER
59374.Fisuc_0191				(PF00271) (PF00176)	(mitochondrial)
59374.Fisuc_1775				PF03422 (PF04616)	ER
59374.FSU_0192				PF03422 (PF04616)	ER
59374.FSU_0207				(PF00271) (PF00176)	(mitochondrial)
59374.FSU_2267				PF03422 (PF03629)	(ER)
59374.FSU_2265				PF17189 PF03422	(ER)
59374.FSU_2264				PF03422 (PF04616)	ER
59374.FSU_2263				PF03422 (PF04616)	ER
59374.FSU_2262				PF03422 (PF04616)	ER
59374.FSU_2269				PF03422 (PF04616)	ER
59374.Fisuc_1765				PF17189 PF03422	(ER)
59374.Fisuc_1764				PF03422 (PF04616)	ER
59374.Fisuc_1767				PF03422 (PF03629)	(ER)
59374.FSU_2522				PF03422 (PF04616)	(mitochondrial)
59374.Fisuc_1790				PF00150 PF03422	ER
59374.Fisuc_1791				PF03422 PF00331	ER
59374.Fisuc_1793				PF03422 PF00331	ER
59374.Fisuc_1794				PF03422 PF00331	ER
59374.Fisuc_0219				(PF13353) (PF04055)	(mitochondrial)
59374.Fisuc_2944				(PF00271) (PF00176)	(mitochondrial)
59374.Fisuc_0953				(PF13353) (PF04055)	(mitochondrial)
59374.FSU_2292				PF03422 PF00331	ER
59374.FSU_2294				PF03422 PF00331	ER
59374.Fisuc_2388				(PF01138) (PF00575) (PF03725) (PF03726)
59374.Fisuc_0872				(PF01346) (PF00254)	ER
59374.FSU_0388				(PF02875) (PF08245)	ER
59374.FSU_3103				PF03422 (PF03629)	ER
59374.Fisuc_1771				(PF02018) (PF10503)	(mitochondrial)
59374.Fisuc_2929				PF03422 (PF04616)	ER
59374.FSU_0182				PF17189 (PF14587)	ER
59374.Fisuc_2396				(PF02018) (PF10503)	ER
59374.Fisuc_0727				PF02156 PF16990	ER
59374.Fisuc_0729				PF02156 PF16990	(mitochondrial)
59374.FSU_2270				(PF02018) (PF10503)	(mitochondrial)
59374.FSU_2274				PF03422 (PF04616)	ER
59374.Fisuc_2246				(PF14714) (PF01926)	(mitochondrial)
59374.Fisuc_1999				PF03422 (PF04616)	(mitochondrial)
59374.Fisuc_1996				PF03422 (PF07745)	ER
59374.Fisuc_1994				PF03422 (PF04616)	(mitochondrial)
59374.FSU_2519				PF03422 (PF07745)	ER
59374.FSU_2517				PF03422 (PF04616)	(mitochondrial)
59374.Fisuc_1419				(PF03947) (PF00181)	mitochondrial; (mitochondrial)
59374.FSU_1887				(PF03947) (PF00181)	mitochondrial; (mitochondrial)
59374.FSU_0598				(PF00271) (PF00176)	(mitochondrial)
59374.FSU_2945				(PF01138) (PF00575) (PF03725) (PF03726)
59374.FSU_2558				PF00759	ER
59374.FSU_0577				(PF00544)	ER; (mitochondrial)
59374.Fisuc_2012				(PF00544)	(ER)
59374.Fisuc_2011				PF00150	ER
59374.FSU_2965				(PF00886)	mitochondrial
59374.FSU_1234				(PF00453)	(mitochondrial)
59374.Fisuc_2488				(PF01103)	ER
59374.Fisuc_2481				(PF00544)	ER
59374.Fisuc_2484				PF07691	ER
59374.Fisuc_0886				(PF00932)	(ER)
59374.FSU_2576				(PF00535)	ER
59374.Fisuc_1866				PF03781	(mitochondrial)
59374.Fisuc_1860				PF00759	ER
59374.Fisuc_2082				(PF01757)	ER
59374.FSU_0089				(PF02938)	mitochondrial
59374.FSU_1685				PF00150	ER
59374.FSU_2015				(PF16116)	ER
59374.FSU_2013				PF00759	ER
59374.FSU_2018				(PF16561)	(mitochondrial)
59374.FSU_1907				PF16314	ER
59374.FSU_0347				PF00150	ER; (ER)
59374.Fisuc_1475				PF07691	ER
59374.Fisuc_1474				PF07691	ER
59374.Fisuc_1473				PF02015	ER
59374.FSU_1664				(PF04402)	ER
59374.FSU_1669				PF03781	ER
59374.FSU_1003				(PF02412)	ER
59374.FSU_2921				(PF03840)	ER
59374.Fisuc_1491				(PF00507)	ER
59374.Fisuc_2917				(PF02412)	ER
59374.Fisuc_2621				(PF04616)	ER
59374.FSU_1493				(PF00722)	ER
59374.Fisuc_0841				(PF08547)	ER
59374.FSU_2604				(PF01121)	(mitochondrial)
59374.FSU_2601				(PF02463)	(mitochondrial)
59374.Fisuc_1828				(PF04851)	(mitochondrial)
59374.Fisuc_1533				(PF16116)	ER
59374.FSU_0516				(PF01103)	ER
59374.Fisuc_1536				(PF16561)	(mitochondrial)
59374.FSU_0514				(PF04055)	(mitochondrial)
59374.Fisuc_1756				(PF00254)	ER
59374.FSU_1022				PF03781	ER
59374.FSU_0255				(PF02412)	ER
59374.Fisuc_2424				(PF00722)	ER
59374.FSU_2622				(PF00722)	ER
59374.Fisuc_0394				PF00759	ER
59374.Fisuc_0393				PF00759	ER
59374.FSU_1823				(PF01661)	(mitochondrial)
59374.FSU_1353				(PF03544)	ER
59374.Fisuc_2090				PF03781	(ER)
59374.Fisuc_1326				PF07691	ER
59374.FSU_2475				(PF13174)	ER
59374.Fisuc_2406				(PF00886)	mitochondrial
59374.Fisuc_0801				PF03781	ER
59374.Fisuc_0112				(PF04055)	(mitochondrial)
59374.Fisuc_0114				(PF01103)	ER
59374.Fisuc_1578				(PF00535)	ER
59374.FSU_0004				(PF02540)	(ER)
59374.Fisuc_2876				PF00759	ER
59374.FSU_2986				(PF00722)	ER
59374.FSU_2187				PF03781	ER
59374.Fisuc_1969				(PF04321)	ER
59374.Fisuc_2461				(PF07745)	mitochondrial
59374.Fisuc_0822				PF12256 (PF03534) PF12255
59374.FSU_1161				PF07857	ER
59374.FSU_2669				(PF00499)	ER
59374.Fisuc_0174				(PF00544)	ER; (mitochondrial)
59374.Fisuc_0170				(PF00899)	mitochondrial
59374.FSU_1373				PF03422	ER
59374.Fisuc_2858				(PF07478)	(mitochondrial)
59374.Fisuc_2073				(PF02463)	(mitochondrial)
59374.Fisuc_1407				PF00347	(mitochondrial)
59374.Fisuc_1768				(PF10503)	ER
59374.FSU_3309				(PF01029)	(ER)
59374.FSU_3154				PF03781	ER
