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Effective results for Sphingobacterium sp. 21 (eggnog40)

Summary

Number of putative secreted proteins: 437
- Predicted by T4SEpre: 0
- Predicted by EffectiveELD: 75 eukaryotic-like domains, contained in 437 proteins (15 high, 422 medium Z-score)
Predicted protein secretion systems (parentheses indicate weak positive predictions lacking more than 50% of core proteins of a secretion system): None

Protein based results

Putative secreted proteins (weak evidence indicated by parentheses)

ProteinEffectiveT3EffectiveCCBDT4SEpreEffectiveELDPredotar
743722.Sph21_2304(PF16355) (PF00703) (PF02836) (PF02837)ER
743722.Sph21_0923PF16334 PF08760 PF16335 PF17168ER
743722.Sph21_1756(PF02929) (PF00703) (PF02836) (PF02837)ER
743722.Sph21_0483(PF00703) (PF02929) (PF02836) (PF02837)ER
743722.Sph21_1975(PF16355) (PF00703) (PF02836) (PF02837)ER
743722.Sph21_4501(PF02929) (PF00703) (PF02836) (PF02837)ER
743722.Sph21_0598PF16334 PF08760 PF16335 PF17168ER
743722.Sph21_4567(PF16355) (PF00703) (PF02836) (PF02837)ER
743722.Sph21_2327(PF16355) (PF00703) (PF02836) (PF02837)ER
743722.Sph21_2864(PF16355) (PF00703) (PF02836) (PF02837)ER
743722.Sph21_2314(PF00703) (PF02929) (PF02836) (PF02837)ER
743722.Sph21_5085(PF00703) (PF02836) (PF02837)ER
743722.Sph21_0596(PF00703) (PF02836) (PF02837)ER
743722.Sph21_4451(PF00703) (PF02836) (PF02837)ER
743722.Sph21_0478(PF00703) (PF02836) (PF02837)ER
743722.Sph21_3373(PF01120) (PF16757)ER
743722.Sph21_2302(PF00295) (PF12708)ER
743722.Sph21_2303(PF02837) (PF14498)ER
743722.Sph21_1342(PF02687) (PF12704)mitochondrial; (mitochondrial)
743722.Sph21_4336(PF11918) (PF03572)ER
743722.Sph21_1361(PF00595) (PF03572)ER
743722.Sph21_1198(PF02687) (PF12704)mitochondrial
743722.Sph21_1199(PF02687) (PF12704)mitochondrial
743722.Sph21_1176(PF02687) (PF12704)mitochondrial
743722.Sph21_1179(PF02687) (PF12704)mitochondrial; (mitochondrial)
743722.Sph21_4700(PF01120) (PF16757)ER
743722.Sph21_3547(PF02687) (PF12704)(ER)
743722.Sph21_2890(PF00295) (PF12708)ER
743722.Sph21_1768(PF01120) (PF16757)ER
743722.Sph21_0965(PF02687) (PF12704)mitochondrial
743722.Sph21_4242(PF07971) (PF14683)ER
743722.Sph21_1226(PF02687) (PF12704)mitochondrial; (mitochondrial)
743722.Sph21_1397(PF00595) (PF03572)ER
743722.Sph21_0828(PF02687) (PF12704)mitochondrial
743722.Sph21_4388(PF02687) (PF12704)mitochondrial
743722.Sph21_3413(PF02687) (PF12704)mitochondrial
743722.Sph21_2610(PF02687) (PF12704)mitochondrial
743722.Sph21_2591(PF02687) (PF12704)ER
743722.Sph21_0443(PF05592) (PF08531)ER; (ER)
743722.Sph21_0444(PF05592) (PF08531)ER
743722.Sph21_0844(PF02687) (PF12704)mitochondrial
743722.Sph21_1221(PF02687) (PF12704)mitochondrial
