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Effective results for Bacteroides thetaiotaomicron VPI-5482 (eggnog40)

Summary

Number of putative secreted proteins: 657
- Predicted by T4SEpre: 0
- Predicted by EffectiveELD: 115 eukaryotic-like domains, contained in 657 proteins (186 high, 471 medium Z-score)
Predicted protein secretion systems (parentheses indicate weak positive predictions lacking more than 50% of core proteins of a secretion system): None

Protein based results

Putative secreted proteins (weak evidence indicated by parentheses)

ProteinEffectiveT3EffectiveCCBDT4SEpreEffectiveELDPredotar
226186.BT_3293(PF02836) PF02929 PF16353 PF02837 PF00703 PF00754ER
226186.BT_0993PF02837 (PF02836) PF02929 PF00703 PF16353ER
226186.BT_1626PF02837 (PF02836) PF02929 PF00703 PF16353ER
226186.BT_4050(PF02836) PF02929 PF16353 PF00754 PF00703 PF02837(ER)
226186.BT_3340PF02837 (PF02836) PF00703 PF02929 PF16353(ER)
226186.BT_3179PF02837 (PF02836) PF00703 PF02929 PF16353ER
226186.BT_0992PF02837 (PF02836) PF02929 PF00703ER
226186.BT_0996PF02837 (PF02836) PF00703 (PF16355)(ER)
226186.BT_3526PF17168 PF16335 PF16334 PF08760ER
226186.BT_3169PF00754 (PF17137) (PF01055) (PF16338)(ER)
226186.BT_1051PF00728 PF00754 PF13287 PF02838ER
226186.BT_4667PF02837 (PF02836) PF00703 (PF16355)ER
226186.BT_0757PF02837 (PF02836) PF00703 (PF16355)ER
226186.BT_2191PF02837 (PF02836) PF00703 PF16353ER
226186.BT_3546PF17168 PF16335 PF16334 PF08760ER
226186.BT_1627PF00728 PF00754 PF13287 PF02838ER
226186.BT_3477PF17168 PF16335 PF16334 PF08760ER
226186.BT_0461PF02837 (PF02836) PF00703 (PF16355)ER
226186.BT_4156PF02837 (PF02836) PF00703 PF02929ER
226186.BT_2680PF02837 (PF02836) PF00703 (PF16355)ER
226186.BT_0459PF00728 PF00754 PF13287 PF02838ER
226186.BT_2912(PF17132) (PF13385) (PF04616)ER
226186.BT_4181PF02837 PF00703 (PF16355)ER
226186.BT_3513PF02837 (PF02836) PF00703ER
226186.BT_0506PF00728 (PF07691) PF02838ER; (ER)
226186.BT_0438PF05089 PF12972 PF12971ER
226186.BT_3292PF02837 (PF02836) PF00703ER
226186.BT_0983PF02837 (PF02836) PF00703ER
226186.BT_4241PF02837 (PF02836) PF00703 PF02929 PF16353
226186.BT_3178PF00728 PF13287 PF02838ER
226186.BT_2969PF02837 (PF02836) PF00703ER
226186.BT_4074PF00754 (PF02836) PF00703ER
226186.BT_1768PF02837 (PF02836) PF00703ER
226186.BT_4337PF00728 PF13287 PF02838ER
226186.BT_3114PF02837 (PF07691) PF00703(ER)
226186.BT_1776PF02837 (PF02836) PF00703(mitochondrial)
226186.BT_3590PF05089 PF12972 PF12971ER
226186.BT_0460PF00728 PF00754 PF02838ER
226186.BT_3092PF02837 (PF02836) PF00703ER
226186.BT_3086(PF17137) (PF01055) (PF16338)ER
226186.BT_4359PF05089 PF12972 PF12971ER
226186.BT_3659(PF17137) (PF01055) (PF16338)ER
226186.BT_2432PF00754 PF02837 PF00703ER
226186.BT_4684PF02837 (PF02836) PF00703ER
226186.BT_2922PF02837 (PF02836) PF00703ER
226186.BT_3300(PF14310) (PF07691)ER
226186.BT_3512PF17168 PF16335 PF16334 PF08760
226186.BT_3298PF01436 PF01833ER
226186.BT_2392PF01436 PF01833ER
226186.BT_4080PF01436 PF01833(ER)
226186.BT_4394PF00728 PF02838ER
226186.BT_4091PF03629 PF02837ER
226186.BT_4657(PF16889) (PF07940)ER
226186.BT_4652(PF07940) (PF16332)ER