59374.FSU_3155				PF03781	ER
59374.FSU_0211				(PF04191)	ER
59374.Fisuc_1203				(PF04402)	ER
59374.Fisuc_1208				PF03781	ER
59374.FSU_3197				(PF05096)	ER
59374.FSU_3190				(PF04616)	ER
59374.Fisuc_2837				(PF16886)	(mitochondrial)
59374.Fisuc_2839				(PF01813)	(mitochondrial)
59374.FSU_2145				(PF08305)	ER
59374.FSU_2362				PF00759	ER
59374.FSU_2361				PF00759	ER
59374.FSU_2368				PF03781	(mitochondrial)
59374.FSU_1439				(PF01467)	(ER)
59374.Fisuc_1043				(PF00722)	ER
59374.FSU_2772				PF00150	ER
59374.Fisuc_1268				PF00177	(mitochondrial)
59374.Fisuc_1266				PF02156	ER
59374.Fisuc_1592				(PF02412)	ER
59374.FSU_0887				(PF00271)	(mitochondrial)
59374.FSU_1333				(PF00932)	(ER)
59374.Fisuc_2818				(PF00679) (PF06421) (PF00009)
59374.Fisuc_2816				(PF06245)	mitochondrial; (mitochondrial)
59374.Fisuc_2814				(PF03449)	mitochondrial; (mitochondrial)
59374.Fisuc_2377				(PF00028)	ER
59374.Fisuc_2378				(PF00028)	ER
59374.FSU_2443				PF02015	ER
59374.FSU_1457				(PF00092)	(ER)
59374.Fisuc_0998				PF08757	ER
59374.Fisuc_0993				(PF01467)	(ER)
59374.Fisuc_0196				(PF13174)	ER
59374.Fisuc_1779				PF03382	(ER); ER
59374.Fisuc_1774				PF03422	ER
59374.Fisuc_1224				PF00150	ER
59374.Fisuc_1656				(PF08305)	ER
59374.FSU_0206				PF17189	ER
59374.Fisuc_1000				(PF13174)	ER
59374.FSU_0603				(PF13174)	ER
59374.Fisuc_1872				(PF02844) PF01071 (PF02843)
59374.FSU_2121				PF03781	ER
59374.FSU_1731				PF00177	(mitochondrial)
59374.Fisuc_1633				PF03781	ER
59374.FSU_0810				PF00759	ER
59374.Fisuc_0730				PF02156	(ER); (plastid)
59374.FSU_3044				PF03422	(ER)
59374.FSU_1285				(PF08547)	ER
59374.Fisuc_0039				(PF03544)	ER
59374.FSU_0348				PF14388	ER
59374.FSU_2268				(PF10503)	ER
59374.Fisuc_0757				PF00331	ER
59374.Fisuc_0754				PF00331	ER
59374.FSU_3024				(PF07745)	mitochondrial
59374.Fisuc_2250				PF17189	ER
59374.Fisuc_2252				PF03781	ER
59374.Fisuc_2704				(PF04685) (PF12215)	(mitochondrial)
59374.FSU_2520				(PF04616)	(ER)
59374.FSU_2521				(PF04616)	ER
59374.FSU_2527				PF08757	ER
59374.FSU_0368				PF01643	ER
59374.Fisuc_2048				(PF00535)	ER
59374.FSU_2065				(PF00535)	ER
59374.FSU_3006				PF00457	(ER)
59374.Fisuc_1426				PF02015	ER
59374.Fisuc_1425				PF02015	ER
59374.FSU_1794				PF07691	ER
59374.Fisuc_2442				PF00457	(ER)
59374.Fisuc_1301				(PF13173)	(mitochondrial)
59374.FSU_1893				PF02015	ER
59374.FSU_1894				PF02015	ER
59374.FSU_1417				(PF00535)	(mitochondrial); ER
59374.Fisuc_2534				PF03422 (PF03629)	(ER)
59374.Fisuc_0799				(PF03544)	ER
59374.Fisuc_0792				(PF00453)	(mitochondrial)
59374.Fisuc_2230				PF00150	ER
59374.FSU_1228				PF00150	(ER)
59374.Fisuc_2943				PF17189	ER
59374.Fisuc_2945				(PF00092)	ER
59374.Fisuc_2947				(PF04191)	ER
59374.FSU_0799				(PF13541)	mitochondrial
59374.Fisuc_0897				PF00150	ER; (ER)
59374.FSU_2566				(PF13173)	(mitochondrial)
59374.Fisuc_1327				PF07691	ER
59374.Fisuc_1859				PF00759	ER
59374.FSU_0093				(PF16886)	(mitochondrial)
59374.FSU_0096				(PF01496)	(mitochondrial)
59374.FSU_0097				(PF00137)	ER
59374.FSU_0095				(PF01813)	(mitochondrial)
59374.FSU_0098				(PF00137)	ER
59374.Fisuc_2004				PF08757	ER
59374.Fisuc_2553				(PF01103)	ER
59374.FSU_2797				PF03781	ER
59374.FSU_2795				PF17189	ER
59374.Fisuc_0405				PF03781	ER
59374.Fisuc_1460				(PF00328)	ER
59374.FSU_1204				(PF01757)	(ER)
59374.FSU_1206				(PF00271) (PF04851) (PF12344)
59374.Fisuc_2961				(PF00722)	ER
59374.Fisuc_1693				PF03781	ER
59374.FSU_2923				PF03781	ER
59374.Fisuc_2575				PF03781	ER
59374.Fisuc_2574				PF03781	ER
59374.Fisuc_2577				PF03781	ER
59374.Fisuc_2576				PF03781	ER
59374.FSU_2003				(PF00535)	ER
59374.FSU_2005				PF00150	ER; (ER)
59374.FSU_2914				PF00150	ER
59374.FSU_1261				PF12256 (PF03534) PF12255
59374.FSU_1265				PF12256 (PF03534) PF12255
59374.Fisuc_2905				(PF01346)	ER
59374.FSU_2619				PF03781	(ER)
59374.FSU_1875				PF00347	(mitochondrial)
59374.FSU_1874				PF00861	mitochondrial; (mitochondrial)
59374.FSU_1678				(PF01757)	ER
59374.FSU_2289				PF03422	mitochondrial
59374.FSU_2932				(PF00028)	ER
59374.FSU_2931				(PF00028)	ER
59374.FSU_0262				(PF04055)	ER
59374.FSU_1244				PF03781	ER
59374.FSU_1242				(PF03544)	ER
59374.Fisuc_0875				(PF00271) (PF00580) (PF13361)
59374.Fisuc_0389				PF03422	ER
59374.Fisuc_0384				(PF13541)	mitochondrial
59374.Fisuc_0659				(PF01207)	mitochondrial; (mitochondrial)
59374.FSU_2491				(PF04321)	ER
59374.FSU_1947				PF02015	(mitochondrial)
59374.FSU_3272				(PF04685) (PF12215)	(mitochondrial)
59374.Fisuc_1521				(PF00535)	ER
59374.FSU_0074				(PF00679) (PF06421) (PF00009)
59374.FSU_0820				PF03781	ER
59374.FSU_0643				(PF01704)	ER
59374.Fisuc_1406				PF00861	mitochondrial; (mitochondrial)
59374.FSU_0923				(PF00535)	mitochondrial
59374.Fisuc_1735				(PF02421)	(mitochondrial)
59374.Fisuc_2627				(PF05096)	(mitochondrial)