743722.Sph21_1227(PF02687) (PF12704)mitochondrial
743722.Sph21_1225(PF02687) (PF12704)mitochondrial
743722.Sph21_1452(PF00703) (PF02836)ER
743722.Sph21_1214(PF02687) (PF12704)mitochondrial
743722.Sph21_1210(PF02687) (PF12704)mitochondrial
743722.Sph21_0079(PF13650) (PF00595)ER
743722.Sph21_1177(PF02687) (PF12704)mitochondrial
743722.Sph21_1178(PF02687) (PF12704)mitochondrial
743722.Sph21_4774(PF02687) (PF12704)mitochondrial
743722.Sph21_3990(PF02687) (PF12704)ER
743722.Sph21_1209(PF02687) (PF12704)mitochondrial
743722.Sph21_1200(PF02687) (PF12704)(mitochondrial); mitochondrial
743722.Sph21_4981(PF02687) (PF12704)mitochondrial
743722.Sph21_2346(PF17132) (PF02837)ER
743722.Sph21_1908(PF00703) (PF02836)ER
743722.Sph21_0472(PF00295) (PF12708)mitochondrial
743722.Sph21_2338(PF00703) (PF02929) (PF02836) (PF02837)
743722.Sph21_2325(PF05592) (PF08531)ER
743722.Sph21_4314(PF02687) (PF12704)mitochondrial
743722.Sph21_2315(PF05592) (PF08531)ER
743722.Sph21_4305(PF07971)ER
743722.Sph21_4309(PF07715)mitochondrial; (mitochondrial)
743722.Sph21_4541(PF00930)ER
743722.Sph21_4234(PF07715)(ER)
743722.Sph21_4543(PF07715)ER
743722.Sph21_3650(PF07715)ER
743722.Sph21_2306(PF07715)ER
743722.Sph21_3271(PF03572)ER
743722.Sph21_3902(PF07715)ER
743722.Sph21_2054(PF07715)mitochondrial
743722.Sph21_2057(PF07971)ER
743722.Sph21_2058(PF04450)ER
743722.Sph21_2059(PF07971)ER
743722.Sph21_1504(PF07715)ER
743722.Sph21_0921(PF07944)ER
743722.Sph21_0431(PF07715)ER
743722.Sph21_0924(PF07715)ER
743722.Sph21_2985(PF13174)(mitochondrial)
743722.Sph21_5157(PF11028)ER
743722.Sph21_4333(PF07715)(mitochondrial)
743722.Sph21_5087(PF07715)mitochondrial; (mitochondrial)
743722.Sph21_5084(PF04616)ER
743722.Sph21_5081(PF04616)ER
743722.Sph21_2842(PF07715)ER
743722.Sph21_3264(PF07715)ER
743722.Sph21_3266(PF07715)ER
743722.Sph21_3268(PF07715)ER
743722.Sph21_3860(PF07715)(mitochondrial)
743722.Sph21_2420(PF07971)ER
743722.Sph21_2423(PF01715)(mitochondrial); (plastid)
743722.Sph21_1642(PF08534)ER
743722.Sph21_1647(PF07715)(ER)
743722.Sph21_0593(PF04616)ER
743722.Sph21_0594(PF04616)ER
743722.Sph21_1422(PF04616)(mitochondrial)
743722.Sph21_4329(PF12831)ER
743722.Sph21_1980PF11790ER
743722.Sph21_5189(PF11028)(ER)
743722.Sph21_4589(PF13088)ER
743722.Sph21_4587(PF13088)ER
743722.Sph21_4699(PF07470)ER
743722.Sph21_4104(PF14534)ER
743722.Sph21_2859(PF14498)ER
743722.Sph21_2857(PF07715)ER; (ER)
743722.Sph21_3925(PF07715)ER
743722.Sph21_0583(PF07715)ER
743722.Sph21_4261(PF07715)mitochondrial
743722.Sph21_4917(PF07715)ER
743722.Sph21_4463(PF04616)ER
743722.Sph21_4460(PF04616)ER
743722.Sph21_4645(PF07715)ER
743722.Sph21_4487(PF06439)ER