226186.BT_4076(PF05592) (PF08531)ER
226186.BT_3015PF13402 PF00754ER
226186.BT_4662(PF16889) (PF07940)ER
226186.BT_2948(PF07691) PF07971ER
226186.BT_2530PF01436 PF01833ER
226186.BT_3009(PF14310) (PF07691)ER
226186.BT_1621PF00728 PF02838ER
226186.BT_1625PF00754 (PF01120)ER
226186.BT_2192PF00754 (PF01120)ER
226186.BT_3956PF00754 (PF01120)ER
226186.BT_3482PF01436 PF01833ER
226186.BT_0291(PF00589) (PF13495)(mitochondrial)
226186.BT_2523(PF05592) (PF08531)ER
226186.BT_2524(PF05592) (PF08531)ER
226186.BT_2855PF00754 PF00703(mitochondrial)
226186.BT_1778(PF14310) (PF07691)mitochondrial
226186.BT_3599PF02837 PF00703ER
226186.BT_3598PF00728 PF02838ER
226186.BT_4136PF00754 (PF01120)ER
226186.BT_2896PF01436 PF01833ER
226186.BT_2627PF01436 PF01833ER
226186.BT_3916(PF00589) (PF13495)(mitochondrial)
226186.BT_3868PF00728 PF02838ER
226186.BT_4151PF02837 PF00703ER
226186.BT_3662PF00754 (PF04616)ER
226186.BT_3085(PF01055) (PF17137)ER
226186.BT_2111(PF14683) PF07971ER
226186.BT_0456PF00728 PF02838ER
226186.BT_1013(PF05592) (PF08531)ER
226186.BT_4681PF00728 PF02838(ER)
226186.BT_1003(PF07944)ER
226186.BT_3350(PF02278)ER
226186.BT_1485PF13905ER
226186.BT_1489(PF07715)(mitochondrial); (ER)
226186.BT_2172(PF07715)ER
226186.BT_3301PF03663ER
226186.BT_4164(PF07715)ER
226186.BT_0190(PF07715)ER; (ER)
226186.BT_4168(PF07715)ER
226186.BT_0195PF16387ER
226186.BT_4270PF00754ER
226186.BT_2911(PF07944)ER
226186.BT_2913(PF07470)ER
226186.BT_2916(PF10022)ER
226186.BT_4430(PF05140)ER
226186.BT_4185(PF04616)ER
226186.BT_4187(PF00295)ER
226186.BT_4180PF03629ER
226186.BT_3514(PF15979)ER
226186.BT_3519(PF07715)(mitochondrial)
226186.BT_3633(PF07715)ER
226186.BT_0504(PF07715)ER
226186.BT_0502(PF07715)ER
226186.BT_3180(PF16401)(ER)
226186.BT_1929(PF00589)(mitochondrial)
226186.BT_3297(PF07715)ER
226186.BT_0727(PF03415)ER
226186.BT_3363(PF05686)mitochondrial; (mitochondrial)
226186.BT_3162PF16387ER
226186.BT_0987PF13905ER
226186.BT_4201(PF07715)ER
226186.BT_3988PF00754ER
226186.BT_3986(PF13385)ER
226186.BT_3983(PF07715)(mitochondrial)
226186.BT_2906(PF14307)ER
226186.BT_2905(PF07715)mitochondrial
226186.BT_2900(PF04616)ER
226186.BT_4408(PF14388)ER
226186.BT_4404(PF07715)(mitochondrial)
226186.BT_4407(PF13385)ER
226186.BT_3563(PF01223)ER
226186.BT_4247(PF07715)(ER); ER
226186.BT_3620(PF03092)(ER)
226186.BT_3192(PF03544)ER
226186.BT_3754(PF13385)ER
226186.BT_3750(PF07715)ER; (ER)
226186.BT_0403(PF00216)(mitochondrial)
226186.BT_1939(PF07715)ER
226186.BT_2378(PF00295)ER
226186.BT_3282(PF16313)ER
226186.BT_2576(PF00589)(mitochondrial); ER
226186.BT_3439PF01823ER
226186.BT_3377(PF02485)ER
226186.BT_1668(PF03544)ER
226186.BT_3174(PF07715)ER
226186.BT_3173(PF14498)ER
226186.BT_1283(PF13385)ER
226186.BT_1440(PF07715)ER
226186.BT_1119(PF07715)ER
226186.BT_2393(PF07715)ER
226186.BT_2390(PF07715)ER
226186.BT_4521(PF00589)mitochondrial
226186.BT_3991PF07971ER
226186.BT_3990PF07971ER
226186.BT_3994PF07971ER
226186.BT_2970(PF01120)ER
226186.BT_4410(PF07940)ER
226186.BT_0150(PF07715)ER
226186.BT_0441PF00754ER
226186.BT_2809(PF07168)ER
226186.BT_2718PF00366(mitochondrial)
226186.BT_2629PF07971ER