59374.Fisuc_0817				PF12256 (PF03534) PF12255
59374.FSU_0226				(PF00722)	ER
59374.Fisuc_2477				PF03422	ER
59374.Fisuc_2471				PF07691	ER
59374.Fisuc_2478				PF03422	(ER)
59374.FSU_2851				PF00331	ER
59374.Fisuc_0344				(PF03544)	ER
59374.Fisuc_1531				PF00759	ER
59374.FSU_1346				PF00150	ER; (ER)
59374.FSU_0691				(PF01128)	ER
59374.FSU_0697				(PF13177)	(mitochondrial)
59374.FSU_2694				(PF04402)	ER
59374.FSU_2695				(PF04402)	ER
59374.FSU_2441				(PF02018)	ER
59374.FSU_2332				(PF04851)	(mitochondrial)
59374.FSU_1972				(PF00507)	ER
59374.Fisuc_0577				(PF02412)	ER
59374.Fisuc_1955				(PF13174)	ER
59374.Fisuc_1773				PF03422	ER
59374.FSU_3310				(PF11028)	(ER)
59374.FSU_3312				(PF00535)	(ER)
59374.FSU_0758				(PF03544)	ER
59374.FSU_0208				(PF00092)	ER
59374.Fisuc_0362				PF00457	ER; (ER)
59374.FSU_3123				(PF01103)	ER
59374.Fisuc_1417				(PF00237)	mitochondrial
59374.Fisuc_1415				PF00252	(mitochondrial)
59374.Fisuc_2840				(PF01496)	(mitochondrial)
59374.Fisuc_2842				(PF00137)	ER
59374.FSU_1090				(PF01207)	mitochondrial; (mitochondrial)
59374.Fisuc_2157				(PF04402)	ER
59374.Fisuc_2158				(PF04402)	ER
59374.FSU_1953				PF07691	ER
59374.FSU_1954				PF07691	ER
59374.Fisuc_1931				(PF02018)	ER
59374.Fisuc_1933				PF02015	ER
59374.FSU_0777				PF00457	ER; (ER)
59374.Fisuc_2303				PF00331	ER
59374.FSU_1426				(PF01128)	(mitochondrial)
59374.FSU_1427				(PF16387)	ER
59374.FSU_3145				PF03781	ER
59374.FSU_3144				PF03781	ER
59374.FSU_3147				PF03781	ER
59374.FSU_3146				PF03781	ER
59374.Fisuc_1217				(PF01757)	ER
59374.FSU_0432				(PF03544)	ER
59374.Fisuc_2824				PF08757	ER
59374.Fisuc_2040				(PF13173)	(mitochondrial)
59374.FSU_2371				(PF04191)	ER
59374.FSU_2374				(PF02844) PF01071 (PF02843)
59374.FSU_1933				(PF00328)	ER
59374.Fisuc_1661				PF00150	ER
59374.Fisuc_2364				PF00150	ER
59374.Fisuc_2367				(PF03840)	ER
59374.Fisuc_2362				PF00759	ER
59374.Fisuc_2363				(PF00544)	ER
59374.Fisuc_2369				PF03781	ER
59374.FSU_1446				(PF13174)	ER
59374.FSU_1444				PF08757	ER
59374.Fisuc_2584				PF03781	ER
59374.Fisuc_2585				PF03781	ER
59374.Fisuc_0980				(PF01128)	(mitochondrial)
59374.Fisuc_0981				(PF16387)	ER
59374.Fisuc_1523				PF00150	ER; (ER)
59374.FSU_0071				(PF06245)	mitochondrial; (mitochondrial)
59374.Fisuc_1057				(PF13173)	(mitochondrial)
59374.FSU_0630				(PF01103)	ER
59374.FSU_0180				(PF02412)	ER
59374.FSU_1321				(PF00271) (PF00580) (PF13361)
59374.Fisuc_2340				(PF00499)	ER; (ER)
59374.Fisuc_2345				(PF00507)	ER
59374.Fisuc_2134				(PF00499)	ER
59374.Fisuc_3082				PF14388	ER
59374.Fisuc_3081				PF00150	ER; (ER)
59374.Fisuc_3086				PF14388	ER
59374.Fisuc_3085				PF14388	ER
59374.FSU_2741				PF00457	ER
59374.Fisuc_0286				(PF13177)	(mitochondrial)
59374.Fisuc_0280				(PF01128)	ER
59374.FSU_2256				(PF00254)	ER
59374.Fisuc_1010				(PF00092)	(ER)
59374.Fisuc_0728				PF00150	ER
59374.Fisuc_2739				(PF11028)	(ER)
59374.Fisuc_2738				(PF01029)	(ER)
59374.FSU_1729				PF02156	ER
59374.Fisuc_1869				(PF04191)	ER
59374.Fisuc_1357				(PF01661)	(mitochondrial)
59374.FSU_0809				PF00759	ER
59374.FSU_2895				(PF00507)	ER
59374.FSU_2890				(PF00499)	ER
59374.Fisuc_2076				(PF01121)	(mitochondrial)
59374.FSU_1105				(PF01715)	(mitochondrial)
59374.Fisuc_0924				PF03422	ER
59374.FSU_2278				PF03382	(ER); ER
59374.FSU_2272				PF03422	ER
59374.FSU_2273				PF03422	ER
59374.FSU_3056				(PF01103)	ER
59374.FSU_3052				PF07691	mitochondrial
59374.Fisuc_1998				(PF04616)	ER
59374.Fisuc_1997				(PF04616)	(ER)
59374.FSU_0351				PF14388	ER
59374.FSU_0352				PF14388	ER
59374.FSU_1195				PF00331	ER
59374.FSU_2078				(PF02412)	ER
59374.Fisuc_0903				(PF03544)	ER
59374.Fisuc_0766				(PF00271) (PF04851) (PF12344)
59374.Fisuc_0764				(PF01757)	(ER)
59374.FSU_3037				PF07691	ER
59374.Fisuc_1418				(PF00203)	(mitochondrial)
59374.Fisuc_2997				(PF04055)	ER
59374.FSU_1767				(PF13173)	(mitochondrial)
59374.Fisuc_2992				PF00331	ER
59374.Fisuc_2990				(PF02412)	ER
59374.Fisuc_0223				(PF01103)	ER
59374.Fisuc_0595				PF03781	ER
59374.Fisuc_1315				(PF09818)	mitochondrial
59374.FSU_2535				(PF00544)	mitochondrial
59374.FSU_2534				PF00150	ER
59374.FSU_1883				PF00252	(mitochondrial)
59374.FSU_1886				(PF00203)	(mitochondrial)
59374.FSU_1885				(PF00237)	mitochondrial
59374.Fisuc_2033				PF00759	ER
59374.FSU_2233				(PF02421)	(mitochondrial)
59374.Fisuc_0786				PF00150	(ER)
59374.Fisuc_1789				PF03422	mitochondrial
59374.Fisuc_1437				PF16314	mitochondrial; (mitochondrial)
59374.Fisuc_2201				PF00457	ER
59374.FSU_0167				(PF01346)	ER
59374.FSU_1782				(PF09818)	mitochondrial
59374.FSU_0780				(PF00588)	(ER)
59374.Fisuc_0203				(PF02875) (PF08245)
59374.Fisuc_1159				(PF00133) (PF13603)
59374.FSU_0570				(PF14464)	(mitochondrial)
59374.FSU_2954				(PF00587) (PF02403)