743722.Sph21_3063(PF05192)(mitochondrial)
743722.Sph21_4710(PF07944)ER
743722.Sph21_3114(PF04450)(mitochondrial)
743722.Sph21_2886(PF07715)ER
743722.Sph21_2229(PF13174)ER
743722.Sph21_2884(PF04616)ER
743722.Sph21_2882(PF14498)ER
743722.Sph21_2222(PF07971)ER
743722.Sph21_2888(PF07715)ER
743722.Sph21_1994(PF03629)ER
743722.Sph21_1990(PF07715)ER
743722.Sph21_2080(PF04616)ER
743722.Sph21_0970(PF07715)ER
743722.Sph21_0488(PF00295)ER
743722.Sph21_0484(PF05592)ER
743722.Sph21_0487(PF05448)ER
743722.Sph21_0482(PF07715)mitochondrial
743722.Sph21_0808(PF07715)ER
743722.Sph21_0378PF16117ER
743722.Sph21_0376(PF03572)ER
743722.Sph21_0375(PF07715)ER
743722.Sph21_0154(PF07715)ER
743722.Sph21_5058(PF04616)ER
743722.Sph21_3616(PF03572)ER
743722.Sph21_4707(PF07715)ER; (mitochondrial)
743722.Sph21_4709(PF07944)ER
743722.Sph21_3432(PF07715)ER
743722.Sph21_2891(PF07470)ER
743722.Sph21_3941(PF07715)ER
743722.Sph21_1764(PF13174)(ER); ER
743722.Sph21_1761(PF06439)ER
743722.Sph21_1969(PF04230)mitochondrial
743722.Sph21_1967(PF07715)(ER)
743722.Sph21_0499(PF17132)ER
743722.Sph21_0497(PF07715)ER
743722.Sph21_0494(PF00295)ER
743722.Sph21_0495(PF07470)ER
743722.Sph21_0492(PF04616)mitochondrial
743722.Sph21_0493(PF15979)ER
743722.Sph21_0490(PF07715)ER
743722.Sph21_1389(PF14534)ER
743722.Sph21_1546(PF02265)ER
743722.Sph21_0388(PF07715)mitochondrial; ER
743722.Sph21_0633(PF07715)ER
743722.Sph21_0636(PF14498)ER
743722.Sph21_0634(PF07715)ER
743722.Sph21_0639(PF07715)ER
743722.Sph21_4248(PF07971)ER
743722.Sph21_4245(PF07715)ER
743722.Sph21_4801(PF01120) (PF16757)(plastid)
743722.Sph21_4803(PF07715)ER
743722.Sph21_3422(PF13415)ER
743722.Sph21_3131(PF07715)ER
743722.Sph21_2953(PF06439)ER
743722.Sph21_2956(PF07715)ER
743722.Sph21_3958(PF06439)(ER); ER
743722.Sph21_1972(PF07715)ER
743722.Sph21_2779(PF07715)(mitochondrial)
743722.Sph21_2773(PF07715)ER
743722.Sph21_1772(PF07715)ER
743722.Sph21_1776(PF07715)ER
743722.Sph21_0603(PF01120)ER
743722.Sph21_0602(PF07715)ER
743722.Sph21_0730(PF07470)ER
743722.Sph21_4250(PF07715)ER
743722.Sph21_0040PF08507ER
743722.Sph21_4812(PF07715)ER
743722.Sph21_4722(PF07715)ER
743722.Sph21_2949(PF07715)(ER)
743722.Sph21_2940(PF07715)(mitochondrial)
743722.Sph21_3961(PF07715)ER
743722.Sph21_3960(PF02265)ER
743722.Sph21_4466(PF07715)mitochondrial
743722.Sph21_2166(PF01120)ER
743722.Sph21_2546(PF07715)ER
743722.Sph21_1949(PF04230)mitochondrial
743722.Sph21_2549(PF07715)ER
743722.Sph21_2766(PF07715)(ER)
743722.Sph21_1018(PF00930)ER
743722.Sph21_1011(PF07715)ER
743722.Sph21_1014(PF07715)ER
743722.Sph21_0942(PF07470)ER
743722.Sph21_0541(PF08534)ER
743722.Sph21_5065(PF07715)ER
743722.Sph21_0617(PF07715)mitochondrial
743722.Sph21_0725(PF07470)(mitochondrial); (plastid)