226186.BT_2626(PF07715)ER
226186.BT_2623PF03663ER
226186.BT_2364(PF07715)ER
226186.BT_2564PF13905ER
226186.BT_2560(PF07715)ER
226186.BT_1050PF00754ER
226186.BT_1619(PF07715)(ER)
226186.BT_3143(PF03432)(mitochondrial)
226186.BT_4739(PF00589)(mitochondrial)
226186.BT_1632(PF13385)ER
226186.BT_4081(PF07715)ER
226186.BT_4088(PF07715)ER
226186.BT_3964(PF04450)ER
226186.BT_3962PF07971ER
226186.BT_3963PF07971ER
226186.BT_3960(PF00648)(ER)
226186.BT_2968(PF07715)ER
226186.BT_2963(PF07470)ER
226186.BT_2964(PF02278)ER
226186.BT_4395PF02838ER
226186.BT_0144(PF04616)ER
226186.BT_0146(PF07470)ER
226186.BT_4266PF01436ER
226186.BT_4267(PF07715)ER
226186.BT_2818(PF07715)ER
226186.BT_0398(PF10531)ER
226186.BT_3776(PF04488)(mitochondrial)
226186.BT_3774PF00754ER
226186.BT_3773PF07971ER
226186.BT_2634(PF00589)ER
226186.BT_2631PF03663ER
226186.BT_2632(PF06824)ER; (ER)
226186.BT_1953(PF07715)ER
226186.BT_2557(PF13683)(mitochondrial)
226186.BT_1042(PF07715)ER
226186.BT_1045(PF13385)ER
226186.BT_1049(PF13385)(ER); ER
226186.BT_3156(PF07715)(mitochondrial)
226186.BT_3155(PF14498)ER
226186.BT_1604(PF05140)ER
226186.BT_1138(PF00589)mitochondrial; (mitochondrial)
226186.BT_1420(PF07715)ER
226186.BT_4727PF16387(ER); ER
226186.BT_1551(PF16313)ER
226186.BT_1552(PF07715)ER
226186.BT_4093PF07971ER
226186.BT_4092PF07971ER
226186.BT_4090(PF07715)ER
226186.BT_4095(PF04616)ER
226186.BT_4094(PF04041)ER
226186.BT_4658(PF07470)ER
226186.BT_2950(PF13385)ER
226186.BT_2958(PF15979)ER
226186.BT_2959(PF04616)ER
226186.BT_4470(PF07715)(ER); ER
226186.BT_2820(PF07715)ER
226186.BT_3558(PF01223)ER
226186.BT_4073PF07971ER
226186.BT_0543(PF12437)mitochondrial; (mitochondrial)
226186.BT_3516(PF04616)ER
226186.BT_3702(PF07715)ER
226186.BT_3706(PF13683)(mitochondrial)
226186.BT_3016(PF07715)ER
226186.BT_3012(PF07715)ER
226186.BT_1631(PF07715)ER
226186.BT_3124PF03629ER
226186.BT_1416(PF05140)ER
226186.BT_4710(PF13385)ER
226186.BT_4711PF00754ER
226186.BT_4660(PF07715)(mitochondrial)
226186.BT_3493(PF07715)ER
226186.BT_2944(PF02350)(mitochondrial)
226186.BT_3492PF01833ER
226186.BT_2949PF03663(ER)
226186.BT_4040PF00754ER
226186.BT_1883PF03663ER
226186.BT_2531(PF07715)ER
226186.BT_0754(PF07715)ER
226186.BT_2447(PF00589)(mitochondrial)
226186.BT_3130PF07971ER
226186.BT_3132PF03629ER
226186.BT_3136(PF00589)(mitochondrial)
226186.BT_2196(PF07715)ER
226186.BT_2199PF07971ER
226186.BT_4707(PF07715)ER
226186.BT_2068(PF02544)ER
226186.BT_2065(PF07715)ER
226186.BT_4634(PF07715)ER
226186.BT_2268(PF07715)ER
226186.BT_2267(PF00589)mitochondrial
226186.BT_3958(PF07715)(ER)
226186.BT_3954(PF04450)ER
226186.BT_3952(PF07715)ER
226186.BT_4671(PF07715)ER
226186.BT_2848(PF17170)ER
226186.BT_2845PF13905ER
226186.BT_4295PF00754ER
226186.BT_3825(PF13683)(mitochondrial)
226186.BT_4290(PF13683)(mitochondrial)
226186.BT_4299PF01436ER
226186.BT_4298(PF07715)ER
226186.BT_4055(PF07715)ER
226186.BT_0029(PF07715)ER
226186.BT_0364(PF07715)ER
226186.BT_0367(PF04616)ER; (ER)
226186.BT_0360(PF04616)ER
226186.BT_0369(PF04616)ER
226186.BT_0290PF00754ER
226186.BT_3108(PF04616)ER
226186.BT_1769PF07971ER; (ER)
226186.BT_1763(PF07715)ER