59374.FSU_0312				(PF00829)	(plastid)
59374.FSU_2969				(PF02881) (PF02978)
59374.Fisuc_2485				PF03422	(ER)
59374.Fisuc_0083				(PF00535)	(ER)
59374.FSU_2573				(PF00535)	(plastid)
59374.Fisuc_0621				(PF06968) (PF04055)
59374.Fisuc_0627				(PF01138) (PF03725)
59374.Fisuc_2565				PF16990 (PF00544)
59374.FSU_1214				(PF01409) (PF02912)
59374.Fisuc_2973				(PF03462) (PF00472)
59374.FSU_2642				PF08732	(mitochondrial)
59374.FSU_1661				(PF00679) (PF00009)
59374.FSU_2298				(PF01757)	(ER)
59374.Fisuc_2911				(PF06968) (PF04055)
59374.FSU_2030				(PF13353) (PF04055)
59374.FSU_1499				(PF13353) (PF04055)
59374.Fisuc_1390				(PF05697) (PF00254)
59374.FSU_1020				(PF01926) (PF06071)
59374.Fisuc_0475				(PF00679) (PF00009)
59374.FSU_0704				(PF13155) PF01807
59374.Fisuc_2645				(PF05496) (PF05491)
59374.Fisuc_0391				(PF05683) (PF05681)
59374.FSU_3280				(PF13353) (PF04055)
59374.FSU_2479				(PF03462) (PF00472)
59374.Fisuc_1720				(PF00271) (PF04851)
59374.Fisuc_1726				(PF01637)	(mitochondrial)
59374.FSU_0238				(PF03462) (PF00472)
59374.FSU_2859				(PF00535)	(ER)
59374.Fisuc_1575				(PF02881)	(mitochondrial)
59374.FSU_0910				(PF08032) (PF00588)
59374.Fisuc_0565				(PF02875) (PF08245)
59374.Fisuc_0568				(PF02875) (PF08245)
59374.Fisuc_0569				(PF02875) (PF08245)
59374.FSU_2457				(PF04191)	(mitochondrial)
59374.Fisuc_0692				(PF00580) (PF13361)
59374.FSU_3135				PF16990 (PF00544)
59374.FSU_0687				(PF00580) (PF13361)
59374.Fisuc_2146				(PF16203) (PF04851)
59374.FSU_0761				(PF01926) (PF01018)
59374.Fisuc_0159				(PF06968) (PF04055)
59374.Fisuc_1200				(PF00679) (PF00009)
59374.FSU_0409				(PF00679) (PF00009)
59374.Fisuc_2162				(PF13353) (PF04055)
59374.Fisuc_0525				(PF13155) PF01807
59374.Fisuc_2310				(PF00535)	(ER)
59374.FSU_1128				(PF00580) (PF13361)
59374.FSU_2843				(PF11987) (PF00009)
59374.FSU_2842				(PF00575) (PF13184)
59374.Fisuc_1048				(PF00271) (PF04851)
59374.Fisuc_1047				(PF13353) (PF04055)
59374.FSU_0422				PF03382	(mitochondrial)
59374.FSU_2160				(PF00271) (PF04851)
59374.FSU_2168				(PF02421)	(mitochondrial)
59374.Fisuc_1676				(PF02421)	(mitochondrial)
59374.FSU_0196				(PF02018) PF00150
59374.FSU_0994				(PF02875) (PF08245)
59374.FSU_0993				(PF02875) (PF08245)
59374.FSU_0990				(PF02875) (PF08245)
59374.Fisuc_2295				(PF00575) (PF13184)
59374.Fisuc_2296				(PF11987) (PF00009)
59374.Fisuc_0292				(PF13155) PF01807
59374.FSU_0293				(PF13353) (PF04055)
59374.FSU_1738				(PF00298) (PF03946)
59374.FSU_1730				PF02156	(mitochondrial)
59374.FSU_1737				PF00687	(mitochondrial)
59374.Fisuc_3090				(PF13507)	(mitochondrial)
59374.Fisuc_0276				(PF00580) (PF13361)
59374.Fisuc_0016				(PF00679) (PF00009)
59374.Fisuc_0484				(PF03948) (PF01281)
59374.FSU_3108				(PF00580) (PF13361)
59374.FSU_2266				PF03422 (PF03629)
59374.Fisuc_1766				PF03422 (PF03629)
59374.Fisuc_1762				PF03422 (PF04616)
59374.Fisuc_1231				(PF08459) (PF01541)
59374.Fisuc_3056				(PF00271) (PF00176)
59374.Fisuc_1182				(PF00580) (PF13361)
59374.FSU_2698				(PF13353) (PF04055)
59374.Fisuc_0167				(PF14464)	(mitochondrial)
59374.FSU_1186				(PF01757)	(ER)
59374.FSU_2062				(PF02881)	(mitochondrial)
59374.Fisuc_0773				(PF01409) (PF02912)
59374.Fisuc_1797				(PF01757)	(ER)
59374.Fisuc_1424				(PF00009) (PF03143)
59374.FSU_1796				(PF00575)	(mitochondrial)
59374.Fisuc_1306				(PF00271) (PF00176)
59374.FSU_1892				(PF00009) (PF03143)
59374.FSU_0947				(PF13155) PF01807
59374.FSU_0562				(PF06968) (PF04055)
59374.FSU_0306				(PF13353) (PF04055)
59374.Fisuc_2539				(PF00580) (PF13361)
59374.FSU_2222				(PF01637)	(mitochondrial)
59374.FSU_0173				(PF06968) (PF04055)
59374.Fisuc_2933				(PF02018) PF00150
59374.Fisuc_1328				(PF00575)	(mitochondrial)
59374.FSU_3214				(PF05496) (PF05491)
59374.FSU_0893				(PF00679) (PF00009)
59374.FSU_0322				(PF00271) (PF00176)
59374.FSU_1058				(PF01138) (PF03725)
59374.FSU_1052				(PF06968) (PF04055)
59374.FSU_1857				(PF05697) (PF00254)
59374.FSU_1692				(PF08459) (PF01541)
59374.FSU_1878				PF00673 PF00281
59374.FSU_1873				PF03719 PF00333
59374.FSU_1872				(PF00327)	mitochondrial; not used
59374.Fisuc_0678				PF03422	(ER)
59374.FSU_1644				(PF00580) (PF13361)
59374.Fisuc_1404				(PF00327)	mitochondrial; not used
59374.Fisuc_1405				PF03719 PF00333
59374.FSU_0922				(PF00535)	(mitochondrial)
59374.Fisuc_1736				(PF03544)	(mitochondrial)
59374.FSU_0249				(PF00958) (PF02540)
59374.Fisuc_2410				(PF02881) (PF02978)
59374.FSU_0827				(PF00271) (PF04851)
59374.FSU_2283				(PF00580) (PF13361)
59374.Fisuc_1503				(PF01346) (PF00254)
59374.Fisuc_2984				(PF00958) (PF02540)
59374.FSU_1772				(PF00271) (PF00176)
59374.FSU_0902				(PF03948) (PF01281)
59374.Fisuc_0347				(PF01926) (PF01018)
59374.FSU_1619				(PF00133) (PF13603)
59374.FSU_0693				(PF03484) (PF03147)