743722.Sph21_0729(PF01120)ER
743722.Sph21_3629(PF07715)(ER)
743722.Sph21_3717(PF07715)ER
743722.Sph21_4286(PF03629)ER
743722.Sph21_4284(PF07944)ER
743722.Sph21_3084(PF13650)ER
743722.Sph21_3086(PF13650)mitochondrial
743722.Sph21_3398(PF07715)ER
743722.Sph21_2370(PF16871)ER
743722.Sph21_2372(PF07715)ER
743722.Sph21_0581(PF13088)ER
743722.Sph21_3882(PF07715)ER
743722.Sph21_2596(PF14534)ER
743722.Sph21_1008(PF07715)ER
743722.Sph21_2750(PF07715)mitochondrial
743722.Sph21_1002(PF00930) (PF00595) (PF03572)
743722.Sph21_2028PF11790ER
743722.Sph21_1006(PF04616)ER
743722.Sph21_1004(PF07715)ER
743722.Sph21_0997(PF07715)ER
743722.Sph21_0993(PF00930)ER
743722.Sph21_0445(PF17132)ER
743722.Sph21_5014(PF13174)(mitochondrial)
743722.Sph21_1228(PF02687) (PF12704)(ER)
743722.Sph21_5018(PF07715)ER
743722.Sph21_0194(PF07715)(ER); ER
743722.Sph21_0266(PF08534)ER
743722.Sph21_5121(PF07715)(ER)
743722.Sph21_5123(PF07715)(ER)
743722.Sph21_4294(PF13088)ER
743722.Sph21_4524(PF07715)ER
743722.Sph21_4748(PF07715)ER
743722.Sph21_3989(PF06439)ER
743722.Sph21_1920(PF07715)(ER)
743722.Sph21_1928(PF07715)(ER); ER
743722.Sph21_2032PF11790ER
743722.Sph21_2746(PF07715)(ER)
743722.Sph21_2631(PF07715)ER
743722.Sph21_1104(PF07715)ER
743722.Sph21_0452(PF15071)ER
743722.Sph21_1851(PF08534)mitochondrial
743722.Sph21_1852(PF07715)ER
743722.Sph21_1215(PF12704)mitochondrial
743722.Sph21_0183(PF07715)ER
743722.Sph21_4358(PF02687) (PF12704)(mitochondrial)
743722.Sph21_4355(PF02687)ER
743722.Sph21_3770(PF03572)ER
743722.Sph21_2918(PF03321)mitochondrial
743722.Sph21_3374(PF01120)ER
743722.Sph21_2356(PF07715)ER
743722.Sph21_1931(PF07715)ER
743722.Sph21_2647(PF04616)ER
743722.Sph21_0468(PF07470)(ER)
743722.Sph21_0466(PF17132)ER
743722.Sph21_0464(PF06439)ER
743722.Sph21_0460(PF07715)(ER)
743722.Sph21_1024(PF04616)ER
743722.Sph21_0088(PF07715)ER
743722.Sph21_4505(PF07971)ER
743722.Sph21_2905(PF07715)(mitochondrial)
743722.Sph21_4162(PF04616)ER; (ER)
743722.Sph21_3699(PF07715)ER
743722.Sph21_3693(PF03572)ER
743722.Sph21_4760(PF07715)ER
743722.Sph21_2837(PF12831)ER
743722.Sph21_2835(PF07715)(ER); ER
743722.Sph21_2347(PF07944)ER
743722.Sph21_2348(PF03629)ER
743722.Sph21_1902(PF13088)ER
743722.Sph21_1900(PF07715)ER; (ER)
743722.Sph21_1906(PF10142)ER
743722.Sph21_1904(PF07715)ER
743722.Sph21_1101(PF07715)ER
743722.Sph21_2658(PF04616)ER
743722.Sph21_2652(PF15979)ER
743722.Sph21_2653(PF04616)ER
743722.Sph21_2651(PF04616)ER
743722.Sph21_0453(PF06439)ER; (ER)
743722.Sph21_0599(PF07944)(ER)
743722.Sph21_0501(PF07715)ER
743722.Sph21_0503(PF07971)ER; (ER)
743722.Sph21_1871(PF07715)(mitochondrial)
743722.Sph21_1879(PF07715)mitochondrial
743722.Sph21_1279(PF07715)ER