226186.BT_1503(PF00589)(ER); (mitochondrial)
226186.BT_2073(PF13086)mitochondrial; (mitochondrial)
226186.BT_0968(PF11028)(ER)
226186.BT_3921(PF03544)ER
226186.BT_4114(PF07715)ER
226186.BT_2859(PF07715)ER
226186.BT_2852(PF04616)ER
226186.BT_2854(PF14310)(ER)
226186.BT_3858PF07971(mitochondrial)
226186.BT_1991(PF01510)(mitochondrial)
226186.BT_3024(PF07715)ER
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226186.BT_1878PF07971ER
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226186.BT_0457PF03629ER
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226186.BT_1308(PF03415)ER
226186.BT_2321(PF00589)(mitochondrial)
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226186.BT_2021(PF00216)(mitochondrial)
226186.BT_3432(PF08011) (PF09820)
226186.BT_0233(PF00589)(mitochondrial)
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226186.BT_0912(PF00216)
226186.BT_0911(PF00216)
226186.BT_2247(PF02026)
226186.BT_1203(PF02350)
226186.BT_4104(PF13086)
226186.BT_4032(PF00216)
226186.BT_0005PF00366
226186.BT_4323(PF01715)
226186.BT_2886PF02357
226186.BT_2881(PF01128)
226186.BT_1699(PF08011)
226186.BT_3275(PF16313)
226186.BT_2094(PF07715)
226186.BT_4622(PF03432)
226186.BT_4135(PF07715)
226186.BT_0125(PF10531)
226186.BT_2871(PF02485)
226186.BT_2870(PF02485)
226186.BT_4009(PF00589)
226186.BT_0339(PF01055)
226186.BT_3478(PF00589)
226186.BT_3041(PF00216)
226186.BT_0795(PF00216)
226186.BT_1827(PF00589)
226186.BT_2409(PF07715)
226186.BT_0462PF02357
226186.BT_1358PF02357
226186.BT_1356(PF10531)
226186.BT_1683(PF07715)
226186.BT_4630(PF04326)
226186.BT_2139(PF06250)
226186.BT_2488(PF00589)
226186.BT_4549(PF00589)
226186.BT_3674(PF07944)
226186.BT_3670(PF07715)
226186.BT_2419(PF00958)
226186.BT_3781(PF06824)
226186.BT_1037(PF13385)
226186.BT_1033(PF04041)
226186.BT_1781(PF04616)
226186.BT_3327(PF04326)
226186.BT_2128PF07959
226186.BT_0076(PF00589)
226186.BT_3663(PF04616)
226186.BT_0443(PF14310)
226186.BT_0446(PF16401)
226186.BT_3240(PF07715)
226186.BT_2929(PF00216)
226186.BT_2203(PF13385)
226186.BT_3335(PF16011)
226186.BT_3888(PF03054)
226186.BT_0276(PF13385)
226186.BT_3530PF07971
226186.BT_0452(PF07715)
226186.BT_1656PF02357
226186.BT_1654(PF10531)
226186.BT_1651(PF01128)
226186.BT_1499(PF00216)
226186.BT_4519(PF06250)
226186.BT_4229(PF04326)
226186.BT_3503PF08760
226186.BT_2742(PF00589)

Detailed merged results for each protein sequence

Individual results for each protein sequence

Genome based results

Summary

  • Gram negative: YES (FDR = 0.5 %)
  • Functional Type III secretion system: NO (FDR = 12.5 %)
  • Functional Type IV secretion system: NO (FDR = 7.2 %)
  • Functional Type VI secretion system: NO (FDR = 7.7 %)

Individual results for each secretion system

Parameters:

==========================================================
EFFECTIVE_T3_OLD=selective
EFFECTIVE_T3_NEW=selective
PREDOTAR_ANIMAL_OR_PLANT=a
PROTEINS=INPUT PROTEINS
MODUS=genome
RUN_PREDOTAR=T
RUN_EFFECTIVE_T3=T
RUN_T4SEpre=0.5
RUN_EFFECTIVE_CCBD=T
RUN_EFFECTIVE_ELD=4
CheckM_COMPLETENESS=
RUN_EffectiveS346=T
GENOTYPE=COG Profile
EMAIL=
==========================================================