59374.Fisuc_1959				(PF03462) (PF00472)
59374.Fisuc_1892				(PF13174)	(mitochondrial)
59374.Fisuc_1547				(PF13353) (PF04055)
59374.Fisuc_1938				(PF04191)	(mitochondrial)
59374.Fisuc_2302				(PF00271) (PF00176)
59374.FSU_1501				(PF00271) (PF04851)
59374.Fisuc_2046				(PF00535)	(plastid)
59374.Fisuc_1669				(PF00271) (PF04851)
59374.FSU_1114				PF03422	(ER)
59374.Fisuc_1279				(PF00009) (PF03143)
59374.Fisuc_1275				(PF00298) (PF03946)
59374.Fisuc_1274				PF00687	(mitochondrial)
59374.Fisuc_1272				(PF00542)	(ER)
59374.Fisuc_2112				PF08732	(mitochondrial)
59374.Fisuc_1648				(PF08032) (PF00588)
59374.Fisuc_2395				(PF00587) (PF02403)
59374.FSU_0610				(PF02875) (PF08245)
59374.Fisuc_0502				(PF00535)	(mitochondrial)
59374.Fisuc_2753				(PF02540)	(mitochondrial)
59374.Fisuc_0282				(PF03484) (PF03147)
59374.Fisuc_0492				(PF08032) (PF00588)
59374.Fisuc_0724				PF07857	(ER)
59374.FSU_2137				(PF08032) (PF00588)
59374.FSU_2397				(PF13174)	(mitochondrial)
59374.FSU_0807				(PF05683) (PF05681)
59374.Fisuc_0748				(PF01757)	(ER)
59374.Fisuc_2711				(PF13353) (PF04055)
59374.FSU_1743				(PF00009) (PF03143)
59374.Fisuc_3047				(PF00829)	(plastid)
59374.Fisuc_3041				(PF13353) (PF04055)
59374.Fisuc_0029				PF03382	(mitochondrial)
59374.FSU_0356				(PF13507)	(mitochondrial)
59374.FSU_2216				(PF00271) (PF04851)
59374.Fisuc_1410				PF00673 PF00281
59374.Fisuc_3027				(PF13353) (PF04055)
59374.Fisuc_0593				(PF01926) (PF06071)
59374.FSU_2682				(PF16203) (PF04851)
59374.FSU_2654				(PF01103)	(mitochondrial)
59374.FSU_2234				(PF03544)	(mitochondrial)
59374.Fisuc_1783				(PF00580) (PF13361)
59374.Fisuc_0205				(PF00163)
59374.Fisuc_1153				(PF03796)
59374.FSU_0622				(PF08305)
59374.Fisuc_1337				(PF06250)
59374.Fisuc_1335				(PF01171)
59374.FSU_0573				(PF00899)
59374.FSU_0311				(PF01016)
59374.Fisuc_2013				(PF02620)
59374.Fisuc_2546				(PF01467)
59374.Fisuc_2018				(PF14622)
59374.Fisuc_0942				(PF04326)
59374.Fisuc_0947				(PF00889)
59374.FSU_2035				(PF01926)
59374.FSU_1049				(PF01207)
59374.FSU_2968				(PF13508)
59374.FSU_2962				(PF01245)
59374.FSU_2963				(PF01746)
59374.FSU_2964				(PF01782)
59374.Fisuc_2294				(PF02576)
59374.Fisuc_2297				(PF02033)
59374.Fisuc_2742				(PF00535)
59374.Fisuc_2740				(PF00535)
59374.Fisuc_2741				(PF00535)
59374.Fisuc_1451				(PF01661)
59374.FSU_0406				(PF00932)
59374.Fisuc_2951				(PF04055)
59374.Fisuc_0887				(PF09359)
59374.Fisuc_0088				(PF12872)
59374.FSU_2579				(PF04230)
59374.FSU_2572				PF04488
59374.FSU_3228				(PF00535)
59374.FSU_3225				(PF00535)
59374.FSU_3226				(PF04230)
59374.FSU_0559				(PF06325)
59374.FSU_0550				(PF00009)
59374.FSU_0080				PF08757
59374.Fisuc_2568				(PF04055)
59374.Fisuc_2569				(PF01207)
59374.Fisuc_2560				(PF00275)
59374.FSU_1069				(PF00271)
59374.Fisuc_0293				(PF02873)
59374.Fisuc_2977				(PF01693)
59374.Fisuc_2604				(PF00542)
59374.FSU_2590				(PF13271)
59374.Fisuc_1118				(PF04055)
59374.FSU_1866				PF00411
59374.FSU_1867				PF00416
59374.Fisuc_1113				PF02527
59374.Fisuc_1116				(PF02677)
59374.Fisuc_0604				(PF00302)
59374.Fisuc_1805				(PF00133)
59374.FSU_2865				(PF01980)
59374.FSU_3243				(PF04230)
59374.FSU_3240				(PF01041)
59374.FSU_3247				(PF00535)
59374.FSU_0537				(PF00092)
59374.FSU_2841				(PF02576)
59374.FSU_1662				(PF04607)
59374.Fisuc_0453				(PF04055)
59374.FSU_1279				PF02787
59374.FSU_2034				(PF01926)
59374.Fisuc_2622				(PF04616)
59374.FSU_1803				(PF01171)
59374.FSU_1805				(PF06250)
59374.Fisuc_0669				(PF01715)
59374.Fisuc_1822				(PF06418)
59374.Fisuc_1823				(PF08713)
59374.Fisuc_1827				(PF01555)
59374.Fisuc_1398				PF00411
59374.Fisuc_1399				PF00416
59374.Fisuc_1975				(PF13241)
59374.FSU_1393				(PF00889)
59374.FSU_1648				(PF04326)
59374.FSU_3091				PF03382
59374.FSU_0705				(PF02873)
59374.FSU_1252				PF03382
59374.FSU_1251				PF03382
59374.Fisuc_2938				PF02787
59374.Fisuc_2397				(PF04055)
59374.Fisuc_0865				(PF03054)
59374.Fisuc_2648				(PF01041)
59374.FSU_1825				PF03382
59374.FSU_1820				(PF04055)
59374.FSU_1829				PF03382
59374.FSU_1605				(PF01926)
59374.Fisuc_0648				(PF00271)
59374.FSU_0069				(PF03449)
59374.Fisuc_2093				(PF00722)
59374.FSU_0394				(PF00308)
59374.FSU_0937				(PF00521)
59374.Fisuc_1722				(PF02384)
59374.FSU_0720				(PF01541)
59374.Fisuc_2403				(PF01245)
59374.Fisuc_2405				(PF01782)
59374.Fisuc_2404				(PF01746)
59374.Fisuc_2409				(PF13508)
59374.Fisuc_0809				PF03382
59374.Fisuc_0808				PF03382
59374.Fisuc_2664				(PF05683)
59374.Fisuc_2661				(PF01757)
59374.Fisuc_2663				(PF01757)
59374.Fisuc_2662				(PF05681)
59374.Fisuc_2669				PF01071
59374.FSU_2649				(PF04055)
59374.FSU_2869				(PF04321)
59374.FSU_3115				(PF01467)
59374.FSU_1235				(PF01632)
59374.Fisuc_1570				(PF12872)
59374.Fisuc_1573				(PF01487)