743722.Sph21_1277(PF12831)ER
743722.Sph21_0471(PF04685)ER
743722.Sph21_0474(PF04616)ER; (ER)
743722.Sph21_5111(PF05192)(mitochondrial)
743722.Sph21_0657(PF01120)mitochondrial; ER
743722.Sph21_2932(PF06439)ER
743722.Sph21_4157(PF14498)ER
743722.Sph21_4798(PF07715)ER
743722.Sph21_2337(PF05592)ER
743722.Sph21_2330(PF07715)ER
743722.Sph21_2485(PF07715)ER
743722.Sph21_2660(PF07715)ER; (ER)
743722.Sph21_1261(PF07715)mitochondrial
743722.Sph21_0178(PF07971)ER
743722.Sph21_0794(PF04616)ER
743722.Sph21_0796(PF07470)ER
743722.Sph21_0793(PF15892)mitochondrial
743722.Sph21_0133(PF14534)ER
743722.Sph21_0132(PF14534)ER
743722.Sph21_0139(PF07715)ER
743722.Sph21_4566(PF07971)ER
743722.Sph21_4561(PF07971)ER
743722.Sph21_2920(PF00595)ER
743722.Sph21_4419(PF07470)ER
743722.Sph21_4141(PF07715)ER
743722.Sph21_4143(PF06439)ER
743722.Sph21_4417(PF15892)ER
743722.Sph21_4415(PF07715)mitochondrial
743722.Sph21_3032PF16117ER
743722.Sph21_2320(PF00295)ER
743722.Sph21_2499(PF07715)ER
743722.Sph21_2494(PF07715)ER
743722.Sph21_2473(PF00930)ER
743722.Sph21_2676(PF07715)ER
743722.Sph21_2677(PF07715)ER
743722.Sph21_1419(PF07715)ER
743722.Sph21_2671(PF04253)ER
743722.Sph21_2781(PF07470)ER
743722.Sph21_1894PF09431(mitochondrial)
743722.Sph21_1095(PF07715)ER
743722.Sph21_1097(PF07715)ER
743722.Sph21_0415(PF08534)ER
743722.Sph21_5174(PF13088)ER
743722.Sph21_5170(PF07715)ER
743722.Sph21_5171(PF07715)ER
743722.Sph21_2865(PF14498)ER
743722.Sph21_2861(PF07715)ER
743722.Sph21_2860(PF01120)(mitochondrial)
743722.Sph21_2863(PF01120)ER
743722.Sph21_2869(PF07470)(mitochondrial)
743722.Sph21_3021(PF05592)ER
743722.Sph21_2267(PF07715)ER
743722.Sph21_2313(PF13088)ER
743722.Sph21_2317(PF13088)ER
743722.Sph21_1662(PF07715)ER
743722.Sph21_2446(PF07715)ER
743722.Sph21_2683(PF07715)ER
743722.Sph21_1882(PF07715)ER
743722.Sph21_1887(PF07715)(mitochondrial)
743722.Sph21_1248(PF07715)ER
743722.Sph21_0939(PF07715)ER
743722.Sph21_0684(PF03572)ER
743722.Sph21_2455PF14360(plastid)
743722.Sph21_1640(PF05970) PF02689
743722.Sph21_1510(PF12831)(ER)
743722.Sph21_0463(PF05592) (PF08531)
743722.Sph21_0480(PF07715)(ER)
743722.Sph21_0968(PF13653)(mitochondrial)
743722.Sph21_3607(PF08534)(ER)
743722.Sph21_4397PF05203 PF04300
743722.Sph21_3730(PF06884)(ER)
743722.Sph21_0214(PF07653) PF00018
743722.Sph21_5060(PF07715)(mitochondrial)
743722.Sph21_2111(PF07715)(ER)
743722.Sph21_2572(PF07715)(plastid)
743722.Sph21_1000(PF07715)(ER)
743722.Sph21_4522(PF08534)(ER)
743722.Sph21_2643(PF07715)(mitochondrial)
743722.Sph21_2657(PF02837) (PF03629)
743722.Sph21_5110(PF05970) PF02689
743722.Sph21_2480(PF00295) (PF12708)
743722.Sph21_1069(PF02687) (PF12704)
743722.Sph21_3272(PF02371)
743722.Sph21_1657(PF12831)