59374.FSU_1236				(PF00707)
59374.FSU_0001				(PF00308)
59374.FSU_0005				(PF00254)
59374.FSU_0911				PF08757
59374.FSU_2327				(PF08713)
59374.FSU_2325				(PF06418)
59374.FSU_2322				(PF02540)
59374.Fisuc_1966				(PF01980)
59374.FSU_0742				(PF02367)
59374.FSU_0216				(PF04055)
59374.FSU_0747				(PF13541)
59374.Fisuc_0699				(PF02384)
59374.Fisuc_0166				(PF14464)
59374.FSU_2451				(PF00271)
59374.Fisuc_0824				(PF03538)
59374.FSU_1162				(PF01926)
59374.Fisuc_2682				(PF04321)
59374.FSU_3130				(PF00275)
59374.FSU_3138				(PF04055)
59374.FSU_3139				(PF01207)
59374.Fisuc_0687				(PF00535)
59374.FSU_0020				PF03382
59374.FSU_0027				PF03781
59374.FSU_0468				(PF01555)
59374.Fisuc_2859				(PF00271)
59374.Fisuc_2851				PF03382
59374.Fisuc_1402				(PF00344)
59374.Fisuc_1403				PF00828
59374.FSU_1083				(PF01757)
59374.Fisuc_2147				(PF13174)
59374.FSU_2306				(PF00133)
59374.FSU_3301				(PF13292)
59374.FSU_0763				(PF01668)
59374.Fisuc_2448				(PF02384)
59374.FSU_1418				(PF04326)
59374.FSU_1149				(PF00535)
59374.FSU_1148				PF04488
59374.FSU_3159				(PF01541)
59374.FSU_1612				(PF03796)
59374.FSU_3153				PF03781
59374.FSU_3157				PF03781
59374.Fisuc_0156				(PF06325)
59374.Fisuc_1201				(PF04607)
59374.FSU_0405				(PF00472)
59374.FSU_3191				(PF04616)
59374.Fisuc_2833				(PF02938)
59374.Fisuc_2164				(PF05066)
59374.Fisuc_2160				(PF13597)
59374.FSU_2144				(PF01757)
59374.FSU_2143				(PF01757)
59374.FSU_2497				(PF13241)
59374.Fisuc_0520				(PF00271)
59374.FSU_2700				(PF05066)
59374.Fisuc_2316				(PF01980)
59374.FSU_1430				(PF00535)
59374.FSU_1123				(PF00535)
59374.FSU_2846				(PF01687)
59374.FSU_2845				(PF01509)
59374.FSU_2844				(PF02033)
59374.Fisuc_0319				(PF13508)
59374.FSU_2777				(PF01029)
59374.FSU_0331				(PF01926)
59374.FSU_1334				(PF09359)
59374.FSU_0429				(PF12392)
59374.Fisuc_2768				PF03382
59374.FSU_1923				(PF01661)
59374.Fisuc_0053				(PF07478)
59374.Fisuc_0054				(PF00814)
59374.Fisuc_0057				PF00759
59374.FSU_1451				(PF00588)
59374.FSU_0856				PF01807
59374.Fisuc_0336				(PF04055)
59374.Fisuc_0332				(PF13541)
59374.Fisuc_1067				(PF13173)
59374.FSU_2751				(PF04055)
59374.Fisuc_0193				(PF00275)
59374.FSU_0997				(PF01795)
59374.FSU_0447				(PF07478)
59374.FSU_0448				(PF00814)
59374.Fisuc_2298				(PF01509)
59374.Fisuc_2299				(PF01687)
59374.Fisuc_1550				(PF01926)
59374.Fisuc_2120				(PF01103)
59374.FSU_2108				PF01643
59374.FSU_2109				(PF00275)
59374.FSU_1719				(PF01541)
59374.Fisuc_1655				(PF01757)
59374.Fisuc_1654				(PF01757)
59374.FSU_0879				(PF02410)
59374.FSU_0751				(PF04055)
59374.FSU_0201				PF02787
59374.FSU_2732				(PF00092)
59374.Fisuc_1005				(PF00588)
59374.Fisuc_0712				(PF00535)
59374.Fisuc_0711				PF04488
59374.FSU_3068				(PF01555)
59374.FSU_3069				(PF04851)
59374.FSU_0600				(PF00275)
59374.Fisuc_2720				(PF02463)
59374.FSU_1736				(PF00466)
59374.Fisuc_3093				(PF00588)
59374.Fisuc_3098				PF00609
59374.FSU_2380				(PF04055)
59374.Fisuc_0012				(PF00472)
59374.Fisuc_0013				(PF00932)
59374.Fisuc_2320				(PF04321)
59374.Fisuc_2321				(PF04055)
59374.Fisuc_2323				(PF02463)
59374.Fisuc_2324				(PF02390)
59374.FSU_0816				(PF08305)
59374.FSU_0817				(PF00535)
59374.Fisuc_0486				(PF01250)
59374.Fisuc_0737				(PF00749)
59374.Fisuc_1289				(PF04851)
59374.Fisuc_1606				(PF01637)
59374.FSU_0487				(PF12872)
59374.FSU_0489				(PF13597)
59374.Fisuc_2709				(PF00009)
59374.FSU_1533				(PF04055)
59374.FSU_1757				(PF04851)
59374.Fisuc_1281				(PF05496)
59374.Fisuc_0036				(PF12392)
59374.Fisuc_1619				PF01643
59374.FSU_2505				(PF00749)
59374.FSU_3121				(PF00271)
59374.Fisuc_2060				(PF07478)
59374.Fisuc_1945				(PF08713)
59374.Fisuc_1947				(PF04055)
59374.Fisuc_1408				PF00410
59374.FSU_1511				(PF00899)
59374.Fisuc_1545				(PF00092)
59374.Fisuc_1982				(PF00749)
59374.Fisuc_0235				(PF01704)
59374.Fisuc_1186				(PF04326)
59374.Fisuc_1368				PF03382
59374.Fisuc_1362				PF03382
59374.Fisuc_1367				PF03382
59374.Fisuc_1366				PF03382
59374.FSU_0364				PF00609
59374.FSU_1183				(PF03796)
59374.FSU_1187				(PF00575)
59374.Fisuc_2519				PF03382
59374.Fisuc_0913				(PF14512)
59374.FSU_2060				(PF01487)
59374.FSU_1759				PF13151
59374.FSU_2204				(PF13173)
59374.Fisuc_1422				PF00297
59374.Fisuc_1423				PF00338
59374.Fisuc_1421				(PF00573)
59374.FSU_0117				(PF00271)
59374.FSU_0116				(PF07478)
59374.FSU_1578				PF12437
59374.FSU_1571				PF02527
59374.FSU_1574				(PF02677)
59374.FSU_1795				PF07691
59374.Fisuc_3035				(PF13241)
59374.Fisuc_0215				(PF08305)
59374.FSU_2541				(PF14622)
59374.FSU_1891				PF00338
59374.FSU_1890				PF00297
59374.FSU_1415				(PF01467)
59374.FSU_1416				(PF00535)
59374.FSU_1142				PF03382
59374.FSU_0416				(PF00254)
59374.FSU_0568				(PF00899)
59374.FSU_0569				(PF14464)
59374.FSU_0300				(PF13241)
59374.FSU_0308				(PF01702)
59374.Fisuc_0975				PF00572
59374.Fisuc_0974				PF00380
59374.Fisuc_0972				(PF04326)
59374.Fisuc_0971				(PF00535)
59374.Fisuc_0970				(PF00535)
59374.FSU_2956				(PF04055)
59374.Fisuc_0793				(PF01632)
59374.Fisuc_0794				(PF00707)
59374.Fisuc_1446				PF02527
59374.Fisuc_1347				(PF04851)
59374.Fisuc_1346				(PF02384)
59374.Fisuc_2235				(PF01029)
59374.FSU_0171				(PF00899)
59374.FSU_1221				(PF00271)
59374.FSU_0796				(PF00162)
59374.Fisuc_0097				(PF00535)
59374.Fisuc_0090				(PF13597)
59374.Fisuc_0093				(PF00092)
59374.Fisuc_0099				(PF01041)
59374.FSU_2563				(PF04055)
59374.Fisuc_1140				(PF02390)
59374.Fisuc_1147				(PF01926)
59374.Fisuc_0638				(PF00271)
59374.Fisuc_1850				(PF01765)
59374.Fisuc_1856				PF03781
59374.FSU_3218				(PF01041)
59374.FSU_0328				(PF00587)
59374.FSU_2028				(PF00092)
59374.Fisuc_0402				(PF00535)
59374.Fisuc_0401				(PF08305)
59374.FSU_1200				(PF01406)
59374.Fisuc_2967				(PF03544)
59374.FSU_2586				(PF00535)
59374.FSU_2584				PF13151
59374.FSU_2580				(PF04055)
59374.FSU_2588				(PF07478)
59374.FSU_2589				(PF01041)
59374.Fisuc_1120				PF12437
59374.Fisuc_0619				(PF01207)
59374.Fisuc_1876				(PF04055)
59374.FSU_3233				(PF05683)
59374.FSU_3232				(PF01757)
59374.FSU_3231				(PF05681)
59374.FSU_3230				(PF01757)
59374.FSU_3238				PF01071
59374.FSU_1079				(PF00271)
59374.FSU_2915				(PF01702)
59374.FSU_2919				(PF08245)
59374.Fisuc_2061				(PF01041)
59374.Fisuc_0426				(PF00749)
59374.FSU_1267				(PF03538)
59374.Fisuc_2903				(PF00587)
59374.Fisuc_2909				(PF00899)
59374.FSU_2617				(PF00587)
59374.FSU_2611				(PF01757)
59374.FSU_1879				(PF17136)
59374.FSU_1876				PF00410
59374.FSU_1871				PF00828
59374.FSU_1870				(PF00344)
59374.Fisuc_1109				(PF00575)
59374.Fisuc_1106				(PF04326)
59374.Fisuc_1103				(PF06325)
59374.Fisuc_1819				(PF02540)
59374.Fisuc_1816				PF12437
59374.FSU_1135				(PF02384)
59374.FSU_3250				(PF04321)
59374.FSU_3089				PF03382
59374.Fisuc_0447				(PF01171)
59374.Fisuc_0442				PF01807
59374.Fisuc_1719				(PF06250)
59374.Fisuc_1710				(PF13173)
59374.FSU_2427				(PF13177)
59374.FSU_2423				(PF00814)
59374.Fisuc_2659				(PF00535)
59374.Fisuc_2656				(PF00535)
59374.Fisuc_2657				(PF04230)
59374.Fisuc_0386				PF16011
59374.Fisuc_0387				PF01643
59374.Fisuc_0381				(PF00162)
59374.FSU_1813				(PF04851)
59374.FSU_1812				(PF02384)
59374.FSU_3277				(PF00009)
59374.FSU_1389				(PF04326)
59374.FSU_1033				(PF00302)
59374.Fisuc_1551				(PF01926)
59374.FSU_0924				(PF00535)
59374.Fisuc_0469				(PF00271)
59374.Fisuc_0461				(PF02410)
59374.FSU_2403				(PF03544)
59374.FSU_0242				(PF01693)
59374.Fisuc_0813				PF02787
59374.Fisuc_2671				(PF01041)
59374.Fisuc_2675				(PF04230)
59374.Fisuc_2679				(PF00535)
59374.FSU_2874				(PF02390)
59374.FSU_2870				(PF04055)
59374.FSU_1834				PF03382
59374.Fisuc_3102				PF01643
59374.FSU_3290				(PF02463)
59374.Fisuc_2088				(PF00587)
59374.Fisuc_2056				PF13151
59374.FSU_0904				(PF01250)
59374.Fisuc_2058				(PF00535)
59374.FSU_2465				(PF08713)
59374.FSU_2467				(PF04055)
59374.FSU_0739				(PF04607)
59374.FSU_0736				(PF13508)
59374.FSU_0734				(PF13508)
59374.Fisuc_0835				PF02787
59374.FSU_1175				(PF00749)
59374.Fisuc_0349				(PF01668)
59374.Fisuc_0165				(PF00899)
59374.FSU_0031				(PF01171)
59374.FSU_2331				(PF01555)
59374.Fisuc_0572				(PF01795)
59374.FSU_3311				(PF00535)
59374.FSU_3313				(PF00535)
59374.Fisuc_2450				(PF10544)
59374.Fisuc_0365				(PF00588)
59374.Fisuc_0363				(PF00521)
59374.FSU_3173				(PF00542)
59374.Fisuc_1897				(PF03544)
59374.Fisuc_0147				(PF00009)
59374.FSU_0105				PF03382
59374.FSU_0107				PF03382
59374.Fisuc_2387				PF00312
59374.FSU_1362				(PF14512)
59374.FSU_0943				(PF00271)
59374.Fisuc_2841				(PF00137)
59374.Fisuc_2849				PF03382
59374.Fisuc_2848				(PF01406)
59374.FSU_2318				PF12437
59374.Fisuc_1936				(PF00271)
59374.FSU_0778				(PF00521)
59374.FSU_1420				PF00380
59374.FSU_1421				PF00572
59374.FSU_1136				(PF00133)
59374.FSU_1429				(PF05704)
59374.Fisuc_0307				(PF01541)
59374.FSU_1765				(PF01555)
59374.FSU_1309				(PF03054)
59374.FSU_0439				(PF01467)
59374.Fisuc_2045				PF04488
59374.FSU_2150				PF00150
59374.Fisuc_0652				(PF01757)
59374.FSU_2488				(PF01980)
59374.Fisuc_1915				(PF00814)
59374.Fisuc_1919				(PF13177)
59374.Fisuc_2365				(PF01702)
59374.Fisuc_2366				(PF08245)
59374.Fisuc_2583				PF03781
59374.Fisuc_2587				PF03781
59374.Fisuc_2589				(PF01541)
59374.Fisuc_0984				(PF00535)
59374.Fisuc_0983				(PF05704)
59374.Fisuc_0321				(PF13508)
59374.Fisuc_0327				(PF02367)
59374.Fisuc_0324				(PF04607)
59374.Fisuc_1056				(PF00899)
59374.FSU_2742				(PF00575)
59374.Fisuc_1277				(PF00584)
59374.Fisuc_1273				(PF00466)
59374.Fisuc_1584				PF00150