743722.Sph21_1652(PF02371)
743722.Sph21_1651(PF02371)
743722.Sph21_3909(PF13906)
743722.Sph21_2056(PF01120)
743722.Sph21_0929(PF07715)
743722.Sph21_0107(PF07715)
743722.Sph21_4859(PF07715)
743722.Sph21_3293(PF16011)
743722.Sph21_1184(PF07715)
743722.Sph21_4462(PF13376)
743722.Sph21_4488(PF00302)
743722.Sph21_3062(PF13174)
743722.Sph21_3934(PF13650)
743722.Sph21_1996(PF12831)
743722.Sph21_0485(PF02371)
743722.Sph21_0714(PF03321)
743722.Sph21_0373(PF05448)
743722.Sph21_0803(PF07715)
743722.Sph21_2897(PF02371)
743722.Sph21_1617(PF01715)
743722.Sph21_0960(PF13376)
743722.Sph21_0384(PF07715)
743722.Sph21_0637(PF02371)
743722.Sph21_3608(PF08534)
743722.Sph21_1977(PF07715)
743722.Sph21_2771(PF14534)
743722.Sph21_0609(PF04685)
743722.Sph21_5258(PF13174)
743722.Sph21_2947(PF07715)
743722.Sph21_2165(PF04616)
743722.Sph21_1945(PF04230)
743722.Sph21_0547(PF02687)
743722.Sph21_3715(PF13875)
743722.Sph21_3397(PF02371)
743722.Sph21_4759(PF08534)
743722.Sph21_4758(PF08534)
743722.Sph21_4934(PF13207)
743722.Sph21_2577(PF13376)
743722.Sph21_0841(PF07715)
743722.Sph21_5011(PF03629)
743722.Sph21_0198(PF05153)
743722.Sph21_0264(PF07715)
743722.Sph21_5239(PF13174)
743722.Sph21_4291(PF07715)
743722.Sph21_2580(PF06439)
743722.Sph21_0521(PF07715)
743722.Sph21_4772(PF03321)
743722.Sph21_2649(PF07715)
743722.Sph21_5107(PF07715)
743722.Sph21_4984(PF02371)
743722.Sph21_2016(PF04230)
743722.Sph21_0477(PF07715)
743722.Sph21_4974(PF03572)
743722.Sph21_4570(PF14534)
743722.Sph21_3689PF08557
743722.Sph21_4406(PF05192)
743722.Sph21_2336(PF02371)
743722.Sph21_2067(PF12708)
743722.Sph21_1469(PF02371)
743722.Sph21_1861(PF02371)
743722.Sph21_0222(PF07715)
743722.Sph21_3786(PF00302)
743722.Sph21_2074(PF04230)
743722.Sph21_3124(PF13376)
743722.Sph21_0414(PF02371)
743722.Sph21_4136(PF13376)
743722.Sph21_2868(PF01120)
743722.Sph21_4697(PF07715)
743722.Sph21_2318(PF05448)

Detailed merged results for each protein sequence

Individual results for each protein sequence

Genome based results

Summary

  • Gram negative: YES (FDR = 0.5 %)
  • Functional Type III secretion system: NO (FDR = 12.5 %)
  • Functional Type IV secretion system: NO (FDR = 7.2 %)
  • Functional Type VI secretion system: NO (FDR = 7.7 %)

Individual results for each secretion system

Parameters:

==========================================================
EFFECTIVE_T3_OLD=selective
EFFECTIVE_T3_NEW=selective
PREDOTAR_ANIMAL_OR_PLANT=a
PROTEINS=INPUT PROTEINS
MODUS=genome
RUN_PREDOTAR=T
RUN_EFFECTIVE_T3=T
RUN_T4SEpre=0.5
RUN_EFFECTIVE_CCBD=T
RUN_EFFECTIVE_ELD=4
CheckM_COMPLETENESS=
RUN_EffectiveS346=T
GENOTYPE=COG Profile
EMAIL=
==========================================================