59374.FSU_0636				(PF01649)
59374.FSU_0634				PF04670
59374.FSU_0451				PF00759
59374.Fisuc_2779				(PF01171)
59374.Fisuc_2775				PF03781
59374.FSU_2684				(PF13174)
59374.Fisuc_2117				PF08757
59374.Fisuc_2115				(PF04055)
59374.FSU_2353				(PF01765)
59374.FSU_2357				PF03781
59374.Fisuc_0515				(PF00521)
59374.Fisuc_0045				(PF01467)
59374.Fisuc_1647				(PF13292)
59374.Fisuc_2347				(PF04607)
59374.FSU_0840				(PF00749)
59374.Fisuc_2063				(PF13271)
59374.Fisuc_1073				(PF03054)
59374.Fisuc_1076				(PF04055)
59374.Fisuc_0700				(PF00133)
59374.Fisuc_0705				PF03382
59374.Fisuc_1256				(PF01541)
59374.FSU_0612				(PF00163)
59374.Fisuc_0503				(PF00535)
59374.Fisuc_2750				(PF00308)
59374.Fisuc_2754				(PF00254)
59374.Fisuc_0504				(PF00535)
59374.Fisuc_0069				(PF01555)
59374.Fisuc_1620				(PF00275)
59374.FSU_0862				(PF01171)
59374.FSU_0869				(PF04055)
59374.Fisuc_0493				PF08757
59374.Fisuc_0725				(PF01926)
59374.FSU_0673				(PF04851)
59374.FSU_0676				(PF04383)
59374.FSU_0497				(PF00535)
59374.FSU_0499				(PF01041)
59374.Fisuc_2730				(PF13292)
59374.Fisuc_2521				PF03382
59374.FSU_2136				(PF13292)
59374.Fisuc_3062				(PF00587)
59374.Fisuc_3065				(PF01926)
59374.Fisuc_0134				(PF00092)
59374.Fisuc_0263				(PF01555)
59374.Fisuc_0262				(PF04851)
59374.Fisuc_0264				(PF04383)
59374.Fisuc_0001				(PF00308)
59374.Fisuc_1354				(PF04055)
59374.Fisuc_1359				PF03382
59374.FSU_0637				(PF01041)
59374.FSU_0803				PF01643
59374.FSU_0802				PF16011
59374.FSU_2897				(PF04607)
59374.FSU_2094				(PF01637)
59374.Fisuc_1033				(PF00271)
59374.Fisuc_0749				(PF00575)
59374.Fisuc_0745				(PF03796)
59374.Fisuc_1291				PF13151
59374.Fisuc_1298				(PF01555)
59374.FSU_0656				(PF03449)
59374.FSU_1522				(PF13173)
59374.FSU_1528				(PF03054)
59374.FSU_1740				(PF00584)
59374.FSU_1748				(PF05496)
59374.Fisuc_3046				(PF01016)
59374.Fisuc_3043				(PF01702)
59374.Fisuc_2110				(PF13508)
59374.Fisuc_0246				(PF03449)
59374.FSU_3012				(PF02384)
59374.Fisuc_0023				(PF00254)
59374.FSU_0359				(PF00588)
59374.Fisuc_2052				(PF04055)
59374.Fisuc_2051				(PF04230)
59374.Fisuc_2500				(PF01555)
59374.Fisuc_2501				(PF04851)
59374.FSU_2070				PF00150
59374.FSU_2213				(PF06250)
59374.FSU_2218				(PF02384)
59374.Fisuc_0761				(PF01406)
59374.Fisuc_1411				(PF17136)
59374.FSU_0104				(PF01406)
59374.Fisuc_1416				PF00189
59374.Fisuc_1414				(PF00831)
59374.Fisuc_2193				(PF00092)
59374.Fisuc_0227				PF04670
59374.Fisuc_0229				(PF01041)
59374.Fisuc_0228				(PF01649)
59374.FSU_2536				(PF02620)
59374.FSU_1882				(PF00831)
59374.FSU_1884				PF00189
59374.FSU_1889				(PF00573)
59374.FSU_2651				PF08757
59374.FSU_2873				(PF02463)
59374.Fisuc_2038				(PF04055)
59374.Fisuc_2523				PF03382
59374.Fisuc_0969				(PF01467)
59374.FSU_2055				(PF12872)
59374.FSU_2944				PF00312
59374.Fisuc_0780				(PF00271)
59374.FSU_3014				(PF10544)
59374.Fisuc_2202				(PF00575)
59374.Fisuc_2209				(PF04055)
59374.FSU_0165				(PF00587)
59374.FSU_1561				(PF06325)
59374.FSU_1564				(PF04326)
59374.FSU_1567				(PF00575)
59374.Fisuc_3008				(PF00535)

Detailed merged results for each protein sequence

• Detailed merged results as table (merge_results.html)
• Detailed merged results as tab delimited file (merge_results.csv)

Individual results for each protein sequence

• EffectiveELD predictions (PROTEINS.ELD.TXT)
• Predotar predictions using animal/human model (Predotar_output_modelANIMAL.TXT)
• Predotar predictions using plant model (Predotar_output_modelPLANT.TXT)

Genome based results

Summary

• Gram negative: YES (FDR = 0.5 %)
• Functional Type III secretion system: NO (FDR = 12.5 %)
• Functional Type IV secretion system: NO (FDR = 7.2 %)
• Functional Type VI secretion system: NO (FDR = 7.7 %)

Individual results for each secretion system

• List of 100 most important COGs/NOGs for prediction of functional Type III secretion system (T3_top100_COGS.xls)
• List of 100 most important COGs/NOGs for prediction of functional Type IV secretion system (T4_top100_COGS.xls)
• List of 100 most important COGs/NOGs for prediction of functional Type VI secretion system (T6_top100_COGS.xls)
• List of COGs assigned to Type III secretion system in KEGG (T3SS_KEGG_cmp.xls)
• List of COGs assigned to Type IV secretion system in KEGG (T4SS_KEGG_cmp.xls)
• List of COGs assigned to Type VI secretion system in KEGG (T6SS_KEGG_cmp.xls)

Parameters:

==========================================================
EFFECTIVE_T3_OLD=selective
EFFECTIVE_T3_NEW=selective
PREDOTAR_ANIMAL_OR_PLANT=a
PROTEINS=INPUT PROTEINS
MODUS=genome
RUN_PREDOTAR=T
RUN_EFFECTIVE_T3=T
RUN_T4SEpre=0.5
RUN_EFFECTIVE_CCBD=T
RUN_EFFECTIVE_ELD=4
CheckM_COMPLETENESS=
RUN_EffectiveS346=T
GENOTYPE=COG Profile
EMAIL=
==========================================================